Variant Visualizer (Variants)

Submit Data | Help | Video Tutorials | News | Publications | Download | REST API | Citing RGD | Contact

Sequence Annotation

Assembly Rnor_5.0

Conservation

Genes ( + )

Genes ( + )

Genes ( - )

Rnor 5.0

LN/MavRrrc (KNAW)

.003	.998	.265	.039	.001	.0	.001	.001	.001	--	.003	.001	.001	.002	.005	.324	.014	--	.011	.0	.038	.007	.007	.989	.027	.029	.0	.01	.0	.001	.0	.0	.0	.001	.004	.006	.0	.0	.0	.0	.01	.0	.207	.001	.0	.001	.004	.001	.008	.016	.002	.001	.006	.008	.001	.0	.094	.0	.002	.001	.029	.002	.001	.321	.621	.546	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.003	.008	.003	.003	.042	.029	.004	.047	.008	.015	.0	.0	.003	.004	.001	.009	.005	.006	.001	.005	.061	.08	.559	.0	.002	.969	.007	.001	.0	.002	.015	.002	.004	.0	.001	.012	.003	.043	--	.0	.004	.007	.004	.001	.069	.773	--	--	--	--	--	.0	.991	.004	.004	.0	.0	.0	.019	.009	.024	.002	.125	.001	.049	.007	.012	.004	.049	.092	--	--	--	--	--	--	.001	.001	.0	.003	.002	.015	.023	.017	.014	.015	.001	.002	.017	.366	.037	.001	.001	.002	.0	.306	.339	.0	.001	.009	.024	.149	.071	--	.003	.866	.16	.157	.004	.004	.0	.003	.02	.003	.0	.001	.21	.034	--	--	--	.058	.0	.06	.004	.002	.006	.004	.003	.002	.114	.183	.092	.001	.002	.028	.0	.16	.068	.011	.004	.0	.012	.001	.0	.0	.003	.653	.529	.003	.673	.008	.0	.005	.006	.0	.0	.001	.003	.009	.051	.006	.005	.648	.001	.002	.0	.0	.0	.002	.008	.001	.01	.027	.017	.082	.0	.23	.0	.007	.001	.008	.999	.001	.009	.002	.002	.001	--	--	.0	.002	.001	.0	.982	.007	.0	.049	.001	.0	.0	--	--	--	--	.112	.032	.04	.008	.082	.055	.216	.008	.025	.525	.381	.008	.214	.009	.017	.003	.007	--	--	--	--	.025	.815	.986	.055	.001	.02	.252	.367	.382	.026	.016	.045	.034	.0	.0	.164	.206	.01	.002	.986	.997	.001	.028	.019	.009	.005	.009	.012	.044	.034	.028	.001	.001	.109	.0	.009	.0	.02	.006	.016	.024	.009	.001	.019	.003	.002	.007	.001	.003	.093	.114	.017	.006	.031	.098	.208	.277	.069	.174	.002	.0	.004	.005	.0	.003	.135	.0	.0	.0	.001	.001	.005	.03	.009	.002	.0	.024	.016	.002	.028	.011	--	.015	.083	.053	.009	.019	.036	.0	.009	.011	.0	.0	.003	.007	.0	.007	.029	.006	.067	.002	.517	.553	.06	.576	.049	.0	.006	.016	.002	.002	.036	.095	.065	.0	.004	.003	.011	.009	.091	.014	.051	.0	.03	.005	.001	.062	.026	.221	.007	.177	.174	.262	.174	.617	.035	.001	.002	.001	.007	.996	.001	.114	.004	.0	.012	.011	.0	.003	.027	.0	.0	.0	.008	.003	1.0	.0	.002	.0	.004	.001	.001	.311	.006	.01	.116	.007	.123	.005	.026	.486	.066	.001	.021	.011	.003	.002	.02	--	--	.052	.824	.0	.0	.001	.062	.098	.0	.002	.074	.03	.084	.0	--	--	--	.001	--	.03	.016	.338	.001	.99	.56	.097	.02	.614	.003	.961	.005	--	.377	.001	.007	.001	.129	.019	.03	.0	.0	--	--	.0	.035	.0	--	--	.137	.116	.0	--	--	--	--	.713	.006	.0	.0	.007	.0	.001	.001
Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4										Lama4
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
C	G	A	T	G	T	2	G	G	A	4	G	C	A	G	A	A	T	A	C	G	3	G	C	2	G	G	A	G	A	T	C	T	A	G	A	C	C	A	A	4	A	G	C	A	G	G	T	A	2	T	T	C	G	C	C	C	C	C	G	C	T	A	A	A	G	T	T	T	A	G	G	A	A	C	G	G	T	T	G	T	A	C	G	C	C	T	G	G	A	C	G	A	G	G	C	G	T	G	T	A	T	3	A	C	T	T	2	G	C	C	A	C	G	G	A	G	C	T	C	2	T	C	2	C	G	3	A	T	C	T	T	T	T	C	A	G	G	C	G	4	G	6	T	T	T	T	T	T	A	G	A	G	C	5	A	A	A	T	C	T	C	T	T	G	A	C	C	G	A	G	G	A	C	T	C	A	A	G	C	C	T	A	4	A	G	A	T	C	C	A	A	T	G	A	A	C	A	G	A	T	T	G	G	T	G	A	A	G	A	C	G	T	G	G	C	T	G	A	G	C	C	C	A	C	A	G	G	C	G	T	C	A	A	G	A	A	C	T	T	G	A	A	C	C	C	G	T	C	G	C	C	2	C	G	A	T	A	A	A	C	G	C	T	A	C	T	G	T	A	C	2	G	T	G	T	T	T	C	C	G	T	A	A	2	T	9	G	30	G	T	T	G	T	T	G	T	T	A	C	A	G	T	C	G	T	T	A	T	C	A	G	C	G	G	G	A	G	T	7	C	A	A	T	C	2	A	A	T	T	T	A	G	C	A	A	C	T	C	T	2	G	G	A	T	A	G	G	A	A	A	C	A	3	A	A	C	A	C	A	G	A	C	T	G	A	T	G	A	T	A	T	T	A	T	C	A	A	G	2	G	A	C	G	C	T	2	T	T	C	C	G	T	G	C	G	A	A	T	T	G	C	C	A	C	G	A	A	G	G	G	A	A	T	G	C	T	T	T	C	G	T	C	G	A	T	G	A	A	T	A	T	A	C	T	C	C	G	G	G	11	T	C	C	A	A	G	G	T	G	A	G	G	A	A	G	C	A	G	T	A	T	C	C	C	T	C	T	8	6	G	A	A	A	A	G	T	T	C	C	T	A	C	G	23	T	G	2	C	G	C	4	G	A	A	T	A	C	A	C	2	G	4	G	T	T	G	C	C	T	4	6	C	C	A	T	G	A	G	2	T	C	A	T	G	2	G	G	T	T	C	C	A	3	9	2	7	T	A	G	G	2	49	G	C	10	G	C	G	C
45,787,158	45,787,613	45,787,663	45,789,386	45,789,536	45,789,860	45,790,937	45,790,938	45,790,940	45,791,123	45,791,124	45,791,285	45,792,423	45,792,798	45,792,834	45,792,864	45,793,446	45,793,586	45,793,644	45,794,047	45,794,321	45,794,349	45,794,435	45,794,717	45,794,893	45,794,901	45,795,323	45,797,179	45,797,520	45,797,605	45,797,983	45,798,320	45,798,585	45,798,815	45,798,952	45,800,414	45,800,758	45,800,759	45,800,858	45,801,409	45,801,777	45,802,525	45,803,535	45,804,052	45,804,876	45,804,885	45,805,103	45,805,716	45,805,788	45,807,206	45,808,137	45,808,281	45,808,311	45,808,457	45,808,466	45,808,468	45,808,509	45,808,998	45,809,090	45,809,245	45,809,724	45,809,971	45,810,170	45,810,508	45,810,722	45,810,743	45,810,839	45,810,844	45,810,951	45,811,055	45,811,056	45,811,059	45,811,073	45,811,118	45,811,255	45,811,258	45,811,261	45,811,286	45,811,292	45,811,299	45,811,329	45,811,336	45,811,377	45,811,401	45,811,421	45,811,437	45,811,453	45,811,472	45,811,482	45,811,523	45,811,929	45,812,531	45,812,658	45,812,713	45,812,731	45,814,104	45,814,237	45,814,467	45,814,797	45,814,801	45,814,946	45,815,112	45,815,410	45,815,415	45,815,791	45,816,365	45,816,664	45,816,785	45,817,142	45,817,157	45,817,490	45,817,922	45,818,348	45,818,556	45,818,564	45,818,624	45,818,718	45,818,945	45,819,040	45,819,092	45,819,748	45,821,617	45,821,757	45,822,095	45,823,277	45,826,710	45,827,156	45,828,539	45,829,436	45,829,803	45,830,569	45,830,629	45,830,679	45,831,465	45,831,921	45,832,481	45,832,605	45,832,699	45,832,987	45,832,995	45,833,627	45,834,106	45,834,268	45,834,751	45,835,202	45,835,484	45,835,896	45,836,372	45,837,061	45,838,564	45,839,119	45,840,325	45,841,072	45,841,103	45,841,141	45,841,286	45,841,388	45,841,407	45,841,468	45,841,583	45,841,640	45,841,685	45,841,826	45,841,912	45,841,950	45,842,035	45,842,119	45,842,280	45,842,395	45,842,595	45,842,711	45,842,788	45,842,811	45,842,901	45,842,939	45,843,019	45,843,143	45,843,503	45,843,524	45,843,776	45,843,965	45,844,017	45,844,091	45,844,368	45,844,389	45,844,549	45,844,637	45,845,059	45,845,261	45,845,263	45,845,919	45,845,921	45,845,965	45,846,036	45,846,057	45,846,323	45,846,327	45,846,328	45,846,397	45,846,639	45,847,110	45,847,653	45,847,659	45,847,842	45,847,891	45,847,994	45,848,029	45,848,045	45,848,061	45,848,064	45,848,082	45,848,100	45,848,146	45,848,159	45,848,160	45,848,167	45,848,183	45,849,107	45,849,516	45,850,346	45,850,568	45,850,637	45,850,653	45,851,388	45,851,501	45,851,510	45,851,517	45,851,519	45,851,771	45,851,799	45,851,921	45,852,306	45,852,515	45,852,624	45,852,680	45,852,696	45,852,838	45,853,081	45,853,082	45,854,140	45,854,660	45,854,703	45,854,858	45,855,400	45,855,473	45,855,506	45,856,234	45,856,597	45,856,620	45,856,622	45,856,704	45,856,773	45,857,558	45,857,671	45,857,919	45,858,286	45,858,510	45,858,616	45,858,632	45,858,696	45,858,860	45,859,886	45,859,961	45,860,377	45,860,402	45,860,680	45,860,725	45,860,741	45,861,489	45,862,008	45,862,073	45,862,118	45,862,188	45,862,211	45,862,340	45,862,803	45,862,920	45,863,142	45,863,312	45,863,547	45,863,723	45,863,801	45,864,199	45,864,465	45,864,468	45,864,470	45,864,907	45,865,707	45,865,849	45,866,068	45,866,092	45,866,300	45,868,146	45,868,530	45,868,767	45,869,201	45,869,280	45,869,295	45,869,341	45,869,537	45,869,559	45,870,665	45,870,871	45,872,873	45,873,059	45,873,635	45,873,709	45,873,736	45,873,863	45,874,151	45,874,836	45,874,957	45,875,888	45,876,358	45,876,578	45,876,583	45,876,584	45,876,657	45,876,659	45,876,671	45,876,751	45,877,037	45,877,079	45,877,231	45,877,430	45,877,486	45,877,505	45,877,586	45,877,595	45,877,730	45,877,780	45,877,951	45,878,017	45,878,099	45,878,345	45,878,356	45,878,388	45,878,389	45,878,392	45,878,435	45,878,503	45,878,591	45,878,661	45,878,675	45,878,917	45,879,117	45,879,187	45,879,272	45,879,314	45,879,536	45,879,874	45,879,973	45,880,004	45,880,006	45,880,020	45,880,046	45,880,052	45,880,067	45,880,071	45,880,091	45,880,097	45,880,103	45,880,121	45,880,139	45,880,151	45,880,154	45,880,423	45,880,562	45,880,688	45,880,691	45,880,779	45,880,819	45,880,870	45,880,976	45,880,991	45,881,011	45,881,063	45,881,300	45,881,354	45,881,357	45,881,385	45,881,432	45,881,454	45,881,528	45,881,621	45,881,709	45,881,898	45,882,209	45,882,244	45,883,214	45,883,467	45,883,597	45,884,148	45,884,255	45,884,261	45,884,271	45,884,388	45,884,399	45,884,400	45,884,407	45,884,410	45,884,422	45,884,704	45,884,820	45,885,108	45,885,385	45,885,877	45,886,026	45,886,050	45,886,116	45,886,117	45,886,225	45,886,308	45,886,571	45,886,605	45,886,627	45,886,656	45,886,807	45,886,822	45,886,835	45,886,843	45,886,958	45,887,023	45,887,381	45,887,462	45,887,515	45,887,516	45,887,610	45,887,618	45,887,741	45,887,790	45,887,812	45,887,860	45,887,978	45,888,320	45,888,355	45,888,452	45,888,480	45,888,588	45,888,590	45,888,610	45,888,698	45,888,724	45,888,772	45,888,957	45,889,121	45,889,210	45,889,215	45,889,256	45,889,609	45,889,663	45,889,747	45,889,887	45,890,440	45,890,505	45,891,047	45,891,086	45,891,435	45,891,655	45,891,659	45,891,719	45,891,781	45,891,830	45,891,915	45,892,031	45,892,361	45,892,363	45,892,949	45,892,982	45,892,984	45,893,125	45,893,219	45,893,465	45,893,472	45,894,522	45,895,117	45,896,190	45,896,871	45,897,030	45,897,204	45,897,606	45,897,944	45,898,061	45,898,122	45,898,320	45,898,405	45,898,440	45,898,442	45,898,483	45,898,542	45,898,577	45,898,597	45,899,194	45,899,200	45,899,329	45,899,544	45,899,582	45,899,658	45,900,150	45,901,368	45,901,942	45,902,929	45,902,937	45,902,978	45,904,144	45,904,162	45,905,273	45,905,294	45,905,784	45,906,252	45,907,662	45,907,792	45,908,238	45,909,003	45,909,892	45,910,057	45,910,185	45,910,374	45,912,130	45,914,424	45,914,926	45,915,379	45,915,986	45,916,053	45,916,339	45,917,019	45,917,404	45,917,482	45,918,091	45,918,251	45,919,338	45,919,507	45,920,283	45,921,481	45,921,486	45,921,536	45,921,543	45,922,257	45,922,627	45,923,976	45,924,013	45,924,124	45,925,525	45,925,765	45,925,799	45,925,819	45,925,828	45,925,895	45,925,925	45,926,060
T	A	7	C	A	T/-	2/-	-	T	A/11	-	A	T	2	A	G	C	C	3	T	A	-	A	T	-	C	A	12	2	G	2	T	C	G	A	G	A	G	C	G	-	G	C	A	G	A	A	G	G	-	C	A	T	11/9	T	T	3	T	2	A	T	G	G	G	G	-	A	C	C	C	T	A	G	6	T	C	C	C	C	T	C	T	A	C	G	T	C	T	T	G	T	A	G	T	A	T	-	5	C	C	G	C	-	3	T	C	C	-	A	T	T	-	2	T	A	T	A	T	C	T	-	3	T	-	25	A	-	-	-	T	T/9	11	7	C	A	G	A	A	A	2	-	A	-	2	C	C	A	A	-	C	A	3	T	T	-	G	T	G	C	T	C	T	C	C	A	G	G	T	A	G	A	A	G	T	C	T	G	G	A	2	A	C	2	-	G	A	G	C	T	A	G	G	G	A	G	G	T	G	A	G	C	C	A	A	C	A	-	C	A	2	T	A	C	3	T	T	C	T	G	5	T	T	G	G	T	2	2	3	T	A	C	T	11	G	T	G	T	C/3	T/4	3/TA	A	C	G	2	T	T	A	G	T	A	T	T	-	A	A	G	C	G	G	G	T	A	T	C	G	T	C	T	C	G	25	-	A	-	A	-	C	C	T	2	A	C	G	4	-	G	-	A	-	A	G	A	A	C	C	2	C	G	G	G	G	A	C	G	2	G	C	C	C	T	T	A	T	A	A	T	T	-	-	-	T	G	2	A	T	-	3	G	C	C	2	G	A	13/15	G	12	4	12	41	17	-	A	A	G	C	G	A	A	G	T/--	2	A	6	-	G	-	A	T	A	T	T	G	T	7	T	G	C	A	G	A	C	G	C	T	C	T	G	T	3	-	A	G	2	A	A	A	-	2	C	G	T	A	C	C	A	C	27	T	A	C	A	T	T	G	C/2	A	2	G	A	2	26	G	G	C	C	T	C	C	C	T	A	C	T	T	C	C	A	T	G	A	G	C	G	T	4	T	T	A	-	-	-	A	T	T	G	G	A	A	C	A	G	C	A	16	C	C	G	C	A	C	G	C	T	A	T	G	T	C	8/-	6/-	3/GA	G	-	T	G	3	-	2	T	T	G	G	T	A	-	G	A	-	T	A	T	-	A	G	C	C	G	T	-	T	-	T	-	19	-	C	7	G	T	C	-	-	5	T	G	C	A	G	C	-	C	T	G	4	A	-	A	C	A	4	T	3/7	G	-	-	-	-	A	G	C	A	-	-	3	G	-	10	T	A	T