Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 62,154 (bp)   Positions: 293
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.039
.019
.0
.0
.063
.224
.015
--
--
.037
.031
.27
.011
--
.031
--
--
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.003
.151
.159
.015
.996
.019
.004
.01
--
.274
.184
.003
.005
.116
.003
.001
.0
.0
.022
.001
.001
.047
.058
.001
.001
.218
.003
.187
.039
.032
.006
.36
.152
.01
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.11
.496
.34
.0
.043
.002
.001
.017
.033
.004
.11
.177
.003
.029
.001
--
.111
.069
.003
.027
.004
.39
.005
.005
.006
.0
.016
.001
.077
.057
.028
.002
.067
.0
.273
.014
.016
.439
.803
.588
.016
.019
.029
.012
.196
.001
.02
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
.111
.002
.0
.0
.015
.009
.009
.001
.001
.007
.009
.001
.0
.295
.059
.021
.387
.256
.125
.003
.111
.239
.009
.002
.001
.009
.005
.009
.001
.001
.154
.144
--
.003
.126
.027
.001
.001
.002
.043
.008
.008
.007
.027
.113
.989
.058
.123
.114
.0
.004
.045
.491
.561
.033
.031
.0
.006
.013
.071
.598
--
--
--
--
--
--
.02
.113
.042
.03
.0
.547
.003
.006
.016
.002
.003
.007
.074
.186
.03
.017
.019
.002
.002
.032
.043
.054
.062
.053
.262
.088
.0
.001
.736
.998
.027
.033
.033
.001
.33
.0
.053
.081
.006
.002
.029
.204
.003
.0
.012
.026
.002
--
--
--
--
--
--
--
.01
.005
.002
.091
.0
.085
.002
.357
.0
.674
.0
.002
.365
.002
.002
.0
.323
.93
.015
.017
.102
.02
.004
.315
.161
.004
.073
.071
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
LOC102555697
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
17
T
C
C
A
A
3
C
C
T
A
A
A
T
C
C
C
C
G
C
T
T
C
T
T
C
T
T
C
5
T
C
T
4
T
T
G
T
G
G
G
C
G
3
A
A
T
A
A
G
T
T
A
C
A
G
T
T
G
A
C
C
A
C
C
C
T
C
C
G
4
G
A
C
T
T
T
T
T
T
T
T
T
C
T
T
T
A
G
5
G
G
11
G
C
T
A
2
G
G
C
10
A
C
T
A
G
G
C
G
T
T
A
G
G
T
C
C
A
T
T
T
T
T
C
T
2
C
T
T
G
A
A
G
9
C
C
T
C
A
2
C
A
C
T
C
A
A
A
T
C
C
C
T
G
A
C
T
G
G
A
C
A
C
A
G
A
A
A
C
A
A
C
G
A
G
A
C
G
3
C
A
A
8
A
A
C
G
C
G
C
G
C
C
G
G
2
T
T
C
T
G
T
G
C
C
C
G
A
C
C
C
T
G
A
A
C
T
G
T
T
T
T
A
G
T
18
T
T
C
T
G
G
T
C
T
T
C
T
G
T
G
12
10
G
T
A
C
A
T
C
C
T
T
C
G
G
C
G
G
T
G
T
C
A
A
A
T
G
C
4
T
T
A
T
A
T
C
G
C
C
G
A
T
G
C
C
C
C
G
T
C
A
  197,887,754
  197,887,911
  197,888,033
  197,888,073
  197,888,129
  197,888,571
  197,888,613
  197,888,850
  197,888,852
  197,888,962
  197,888,977
  197,889,258
  197,889,692
  197,890,130
  197,890,170
  197,891,044
  197,891,209
  197,891,908
  197,892,679
  197,893,829
  197,893,836
  197,893,845
  197,893,849
  197,893,860
  197,893,862
  197,893,866
  197,893,918
  197,893,922
  197,893,925
  197,893,926
  197,893,940
  197,893,948
  197,893,951
  197,893,964
  197,893,967
  197,893,991
  197,893,992
  197,894,289
  197,894,679
  197,894,702
  197,895,449
  197,895,451
  197,896,902
  197,897,064
  197,897,277
  197,897,814
  197,897,851
  197,898,020
  197,898,087
  197,898,262
  197,898,578
  197,898,584
  197,898,647
  197,898,698
  197,898,804
  197,898,812
  197,898,813
  197,898,890
  197,899,597
  197,899,969
  197,900,710
  197,900,960
  197,901,237
  197,901,240
  197,901,429
  197,901,532
  197,901,606
  197,901,694
  197,902,060
  197,902,566
  197,902,708
  197,903,553
  197,903,661
  197,903,790
  197,904,190
  197,904,193
  197,904,197
  197,904,200
  197,904,201
  197,904,205
  197,904,209
  197,904,213
  197,904,217
  197,904,232
  197,904,248
  197,904,251
  197,904,253
  197,904,507
  197,904,832
  197,905,046
  197,905,050
  197,905,111
  197,905,188
  197,905,280
  197,905,418
  197,905,729
  197,906,185
  197,906,706
  197,906,749
  197,906,755
  197,906,790
  197,907,130
  197,907,185
  197,907,726
  197,907,806
  197,907,908
  197,909,059
  197,909,093
  197,909,130
  197,909,750
  197,910,100
  197,910,218
  197,910,256
  197,910,417
  197,910,654
  197,911,270
  197,911,334
  197,911,339
  197,911,379
  197,911,564
  197,911,620
  197,911,870
  197,912,180
  197,912,266
  197,912,410
  197,912,459
  197,912,609
  197,912,625
  197,912,712
  197,912,753
  197,913,179
  197,913,443
  197,913,911
  197,914,034
  197,914,073
  197,914,152
  197,914,239
  197,914,793
  197,914,993
  197,915,022
  197,915,026
  197,915,038
  197,915,043
  197,915,078
  197,915,311
  197,915,909
  197,916,132
  197,916,133
  197,916,222
  197,916,662
  197,916,666
  197,916,670
  197,916,674
  197,918,220
  197,918,288
  197,918,383
  197,918,464
  197,918,587
  197,918,758
  197,918,847
  197,918,898
  197,918,925
  197,918,961
  197,919,179
  197,919,227
  197,919,243
  197,919,378
  197,919,562
  197,919,616
  197,919,629
  197,919,640
  197,919,970
  197,920,028
  197,920,030
  197,920,188
  197,920,192
  197,920,252
  197,920,261
  197,920,464
  197,920,743
  197,920,812
  197,920,813
  197,920,933
  197,921,109
  197,921,125
  197,921,133
  197,921,134
  197,921,257
  197,921,268
  197,921,859
  197,922,003
  197,922,127
  197,922,732
  197,922,837
  197,922,916
  197,923,082
  197,923,468
  197,924,142
  197,924,227
  197,924,250
  197,924,979
  197,925,136
  197,925,210
  197,925,423
  197,925,461
  197,925,596
  197,925,603
  197,925,659
  197,925,667
  197,925,682
  197,925,686
  197,925,700
  197,925,800
  197,925,909
  197,925,913
  197,926,100
  197,926,252
  197,926,290
  197,926,407
  197,926,950
  197,927,242
  197,927,246
  197,927,250
  197,927,513
  197,927,599
  197,927,662
  197,927,857
  197,927,932
  197,927,938
  197,927,945
  197,927,958
  197,927,961
  197,927,965
  197,927,971
  197,927,980
  197,928,079
  197,928,182
  197,928,306
  197,928,764
  197,928,906
  197,929,013
  197,931,391
  197,932,194
  197,932,196
  197,933,198
  197,933,612
  197,933,884
  197,934,202
  197,934,239
  197,934,325
  197,934,329
  197,934,498
  197,934,558
  197,934,659
  197,934,665
  197,934,672
  197,934,697
  197,934,707
  197,934,837
  197,934,874
  197,934,885
  197,934,897
  197,934,920
  197,934,987
  197,935,003
  197,935,241
  197,935,306
  197,935,960
  197,936,733
  197,937,410
  197,938,004
  197,938,863
  197,938,878
  197,941,012
  197,941,959
  197,942,827
  197,944,453
  197,944,643
  197,944,806
  197,944,813
  197,944,873
  197,945,085
  197,945,146
  197,945,750
  197,945,795
  197,948,539
  197,948,760
  197,948,827
  197,949,151
  197,949,260
  197,949,477
  197,949,516
  197,949,817
-
C
T
T
G
G
-
T
T
C
3
-
G
C
A
C/T
G
T
A
C/2
T/C
T/-
C/-
T/C
T/C
C/T
T/-
T/-
C/-
5/-
T/C
C/-
T/2
-
5
C
A
G
A
C
C
G
A
-
G
G
C
G
G
T
C
C
G
T
C
A
C
C
A
9
T
G
C
A
G
G
C
A
4
A
-
A
T
A
T/C
A
A
T/C
A
A
A
A
A
T
T/C
C
A
G
A
-
-/GT
A
-
A
T
5
C
-
C
G/C
3
-
G
T
C
G
G/-
A
-
T
C
2
G
A
A
C
A
A
2
C
C
C
C
C
T
-
-
T
C
C
A
C
G
A
-
C/T
C/T
C
C/4
A/2
2/-
C/-
A/4
C/T
G
T
C
C
-
T/C
C/T
C/T
C/T
C
A
G
T
-
A
T
G
-
G
T
G
A
C/3
T
G
G
G
C
-
-
G
C
3
A
2
-
A
G
G
-
A/T
A/T
C/T
A
T
A
T
-
T
T
T
T
-
C
G
T
G
A
C
A
A
C/-
C/G
G/2
C
G
G
C/T
C
A
G
G
C/T
G
-
C
T/A
T/A
T/A
T
A
G
18/-
T/C
T/C
A
A
T
T
C
T
A
C
T
C
A
C
T
12/-
10/-
A
2
G
G
3
TG/4
G
T
C
C
-
A
3
T
T
A
C
G/T
T/C
C/A
C
G
G
G
C
T
-
C
G
G
G
G
C
5
-
T
T
A
3
G
A
A
T
T
19
-
16
T
G