Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 77,278 (bp)   Positions: 306
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
--
--
--
.017
.003
.0
.707
.023
.005
.001
.01
.008
.034
.098
.015
.055
.004
.003
--
--
--
--
.124
.049
.033
.006
.218
--
.028
.0
.018
.005
.005
.001
.036
.0
.004
.003
.001
.917
.241
.352
.188
.024
.005
.045
.003
.086
.058
.021
.038
.003
.008
.006
1.0
.003
.001
.078
--
.015
.149
.02
.121
.003
.998
.043
.172
--
--
.044
.07
.04
.033
.054
.04
.203
.064
.082
.136
.134
.349
--
.008
.544
.455
.657
.655
.59
.054
.065
.003
.041
.35
.003
.058
--
.01
.051
.04
.0
.0
.09
.033
.018
.02
.18
.017
.062
.047
.039
.012
.08
.002
.004
.035
.034
.002
.058
.042
.022
.012
.006
.042
.003
.51
.013
.0
.097
.413
.121
.001
.001
.001
.001
.001
--
--
--
--
--
.169
.026
.055
.116
.0
.021
.004
.214
.014
.016
.009
.002
.003
.999
.968
.621
.001
.003
.022
.016
.077
.028
.063
.048
.166
.008
.161
.009
.002
.082
.199
.002
.002
.003
.03
.013
.091
.061
.003
.006
.103
.99
.101
.275
.0
.0
.001
.002
.004
.001
.0
.101
.043
.036
.004
.612
.031
--
--
--
--
.034
.579
.133
.127
.012
.008
.011
.036
.044
.009
.032
.005
.192
.004
.013
.06
.01
.0
.023
.878
.001
.038
.021
.019
--
--
.002
.169
.055
.0
.001
.01
.0
.001
.0
.004
.001
.005
.0
.233
.001
.019
.015
.005
.001
.005
.0
.066
.002
.0
.215
.888
.27
.004
.605
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.005
.012
.001
.001
.021
.025
.001
.0
.998
.031
.049
.766
.807
.89
.027
.014
.493
--
--
.001
.002
.013
.002
.014
.0
--
.001
.024
.002
.007
.006
.001
.001
.142
.045
.011
.009
.012
.02
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
LOC102547989
C
G
A
C
T
T
A
T
A
T
G
A
T
G
G
T
T
A
T
A
C
T
T
G
C
A
T
G
A
G
C
T
A
A
T
C
A
T
A
A
A
C
A
G
C
C
A
C
G
A
C
C
T
10
8
A
A
G
A
T
C
C
A
C
T
4
C
A
C
A
A
T
G
C
A
C
C
A
A
A
T
A
C
T
A
5
T
T
T
G
A
T
C
T
C
T
38
A
A
G
T
G
C
A
C
A
A
C
C
G
A
A
C
G
T
3
G
G
G
T
T
A
A
T
G
T
C
G
A
C
G
T
T
C
7
T
T
A
C
T
T
T
A
A
A
T
A
C
T
A
G
A
T
C
A
A
103
T
T
T
T
C
C
T
A
C
T
2
C
C
A
A
A
A
T
C
G
A
C
G
15
81
C
C
T
G
A
G
A
G
A
G
G
G
A
T
T
A
A
T
T
T
G
A
T
T
A
A
C
G
G
A
A
T
C
T
C
C
A
G
A
G
T
C
T
G
T
C
T
T
C
C
C
T
A
G
T
C
G
A
A
C
G
T
A
A
T
C
G
C
C
C
T
A
T
A
A
4
6
T
C
C
C
C
T
A
T
C
T
A
4
T
2
G
A
G
T
2
T
C
T
G
A
C
C
A
2
C
G
G
G
C
T
16
T
C
2
T
T
C
G
A
G
T
A
C
  37,626,257
  37,626,273
  37,626,287
  37,626,296
  37,626,892
  37,626,923
  37,628,398
  37,628,822
  37,628,907
  37,628,955
  37,630,046
  37,630,509
  37,630,518
  37,631,087
  37,631,110
  37,631,725
  37,632,037
  37,632,087
  37,632,095
  37,632,787
  37,632,914
  37,633,462
  37,633,579
  37,633,738
  37,633,928
  37,635,193
  37,635,409
  37,635,574
  37,636,945
  37,642,587
  37,642,616
  37,642,755
  37,642,758
  37,643,457
  37,643,578
  37,643,614
  37,643,777
  37,643,944
  37,644,646
  37,644,824
  37,645,213
  37,645,347
  37,645,362
  37,645,965
  37,646,552
  37,646,700
  37,646,776
  37,646,808
  37,647,229
  37,647,357
  37,647,474
  37,648,286
  37,648,969
  37,650,054
  37,650,056
  37,650,393
  37,650,864
  37,651,000
  37,654,327
  37,654,377
  37,654,606
  37,655,212
  37,655,358
  37,655,415
  37,655,636
  37,657,647
  37,658,262
  37,658,888
  37,659,806
  37,659,967
  37,660,099
  37,660,145
  37,660,254
  37,660,474
  37,660,617
  37,660,878
  37,660,997
  37,661,008
  37,661,033
  37,661,041
  37,661,184
  37,661,453
  37,661,555
  37,661,748
  37,661,826
  37,661,831
  37,661,887
  37,661,897
  37,661,922
  37,662,085
  37,662,266
  37,662,344
  37,662,506
  37,662,585
  37,662,698
  37,662,909
  37,663,000
  37,663,079
  37,663,122
  37,663,162
  37,663,246
  37,663,269
  37,664,074
  37,664,246
  37,664,348
  37,664,349
  37,664,385
  37,664,514
  37,664,547
  37,664,553
  37,664,733
  37,664,755
  37,664,832
  37,664,907
  37,664,946
  37,665,211
  37,665,444
  37,665,507
  37,665,637
  37,665,763
  37,665,956
  37,665,974
  37,666,219
  37,666,290
  37,666,293
  37,666,361
  37,666,501
  37,666,638
  37,666,830
  37,667,439
  37,667,562
  37,667,602
  37,667,860
  37,667,904
  37,667,906
  37,668,117
  37,668,508
  37,668,544
  37,668,556
  37,668,566
  37,668,701
  37,668,836
  37,669,071
  37,669,324
  37,669,487
  37,669,629
  37,669,666
  37,669,911
  37,670,006
  37,670,277
  37,670,281
  37,670,322
  37,670,428
  37,670,447
  37,670,632
  37,670,756
  37,671,035
  37,671,253
  37,671,284
  37,672,018
  37,672,204
  37,672,342
  37,672,715
  37,672,789
  37,672,805
  37,672,859
  37,673,049
  37,673,175
  37,673,228
  37,673,243
  37,673,293
  37,673,414
  37,673,508
  37,673,517
  37,673,611
  37,673,681
  37,673,690
  37,673,769
  37,673,971
  37,680,184
  37,680,389
  37,680,407
  37,680,625
  37,680,634
  37,680,759
  37,680,881
  37,680,893
  37,680,927
  37,681,023
  37,681,062
  37,681,093
  37,681,105
  37,681,304
  37,681,367
  37,681,596
  37,681,647
  37,681,703
  37,681,747
  37,681,828
  37,681,867
  37,682,024
  37,682,087
  37,682,355
  37,682,436
  37,683,106
  37,683,239
  37,683,684
  37,683,709
  37,683,776
  37,683,909
  37,683,912
  37,683,934
  37,683,936
  37,684,000
  37,684,037
  37,684,070
  37,684,119
  37,684,233
  37,684,541
  37,684,624
  37,684,825
  37,684,911
  37,685,104
  37,685,178
  37,685,185
  37,685,186
  37,685,193
  37,685,227
  37,685,300
  37,685,455
  37,686,086
  37,686,157
  37,686,216
  37,686,248
  37,686,358
  37,686,359
  37,686,452
  37,686,478
  37,686,480
  37,686,610
  37,686,642
  37,686,881
  37,686,903
  37,687,005
  37,687,017
  37,687,037
  37,687,063
  37,687,092
  37,687,202
  37,687,282
  37,687,349
  37,687,788
  37,687,908
  37,687,998
  37,688,051
  37,688,128
  37,688,635
  37,688,744
  37,689,280
  37,689,334
  37,689,452
  37,689,730
  37,690,016
  37,690,119
  37,690,499
  37,690,930
  37,691,060
  37,691,664
  37,691,920
  37,692,294
  37,692,635
  37,692,674
  37,692,685
  37,692,789
  37,693,036
  37,694,041
  37,694,242
  37,694,384
  37,694,605
  37,694,607
  37,695,039
  37,695,117
  37,695,179
  37,695,575
  37,697,131
  37,697,206
  37,697,731
  37,697,737
  37,698,619
  37,698,974
  37,699,026
  37,699,091
  37,699,624
  37,699,838
  37,700,002
  37,700,480
  37,701,162
  37,701,351
  37,701,363
  37,702,181
  37,702,455
  37,702,538
  37,702,593
  37,702,619
  37,703,109
  37,703,233
T
A
G
A
C
C
G
3
-
C
T
T
C
C
C
2
C
G
A
G
T
A
G
A
C/3
G
G
A
2
A
T
G
G
C
A
G
G
C
G
2
G
T
G
A
A
T
T
G
A
T
T
5/7
C
10/-
8/-
2
C
A
G
4
G
3
T
G
G
-
A
C
A
6
G
C
A
T
G
T
3
T
T
T
A
G
T
C
G
-
-
G
-
T
G
C
A
C
T
C
-
G
T
A
G
T
G
G
T
G
G
A
T
C
G
T
T
C
A
-
T
A
A
A
-
G
C
G
C
-
T
A
C
A
C
C
C
A
-
C
A
C
A
A
G
G
G
2
C
C
-
T
C
T
A
G
A
G
G
G
-
C
C
C
C
T
A
C
T
T
C
-
A
T
T
G
G
T
G
T
T
G
3
A
-
-
T
T
2
A
G
-
G
A
G
A
C
A
G
C
G
T
G
A
G
C
T
G
G
A
T
G
T
A
T
T
3
G
G
C
A
T
G
C
3
A
C
G
-
C
C
T
C
G
T
G
T
-
C
T
C
T
C
G
G
G
A
C
G
C
C
T
A
T
T
T
C
G
2
C
G
-
-
C
5
T
T
T
C
2
C
T
A
G
-
C
-
A
G
A
13
-
T/2
C/4
2
2
-
T
G
G
-
T
A
A
2
T
C
-
C
A
2/-
9
19
T
A
G
A
C
C
-