Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 71,691 (bp)   Positions: 362
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.102
.023
.01
.0
.13
.013
.028
.003
--
--
--
--
--
.032
.001
.418
.184
.005
.001
.046
.0
.001
.383
.002
.003
.002
.085
.001
.002
.002
.11
.999
.294
.001
.096
.002
.002
.0
.002
.002
.001
.017
.43
.061
--
--
--
--
--
--
.036
--
--
--
--
.01
.022
.104
.003
.045
.018
.0
.077
.007
.0
.054
.005
.003
.507
.373
.644
.789
.004
.025
.026
.024
.0
.002
.003
.015
.268
--
--
--
.833
.074
.002
.014
.198
--
--
--
--
.003
.0
.01
--
--
--
.001
.0
.001
.0
.0
.006
.0
.009
.0
.003
.071
.0
.004
.002
.001
.235
.0
.0
.042
.001
.0
.009
.0
.016
--
.04
.046
--
--
--
--
--
.016
.345
.041
.007
.003
.013
.222
.062
.039
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.112
--
--
.004
.003
.001
.003
.088
--
--
--
--
--
--
--
.007
.001
.001
.026
.003
.0
.0
.007
.0
.002
.004
.002
.733
.068
.971
.997
.045
.003
.004
.006
.02
--
.204
.008
.486
.005
--
--
--
--
--
.003
.008
.01
.02
.001
.007
.005
.043
.012
.013
.0
.009
.0
.0
--
.0
.862
.114
.065
.004
.004
--
--
--
--
.004
.001
.036
.017
.087
.05
.081
.014
.243
.212
.055
--
--
--
.005
.009
.007
.08
.196
.164
.025
.065
.142
.006
.046
.008
.093
.0
.0
.001
.003
.02
.003
.273
.004
.004
.134
.174
.06
.017
.012
.189
.013
.017
.003
.428
.004
.027
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.019
.0
.004
.0
.017
.001
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
C
C
A
T
G
T
A
C
A
C
3
T
T
G
C
A
C
A
C
C
G
T
C
A
T
T
T
A
2
T
T
3
2
C
A
A
G
G
A
T
T
T
C
T
G
G
8
A
A
G
T
C
C
C
G
G
A
T
T
G
T
T
G
T
G
A
T
G
A
T
C
T
C
G
T
G
14
T
T
T
C
A
A
T
G
G
A
A
G
G
A
4
2
2
4
G
A
A
A
4
C
4
A
G
A
C
C
C
C
T
G
G
C
G
G
T
G
G
T
G
A
G
A
C
G
C
A
G
C
G
A
C
G
T
T
C
T
T
T
G
A
A
A
A
T
A
T
G
C
A
G
C
T
9
T
T
T
G
G
A
T
T
T
A
T
G
A
A
A
C
A
A
G
8
C
G
G
A
G
G
C
A
C
T
A
T
G
C
2
A
C
T
G
T
A
A
C
G
A
A
T
G
T
T
C
A
G
A
C
C
A
C
T
G
C
A
A
A
G
A
T
G
T
C
T
G
C
T
C
C
A
A
4
A
G
A
A
G
G
G
G
G
G
C
G
4
G
T
C
T
G
C
A
A
T
T
G
C
T
G
T
C
C
C
T
12
3
G
T
G
C
A
T
G
T
A
T
G
G
A
C
G
C
G
G
G
G
G
G
G
C
C
T
G
G
C
A
T
T
G
C
G
A
G
T
G
2
T
C
T
T
C
A
T
A
G
C
A
G
T
C
G
T
A
T
A
C
C
C
T
A
A
T
A
C
C
G
A
T
A
T
T
A
A
T
A
G
C
G
C
A
A
G
T
G
T
G
C
C
C
T
  24,375,651
  24,376,607
  24,377,526
  24,377,558
  24,382,262
  24,382,323
  24,382,440
  24,382,452
  24,382,520
  24,382,557
  24,382,603
  24,382,886
  24,382,888
  24,384,401
  24,384,463
  24,384,506
  24,385,408
  24,385,416
  24,385,622
  24,385,983
  24,386,703
  24,387,281
  24,387,316
  24,387,918
  24,388,216
  24,388,695
  24,388,930
  24,389,736
  24,390,198
  24,390,246
  24,390,247
  24,390,291
  24,390,309
  24,390,395
  24,390,692
  24,390,704
  24,390,895
  24,390,897
  24,390,905
  24,391,151
  24,391,155
  24,391,225
  24,391,745
  24,391,844
  24,391,947
  24,392,788
  24,392,887
  24,393,017
  24,393,207
  24,393,385
  24,393,527
  24,393,799
  24,394,022
  24,394,026
  24,394,070
  24,394,129
  24,394,316
  24,394,323
  24,394,487
  24,394,755
  24,394,766
  24,394,858
  24,395,603
  24,395,700
  24,396,223
  24,396,387
  24,396,403
  24,396,416
  24,396,869
  24,397,063
  24,397,082
  24,397,250
  24,397,430
  24,397,973
  24,398,040
  24,398,112
  24,398,258
  24,398,555
  24,398,926
  24,399,867
  24,399,943
  24,400,011
  24,401,205
  24,401,233
  24,401,252
  24,404,921
  24,405,093
  24,405,203
  24,405,240
  24,405,265
  24,405,367
  24,405,369
  24,405,386
  24,405,388
  24,405,442
  24,405,444
  24,405,541
  24,405,563
  24,405,569
  24,405,575
  24,405,742
  24,405,747
  24,405,770
  24,405,773
  24,406,053
  24,406,061
  24,406,113
  24,406,172
  24,406,179
  24,406,184
  24,406,336
  24,406,503
  24,407,079
  24,407,167
  24,407,199
  24,407,281
  24,407,413
  24,407,415
  24,407,438
  24,407,484
  24,407,521
  24,407,637
  24,407,780
  24,407,790
  24,408,086
  24,408,105
  24,408,181
  24,408,524
  24,408,675
  24,408,682
  24,408,717
  24,408,721
  24,408,925
  24,409,438
  24,409,470
  24,409,716
  24,409,793
  24,409,824
  24,409,834
  24,409,900
  24,409,916
  24,410,103
  24,410,343
  24,410,369
  24,410,453
  24,410,510
  24,410,679
  24,410,681
  24,410,815
  24,414,726
  24,414,791
  24,414,873
  24,414,988
  24,416,129
  24,416,224
  24,416,342
  24,416,670
  24,416,729
  24,416,845
  24,417,132
  24,417,196
  24,417,621
  24,417,661
  24,417,756
  24,417,844
  24,417,905
  24,417,931
  24,417,971
  24,418,421
  24,418,944
  24,419,065
  24,419,169
  24,419,414
  24,420,158
  24,420,162
  24,420,577
  24,420,908
  24,421,219
  24,421,323
  24,421,329
  24,421,391
  24,421,405
  24,421,507
  24,421,518
  24,421,573
  24,421,605
  24,421,631
  24,421,664
  24,421,747
  24,421,891
  24,422,123
  24,422,573
  24,422,650
  24,422,676
  24,422,994
  24,423,203
  24,423,243
  24,423,442
  24,423,693
  24,423,797
  24,423,824
  24,424,274
  24,424,514
  24,425,078
  24,425,144
  24,425,329
  24,425,731
  24,426,228
  24,427,622
  24,427,741
  24,427,867
  24,428,487
  24,428,773
  24,431,382
  24,432,012
  24,432,228
  24,432,390
  24,432,720
  24,432,826
  24,432,850
  24,433,280
  24,433,445
  24,433,458
  24,433,468
  24,433,546
  24,433,721
  24,433,866
  24,434,085
  24,434,148
  24,434,186
  24,434,420
  24,435,012
  24,435,203
  24,435,206
  24,435,239
  24,435,255
  24,435,259
  24,435,329
  24,435,383
  24,435,408
  24,435,871
  24,435,892
  24,436,105
  24,436,114
  24,436,141
  24,436,320
  24,436,554
  24,436,563
  24,436,576
  24,436,661
  24,436,753
  24,436,844
  24,436,846
  24,436,888
  24,436,922
  24,436,949
  24,436,968
  24,437,126
  24,437,366
  24,437,367
  24,437,439
  24,437,451
  24,437,701
  24,438,023
  24,438,083
  24,438,282
  24,438,367
  24,438,370
  24,438,639
  24,438,760
  24,439,016
  24,439,048
  24,439,074
  24,439,128
  24,439,139
  24,439,352
  24,439,673
  24,439,695
  24,439,705
  24,439,848
  24,440,020
  24,440,072
  24,440,105
  24,440,119
  24,440,122
  24,440,131
  24,440,158
  24,440,298
  24,440,314
  24,440,424
  24,440,527
  24,440,811
  24,440,855
  24,440,922
  24,440,948
  24,441,155
  24,441,172
  24,441,226
  24,441,242
  24,441,272
  24,441,280
  24,441,294
  24,441,373
  24,441,395
  24,441,417
  24,441,438
  24,441,447
  24,441,471
  24,441,625
  24,441,628
  24,441,692
  24,441,693
  24,441,705
  24,441,718
  24,441,723
  24,441,754
  24,441,767
  24,441,770
  24,441,961
  24,442,080
  24,442,139
  24,442,140
  24,442,171
  24,442,244
  24,442,247
  24,442,283
  24,442,286
  24,442,287
  24,442,299
  24,442,335
  24,442,360
  24,442,376
  24,442,381
  24,442,394
  24,442,396
  24,442,490
  24,442,511
  24,442,573
  24,442,585
  24,442,635
  24,442,758
  24,442,930
  24,443,076
  24,443,099
  24,443,173
  24,443,183
  24,443,233
  24,443,268
  24,443,276
  24,443,455
  24,443,591
  24,443,876
  24,444,023
  24,444,039
  24,444,183
  24,444,201
  24,444,275
  24,444,504
  24,445,142
  24,445,744
  24,445,901
  24,446,539
C/2
T
A
G
A
A
C
C
G
C
T
3/-
15
2
T
T
2
2
G
A
3
A
C
A
G
C
-
C
T
2/-
T/-
-
-
-
T
G
G
C
C
G
G
C
C
G
G
C
A
-
G
G
6
A
C/T
C/T
T
A
A
T
C
C
A
C
G
2
G
A
C
-
A
T
C
T
C
T
A
C
A
-
C
C
-
T
T
2
C
A
A
G
C
A
A
C
-
-
-
-
G/A
A/C
A/C
A/C
4/-
3
-
3
C
T
T
T
T
T
C
2
A
T
T
A
C
A
C
A
T
2
A
G
T
A
G
T
G/C
C/T
A
A/G
A
A
A
C
-
G
G
G
A
G
G
C
T
3
A/-
T/-
T
G
G
A
C/A
C
-
C
C
A
T
C
G
-
A
A
2
G
C
G
C
7
T
C
G
-
-
T
2
C
T
T
2
G
T
T
C
G
C
C
2
-
C
A
-
T
C
G
G
2
A
G
G
C
T
C
C
A
G
C
G
A
2
G
A
C
2
T
G
G
G
A
G
C
-
G
C/A
G
A
A
C
A
T
G
A/G
-
A/G
A
A/G
G
-
G/A
T
A
A
A
G
A
-
A
C
A
A
A
A
G
-
C
C
T
2
2
2
C
T
T
T
G
12/-
-
A
A
A
T
24
C
A
2
G
C
A
C
-
A
A
T
T
T
-
C
T
A
A
T
2
C
G/2
3
T
G
A
G
A
G
-
C
A
C
T
-
C
T
C
G
A
G
G
G
C
A
T
A
A
A
A
G
G
A
T
T
T
C/2
C
C
G
C
G
T
T
A
G
C
G
G
C
G
G
G
G
A
T
A
-
T
G
A
-
A
3/TA
T
T
T
T
G