Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 230,713 (bp)   Positions: 557
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.131
.0
.022
.0
.003
.001
.015
.001
.053
.002
.001
.001
.008
.003
.0
.0
.0
.0
.865
.008
--
.001
.001
.828
.07
--
.082
.0
.013
.034
.009
.007
.024
.003
.377
--
--
.0
.011
.123
.04
.002
.327
.082
--
--
.037
.429
.34
.015
.051
.056
.102
.005
--
--
.002
.024
.097
.282
.011
--
--
--
--
--
.006
.0
.03
.001
.06
.0
.007
.102
.0
--
.001
.001
.005
.002
.0
.001
.998
.977
1.0
1.0
.013
.649
.021
.008
.019
.007
--
--
.016
.018
.004
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
.048
.4
.686
.029
.02
.274
.098
.002
.014
.153
.046
.057
.001
.013
.104
.103
.082
.003
.001
.0
.001
.002
.002
.016
.01
.004
.0
.039
1.0
.036
.002
.0
1.0
1.0
.995
.999
.757
1.0
.012
.006
.002
.03
.016
.007
.0
.06
.002
.001
.0
.651
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.708
.013
.016
.001
.011
.028
.924
.179
.008
.569
.734
.008
.0
.0
.0
.002
--
--
--
--
--
.055
.97
1.0
.02
.0
.0
.018
.005
.002
.062
.028
.031
.009
.001
.381
.001
.03
.068
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.134
.004
.106
.003
.19
.011
.0
.0
.008
.004
.025
.03
.002
.432
.002
.254
.06
--
--
--
--
--
--
.028
.025
.002
--
.009
.646
.0
.0
.009
.0
.985
.001
.001
.019
.065
.049
.046
.054
.006
.006
.084
.005
.002
.008
.008
--
.021
.001
.174
.001
.0
.006
.001
--
.008
.002
.003
.002
.003
.052
.004
.12
.004
.065
.006
.997
.999
.003
.021
.001
.0
.045
.001
.012
.014
.001
.0
.0
.729
.177
.001
.001
.011
.039
.265
.001
.782
.009
.014
.007
.0
.002
.088
.001
.056
.035
.002
.081
.022
--
.003
.008
--
.007
.062
.021
.0
.003
.005
.009
.242
.001
.001
.068
.01
.467
.084
.0
.015
.009
.001
.0
.001
.002
.0
.003
.002
.01
.0
.0
.0
.0
.001
.013
.099
.036
--
--
.0
--
.001
--
--
.004
.003
.033
.124
.002
.006
--
.179
--
--
--
.039
.994
.997
.991
.332
.992
.001
.112
.114
1.0
.003
.012
.0
.0
.006
.006
.0
.06
.0
.0
.002
.001
.0
.003
.115
.009
.0
.003
.129
.002
.011
.005
.005
.016
.004
.003
.004
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.222
.955
.001
.0
.003
.048
.002
.001
.0
.0
.001
.001
.011
.153
.033
.0
.0
.0
.008
.002
.001
.0
.0
.0
.002
.001
.001
.001
.084
.104
.0
.0
.009
.089
.093
.108
.019
.003
.008
--
--
.037
--
.017
.185
.256
.025
.063
.464
.334
.007
.013
.017
.02
.004
.017
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.229
.211
.043
--
.001
.0
.004
.128
.01
.998
.001
.004
.102
.001
.002
.002
.021
.993
.998
.173
1.0
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
G
A
C
T
A
A
G
C
G
T
5
T
C
T
2
T
2
C
T
2
T
10
C
T
T
12
8
59
A
C
G
G
G
8
4
T
2
T
G
T
G
T
18
T
C
2
C
G
T
C
2
A
G
2
A
C
G
T
T
2
T
C
C
T
T
T
C
C
A
G
C
T
A
5
T
A
G
T
T
C
A
T
A
T
A
T
C
C
C
C
C
T
G
2
A
A
C
T
C
G
A
C
A
G
12
G
T
G
T
T
T
G
G
G
C
C
A
G
T
2
A
A
G
A
G
A
A
G
A
C
T
T
2
8
4
2
A
A
T
T
2
A
A
A
C
T
A
T
G
T
T
G
T
T
8
T
G
C
T
A
T
C
C
A
G
A
C
T
2
C
G
A
T
A
A
G
C
12
T
T
G
C
A
C
2
T
T
12
10
G
2
T
T
A
7
A
C
2
C
C
T
G
A
T
A
G
A
A
G
T
A
A
G
A
A
G
G
A
A
G
A
T
T
3
2
A
A
G
T
C
T
G
T
T
T
A
C
C
G
A
2
A
A
T
T
T
G
T
T
C
C
6
G
T
G
T
C
T
T
C
G
C
C
2
G
T
A
G
T
A
2
2
T
A
G
G
G
C
C
G
T
T
T
A
G
A
A
G
G
C
T
T
G
C
T
C
A
G
A
G
T
T
T
G
C
G
G
C
A
26
A
A
C
C
T
T
G
A
C
2
C
C
T
T
T
G
A
4
A
A
G
T
G
C
C
G
C
C
T
A
C
C
G
A
C
G
C
G
G
T
C
A
G
12
T
A
T
T
G
G
12
T
T
G
G
G
T
C
T
T
A
C
T
T
A
C
C
C
G
5
T
4
C
3
C
A
C
T
T
C
4
5
T
A
C
A
12
G
A
C
C
11
C
C
T
G
G
6
4
2
A
11
G
T
C
G
G
6
3
G
3
4
A
C
C
10
T
G
G
T
G
T
A
A
A
G
G
2
A
T
A
A
A
G
T
C
C
4
10
6
6
G
G
G
A
24
G
T
G
T
T
G
T
G
T
A
C
C
C
C
G
G
T
G
A
T
G
2
G
G
G
T
A
T
T
A
C
2
T
G
T
C
C
T
G
T
A
C
T
T
A
T
G
T
G
G
G
A
G
6
G
T
G
C
A
C
C
C
G
T
G
C
G
T
C
T
T
C
G
C
T
G
T
A
T
T
C
T
C
C
T
G
G
G
A
G
4
G
A
C
T
G
T
G
C
  40,150,487
  40,150,713
  40,151,117
  40,151,214
  40,151,236
  40,151,354
  40,151,470
  40,151,932
  40,152,763
  40,152,792
  40,152,943
  40,153,104
  40,153,306
  40,153,329
  40,153,460
  40,153,800
  40,153,840
  40,153,844
  40,154,463
  40,155,040
  40,155,933
  40,156,284
  40,156,285
  40,157,723
  40,157,762
  40,157,794
  40,158,082
  40,158,887
  40,159,449
  40,159,890
  40,160,153
  40,161,493
  40,162,129
  40,163,048
  40,163,232
  40,163,814
  40,163,818
  40,165,272
  40,165,727
  40,165,772
  40,165,877
  40,166,298
  40,166,327
  40,166,692
  40,167,254
  40,169,962
  40,172,201
  40,173,906
  40,174,082
  40,174,419
  40,175,413
  40,175,605
  40,175,861
  40,177,800
  40,179,652
  40,179,657
  40,179,882
  40,181,950
  40,182,075
  40,183,082
  40,183,350
  40,185,400
  40,185,430
  40,185,469
  40,185,474
  40,185,911
  40,186,133
  40,186,168
  40,186,306
  40,186,348
  40,186,830
  40,186,998
  40,187,092
  40,187,436
  40,187,676
  40,187,722
  40,187,938
  40,188,310
  40,188,803
  40,189,282
  40,189,550
  40,189,568
  40,190,116
  40,190,219
  40,190,265
  40,190,941
  40,191,291
  40,191,824
  40,191,997
  40,192,013
  40,193,089
  40,193,571
  40,194,164
  40,194,383
  40,194,410
  40,194,783
  40,194,815
  40,195,164
  40,195,366
  40,195,544
  40,195,588
  40,195,752
  40,196,325
  40,196,347
  40,196,758
  40,196,840
  40,197,669
  40,197,680
  40,197,945
  40,197,954
  40,198,056
  40,198,072
  40,198,393
  40,198,747
  40,199,448
  40,199,490
  40,200,181
  40,200,667
  40,201,107
  40,201,129
  40,201,225
  40,201,256
  40,201,311
  40,201,619
  40,201,766
  40,201,990
  40,202,282
  40,202,699
  40,202,705
  40,202,754
  40,202,787
  40,202,878
  40,204,435
  40,205,770
  40,208,233
  40,209,274
  40,209,278
  40,209,310
  40,209,649
  40,210,561
  40,211,809
  40,212,583
  40,212,854
  40,212,895
  40,212,947
  40,213,039
  40,213,445
  40,213,592
  40,213,982
  40,214,657
  40,214,674
  40,214,797
  40,214,799
  40,214,810
  40,214,917
  40,214,921
  40,215,049
  40,215,175
  40,215,258
  40,216,956
  40,217,088
  40,217,320
  40,217,888
  40,217,915
  40,218,077
  40,218,947
  40,219,139
  40,219,175
  40,219,202
  40,219,877
  40,219,880
  40,219,900
  40,219,901
  40,220,078
  40,220,888
  40,221,583
  40,221,598
  40,221,603
  40,222,347
  40,222,397
  40,223,380
  40,223,534
  40,223,553
  40,223,983
  40,224,055
  40,225,483
  40,225,667
  40,226,138
  40,227,346
  40,227,970
  40,227,972
  40,228,588
  40,228,591
  40,228,950
  40,229,141
  40,229,447
  40,229,449
  40,230,058
  40,230,314
  40,230,449
  40,231,014
  40,231,380
  40,231,632
  40,232,164
  40,233,589
  40,234,471
  40,235,404
  40,235,898
  40,235,899
  40,235,940
  40,236,762
  40,236,777
  40,236,840
  40,237,291
  40,237,988
  40,238,141
  40,238,549
  40,238,568
  40,238,733
  40,239,254
  40,239,255
  40,240,461
  40,240,945
  40,241,052
  40,241,203
  40,241,256
  40,241,257
  40,241,407
  40,241,428
  40,241,780
  40,242,614
  40,243,097
  40,243,143
  40,243,183
  40,243,481
  40,243,486
  40,243,594
  40,243,704
  40,243,817
  40,243,972
  40,244,278
  40,244,767
  40,245,293
  40,245,681
  40,245,833
  40,245,873
  40,245,975
  40,245,976
  40,245,992
  40,246,036
  40,246,969
  40,247,009
  40,247,244
  40,247,292
  40,248,249
  40,248,273
  40,248,425
  40,249,490
  40,250,352
  40,251,109
  40,251,536
  40,252,551
  40,252,577
  40,252,725
  40,252,734
  40,252,993
  40,252,994
  40,253,102
  40,253,936
  40,254,399
  40,254,521
  40,255,382
  40,255,688
  40,255,692
  40,256,211
  40,256,530
  40,256,536
  40,256,601
  40,257,008
  40,257,778
  40,257,916
  40,258,116
  40,258,592
  40,259,073
  40,259,485
  40,259,512
  40,259,596
  40,259,939
  40,260,118
  40,260,382
  40,260,409
  40,260,477
  40,260,552
  40,260,570
  40,260,571
  40,262,897
  40,266,141
  40,266,219
  40,266,879
  40,266,979
  40,267,004
  40,267,271
  40,267,302
  40,267,559
  40,267,718
  40,267,797
  40,267,952
  40,268,201
  40,268,269
  40,268,394
  40,268,474
  40,268,587
  40,268,749
  40,269,175
  40,269,593
  40,269,606
  40,270,327
  40,271,039
  40,271,362
  40,272,795
  40,273,659
  40,273,831
  40,274,139
  40,274,823
  40,274,833
  40,274,978
  40,275,435
  40,275,747
  40,276,423
  40,276,514
  40,276,718
  40,277,293
  40,277,332
  40,278,544
  40,278,910
  40,278,911
  40,279,600
  40,279,634
  40,279,711
  40,280,458
  40,280,482
  40,280,747
  40,282,151
  40,282,644
  40,282,665
  40,283,241
  40,283,263
  40,283,270
  40,284,296
  40,284,372
  40,284,523
  40,285,139
  40,285,145
  40,285,681
  40,285,878
  40,286,087
  40,288,343
  40,288,980
  40,291,219
  40,293,710
  40,294,671
  40,294,715
  40,295,075
  40,295,179
  40,295,349
  40,295,407
  40,295,409
  40,295,473
  40,295,483
  40,296,778
  40,297,162
  40,298,475
  40,298,875
  40,299,473
  40,299,767
  40,299,871
  40,300,454
  40,300,455
  40,300,460
  40,300,461
  40,300,463
  40,300,466
  40,300,473
  40,300,477
  40,300,481
  40,300,511
  40,300,672
  40,302,253
  40,302,512
  40,302,593
  40,302,808
  40,302,962
  40,303,273
  40,303,770
  40,303,822
  40,303,854
  40,304,386
  40,308,650
  40,310,283
  40,312,514
  40,313,290
  40,314,023
  40,317,609
  40,317,872
  40,319,121
  40,320,336
  40,320,350
  40,321,340
  40,322,546
  40,323,497
  40,323,499
  40,323,515
  40,323,606
  40,324,750
  40,324,760
  40,324,874
  40,324,903
  40,327,003
  40,335,135
  40,337,424
  40,337,427
  40,337,900
  40,339,060
  40,343,223
  40,344,285
  40,344,621
  40,345,377
  40,345,380
  40,345,511
  40,345,634
  40,346,092
  40,346,463
  40,348,007
  40,348,104
  40,348,144
  40,348,811
  40,349,321
  40,349,671
  40,353,172
  40,353,799
  40,355,777
  40,356,898
  40,358,118
  40,358,120
  40,358,121
  40,358,132
  40,358,141
  40,358,144
  40,358,147
  40,358,244
  40,358,274
  40,358,288
  40,358,300
  40,358,308
  40,358,314
  40,358,317
  40,358,322
  40,360,036
  40,360,128
  40,360,434
  40,363,246
  40,363,380
  40,365,064
  40,365,491
  40,365,683
  40,365,739
  40,365,781
  40,365,979
  40,365,983
  40,366,616
  40,366,728
  40,366,729
  40,366,737
  40,366,757
  40,366,887
  40,366,939
  40,367,022
  40,367,093
  40,367,135
  40,367,166
  40,367,251
  40,367,386
  40,367,393
  40,367,400
  40,367,707
  40,367,724
  40,367,799
  40,367,899
  40,367,917
  40,367,943
  40,367,959
  40,368,098
  40,368,225
  40,368,319
  40,368,845
  40,368,952
  40,369,026
  40,369,056
  40,369,076
  40,369,086
  40,369,254
  40,369,260
  40,369,326
  40,369,543
  40,369,673
  40,369,740
  40,369,797
  40,369,841
  40,369,879
  40,369,932
  40,370,101
  40,370,216
  40,370,421
  40,370,422
  40,370,441
  40,370,535
  40,370,631
  40,370,676
  40,370,781
  40,370,811
  40,370,993
  40,370,995
  40,371,006
  40,371,077
  40,371,095
  40,371,130
  40,371,141
  40,371,204
  40,371,231
  40,371,286
  40,371,409
  40,371,463
  40,371,594
  40,371,595
  40,371,779
  40,371,883
  40,372,079
  40,372,182
  40,372,203
  40,372,676
  40,373,651
  40,373,996
  40,374,347
  40,375,921
  40,377,319
  40,377,982
  40,378,273
  40,378,523
  40,378,865
  40,379,251
  40,379,576
  40,380,272
  40,380,304
  40,380,426
  40,380,453
  40,380,691
  40,380,829
T
T
T
G
A
C
G
C
A
T
A
C
5/-
3
T
C
-
C
-
T
2
-
T/-
-
3
9
3
-
-
-
-
T
A
A
C
8/-
-
C
-
3
A
2
A
C
-
2
G
-
T
2
C
T
-
G
G/3
2/-
G
5/3
A
C
3
2/-
C
A
A
A
A
C
T
T
G
A
2
TA/3
3
5/-
A
G
A
C
G
T
G
2
C
C
G
C
T
T
G
A
T
A
T
-
12
G
T
C
2
A
G
G
G
A
-
A
C
T
C
C
G
C
A
A
A
G
C
T
A
-
T
T
7
-
A
C
G
C
T
T
C
C
-
8/-
4/-
-
G
G
C
C
-
4
G
3
15/16
3
G
C
A
2
3
2
C
C
-
A
C
A
C
G
C
G
T
G
A
C
T
C
-
G
A
2
2
G
T
A
T
-
18
C
A
3
T
T
-
C
C
12/-
-
G/3
2/-
G
C
-
-
-
A
-
T
A
-
A
G
C
G
A
C
G
T
C
-
T
A
G
C
A
T
-
G
A
2
2
T/2
3/-
-
G
T
A
2
A
C
A
C
C
C
G
T
T
A
G
-
2
T
3
-
A
A
C
C
T
4
-
A
C
A
C
T
G
C
A
A
T
T
2/-
G/12
A
G
C
A
5
2/-
2/-
2
G
T
A
A
A
T
A
C
-
C
G
A
C
G
A
10
T
C
C
A
T
C
T
G
-
G
A
C
A
C
A
G
A
A
T
C
-
9
G
T
T
C
-
A
G
T
-
T
T
-
C
C
A
T
-
C
G
T
C
C
A
T
A
T
T
2
G
T
T
A
G
T
5
T
C
C
-
A
G
2
-
C
38
2
C
40
GA/4
-
9
C
G/11
9
C
-
T
C
C
G
T
C
C
T
10
2
3
A
-
G
-
T
-
T
G
T
C
G
G
-
-
A
19
T
G
-
G/15
5
G
5
-
T
2
C
A
A
6/-
4/-
-
7
-
9
-
T
T
3
6/-
3/-
A
-
-
G
T
4
-
A
G/7
9
A
A
C
G
G
13
G/5
A
-
G
C
-
T
T
2
-
G
T
4/-
-
-
-
2
2
2
G
-
A
A
2
-
C
A
C
A
C
G
17
G
T
G
A
A
G
A
C
G
A
-
A
A
A
C
14
2
C
G
3
-
3
A
A
T
A
G
T
C
G
T
-
A
2
C
A
C
A
A
A
G
A
-
A
A
A
T
G
T
T
T
A
C
A
T
A
C
A
G
8
T
A
T
A
A
A
2
C
C
T
C
T
17
A
A
A
A
C
A
-
A
G
T
A
A
C
A
3