Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 230,713 (bp)   Positions: 592
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.0
.022
.0
.003
.001
.015
.001
.0
.001
.001
.002
.001
.015
.001
.002
.0
.003
.0
.001
.0
.0
.895
.124
.0
.001
--
--
.003
.001
.003
.238
.484
.161
.026
.094
.004
.013
.002
.619
.064
.022
.002
.0
.005
.001
.02
.033
.036
.028
.047
.006
.023
.013
.001
.0
.006
.005
.012
.012
.0
.001
.015
.324
.012
.0
.004
.327
--
--
.046
.007
.005
.034
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.11
.249
.839
.02
.206
.188
.068
.081
.082
.009
.017
.054
.002
.016
.004
.05
.272
.013
.013
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.033
.048
.004
.22
.336
.015
.012
.001
--
--
.003
.047
.052
.051
.03
.033
.023
.107
.001
.005
.093
.001
.0
.007
.028
.0
.0
.137
.009
.002
.006
.019
--
.013
--
--
--
.002
.007
.007
.001
.001
.14
.004
.024
.097
.029
.908
.917
.487
.968
.999
.404
.282
.011
.011
.01
.01
.0
.011
.015
1.0
.196
.007
.11
--
--
--
--
--
.0
.002
.0
.001
.0
.998
1.0
.013
.008
.019
.007
--
.018
.03
.028
.004
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.041
.001
--
--
.4
.196
.686
.002
.271
.001
.0
1.0
.002
.0
1.0
1.0
.995
1.0
1.0
.006
.014
.03
.179
.005
.007
.021
.004
.005
.923
--
--
--
--
--
--
--
.515
.179
.008
.0
.002
.0
.0
.0
.002
--
--
--
--
.97
--
--
--
--
--
.004
.005
.004
.803
.799
.19
.003
.011
.134
.0
.0
.008
.004
.025
.03
.002
.432
.004
.002
.254
.001
.06
--
--
--
--
--
.028
.09
--
.025
.002
.009
.0
.005
.009
.997
.985
.245
.019
.049
.046
.0
.002
.001
--
.013
.0
.151
.001
.047
.005
.0
.011
.043
.0
.0
.551
.109
.001
.0
.0
.0
.01
.025
.005
.011
.717
.258
.006
.001
.084
.005
.002
.003
.073
.008
--
.021
.001
.023
.041
--
--
--
.003
.0
.181
.003
.048
.002
.0
.006
.133
.001
.001
.0
.002
.004
.001
.086
.014
.12
.095
.109
.13
.007
.065
.009
.004
.997
.999
.003
.003
.021
.0
.0
.003
.001
.014
.001
.006
.073
.469
.001
.0
.001
.011
.038
.047
.001
.06
.0
.009
.014
.007
.0
.0
.0
.002
.002
.088
.013
.056
.001
.035
.002
.01
.11
.007
.0
--
.275
.024
.003
.019
.0
.0
.008
--
.004
.021
.059
.021
.02
.0
.003
.001
.009
.242
.002
.001
.188
.47
.037
.467
.01
.084
.0
.015
.009
.001
.0
.001
.002
.0
.003
.002
.01
.0
.003
.0
.0
.0
.0
.001
.055
.099
.093
.013
.015
.018
--
--
.0
.004
.002
--
--
--
--
--
.222
.0
.003
.07
.124
.0
.002
.006
.024
--
--
--
.039
.765
.994
.997
.993
.991
.332
.068
.992
.864
.0
.0
.0
.0
.012
.001
.001
.0
.003
.007
.001
.012
.012
.0
.0
.06
.0
.115
.087
.129
.011
.005
.005
.016
.004
.003
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.222
.035
.012
.05
.012
--
--
--
--
--
.229
.211
--
.0
.004
.006
.008
.032
.001
.01
.001
.002
.021
.998
.173
1.0
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
Kif5c
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
G
A
C
T
A
A
C
G
G
C
T
A
T
A
9
T
C
C
2
T
T
T
A
A
T
T
A
A
A
G
T
T
A
A
C
G
T
A
2
T
A
A
G
G
4
G
26
A
T
T
G
8
C
T
A
G
G
G
C
G
A
A
G
T
G
G
T
T
A
T
C
T
G
G
C
G
A
G
T
C
T
A
A
2
T
A
G
A
A
C
G
C
4
C
A
C
A
C
C
T
G
A
C
C
G
A
C
A
A
T
A
G
T
A
T
G
A
A
C
A
6
4
T
T
A
G
2
T
A
C
T
A
T
C
T
T
C
T
3
A
G
G
C
T
A
G
G
C
A
C
G
C
C
2
A
G
C
A
A
T
A
C
G
C
T
G
T
T
C
C
T
T
G
G
G
A
G
C
3
C
C
T
G
T
C
C
T
T
A
A
C
T
A
T
A
C
C
C
G
2
T
C
A
A
C
C
T
C
G
A
T
T
T
G
G
T
G
G
C
C
T
A
G
A
A
C
C
G
A
C
G
A
G
2
T
T
T
C
2
4
2
A
C
A
C
A
T
A
A
A
C
T
2
C
G
T
A
T
C
4
2
6
C
T
T
G
G
14
12
T
T
A
T
G
A
G
G
C
T
A
A
G
A
A
T
2
A
C
C
G
6
T
3
T
G
A
T
T
G
T
T
C
G
C
C
2
G
T
A
G
G
T
C
A
2
2
A
G
G
G
T
A
C
C
T
C
C
G
T
A
C
C
T
G
G
G
C
A
C
G
C
T
C
G
A
G
T
A
G
G
G
A
A
G
T
G
C
G
A
7
G
T
T
A
G
A
G
T
T
T
T
A
A
G
C
2
A
C
G
G
T
G
A
G
T
T
T
A
G
T
C
C
G
A
A
T
C
C
G
2
T
G
C
T
C
T
T
C
A
A
A
G
T
A
C
A
C
C
C
T
G
C
C
T
T
A
C
G
A
C
G
C
G
G
A
C
C
A
G
A
T
G
C
A
40
C
T
T
T
A
T
G
A
A
4
T
2
T
A
G
G
T
G
T
T
T
A
C
G
T
T
A
C
C
C
G
5
T
4
C
3
C
T
A
C
G
T
T
12
4
2
C
A
2
T
A
C
C
C
A
T
G
A
6
G
G
C
G
C
G
C
T
G
G
4
2
A
A
11
G
2
T
C
C
G
C
A
C
C
C
A
G
A
C
3
G
G
C
4
A
C
G
C
A
A
A
A
A
A
G
T
C
C
T
C
A
G
G
T
C
G
G
T
G
T
G
6
T
C
T
A
C
T
C
T
T
T
C
T
C
C
C
A
A
G
A
T
T
G
C
  40,150,713
  40,150,789
  40,151,117
  40,151,214
  40,151,236
  40,151,354
  40,151,470
  40,151,932
  40,151,938
  40,151,963
  40,151,964
  40,152,792
  40,153,012
  40,153,085
  40,153,104
  40,153,128
  40,153,138
  40,153,329
  40,153,460
  40,153,572
  40,153,840
  40,153,844
  40,154,462
  40,154,520
  40,154,912
  40,155,390
  40,155,830
  40,155,851
  40,156,383
  40,156,945
  40,156,956
  40,157,050
  40,157,089
  40,157,342
  40,157,459
  40,157,620
  40,158,194
  40,158,226
  40,158,419
  40,158,538
  40,158,543
  40,158,571
  40,158,666
  40,158,798
  40,158,818
  40,158,891
  40,158,898
  40,158,903
  40,158,905
  40,158,938
  40,158,949
  40,159,160
  40,159,184
  40,159,449
  40,159,529
  40,159,532
  40,159,682
  40,160,192
  40,160,738
  40,161,793
  40,162,437
  40,162,845
  40,163,074
  40,163,540
  40,164,561
  40,165,272
  40,165,714
  40,166,327
  40,167,241
  40,167,344
  40,167,700
  40,167,756
  40,167,877
  40,167,968
  40,168,274
  40,168,489
  40,168,809
  40,168,897
  40,169,042
  40,169,106
  40,169,438
  40,169,452
  40,169,617
  40,169,660
  40,169,820
  40,169,963
  40,170,004
  40,170,861
  40,170,879
  40,171,371
  40,171,418
  40,171,499
  40,171,961
  40,172,129
  40,172,172
  40,172,206
  40,172,208
  40,172,216
  40,172,237
  40,172,240
  40,172,244
  40,172,333
  40,172,434
  40,172,485
  40,172,506
  40,172,536
  40,172,622
  40,172,667
  40,172,670
  40,172,749
  40,172,767
  40,173,106
  40,173,113
  40,173,115
  40,173,116
  40,173,313
  40,173,328
  40,173,369
  40,173,383
  40,173,389
  40,173,448
  40,173,581
  40,173,902
  40,173,904
  40,174,116
  40,174,120
  40,174,245
  40,174,578
  40,174,590
  40,174,992
  40,175,038
  40,175,039
  40,175,413
  40,175,545
  40,175,641
  40,175,776
  40,175,857
  40,176,659
  40,176,762
  40,176,896
  40,177,093
  40,177,422
  40,177,465
  40,177,596
  40,177,950
  40,178,600
  40,178,780
  40,178,901
  40,178,924
  40,179,004
  40,179,178
  40,179,222
  40,179,299
  40,179,436
  40,179,502
  40,179,657
  40,179,882
  40,180,302
  40,180,505
  40,180,563
  40,180,589
  40,180,794
  40,181,719
  40,181,950
  40,182,075
  40,182,164
  40,182,616
  40,182,619
  40,182,641
  40,182,685
  40,182,722
  40,183,052
  40,183,082
  40,183,350
  40,183,372
  40,183,400
  40,183,401
  40,183,644
  40,183,830
  40,183,968
  40,184,074
  40,184,263
  40,184,358
  40,184,451
  40,185,283
  40,185,430
  40,185,469
  40,185,474
  40,185,905
  40,186,168
  40,187,507
  40,187,676
  40,187,726
  40,189,550
  40,190,116
  40,190,941
  40,191,291
  40,192,013
  40,193,089
  40,193,571
  40,194,192
  40,194,783
  40,194,803
  40,194,804
  40,194,815
  40,195,164
  40,195,366
  40,195,467
  40,195,544
  40,195,588
  40,195,754
  40,196,758
  40,197,945
  40,198,056
  40,198,072
  40,198,177
  40,198,181
  40,198,393
  40,198,747
  40,199,448
  40,200,181
  40,200,667
  40,200,839
  40,201,107
  40,201,129
  40,201,311
  40,201,409
  40,201,448
  40,201,638
  40,201,648
  40,201,990
  40,202,587
  40,202,625
  40,202,705
  40,202,754
  40,203,277
  40,203,688
  40,204,435
  40,205,770
  40,208,030
  40,208,233
  40,209,278
  40,209,280
  40,209,649
  40,210,392
  40,210,561
  40,210,688
  40,212,855
  40,214,657
  40,218,429
  40,218,947
  40,219,175
  40,219,202
  40,219,877
  40,219,880
  40,219,900
  40,220,448
  40,220,888
  40,221,598
  40,222,190
  40,222,347
  40,222,383
  40,223,966
  40,223,980
  40,225,566
  40,226,138
  40,226,870
  40,226,988
  40,227,814
  40,227,968
  40,227,970
  40,229,141
  40,231,632
  40,233,589
  40,234,471
  40,235,914
  40,237,291
  40,238,568
  40,238,733
  40,238,767
  40,239,105
  40,239,254
  40,239,255
  40,240,461
  40,240,850
  40,240,945
  40,241,186
  40,241,257
  40,241,428
  40,245,897
  40,246,353
  40,246,584
  40,247,292
  40,247,297
  40,247,309
  40,247,311
  40,248,425
  40,249,285
  40,251,017
  40,251,109
  40,251,513
  40,251,536
  40,252,040
  40,252,551
  40,252,577
  40,252,725
  40,252,734
  40,252,993
  40,252,994
  40,253,102
  40,253,936
  40,254,382
  40,254,399
  40,254,521
  40,254,899
  40,255,382
  40,255,688
  40,255,692
  40,256,530
  40,256,536
  40,256,601
  40,257,008
  40,257,069
  40,257,631
  40,257,778
  40,257,916
  40,258,592
  40,258,606
  40,259,557
  40,259,596
  40,260,035
  40,260,118
  40,260,194
  40,260,477
  40,260,570
  40,260,571
  40,260,863
  40,261,065
  40,261,362
  40,261,773
  40,262,029
  40,262,193
  40,262,221
  40,262,338
  40,262,611
  40,262,686
  40,262,746
  40,263,423
  40,263,533
  40,263,604
  40,263,769
  40,264,027
  40,264,145
  40,264,335
  40,264,624
  40,264,998
  40,265,112
  40,265,193
  40,265,239
  40,265,282
  40,265,296
  40,265,346
  40,265,368
  40,266,141
  40,266,484
  40,266,879
  40,266,979
  40,267,004
  40,267,188
  40,267,230
  40,267,302
  40,267,559
  40,267,718
  40,268,474
  40,268,515
  40,268,524
  40,268,575
  40,268,576
  40,268,612
  40,269,593
  40,269,952
  40,270,312
  40,270,327
  40,270,553
  40,270,692
  40,270,734
  40,270,869
  40,271,044
  40,271,132
  40,271,212
  40,271,227
  40,272,291
  40,272,301
  40,272,470
  40,272,512
  40,272,572
  40,272,795
  40,272,937
  40,272,941
  40,272,951
  40,273,660
  40,273,831
  40,274,319
  40,274,326
  40,274,823
  40,274,833
  40,274,965
  40,274,978
  40,275,435
  40,275,863
  40,276,423
  40,276,501
  40,276,718
  40,277,332
  40,278,544
  40,278,823
  40,279,029
  40,279,343
  40,279,711
  40,279,964
  40,280,458
  40,280,482
  40,280,501
  40,280,763
  40,282,644
  40,282,872
  40,283,040
  40,283,241
  40,283,263
  40,283,270
  40,284,083
  40,284,084
  40,284,227
  40,284,356
  40,284,372
  40,284,523
  40,284,954
  40,285,145
  40,285,565
  40,285,681
  40,285,878
  40,285,899
  40,286,086
  40,287,594
  40,288,116
  40,288,980
  40,290,220
  40,290,613
  40,291,219
  40,292,091
  40,293,392
  40,293,684
  40,293,710
  40,294,671
  40,294,716
  40,295,057
  40,295,083
  40,295,179
  40,295,180
  40,295,349
  40,295,405
  40,295,413
  40,295,473
  40,295,483
  40,295,596
  40,297,162
  40,297,425
  40,298,424
  40,298,731
  40,299,473
  40,299,701
  40,299,767
  40,299,871
  40,300,454
  40,300,455
  40,300,460
  40,300,461
  40,300,463
  40,300,466
  40,300,473
  40,300,477
  40,300,481
  40,300,511
  40,300,672
  40,300,790
  40,302,253
  40,302,307
  40,302,488
  40,302,593
  40,302,808
  40,303,265
  40,303,273
  40,303,275
  40,303,580
  40,303,609
  40,303,773
  40,303,822
  40,303,854
  40,304,386
  40,305,014
  40,305,682
  40,308,650
  40,308,669
  40,312,514
  40,313,290
  40,313,291
  40,315,371
  40,317,346
  40,317,609
  40,317,997
  40,319,121
  40,319,639
  40,320,336
  40,320,350
  40,322,412
  40,323,406
  40,323,499
  40,323,515
  40,323,606
  40,324,579
  40,324,750
  40,324,760
  40,324,873
  40,324,874
  40,324,903
  40,325,367
  40,327,003
  40,327,790
  40,329,545
  40,330,380
  40,330,829
  40,331,357
  40,332,664
  40,332,807
  40,333,327
  40,336,726
  40,339,060
  40,340,102
  40,342,202
  40,343,222
  40,343,223
  40,344,285
  40,344,298
  40,345,634
  40,348,192
  40,349,321
  40,353,223
  40,355,777
  40,358,118
  40,358,120
  40,358,121
  40,358,132
  40,358,141
  40,358,144
  40,358,147
  40,358,281
  40,358,301
  40,358,305
  40,358,314
  40,358,317
  40,360,434
  40,360,667
  40,360,937
  40,361,158
  40,362,807
  40,363,246
  40,363,380
  40,366,850
  40,367,929
  40,367,935
  40,370,412
  40,371,336
  40,371,679
  40,371,700
  40,371,779
  40,371,884
  40,372,079
  40,372,182
  40,372,676
  40,373,996
  40,374,347
  40,374,569
  40,375,067
  40,376,241
  40,378,273
  40,378,556
  40,379,251
  40,379,576
  40,380,304
  40,380,453
  40,380,691
  40,380,829
T
3
T
G
A
C
G
C
G
C
A
T
-
-
C
C
-
3/3
T
A
-
C
T/3
C
C
T
A
C
G
G
G
A
C
C
G
C
T
-
-
G
-
C
C
G
A
A
-
C
-
G
A
C
A
-
G
C
T
A
A
T
T
A
G
G
C
C
3/5
A
T/C
T/-
-
C
T
C
T
2
T
3
G
T
G
2
C
G
G
-
C
T
A
-
G
T
C
T
-
T
T
T
C
G
G
G
A
T
T
T
A
G
T
2
C
14
4
-
7
G
C
A
G
G
G
G
6/-
4/-
2
G
G
A
-
A
G
T
C
G
A
T
5
C
T
2
-
G
T
A
T
C
G
C
A
T
3
T
A
T
A
-
G
A
T
3
T
C
G
5
A
A
C
T
G
A
T
T
C
3
11
2
14
C
A
T
-
T
A
A
G/3
C
A
A
C
C
G
5
3/5
G
G
C
G
T
G
A
A
-
A
2
7
G
T
T
C
2
A
G
C
C
C
2
T
G
C
A
A
G
2
C
T
T
G
A
A
G/A
-
T
C
G
C
-
-
C
C
T
-
4/-
2/-
G
A
G
T
2
C
C
G
C
T
C
-
G
A
2
T
C
T
4/-
-
-
T
C
G
A
A
14/-
12/-
C
-
G
C
T
T
A
T
T
C
-
G
A
T
2
3
-
T
T
T
A
6/-
T/C
3/-
T/C
A
2
C
G
A
C
A
A
A
T
T
2/-
G/12
A
G
C
C
A
T
5
-
-
G
T
A
A
A
G
A
T
C
T
T
A
C
G
T
T
C
A
A
A
A
G
T
A
T
C
T
T
G
A
C
G
A
T
C
G
G
A
C
T
2
A
G
-
T
C
G
G
-
G
A
C
C
A
C
C
T
A
3
2/-
9/7
T
A
A
C
T
G
A
C
111
A
G
A
G
T
G
C
G
G
C
2
T
A
-
2
A
T
-
T
C
C
A
T
5
C
T
C
T
T
G
T
T
T
2
-
T
T
C
C
G
T
5
A/C
C/A
A
T
C
C
G
A
G
G
2
G
3/5
T
6
38/34
40/-
T
2
A
C
G
C
40
-
G
-
T/9
2/-
C
15/13
G/5
C
-
A
C
C
C
G
T
A
C
C
T
10
2
3
A
-
G
-
T
-
T
A
G
T
A
C
G
12/-
4/-
2/-
G
G
-
A
21/17
T
T
T
G
C
21
A/9
-
A
C
5
2
T
A
2
C
A
A
-
-
3/7
G
-
9
2/-
T/-
T
T
T
T
T
T
T
T
2
A
G
T
-
A
-
C/3
4/-
G
T
G/7
A
5
-
G
-
T
T
2
-
G
T
C
-
-
2
4
A
T
A
A
C
2
-
-
-
3
T
C
T
-
A
-
C
C
C
17
A
T
T
T
C
G
A
G
A
C
A
3