Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 218,986 (bp)   Positions: 426
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.242
.003
.048
.004
.001
.428
.132
.005
.117
--
--
--
.003
.419
.461
.008
.01
.002
.02
.29
.002
.005
--
--
.047
.001
--
--
.237
--
--
.138
.0
.126
.363
--
.99
.926
.511
.796
.68
.075
.127
.046
.0
.008
.001
.005
.025
.0
.001
.009
.0
.0
.001
.001
.0
.001
.016
.006
.004
.004
.138
.215
.023
.958
.051
.003
.01
.06
.012
.001
.001
.003
.007
.0
.001
.003
.006
.018
.05
.046
.008
.046
.004
.054
.002
.001
.06
.0
.006
.715
.0
.633
.738
.012
.123
.527
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.002
.055
.0
.16
--
.077
.009
.0
.0
.008
.005
.002
.01
.0
.007
--
.001
.004
.015
.012
.001
.99
.0
.63
.002
.045
.003
.0
.021
.008
.0
1.0
.04
.001
.023
.035
.007
.023
.091
.059
--
.034
.003
.005
.035
.001
.053
.282
.216
.475
.001
.0
.0
.001
.11
.001
.003
.038
.007
.992
.019
.001
.007
.062
.007
.045
.071
.077
.0
.015
.875
.009
.015
.002
.0
.001
.07
--
--
--
--
.024
.034
.001
.0
.005
.149
.318
.001
.002
.0
.034
.002
.073
.433
.133
.265
.003
.203
.002
.008
.004
.004
.119
.015
.008
.0
.0
.101
.023
.0
--
--
--
--
--
.029
.01
.013
.012
.234
.65
.773
.007
.611
.001
.001
.008
.254
.012
.011
.01
.248
.0
.455
--
--
--
--
--
.011
.015
.331
.0
.021
.025
.133
.016
.06
.042
.113
.04
.095
.145
.026
.003
.001
.073
.009
.012
.015
.014
.005
.113
.239
.376
.532
.006
.01
.148
--
--
.01
.213
.032
.424
.088
.384
.001
.12
.128
.004
.099
.017
--
.005
.138
.0
.183
.98
.314
.014
.003
--
.052
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.072
.001
.0
.157
.004
.372
.002
.001
.516
.004
.943
.05
.0
.011
.114
.01
.0
.003
.001
.003
--
.214
.099
--
--
.001
.48
--
.026
.2
.658
.003
.077
.095
.026
.01
.0
.002
.024
.002
.0
.01
.144
.015
.005
.265
.003
.385
.005
.002
.033
.206
.052
.059
.0
.039
.002
.001
.001
.0
.938
.004
.008
.029
.033
.004
--
.003
.211
.167
.081
.873
.001
.028
.259
.232
.0
.0
.114
.066
.002
.008
.001
.001
.049
.001
.0
.197
.64
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
Jakmip2
8
18
T
C
A
G
T
A
A
2
G
A
T
6
2
2
3
T
G
T
C
C
A
A
C
G
T
C
A
G
A
T
T
A
A
T
A
C
A
C
G
T
C
A
C
C
G
T
A
C
A
G
T
A
C
A
A
G
G
A
C
C
G
C
T
C
A
C
A
C
T
C
G
T
C
G
A
A
G
T
A
A
8
4
C
A
T
T
4
G
A
G
C
G
2
C
A
A
A
T
G
A
A
T
G
C
A
G
A
T
C
T
T
T
C
T
A
C
G
T
T
T
A
A
A
T
6
G
C
C
G
G
C
C
G
A
G
11
G
C
2
G
C
T
G
A
G
A
T
T
G
T
G
A
A
A
T
T
6
T
2
A
G
5
C
G
G
C
5
G
5
G
T
A
A
C
T
3
T
T
C
C
A
T
G
T
T
G
A
G
T
T
5
C
A
T
G
C
C
G
T
T
T
G
C
T
C
C
G
A
A
3
A
A
C
12
C
A
3
2
T
G
C
C
C
C
T
C
26
T
A
C
A
T
G
A
G
G
A
C
G
G
A
A
C
A
8
A
A
6
G
C
A
G
A
C
G
T
G
C
A
G
G
A
T
A
2
C
G
4
G
G
G
G
G
5
C
4
2
A
C
A
4
G
G
3
A
G
C
T
8
G
C
A
G
G
G
6
A
A
G
C
G
10
T
C
2
T
A
T
A
7
C
T
C
G
T
G
A
A
G
T
C
A
A
A
C
G
G
T
G
G
C
C
C
C
T
A
C
A
G
A
A
T
T
G
T
C
T
T
C
G
C
T
C
G
A
T
G
A
G
T
14
4
C
T
2
G
C
C
G
C
A
A
8
T
C
8
G
G
A
C
C
G
A
T
2
G
G
T
C
C
T
C
A
G
T
A
C
G
T
T
T
C
A
6
T
2
G
T
16
8
C
T
A
C
G
A
G
T
T
A
C
G
T
T
  37,524,907
  37,526,163
  37,528,790
  37,530,770
  37,531,144
  37,532,329
  37,532,590
  37,532,728
  37,534,681
  37,536,294
  37,542,293
  37,543,570
  37,545,508
  37,545,663
  37,545,667
  37,545,765
  37,547,747
  37,547,749
  37,549,405
  37,550,342
  37,554,972
  37,554,975
  37,555,559
  37,555,563
  37,557,785
  37,560,029
  37,563,264
  37,563,303
  37,565,142
  37,565,424
  37,565,431
  37,570,797
  37,572,617
  37,572,937
  37,575,243
  37,576,272
  37,576,374
  37,576,544
  37,576,604
  37,576,696
  37,577,999
  37,578,171
  37,578,743
  37,579,146
  37,579,533
  37,580,276
  37,580,279
  37,580,282
  37,580,292
  37,580,298
  37,580,313
  37,580,349
  37,580,360
  37,580,362
  37,580,365
  37,580,371
  37,580,430
  37,580,433
  37,580,500
  37,580,503
  37,580,506
  37,580,514
  37,580,619
  37,580,693
  37,581,919
  37,582,151
  37,582,440
  37,582,917
  37,583,132
  37,583,583
  37,584,781
  37,589,679
  37,590,515
  37,590,522
  37,590,525
  37,590,768
  37,590,792
  37,590,874
  37,591,036
  37,591,538
  37,591,614
  37,591,621
  37,593,191
  37,593,218
  37,593,250
  37,593,380
  37,594,657
  37,594,658
  37,595,064
  37,595,498
  37,595,701
  37,596,412
  37,596,912
  37,597,793
  37,597,841
  37,598,009
  37,598,300
  37,598,364
  37,600,846
  37,601,302
  37,601,565
  37,601,656
  37,602,533
  37,602,627
  37,603,398
  37,603,742
  37,604,685
  37,605,654
  37,605,675
  37,605,688
  37,606,562
  37,606,972
  37,608,056
  37,609,082
  37,609,167
  37,609,248
  37,610,750
  37,610,891
  37,611,087
  37,612,027
  37,614,303
  37,614,887
  37,615,080
  37,615,841
  37,615,874
  37,616,056
  37,616,745
  37,616,756
  37,617,070
  37,617,534
  37,617,948
  37,618,875
  37,621,742
  37,622,431
  37,622,558
  37,622,888
  37,623,677
  37,623,867
  37,624,198
  37,624,249
  37,624,406
  37,624,918
  37,625,186
  37,626,045
  37,626,395
  37,626,522
  37,627,319
  37,627,336
  37,627,365
  37,627,691
  37,627,965
  37,628,494
  37,628,981
  37,629,679
  37,630,125
  37,630,277
  37,630,622
  37,631,031
  37,631,054
  37,631,108
  37,631,223
  37,631,692
  37,632,301
  37,632,668
  37,632,743
  37,632,785
  37,632,850
  37,633,302
  37,634,428
  37,634,657
  37,634,947
  37,635,672
  37,636,118
  37,636,424
  37,637,106
  37,637,330
  37,637,748
  37,638,325
  37,638,332
  37,638,335
  37,638,585
  37,639,744
  37,639,804
  37,640,788
  37,641,953
  37,643,496
  37,643,680
  37,643,681
  37,644,890
  37,644,958
  37,646,221
  37,646,336
  37,646,917
  37,649,400
  37,649,571
  37,649,614
  37,649,755
  37,650,435
  37,651,275
  37,651,330
  37,652,020
  37,652,658
  37,652,677
  37,653,008
  37,653,665
  37,654,075
  37,655,649
  37,655,686
  37,655,901
  37,656,262
  37,656,336
  37,657,301
  37,657,304
  37,657,891
  37,658,370
  37,658,818
  37,659,288
  37,659,428
  37,659,797
  37,659,798
  37,660,065
  37,660,567
  37,660,582
  37,660,850
  37,660,893
  37,660,912
  37,660,960
  37,661,059
  37,661,324
  37,661,354
  37,661,355
  37,661,459
  37,662,004
  37,662,010
  37,662,014
  37,662,144
  37,662,376
  37,662,484
  37,662,491
  37,662,630
  37,662,844
  37,662,929
  37,662,930
  37,663,196
  37,663,494
  37,663,875
  37,664,523
  37,665,258
  37,665,308
  37,665,538
  37,665,672
  37,665,860
  37,666,323
  37,666,620
  37,666,964
  37,667,164
  37,667,391
  37,667,524
  37,668,149
  37,668,218
  37,669,071
  37,669,158
  37,670,528
  37,671,139
  37,671,430
  37,672,259
  37,672,355
  37,673,057
  37,673,320
  37,673,603
  37,673,655
  37,673,663
  37,673,667
  37,674,368
  37,674,696
  37,675,121
  37,675,521
  37,675,522
  37,675,524
  37,675,611
  37,675,719
  37,675,729
  37,677,231
  37,677,739
  37,678,440
  37,678,744
  37,679,693
  37,679,968
  37,680,365
  37,680,429
  37,680,777
  37,681,224
  37,681,225
  37,681,441
  37,682,257
  37,682,674
  37,683,201
  37,683,794
  37,684,349
  37,684,577
  37,684,730
  37,684,838
  37,684,952
  37,686,277
  37,687,488
  37,688,635
  37,689,266
  37,689,690
  37,690,191
  37,690,535
  37,691,435
  37,691,572
  37,691,784
  37,691,825
  37,692,809
  37,692,824
  37,693,372
  37,693,756
  37,694,361
  37,694,450
  37,694,454
  37,695,115
  37,695,133
  37,695,357
  37,695,418
  37,695,557
  37,695,657
  37,696,147
  37,696,188
  37,696,396
  37,697,008
  37,697,014
  37,697,017
  37,697,063
  37,697,581
  37,697,856
  37,697,924
  37,698,265
  37,698,267
  37,698,573
  37,698,840
  37,699,828
  37,700,718
  37,701,578
  37,701,708
  37,701,776
  37,702,126
  37,702,968
  37,703,676
  37,704,096
  37,704,944
  37,705,790
  37,706,367
  37,706,421
  37,706,698
  37,706,727
  37,707,156
  37,707,362
  37,707,491
  37,708,506
  37,708,764
  37,709,413
  37,709,804
  37,710,077
  37,710,320
  37,710,417
  37,710,524
  37,710,830
  37,711,405
  37,711,415
  37,712,361
  37,712,390
  37,712,711
  37,712,929
  37,715,471
  37,715,874
  37,716,282
  37,716,392
  37,716,456
  37,716,972
  37,718,063
  37,718,349
  37,718,533
  37,718,653
  37,720,378
  37,721,251
  37,725,237
  37,725,682
  37,726,878
  37,726,879
  37,727,120
  37,727,324
  37,728,504
  37,729,939
  37,730,213
  37,730,599
  37,731,390
  37,731,556
  37,732,793
  37,732,923
  37,733,736
  37,733,841
  37,733,886
  37,734,625
  37,734,810
  37,735,475
  37,735,516
  37,735,602
  37,735,722
  37,735,780
  37,735,831
  37,735,839
  37,736,090
  37,736,626
  37,736,998
  37,738,086
  37,738,644
  37,738,752
  37,739,494
  37,739,571
  37,739,611
  37,740,488
  37,740,770
  37,741,461
  37,742,236
  37,743,213
-
-
G
T
G
T
C
2
5/3
2/-
A
-
-
6/-
2/-
2/-
3/-
T/-
A
9
C/2
C/8
G
G
G
A
2
2
21
2
-
C
C
G
15/17
C
2
T
G
T
A
3
T
-
2
T
A
G
G
T
T
A
G
C
T
T
G
T
-
C
T
A
A
T
-
T
-
T
-
T
T/-
G
A
C
T
C
G
G
C
-
C
G
-
-
9
G
G
A
-
A
9
C
T
3/5
2/-
T
3
5
G
A
A
C
C
C
C
-
G
C
G
G
A
G
C
C
A
-
-
11/9
A
G
C
C
G
T
G
9/7
6/-
G/3
T
T
4
A
C/11
A
A
T
A
11/-
A
A
-
2
T
C
T
G
A
C
G
A
T
C
C
G
G
G
C
C
-
C
-
G
T
-
T
A
A
T
-
A
-
A
G
C
11
A
A
-
G
G
A
C/3
T
C
C
C
C
A
2
A
T/-
C
-
G
G
11
A
T
T
A
C
C
C
A
A
C
3
4
T
T
C
-
C
C
-
-
T
G
3/-
2/-
?
C
T
2
T
5
5
T
-
A
G
T
C
G
-
C
T
A
G
-
T
T
T
G
T
G
-
3/3
A/-
6/-
2
9/5
C
A
2
T
A
C
2
T
T
A
A
C
C
-
-
G
A
-
3
T
T
A
A
-
C/11
4/-
2/-
G
A
2
-
A
A
-
5
5/3
T
C
-
T
T
G
2
A
A
-
G
G
A
G
A
10/-
C
T
-
C
G
G
T
-
7
2
2
T
G
A
3
G
A
G
T
C
T
2
T
3
A
2
-
C
T
G
T
T
13/11
G
A
T
A
G
C
A
21
A
-
T
C
-
A
A
A
4
T
T
-
-
T
G
C
G
-
-
T
A
2/-
A
G
T
A
T
C
G
-
C
-
-
C
A
G
T
T
A
G
A
2/-
A
A
C
G
2
A
T
C
C
G
G
T
T
A
C
4
T
-
-
-
-
A
G
16/-
8/-
T
C
G
A
A
-
A
C
3/TA
G
T
2
A
G