Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 153,376 (bp)   Positions: 513
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.011
.051
.015
.009
.006
.03
.012
.003
.052
.009
.111
.094
.002
.016
--
--
--
--
--
--
.34
.032
.195
.13
.077
.073
.408
.312
.004
.397
.039
.06
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.015
.017
.094
--
--
--
--
.013
.01
.075
.001
.134
.106
.248
.058
.019
.003
.343
.048
.007
.01
.019
.0
.004
.049
--
--
--
--
--
--
.015
.003
.002
.099
.038
.055
.187
--
.001
.006
.001
.166
.175
.046
.079
.001
.001
.095
.051
.001
.001
.002
--
--
--
--
--
--
.0
.004
.89
.625
.001
.048
.0
.001
.001
.0
.001
--
.003
.001
.0
.002
.004
.001
.008
--
--
.068
.006
.519
.071
.043
.377
.102
.136
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.164
.001
.0
.0
.019
.007
.001
.011
.003
.0
.003
.02
.003
.007
.0
.001
.003
.0
.087
.13
.104
.202
.328
.104
.003
.01
.058
.003
.719
.001
.996
.999
.982
.925
.005
.061
.229
.0
.005
.688
.12
.021
.001
.007
.028
--
--
--
--
.125
.001
.0
.017
1.0
.0
.0
.0
.003
.001
.041
.001
.001
.022
.015
.0
.001
.03
.011
.001
.003
.148
.079
.241
.009
.04
.002
.006
.033
.037
.0
.001
.001
.003
.003
.957
.068
.0
.001
.001
1.0
.998
.0
.972
.017
.012
.023
.007
.002
.045
.0
.001
.0
.001
.0
.002
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.077
.044
.008
.001
.001
.03
.108
.031
.065
.055
.034
.327
.044
.008
--
--
--
--
--
--
.042
.0
.001
.035
.021
.0
.179
.073
.601
.338
.051
.009
.0
.011
.004
.0
.004
.006
.003
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.017
.195
.006
.005
.006
.015
.049
.019
.021
.091
.077
.174
.017
.012
.025
.015
.022
.519
.47
.083
.028
--
--
--
--
.034
.007
.003
.031
.006
.038
.015
.034
.176
.505
.001
.009
.006
.341
.005
.0
.009
.013
.008
.006
.007
.001
.009
.007
.133
.003
.047
.006
.144
.0
.03
.035
.107
.092
.096
.067
.666
.715
.001
.222
.025
.002
.127
.024
.002
.002
.002
.03
.0
.038
.034
.035
.04
.091
--
--
--
.082
.588
.57
.028
.099
.003
--
--
--
--
--
--
.152
.026
.068
.045
.004
.017
.01
.05
.063
.055
.051
.218
.345
.415
.079
.039
.013
.005
.018
.093
.071
.296
.057
.025
.046
.002
.015
.034
.015
.005
.021
.025
.027
--
--
--
.282
.002
.001
.09
.073
.049
.014
.063
.003
.007
.114
.106
.017
.019
.019
.005
.56
.349
.011
.002
.008
.038
.001
.035
.226
.001
.01
.016
.015
.003
.104
.164
.105
.035
.0
.001
.0
.001
.008
.0
.007
--
.003
--
--
--
--
--
.161
--
--
--
--
.032
.072
.0
.0
.013
.847
.003
.001
.008
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
C
C
C
T
2
T
C
2
T
G
C
A
G
T
A
3
T
T
C
14
G
C
C
C
T
15
T
2
T
C
A
T
C
G
C
C
A
G
G
G
G
G
G
G
T
C
G
T
A
G
A
A
A
T
A
T
C
T
8
C
24
G
T
T
A
G
A
T
C
A
A
G
A
C
G
T
T
C
G
T
G
A
C
C
G
A
C
T
T
A
G
C
A
A
C
T
T
C
C
A
T
C
2
A
T
G
T
T
C
T
A
A
A
T
G
C
A
A
C
G
A
A
2
T
A
G
T
G
T
C
G
T
T
G
G
G
G
A
G
A
T
C
T
A
4
A
A
C
C
G
A
T
A
C
A
A
A
A
G
13
C
G
C
A
C
T
T
C
7
T
A
G
A
G
A
A
G
G
T
C
20
T
A
A
8
G
G
A
A
G
A
C
G
2
A
G
T
9
G
T
G
C
T
C
C
A
C
G
A
G
C
A
T
118
A
A
C
A
A
G
C
G
A
G
G
T
T
C
A
C
C
T
G
G
C
T
G
T
A
G
G
C
A
A
T
C
T
C
G
3
3
A
A
C
A
C
C
T
T
T
6
G
G
G
G
G
C
A
T
A
C
A
3
T
T
T
A
G
G
A
C
A
C
G
A
T
G
C
G
T
A
C
C
A
A
T
C
T
T
G
A
3
C
T
A
C
G
C
T
G
T
C
C
A
T
T
T
C
C
C
A
G
C
T
C
C
A
C
T
C
T
G
A
A
C
G
C
3
C
A
4
C
4
5
T
G
A
G
A
A
T
A
T
G
A
T
T
6
T
A
A
A
T
G
G
G
T
G
A
G
T
G
T
A
G
A
G
C
A
A
8
A
T
G
T
4
A
C
G
C
G
T
G
A
T
A
A
G
A
T
G
G
A
G
A
C
T
G
G
G
T
A
T
T
A
A
T
14
12
A
3
G
G
T
G
C
T
G
C
G
G
C
G
G
A
T
T
G
T
A
T
A
T
A
A
G
A
C
A
T
G
A
G
C
A
T
C
G
G
T
G
T
A
C
A
T
A
A
4
T
T
T
T
T
A
G
C
C
3
T
C
G
G
T
C
56
T
C
A
G
G
A
T
C
G
T
A
A
42
44
A
C
C
G
T
C
A
T
4
T
A
  150,733,060
  150,733,335
  150,733,353
  150,733,379
  150,733,382
  150,733,391
  150,733,425
  150,733,464
  150,733,486
  150,733,496
  150,733,527
  150,734,104
  150,734,763
  150,735,391
  150,735,596
  150,735,754
  150,735,757
  150,735,762
  150,736,359
  150,736,598
  150,736,659
  150,737,167
  150,737,452
  150,737,545
  150,737,636
  150,737,969
  150,738,538
  150,738,806
  150,739,503
  150,739,688
  150,739,718
  150,739,840
  150,740,162
  150,740,373
  150,740,496
  150,740,517
  150,740,571
  150,740,572
  150,740,578
  150,740,584
  150,740,672
  150,740,696
  150,740,796
  150,740,952
  150,740,969
  150,741,043
  150,741,060
  150,741,192
  150,741,264
  150,741,580
  150,741,629
  150,742,005
  150,742,127
  150,742,225
  150,742,362
  150,742,532
  150,742,829
  150,743,987
  150,744,230
  150,744,348
  150,745,062
  150,745,094
  150,745,678
  150,746,871
  150,746,939
  150,746,961
  150,747,283
  150,747,874
  150,748,243
  150,748,254
  150,748,775
  150,749,516
  150,750,244
  150,750,632
  150,750,663
  150,750,695
  150,751,194
  150,753,265
  150,754,338
  150,754,487
  150,754,911
  150,755,281
  150,755,483
  150,756,002
  150,756,910
  150,757,310
  150,759,921
  150,760,469
  150,760,830
  150,761,076
  150,761,684
  150,761,758
  150,761,845
  150,761,847
  150,761,931
  150,761,936
  150,762,034
  150,762,048
  150,762,817
  150,763,512
  150,763,514
  150,763,515
  150,763,596
  150,763,602
  150,763,612
  150,764,249
  150,764,828
  150,764,989
  150,765,279
  150,765,429
  150,765,571
  150,765,648
  150,765,777
  150,766,000
  150,766,026
  150,766,270
  150,766,502
  150,766,763
  150,766,787
  150,766,797
  150,766,844
  150,766,895
  150,767,138
  150,767,322
  150,767,365
  150,767,366
  150,767,672
  150,767,694
  150,767,762
  150,767,830
  150,767,862
  150,767,985
  150,768,013
  150,768,144
  150,768,200
  150,768,225
  150,768,243
  150,768,259
  150,768,266
  150,768,364
  150,768,819
  150,768,911
  150,768,928
  150,769,198
  150,769,808
  150,769,854
  150,769,865
  150,769,877
  150,770,089
  150,770,239
  150,775,714
  150,775,762
  150,775,763
  150,775,910
  150,775,947
  150,775,961
  150,776,289
  150,776,363
  150,776,621
  150,776,711
  150,776,743
  150,776,920
  150,776,990
  150,777,129
  150,777,206
  150,777,649
  150,777,917
  150,778,186
  150,778,193
  150,778,209
  150,778,288
  150,778,359
  150,778,409
  150,778,683
  150,778,712
  150,778,785
  150,778,913
  150,779,046
  150,779,426
  150,779,484
  150,779,490
  150,779,497
  150,779,564
  150,780,018
  150,780,252
  150,780,275
  150,780,312
  150,780,625
  150,780,666
  150,781,090
  150,781,544
  150,782,805
  150,782,966
  150,783,213
  150,783,235
  150,783,288
  150,784,183
  150,784,955
  150,785,145
  150,785,529
  150,786,013
  150,786,034
  150,786,593
  150,786,859
  150,786,971
  150,787,685
  150,787,872
  150,787,937
  150,787,958
  150,788,015
  150,788,017
  150,788,052
  150,788,484
  150,788,530
  150,788,596
  150,788,840
  150,788,991
  150,789,316
  150,789,359
  150,789,884
  150,789,961
  150,791,020
  150,791,234
  150,791,494
  150,791,595
  150,791,942
  150,791,996
  150,792,013
  150,792,085
  150,792,357
  150,792,409
  150,792,613
  150,792,644
  150,792,970
  150,792,999
  150,793,217
  150,793,291
  150,793,294
  150,793,576
  150,793,873
  150,794,178
  150,794,535
  150,794,713
  150,795,430
  150,795,582
  150,796,138
  150,796,754
  150,796,931
  150,797,012
  150,797,064
  150,797,172
  150,797,765
  150,797,770
  150,797,869
  150,797,945
  150,798,026
  150,798,159
  150,798,417
  150,798,485
  150,798,522
  150,798,621
  150,798,749
  150,798,904
  150,799,254
  150,799,350
  150,799,366
  150,799,502
  150,799,527
  150,799,638
  150,799,666
  150,800,249
  150,800,368
  150,800,429
  150,800,454
  150,800,502
  150,800,507
  150,800,508
  150,800,632
  150,800,830
  150,800,870
  150,801,037
  150,801,041
  150,801,161
  150,801,356
  150,801,889
  150,802,001
  150,802,110
  150,802,152
  150,802,155
  150,802,179
  150,802,455
  150,802,716
  150,803,445
  150,803,949
  150,804,127
  150,804,214
  150,804,337
  150,804,618
  150,805,124
  150,805,147
  150,805,193
  150,805,619
  150,805,778
  150,805,906
  150,806,120
  150,806,495
  150,806,859
  150,807,118
  150,807,309
  150,807,387
  150,807,452
  150,808,046
  150,808,067
  150,808,102
  150,808,126
  150,808,127
  150,808,160
  150,808,162
  150,808,177
  150,808,186
  150,808,212
  150,808,458
  150,808,842
  150,809,581
  150,809,582
  150,809,832
  150,810,014
  150,810,264
  150,810,317
  150,810,670
  150,810,872
  150,810,971
  150,811,186
  150,811,297
  150,811,301
  150,811,812
  150,811,966
  150,812,187
  150,812,293
  150,812,386
  150,812,431
  150,812,842
  150,813,816
  150,813,823
  150,813,842
  150,813,862
  150,814,274
  150,814,367
  150,814,653
  150,815,242
  150,815,297
  150,815,323
  150,815,990
  150,816,420
  150,816,434
  150,816,457
  150,816,608
  150,816,666
  150,816,954
  150,817,133
  150,817,181
  150,817,378
  150,817,518
  150,817,527
  150,818,227
  150,818,258
  150,818,977
  150,818,982
  150,819,135
  150,819,164
  150,819,796
  150,820,208
  150,820,618
  150,820,626
  150,820,718
  150,820,859
  150,821,982
  150,823,350
  150,823,619
  150,824,284
  150,824,318
  150,825,194
  150,825,825
  150,826,131
  150,826,144
  150,827,798
  150,828,533
  150,828,549
  150,829,776
  150,830,741
  150,830,791
  150,831,248
  150,832,586
  150,832,874
  150,833,371
  150,833,492
  150,835,290
  150,836,039
  150,836,454
  150,836,699
  150,839,736
  150,839,793
  150,840,036
  150,841,684
  150,842,114
  150,843,264
  150,843,335
  150,843,352
  150,843,613
  150,843,876
  150,843,878
  150,844,403
  150,844,932
  150,844,942
  150,844,963
  150,845,120
  150,845,225
  150,845,444
  150,845,457
  150,845,607
  150,845,609
  150,845,734
  150,845,757
  150,845,863
  150,845,895
  150,845,900
  150,845,932
  150,845,957
  150,846,013
  150,846,124
  150,846,316
  150,846,336
  150,846,340
  150,846,343
  150,846,877
  150,847,278
  150,847,732
  150,848,011
  150,848,595
  150,848,598
  150,848,807
  150,848,812
  150,849,040
  150,849,468
  150,849,501
  150,849,511
  150,849,512
  150,849,785
  150,850,765
  150,853,005
  150,853,680
  150,853,864
  150,854,039
  150,854,056
  150,854,117
  150,854,552
  150,854,950
  150,855,938
  150,856,511
  150,856,680
  150,856,681
  150,857,170
  150,857,182
  150,857,298
  150,857,329
  150,857,331
  150,857,437
  150,858,023
  150,858,089
  150,858,233
  150,859,254
  150,859,266
  150,859,520
  150,859,615
  150,859,630
  150,860,791
  150,861,073
  150,861,536
  150,862,248
  150,862,643
  150,862,760
  150,862,828
  150,862,966
  150,863,441
  150,864,641
  150,865,537
  150,865,945
  150,866,238
  150,866,345
  150,866,569
  150,866,854
  150,867,370
  150,867,638
  150,867,800
  150,868,947
  150,869,054
  150,869,061
  150,869,138
  150,869,182
  150,869,596
  150,870,124
  150,870,127
  150,870,393
  150,870,941
  150,871,829
  150,872,672
  150,874,790
  150,874,835
  150,876,424
  150,879,255
  150,879,700
  150,883,085
  150,884,870
C
3
3
5
6
9
-
5
2
-
2
2
T
G
A
10
-
-
-
G
A
-
A
T
T
A
-
-
A
-
C
T
C
-
T
A
T
T
C
A
A
A
T
A
C
A
C
G
A
C
G
T
G
G
G
-
-
C
A
C
-
T
-
A
4
19
C
7
G
C
A
A/5
G
A
C
T
2
G
C
T
GC/3
C
A
3
T
T
T
2
A
G
C
2
-
A
G
C
T
C
C
T
A
G
C
T
-
T
C
A
C
G
-
-
G
C
G
A
T
T
-
G
T
A
G
G
-
T/-
G
A
G
A
C
5
A
A
C
T
A
A
A
T
A
G
C
T
G
G
-
G
-
T
T
C
C
G
C
A
G
G
T
T
A
-
G
A
T
C
T
C
-
T
-
7
G
T
G
4
T
G
A
A
C
T
-
G
T
T
-
A
A
G
T
T
T
T
T
-
G
7
A
-
A
19
A
G
A
2
T
G
-
C
G
C
A
-
A
-
G
T
-
G
G
T
4
T
2
A
A
G
C
2
G
A
T
18
A
T
T
2
A
C
G
T
C
2
T
T
G
A
C
15
4
-
-
T
C
A
T
-
G
C
C
A
-
A
A
C
T
A
T
G
3
G
T
G
-
A
13
C
C
A
C
G
T
20
T
A
G
G
T
T
A
C
G
T
T
G
T
C
-
C
5
A
C
-
5
G
G
T
3
T
C
19
4
7
4
T
5
3
4
4
G
T
T
2
20
C
T
G
G
T
A
T
A
A
G
2
T
A
T
-
A
2
4/-
C/2
4/-
5/-
C
T
?
A
C
G
C
G
C
A
G
C
C
-
2
C
G
G
C
A
2
A
C
A
C
C
A
A
-
G
A
G
A
5
-
G
-
C
C
A
C
4/-
G
G
A
CT/3
C
-
G/4
G
C
G
G
A
-
C
T
A
G
A
G
A
-
A
A
A
C
C
C
C
-
8
C
14/-
12/-
G
-
T
A
C
A
2
C
A
T
A
A
T
A
A
G
C
C
13
2
C
A
G
C
G
T
C
G
C/-
-
C
A
T
T
T
G
C
A
A
A
C
A
C
G
T
C
G
G
T
-
2
C
C
G
G
G
T
T
T
-
-
5
A
A
C
G
-
C
T
G
A
A
G
A
T
3
G
G
T
42/-
44/-
G
T
G
A
C
A
A/3
3/5
-
C
G