Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 153,376 (bp)   Positions: 488
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.01
.018
.015
.007
.03
.014
.012
.003
.065
.002
.032
.073
.249
--
.042
--
.013
.058
.175
.0
.0
.002
.01
.019
.006
.004
.049
.01
--
--
.509
.0
.077
.004
.001
.099
.021
.038
.014
.001
.687
.615
.001
.046
.079
.001
.095
.051
.001
.001
.001
.002
--
--
--
--
.0
.931
.004
.89
.888
.625
.001
.048
.0
.001
.001
.0
.001
.003
.001
.0
.002
.004
.001
.008
.035
--
.068
.006
.519
.071
.043
.377
.102
.233
.136
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.304
--
--
.0
.0
.019
.001
.011
.0
.003
.02
.003
.007
.001
.003
.0
.087
.13
.202
.328
.104
.003
.01
.058
.003
.719
.001
.996
.999
.998
.925
.005
.061
.229
.001
.0
.005
.688
.12
.021
.064
.001
.028
--
--
--
--
.023
.125
.0
.017
1.0
.0
.0
.006
.001
.0
.003
.001
.041
.001
.001
.022
.015
.0
.001
.462
.011
.001
.003
.148
.079
.241
.009
.04
.006
.037
.0
.001
.001
.003
.003
.974
.068
.0
.001
.001
.998
.0
.017
.098
.001
.005
.023
1.0
.979
.007
.002
.045
.0
.004
.0
.001
.0
.002
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.002
.03
.108
.065
.055
.021
.034
.284
.008
.01
--
--
--
--
--
--
.031
.003
.042
.021
.004
.021
.001
.0
.051
.009
.011
--
.006
.296
--
--
--
--
.017
.631
.004
.091
.013
.015
.004
--
.003
.411
.313
.001
.006
.001
.341
.009
.001
.003
.008
.003
.007
.004
.001
.017
.029
.133
.144
.043
.035
.005
.093
--
--
.067
.618
.653
.784
.001
.0
.001
.001
.576
.007
.571
.001
.127
.001
.148
.104
.002
.0
.003
.007
.013
.001
.004
.0
.004
.038
.019
.048
.088
.028
.034
.002
.012
.035
.091
.343
.336
.226
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.036
.082
.588
.051
.57
.028
.099
--
--
--
--
--
.029
.017
.068
.002
.004
.01
.063
.055
.345
.415
.004
.039
.013
.018
.093
.169
.296
.057
.025
.046
.097
.002
.015
.042
.015
.005
.021
.025
.006
.027
.207
.469
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.001
.0
.009
.004
.001
.023
.025
.014
.063
.003
.007
.114
.106
.017
.019
.019
.56
.349
.002
.008
.026
.038
.001
.035
.001
.226
.001
.0
.01
.452
.048
.015
.003
.189
.019
.021
.105
.099
.263
.035
.0
.0
.001
.039
.001
.002
--
.0
.002
.049
--
--
--
--
--
.161
--
--
--
.004
.032
.014
.072
.107
.001
.0
.016
.0
.005
.847
.0
.044
.002
.003
.361
--
--
.016
.001
.673
.008
.894
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
Itprid1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
A
2
3
2
3
T
C
T
A
G
T
A
C
C
G
T
C
A
6
G
G
A
G
A
T
C
2
T
A
A
G
4
C
9
G
G
T
A
C
A
A
T
T
A
G
A
A
C
T
G
T
C
T
C
2
A
C
T
G
G
T
T
C
T
A
A
A
T
C
A
A
C
G
A
A
G
T
A
G
T
G
T
C
G
G
T
T
G
G
G
G
A
G
G
C
A
T
C
T
A
A
4
A
G
C
T
G
A
T
C
A
A
A
G
13
C
C
A
C
3
T
7
T
A
G
A
G
A
A
G
G
T
A
20
T
A
A
9
8
G
G
A
A
C
G
C
G
2
A
G
A
T
G
T
G
C
T
A
A
C
C
A
C
G
A
G
C
A
T
G
A
G
C
A
A
G
C
G
G
T
T
C
A
C
C
T
G
G
C
T
T
A
G
G
C
A
A
G
C
A
T
C
T
6
G
3
3
A
A
C
A
C
C
T
T
T
2
A
A
A
3
C
G
G
G
G
A
T
A
A
T
A
G
A
T
C
A
C
G
A
T
G
C
T
T
2
T
A
A
C
A
C
T
A
3
T
T
C
22
A
T
C
C
C
C
4
T
C
C
T
T
A
A
C
T
T
A
6
A
G
C
T
C
G
G
C
C
A
A
T
G
A
G
T
T
G
A
C
A
T
T
G
T
A
C
C
C
T
A
C
A
T
C
G
A
C
A
4
T
G
G
A
T
C
T
G
T
T
A
A
G
C
T
A
T
G
A
C
C
A
A
C
C
T
T
T
A
C
T
G
A
A
G
A
C
C
G
T
A
T
2
T
A
A
12
A
G
G
C
T
C
C
G
C
G
C
A
T
T
6
8
T
A
T
A
T
A
A
C
G
A
C
G
A
A
G
G
A
C
A
A
G
G
G
A
C
T
C
T
C
C
T
C
G
G
T
G
T
A
C
T
A
T
T
G
T
T
T
A
T
A
G
G
12
C
C
3
T
T
T
G
A
A
G
T
2
C
A
T
8
C
C
C
T
T
C
G
T
A
A
A
G
A
G
C
C
G
G
C
T
8
G
G
T
4
C
A
A
10
A
G
T
T
C
A
G
  150,733,060
  150,733,337
  150,733,378
  150,733,379
  150,733,389
  150,733,425
  150,733,441
  150,733,464
  150,733,486
  150,733,515
  150,735,391
  150,737,452
  150,738,538
  150,738,682
  150,740,637
  150,741,135
  150,742,005
  150,742,794
  150,743,259
  150,743,472
  150,745,042
  150,745,987
  150,746,953
  150,747,283
  150,747,874
  150,747,884
  150,748,254
  150,748,775
  150,749,093
  150,750,170
  150,750,244
  150,751,733
  150,753,231
  150,753,806
  150,753,929
  150,754,229
  150,754,911
  150,754,947
  150,755,281
  150,755,529
  150,757,310
  150,758,562
  150,759,390
  150,760,470
  150,761,684
  150,761,758
  150,761,845
  150,761,931
  150,761,936
  150,762,034
  150,762,048
  150,762,518
  150,762,817
  150,763,512
  150,763,596
  150,763,602
  150,763,612
  150,764,249
  150,764,535
  150,764,828
  150,764,989
  150,764,990
  150,765,279
  150,765,429
  150,765,571
  150,765,648
  150,765,777
  150,766,000
  150,766,026
  150,766,270
  150,766,763
  150,766,787
  150,766,797
  150,766,844
  150,766,895
  150,767,138
  150,767,322
  150,767,345
  150,767,363
  150,767,672
  150,767,694
  150,767,762
  150,767,830
  150,767,862
  150,767,985
  150,768,013
  150,768,038
  150,768,144
  150,768,200
  150,768,225
  150,768,243
  150,768,259
  150,768,266
  150,768,364
  150,768,819
  150,768,878
  150,768,892
  150,768,911
  150,768,928
  150,769,198
  150,769,808
  150,769,839
  150,769,854
  150,769,865
  150,770,089
  150,770,540
  150,770,611
  150,775,550
  150,775,762
  150,775,763
  150,775,910
  150,775,961
  150,776,289
  150,776,621
  150,776,711
  150,776,743
  150,776,920
  150,776,990
  150,777,206
  150,777,649
  150,777,917
  150,778,184
  150,778,193
  150,778,288
  150,778,359
  150,778,409
  150,778,683
  150,778,712
  150,778,785
  150,778,913
  150,779,046
  150,779,426
  150,779,484
  150,779,490
  150,779,541
  150,779,564
  150,780,018
  150,780,252
  150,780,275
  150,780,311
  150,780,312
  150,780,625
  150,780,666
  150,781,090
  150,781,544
  150,782,003
  150,782,805
  150,783,213
  150,783,235
  150,783,288
  150,784,183
  150,784,621
  150,785,128
  150,785,145
  150,786,013
  150,786,034
  150,786,593
  150,786,859
  150,786,971
  150,787,386
  150,787,596
  150,787,685
  150,787,872
  150,787,937
  150,787,958
  150,788,015
  150,788,017
  150,788,052
  150,788,484
  150,788,530
  150,788,596
  150,788,756
  150,788,991
  150,789,019
  150,789,359
  150,789,884
  150,789,961
  150,791,020
  150,791,234
  150,791,494
  150,791,942
  150,792,013
  150,792,085
  150,792,357
  150,792,409
  150,792,613
  150,792,644
  150,792,974
  150,792,999
  150,793,217
  150,793,291
  150,793,294
  150,793,873
  150,794,178
  150,794,713
  150,794,891
  150,795,337
  150,795,431
  150,795,582
  150,795,862
  150,795,982
  150,796,138
  150,796,754
  150,796,931
  150,797,012
  150,797,037
  150,797,172
  150,797,765
  150,797,770
  150,797,869
  150,797,945
  150,798,026
  150,798,159
  150,798,417
  150,798,485
  150,798,522
  150,798,621
  150,798,749
  150,798,921
  150,798,922
  150,798,927
  150,798,933
  150,798,940
  150,799,143
  150,799,254
  150,799,366
  150,799,502
  150,799,527
  150,799,666
  150,800,249
  150,800,368
  150,800,506
  150,800,632
  150,800,830
  150,801,037
  150,801,041
  150,801,061
  150,801,161
  150,801,344
  150,802,000
  150,802,009
  150,802,110
  150,802,152
  150,802,155
  150,802,246
  150,802,622
  150,802,716
  150,803,187
  150,803,351
  150,803,445
  150,804,223
  150,804,250
  150,804,337
  150,804,528
  150,804,618
  150,805,778
  150,805,906
  150,806,495
  150,806,577
  150,807,387
  150,807,801
  150,808,127
  150,808,162
  150,808,165
  150,808,189
  150,808,458
  150,809,539
  150,809,583
  150,810,872
  150,811,836
  150,811,966
  150,813,229
  150,814,098
  150,814,653
  150,815,857
  150,815,872
  150,816,624
  150,816,954
  150,817,081
  150,817,133
  150,817,518
  150,817,543
  150,817,860
  150,818,227
  150,818,257
  150,818,977
  150,819,545
  150,819,549
  150,819,561
  150,819,610
  150,819,796
  150,820,718
  150,821,422
  150,823,350
  150,823,915
  150,824,294
  150,824,927
  150,825,059
  150,825,194
  150,825,821
  150,825,824
  150,825,848
  150,826,144
  150,827,296
  150,827,417
  150,827,537
  150,828,507
  150,828,594
  150,829,373
  150,829,709
  150,829,776
  150,829,865
  150,830,190
  150,830,211
  150,831,248
  150,831,373
  150,831,680
  150,832,478
  150,832,583
  150,832,601
  150,833,355
  150,833,371
  150,833,388
  150,833,492
  150,833,855
  150,834,245
  150,834,356
  150,834,973
  150,835,290
  150,835,404
  150,835,790
  150,836,039
  150,836,699
  150,836,967
  150,837,529
  150,837,538
  150,837,634
  150,837,696
  150,837,726
  150,838,110
  150,838,759
  150,838,956
  150,839,324
  150,839,626
  150,839,666
  150,839,711
  150,839,793
  150,839,801
  150,840,849
  150,840,887
  150,841,355
  150,841,684
  150,842,114
  150,842,408
  150,843,264
  150,843,335
  150,843,352
  150,843,697
  150,844,680
  150,844,932
  150,844,942
  150,844,963
  150,845,224
  150,845,254
  150,845,444
  150,845,469
  150,845,607
  150,845,734
  150,845,863
  150,845,895
  150,845,957
  150,846,013
  150,846,233
  150,846,316
  150,846,336
  150,846,343
  150,846,877
  150,847,360
  150,847,732
  150,848,011
  150,848,595
  150,848,598
  150,848,599
  150,848,807
  150,848,812
  150,849,069
  150,849,468
  150,849,501
  150,849,511
  150,849,512
  150,849,665
  150,849,785
  150,849,835
  150,850,013
  150,850,520
  150,850,765
  150,850,813
  150,850,861
  150,850,865
  150,851,609
  150,853,162
  150,853,250
  150,853,527
  150,853,569
  150,853,631
  150,854,033
  150,854,047
  150,854,640
  150,854,648
  150,854,704
  150,854,730
  150,855,013
  150,855,205
  150,855,938
  150,856,511
  150,856,680
  150,856,681
  150,857,170
  150,857,182
  150,857,298
  150,857,329
  150,857,331
  150,858,023
  150,858,089
  150,859,255
  150,859,266
  150,859,354
  150,859,520
  150,859,615
  150,859,630
  150,859,967
  150,860,791
  150,861,073
  150,861,340
  150,861,536
  150,861,898
  150,862,327
  150,862,643
  150,862,760
  150,862,970
  150,863,087
  150,863,312
  150,863,441
  150,863,590
  150,863,690
  150,864,641
  150,865,537
  150,865,629
  150,865,945
  150,866,036
  150,866,345
  150,866,981
  150,867,566
  150,867,830
  150,867,848
  150,868,210
  150,868,947
  150,869,054
  150,869,061
  150,869,138
  150,869,182
  150,869,596
  150,870,393
  150,870,656
  150,870,924
  150,871,066
  150,871,829
  150,872,538
  150,872,672
  150,872,986
  150,873,388
  150,874,790
  150,876,427
  150,876,804
  150,877,869
  150,879,255
  150,879,696
  150,879,729
  150,880,393
  150,881,168
  150,882,173
  150,882,244
  150,882,267
  150,882,664
  150,883,085
  150,883,211
  150,884,870
  150,885,699
C
C/G
A/2
2/-
3/-
2/-
3/-
T/-
C/2
T/-
G
A
-
T
T
A
T
C
A
-
-
A
T
C
7
A/2
C
A
2/-
C
G
G
A
-
T
-
G/2
A
C
2
T
G
G
-
C
2
-
G
C
T
C
A
C
T
C
T
-
T
T
C
A
A
C
G
-
-
G
C
G
A
T
-
G
T
A
G
G
A
-
G
A
G
A
C
5
A
G/T
A
C
T
A
A
A
T
G/A
A
G
G
C
T
G
G
G
-
-
A
4/3
G
C
C
G
A
G
T
T
A
-
G
T
C
T
-
-
-
7/C
G
T
G
4
T
G
A
A
C
A/G
-
G
T
T
-
8/-
A
A
G
T
T
T
T
T
-
G
G/T
C
A
A
19
A
G
A
10
-
2
T
G
-
C
G
C
A
-
A
A
G
A
-
G
G
T
4
T
A
G
C
2
G
A
T
T/2
A
T
T
2
C
G
C
T
T
-
T
T
T
T
G
A
C
-
2
-
-
T
C
A
T
-
G
C
C
A
2/-
2
G
G
-
T
A
C
T
A
G
3
G
10
C
C
C
G
2
T
2
T
A
G
G
T
G
G
C
-
A
G
C
T
T
T
C
C
-
G
3
T
22/-
T
T/C
C/T
C/T
T
C/G
-
A
T
T
G
-
5
A/G
T
T/G
C
3
-
G
A
-
C
A
2
G/C
C/G
C/G
A/G
C
-
2
G
A
A
C
G/A
G
G
-
T/C
C
A
C
G
T
T
T
C
G
A
C
G
3
C
A/G
T
G
-
T/-
?
5
G
C
T
C
A
C
G
T
G
A
T
A
G
C
T
C
G
T
G
-
T
T
A
C
C
G
A
A
A
G
G
A
G
A
G
A
C
C
C
-
G
8
T
-
G
T
A
2
C
A
T
A
T
A
A
G
C
C
-
8/-
2
C
G
G
C
G
T
G
C
2
T
A
G
G
G/A
G/A
A/G
C/T
A/G
A/C
G/C
A
A
-
C/A
T/G
C/T
T/G
T
G
C
A
A
A
C
A
C
G
T
G
G
-
2
A
C
C
G
G
G
G
A
T
-
T
T
-
T/C
2
G
A
G
G
A
C
-
G
G
C
-
T
T
T
G
A
T
4
G
G
T
G
A
G
A
G
T
A
A
A
C
-
3
A
5
4/-
C/-
C
-
-
A/G
G/A
2
C
T
G
A