Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 333,173 (bp)   Positions: 567
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.208
.045
.206
.001
.002
.016
.0
.005
.001
.113
.0
.002
.0
.0
.008
.0
.0
.003
.001
.757
.893
.001
.009
.108
.001
.0
.0
.001
.014
.002
.105
.002
.005
.017
.047
.0
.02
.848
.963
.007
.0
.204
.001
.007
.001
.274
1.0
.005
.002
.039
.0
.08
.069
.054
.862
.049
.167
.0
.002
.012
.0
--
.007
.002
.002
.005
.949
.018
.038
.001
.443
.01
.002
.24
.015
.053
.0
.095
.001
.0
.071
.003
.062
.001
.149
.027
.019
.057
.025
.342
.095
.005
.008
.013
.061
.042
.015
.04
.001
.077
.0
.019
.003
.002
.001
.02
.009
.011
.001
.001
.0
.041
.165
.014
.002
.005
.848
.001
.0
.004
--
.003
.003
.0
.002
.242
.014
.07
.004
.0
.002
.011
.003
.001
.021
.003
.002
.004
.127
.019
.001
.003
.0
.0
.002
.055
.001
.001
.0
.001
.008
.355
.009
.05
.004
.0
.015
.0
.029
.0
.001
.074
.116
.001
.001
--
--
--
--
.027
.003
.001
.003
.001
.006
.0
.128
.018
.0
.001
.173
.217
.005
.715
.01
.003
.035
.107
.0
.005
.01
.0
.022
.016
.065
.067
.01
.001
.021
.191
.002
.001
.0
.0
.001
.028
.152
.0
.084
.022
.0
.0
.0
.078
.001
.091
.002
.0
.0
.2
.097
.009
.001
.01
.023
.001
.329
.252
.035
.08
.068
.02
.023
.056
.418
.111
.034
.013
.019
.002
.083
.063
.025
.008
.001
.006
.002
.002
.323
.015
.005
.0
.155
.004
.015
.0
--
--
--
--
.324
.011
.001
.006
.054
.03
.0
.0
.002
.004
.008
.029
.277
.188
.001
.001
.032
.033
.03
.023
.004
.0
.229
.013
.015
1.0
.0
.009
.0
.005
.0
.037
.0
.0
.001
.003
.003
.026
.008
.039
.026
.234
.003
.001
.008
.005
.224
.022
.0
.005
.002
.001
.013
.001
.0
.014
.187
.0
.001
.001
.0
.838
.003
.983
.02
.018
.0
.044
.002
.999
.394
.008
.0
.447
.445
.003
.236
.014
.007
.007
.007
.004
.0
.017
.003
.01
.002
.003
.001
.004
.007
.291
.002
.007
.011
.003
.001
.002
.001
.001
.005
.018
.005
.001
.056
.0
.0
.001
.001
.0
.002
.007
.004
.057
.025
.081
.05
.004
.123
.003
.936
.973
.007
.003
.0
.996
.003
.007
.0
.09
.0
.124
.0
.001
.105
.002
.001
.002
.005
.001
.001
.001
.0
.034
.0
.105
.014
.496
.131
.003
.003
.002
.198
.989
.0
.025
.0
.001
.006
.0
.0
.019
.001
.04
.008
.0
.001
.001
.001
.0
.0
.003
.274
.008
.03
.027
.002
.0
.0
.0
.006
.005
.004
.082
.414
.028
.003
.034
.0
.024
.002
.018
.0
.979
.002
.01
.346
.012
.094
.065
.006
.001
.0
.0
.004
.005
.003
.993
.868
.001
.001
.01
.001
.001
.004
.016
.03
.004
.005
.014
.001
.004
.004
.002
.005
.001
--
--
--
.0
.0
.0
.98
.923
.03
.001
.002
.0
.003
.004
.0
.014
.029
.0
.015
.001
.131
.034
.041
.0
.0
.54
.0
.0
.004
.011
.025
.118
.272
.008
.005
.0
.014
.013
.059
.003
.004
.549
.001
.001
.001
.009
.015
.172
.0
.029
.586
.01
.038
.008
.001
.006
.13
.093
.003
.0
.002
.0
.008
.434
.0
.015
.145
.432
.021
.873
.348
.917
.897
.0
.0
.009
.207
.0
.009
.01
.501
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
A
T
T
G
2
A
2
C
A
T
C
A
C
T
G
T
2
A
G
C
C
C
T
G
A
C
A
G
G
G
T
C
A
A
A
A
C
A
3
C
G
T
3
G
C
T
C
G
G
A
A
A
C
C
T
C
A
7
G
C
T
T
C
A
C
T
A
A
2
G
C
A
C
12
T
G
A
A
G
A
C
C
G
T
C
A
G
C
T
5
G
A
A
T
C
C
T
T
T
G
A
T
G
A
T
G
T
G
G
A
T
C
T
T
G
G
C
4
A
2
T
C
T
C
C
2
A
A
A
T
C
T
G
T
G
G
A
C
C
A
G
G
A
T
G
A
G
31
T
G
T
G
T
4
C
A
T
A
G
A
G
T
A
T
T
T
C
C
A
C
G
A
G
T
T
3
T
G
A
A
A
G
T
T
4
T
A
G
T
C
2
T
A
T
G
A
C
A
26
C
C
A
C
G
T
A
T
2
A
G
T
G
T
G
4
T
T
A
G
C
A
T
A
T
A
A
T
T
C
G
C
C
G
C
A
A
C
T
T
A
A
C
A
T
G
A
A
G
9
G
A
T
G
T
T
G
C
T
T
G
T
T
C
A
G
T
T
C
T
C
A
C
T
T
C
T
A
T
T
C
C
G
T
T
T
C
T
A
T
T
G
T
T
A
T
A
A
G
T
G
T
A
A
C
T
A
T
G
A
C
A
A
T
C
T
G
G
G
T
A
T
T
T
G
C
6
T
T
A
4
G
3
5
A
C
T
G
2
A
G
A
G
G
C
T
T
C
C
14
G
C
G
C
A
G
A
G
T
18
C
G
G
T
C
A
C
G
11
T
G
T
T
G
G
T
G
4
C
G
G
C
G
C
C
C
A
A
A
G
5
A
A
A
T
C
G
C
G
C
C
A
T
A
G
C
A
A
A
G
8
5
T
C
G
G
C
G
G
T
C
C
C
T
G
G
G
15
T
T
A
T
C
T
T
2
G
A
A
2
T
T
T
C
A
A
G
T
C
C
C
C
T
G
C
C
G
C
A
C
G
C
C
G
T
T
T
G
C
T
G
C
G
T
T
A
3
C
G
G
G
G
C
A
A
T
T
G
C
T
C
G
T
T
G
C
C
C
A
10
T
4
G
G
A
2
T
A
G
G
T
G
C
A
A
C
A
A
G
C
A
T
G
G
A
G
C
T
C
A
T
C
T
T
G
G
T
G
C
A
A
G
A
G
T
A
A
A
G
C
T
T
G
C
A
A
A
G
A
T
G
T
A
T
G
G
  204,718,393
  204,719,090
  204,720,929
  204,722,117
  204,722,650
  204,723,119
  204,723,836
  204,725,083
  204,725,188
  204,725,669
  204,726,039
  204,727,608
  204,728,526
  204,730,954
  204,731,597
  204,731,635
  204,731,701
  204,731,971
  204,732,298
  204,732,467
  204,732,868
  204,733,197
  204,734,059
  204,735,861
  204,736,665
  204,737,106
  204,739,788
  204,740,324
  204,740,991
  204,741,084
  204,742,136
  204,742,471
  204,743,530
  204,743,558
  204,743,697
  204,745,232
  204,748,239
  204,748,472
  204,749,012
  204,749,819
  204,749,988
  204,751,099
  204,751,204
  204,751,929
  204,752,267
  204,752,530
  204,752,933
  204,753,327
  204,753,599
  204,757,802
  204,758,004
  204,760,094
  204,761,776
  204,761,921
  204,761,924
  204,763,366
  204,763,407
  204,764,609
  204,764,739
  204,764,753
  204,766,473
  204,767,306
  204,767,417
  204,768,137
  204,768,854
  204,769,696
  204,770,568
  204,770,917
  204,771,302
  204,771,372
  204,771,554
  204,771,663
  204,772,001
  204,772,072
  204,772,858
  204,774,949
  204,778,407
  204,782,080
  204,783,135
  204,783,223
  204,783,445
  204,787,720
  204,787,861
  204,788,831
  204,789,098
  204,790,045
  204,791,037
  204,791,809
  204,792,030
  204,792,130
  204,792,223
  204,792,309
  204,792,886
  204,793,037
  204,793,080
  204,793,153
  204,793,182
  204,793,738
  204,794,335
  204,795,200
  204,795,327
  204,795,337
  204,795,826
  204,796,456
  204,796,497
  204,796,647
  204,796,688
  204,796,884
  204,796,907
  204,796,912
  204,797,646
  204,797,856
  204,797,870
  204,797,996
  204,798,138
  204,798,893
  204,800,092
  204,800,281
  204,800,837
  204,801,328
  204,801,355
  204,801,388
  204,801,389
  204,801,465
  204,802,221
  204,803,069
  204,803,343
  204,803,456
  204,803,489
  204,803,695
  204,804,482
  204,805,155
  204,805,551
  204,806,930
  204,807,703
  204,808,395
  204,808,763
  204,809,417
  204,809,471
  204,810,431
  204,810,626
  204,810,701
  204,810,708
  204,810,722
  204,810,777
  204,812,919
  204,813,583
  204,814,150
  204,814,164
  204,815,043
  204,815,179
  204,816,338
  204,816,738
  204,817,138
  204,818,113
  204,818,409
  204,818,440
  204,818,635
  204,819,048
  204,819,471
  204,819,904
  204,821,826
  204,821,837
  204,821,884
  204,821,885
  204,822,457
  204,822,491
  204,822,496
  204,822,562
  204,823,846
  204,824,696
  204,824,700
  204,824,747
  204,824,804
  204,825,000
  204,825,024
  204,825,068
  204,825,094
  204,825,270
  204,825,365
  204,825,497
  204,825,743
  204,825,850
  204,826,177
  204,827,063
  204,828,518
  204,829,429
  204,830,316
  204,831,821
  204,833,950
  204,834,125
  204,834,162
  204,834,731
  204,834,870
  204,835,107
  204,835,583
  204,835,677
  204,837,267
  204,837,504
  204,837,723
  204,838,157
  204,838,309
  204,838,325
  204,838,402
  204,840,176
  204,840,370
  204,840,442
  204,840,615
  204,841,003
  204,841,408
  204,842,507
  204,842,667
  204,843,654
  204,843,939
  204,844,452
  204,845,266
  204,845,305
  204,847,095
  204,848,448
  204,850,662
  204,860,385
  204,860,517
  204,864,110
  204,864,350
  204,865,353
  204,867,483
  204,868,708
  204,869,516
  204,869,607
  204,869,682
  204,869,897
  204,870,629
  204,870,661
  204,870,815
  204,870,862
  204,871,011
  204,871,626
  204,871,731
  204,872,032
  204,872,926
  204,873,116
  204,873,169
  204,873,174
  204,873,284
  204,873,904
  204,874,100
  204,874,534
  204,874,608
  204,874,763
  204,874,869
  204,875,067
  204,875,193
  204,875,473
  204,875,554
  204,877,316
  204,880,886
  204,881,199
  204,881,249
  204,881,333
  204,881,352
  204,881,398
  204,882,103
  204,882,142
  204,882,347
  204,882,787
  204,882,798
  204,883,005
  204,883,444
  204,883,664
  204,884,002
  204,884,682
  204,884,871
  204,885,387
  204,885,404
  204,885,490
  204,885,848
  204,885,999
  204,886,003
  204,886,005
  204,886,187
  204,886,443
  204,886,855
  204,886,977
  204,887,514
  204,887,783
  204,887,922
  204,888,392
  204,889,240
  204,889,313
  204,889,324
  204,889,330
  204,889,630
  204,889,726
  204,890,210
  204,890,294
  204,890,319
  204,890,333
  204,890,564
  204,890,572
  204,890,782
  204,890,856
  204,891,093
  204,891,465
  204,891,610
  204,891,995
  204,892,524
  204,892,545
  204,892,579
  204,893,103
  204,893,179
  204,893,534
  204,893,644
  204,893,695
  204,893,880
  204,894,001
  204,894,726
  204,894,765
  204,895,320
  204,895,604
  204,895,618
  204,897,559
  204,899,769
  204,900,636
  204,901,798
  204,902,756
  204,903,178
  204,904,057
  204,904,551
  204,904,664
  204,905,544
  204,905,869
  204,906,402
  204,906,507
  204,907,562
  204,907,566
  204,907,771
  204,908,217
  204,908,489
  204,909,629
  204,910,260
  204,910,537
  204,910,627
  204,911,354
  204,911,519
  204,912,190
  204,912,206
  204,912,240
  204,912,245
  204,912,274
  204,912,383
  204,912,386
  204,912,656
  204,912,727
  204,912,904
  204,912,920
  204,913,047
  204,913,079
  204,913,492
  204,914,012
  204,914,739
  204,915,012
  204,915,169
  204,915,177
  204,915,483
  204,916,288
  204,916,556
  204,916,839
  204,917,999
  204,918,280
  204,918,285
  204,918,429
  204,918,518
  204,918,667
  204,918,977
  204,919,143
  204,921,064
  204,921,120
  204,921,170
  204,921,802
  204,922,296
  204,923,113
  204,923,132
  204,923,296
  204,923,373
  204,923,902
  204,924,428
  204,924,781
  204,925,465
  204,925,610
  204,925,628
  204,925,786
  204,926,308
  204,926,335
  204,926,344
  204,926,641
  204,926,810
  204,927,276
  204,927,539
  204,928,525
  204,929,431
  204,929,598
  204,929,810
  204,930,027
  204,930,139
  204,931,058
  204,931,166
  204,931,221
  204,931,906
  204,931,953
  204,932,119
  204,932,148
  204,934,652
  204,937,267
  204,937,545
  204,937,987
  204,940,597
  204,940,611
  204,941,048
  204,941,539
  204,942,122
  204,943,265
  204,943,450
  204,944,257
  204,945,236
  204,947,324
  204,947,808
  204,950,509
  204,950,977
  204,951,843
  204,954,545
  204,956,377
  204,956,789
  204,956,896
  204,957,939
  204,961,677
  204,962,133
  204,965,351
  204,965,358
  204,965,361
  204,968,733
  204,974,462
  204,975,767
  204,975,895
  204,976,680
  204,978,599
  204,978,634
  204,978,661
  204,978,778
  204,978,980
  204,980,278
  204,980,420
  204,980,708
  204,980,850
  204,981,254
  204,982,070
  204,982,265
  204,982,547
  204,983,457
  204,983,706
  204,984,137
  204,985,368
  204,985,549
  204,987,044
  204,989,588
  204,991,594
  204,993,018
  204,993,019
  204,993,084
  204,993,388
  204,994,810
  204,995,530
  204,995,586
  204,996,110
  204,998,953
  204,999,625
  204,999,944
  205,000,428
  205,000,560
  205,000,789
  205,000,859
  205,001,071
  205,001,073
  205,001,074
  205,001,168
  205,001,178
  205,001,268
  205,007,672
  205,007,818
  205,008,046
  205,009,103
  205,009,440
  205,009,812
  205,009,905
  205,010,005
  205,010,137
  205,010,387
  205,010,648
  205,010,683
  205,010,719
  205,010,788
  205,010,980
  205,010,991
  205,011,152
  205,013,891
  205,015,486
  205,015,796
  205,018,320
  205,018,321
  205,018,866
  205,019,638
  205,020,772
  205,020,825
  205,020,866
  205,021,014
  205,021,837
  205,021,991
  205,022,289
  205,023,083
  205,023,365
  205,023,693
  205,024,515
  205,024,989
  205,026,496
  205,026,571
  205,026,974
  205,027,792
  205,027,861
  205,028,534
  205,028,897
  205,029,074
  205,029,083
  205,030,180
  205,030,575
  205,031,106
  205,031,295
  205,031,395
  205,032,135
  205,034,568
  205,034,871
  205,035,839
  205,036,145
  205,036,391
  205,036,677
  205,036,695
  205,037,226
  205,037,232
  205,037,236
  205,040,102
  205,040,154
  205,041,061
  205,041,080
  205,041,517
  205,041,661
  205,041,700
  205,041,760
  205,041,785
  205,041,922
  205,042,400
  205,042,407
  205,043,027
  205,043,045
  205,043,279
  205,043,387
  205,044,933
  205,045,013
  205,045,119
  205,046,315
-
C
G
C
9
A
-
G
-
T
G
G
T
G
3
C
A
C
-
15
3
A
A
2
2
3
G
2
G
A
A
A
C
T
2
2
G
T
A
G
-
T
T
-
-
A
T
C
T
A
A
G
G
T
G
A
A
T
C
-
A
A
-
C
T
G
G
7
T
T
-
A
T
G
T
-
C
T
G
G
C
C
T
T
A
2
T
T
A
T
C
-
T
C
G
T/C
7
T
G
A
2
2
G
G
T
G
G
A
C
A
A
2
C
T
2
C
T
A
T
-
A/G
2/-
T/G
T
C
T
3
-
-
G
G
C
T
G
A
C
A
3
2
A
A
G
A
A
2
3
A
T
A
-
C
9
G
A
G
-
G
G
2
C
A
G
T
A
G
C
C
G
T
G
G
G
C
T
-
C
C
-
G
T
C
-
C
A
C
C
-
C
G
A
C
T
-
C
G
G
A
C
G
2
-
T
T
G
T
A
C
G
C
-
G
A
G
-
G
A
-
C
C
G
2
T
G
G
T
C
G
G
C
C
T
A
T
T
A
A
G
T
A
C
C
G
C
T
G
C
A
2
G
3
-
A
2
A
A
G
3
A
G
A
C
A
C
C
T
C
T
C
C
T
C
A
G
T
G
-
-
5
2
A
C
T
T
A
C
C
C
T
5
G
A
A
A
C
C
T
4
G
G
A
4
A
C
G
G
A
C
G
C
C
G
T
G
G
C
T
G
-
T
T
C
C
-
G
C
T
T
-
C
C
2
-
A
-
-
G
T
-
A
-
C
A
G
A
A
A
2
13
T
T
-
A
T
-
4
G
A
G
A
3
-
7
3
A
C
T
G
T
-
-
C
A
C
C
A
A
A
T
-
T
2
A
T
T
T
T
T
G
G
-
A
-
2
C
G
C
-
A
T
A
T
T
T
C
G
A
T
G
G
C
2
8/-
-
-
T
2
2
G
A
A
C
T
T
A
C
A
A
T
-
C
C
G
C
T
A
C
-
-
2
G
-
A
C
A
T
G
G
T
A
A
T
A
T
C
A
T
T
T
T
G
T
A
T
T
A
T/2
A
A
A
T
C
A
-
A
G
C
G
-
T
A
-
2
T
T
G
G
-
-
2
T
A
2
A
G
G
A
T
G
T
-
-
A
-
A
A
G
-
6
-
A
A
2
2
T
G
G
A
G
G
T
T
G
A
T
A
G
A
T
G
G
G
A
T
A
C
A
A
A
A
T
G
T
A
G
A
G
G
G
G
C
T
-
-
A
T
-
G
C
A
-
G
-
A
T
C
A
A