Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 81,952 (bp)   Positions: 200
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.001
.0
.002
.077
.001
.001
.001
.173
.575
.002
.005
.67
.003
.114
.528
.093
.084
.009
.047
.001
.122
.177
.179
.183
.185
.133
.007
.021
.014
.001
.02
.043
.014
--
.272
--
--
--
.003
.005
.116
.069
.049
.4
.805
.118
.288
.081
.033
.141
.004
--
--
--
.005
.02
.001
.023
.004
.047
.118
.138
.007
.597
.001
.066
.054
.0
.008
.131
.001
.035
.0
.999
.216
.796
.185
.023
.0
.006
.001
.027
.005
.081
.055
.05
.174
.069
--
--
--
.013
.052
.028
.08
.005
.009
.055
.024
.046
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.228
.001
.363
.016
.104
.009
.001
.004
.005
.001
.041
.0
.081
.071
--
--
--
--
--
--
.002
.056
.013
.004
.003
.002
.006
1.0
.031
.005
.251
.027
.114
--
.42
.001
.017
.087
--
--
--
--
--
--
.002
.029
.079
.983
.0
.016
--
.043
.001
.274
.005
.055
.098
.387
.099
.001
.001
.455
.156
.001
.718
.005
.02
.0
.004
.739
.0
.003
.002
.008
.012
.001
.253
.027
.022
.013
.004
.031
.084
.012
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
Hfm1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
C
T
G
A
T
A
T
A
T
A
C
C
C
G
C
2
A
G
A
T
A
2
G
A
G
C
A
A
C
A
4
G
T
A
4
3
A
A
A
8
C
C
A
G
C
T
T
T
A
C
T
2
G
C
A
G
T
A
C
G
G
C
A
T
A
T
C
T
C
A
A
A
T
T
C
G
C
A
A
C
G
T
A
T
T
A
C
C
C
A
G
A
G
T
T
7
C
C
A
C
G
A
C
G
2
G
C
T
C
T
T
A
G
A
A
T
A
A
A
A
G
A
T
C
2
G
G
G
A
C
T
C
A
C
A
A
C
8
A
A
T
A
2
T
T
G
C
A
G
C
T
C
T
G
C
T
2
C
C
A
3
T
C
A
G
G
G
C
G
C
C
T
C
A
C
A
C
C
G
C
G
T
T
T
C
T
C
T
A
7
A
C
T
A
T
G
A
C
  3,876,243
  3,876,363
  3,876,373
  3,876,384
  3,876,389
  3,876,402
  3,876,404
  3,876,406
  3,877,099
  3,877,497
  3,877,879
  3,877,923
  3,878,424
  3,879,288
  3,879,566
  3,879,840
  3,880,000
  3,880,003
  3,880,639
  3,880,756
  3,882,458
  3,882,754
  3,882,773
  3,882,775
  3,882,779
  3,882,785
  3,882,812
  3,883,916
  3,884,330
  3,884,331
  3,884,794
  3,884,891
  3,886,585
  3,886,862
  3,887,233
  3,887,515
  3,887,671
  3,887,672
  3,887,779
  3,887,800
  3,888,917
  3,889,204
  3,889,223
  3,889,579
  3,890,655
  3,890,886
  3,891,647
  3,891,769
  3,891,894
  3,892,099
  3,893,140
  3,893,391
  3,893,765
  3,893,790
  3,893,803
  3,895,849
  3,896,967
  3,897,583
  3,900,989
  3,901,413
  3,902,357
  3,902,366
  3,902,368
  3,902,412
  3,902,482
  3,903,300
  3,903,351
  3,903,724
  3,906,043
  3,906,349
  3,906,924
  3,907,407
  3,907,419
  3,908,091
  3,908,356
  3,909,666
  3,910,042
  3,910,369
  3,911,135
  3,911,213
  3,911,579
  3,911,693
  3,911,730
  3,912,203
  3,912,357
  3,912,363
  3,912,374
  3,912,382
  3,912,403
  3,912,432
  3,912,461
  3,912,469
  3,912,478
  3,912,498
  3,912,756
  3,912,866
  3,912,943
  3,912,992
  3,913,078
  3,913,133
  3,913,307
  3,914,189
  3,914,238
  3,914,811
  3,915,142
  3,915,369
  3,915,533
  3,915,567
  3,915,730
  3,916,284
  3,916,483
  3,917,273
  3,918,002
  3,918,242
  3,919,136
  3,919,173
  3,920,860
  3,923,112
  3,923,971
  3,925,055
  3,926,198
  3,927,080
  3,927,113
  3,927,200
  3,927,747
  3,927,925
  3,928,750
  3,928,840
  3,928,991
  3,929,366
  3,929,401
  3,930,115
  3,930,858
  3,930,879
  3,930,983
  3,931,144
  3,931,949
  3,932,209
  3,932,657
  3,932,725
  3,935,043
  3,935,443
  3,935,502
  3,935,817
  3,937,783
  3,938,204
  3,938,470
  3,938,706
  3,938,896
  3,939,117
  3,939,486
  3,940,021
  3,940,656
  3,940,764
  3,940,801
  3,940,804
  3,940,859
  3,940,873
  3,940,887
  3,940,891
  3,940,992
  3,941,557
  3,942,503
  3,943,158
  3,943,216
  3,943,586
  3,944,269
  3,944,712
  3,945,521
  3,946,533
  3,947,592
  3,947,618
  3,947,628
  3,947,754
  3,947,758
  3,947,767
  3,947,835
  3,947,954
  3,948,701
  3,948,747
  3,948,810
  3,948,844
  3,949,380
  3,949,482
  3,950,791
  3,951,028
  3,951,177
  3,951,811
  3,952,121
  3,952,224
  3,952,529
  3,953,681
  3,953,722
  3,953,756
  3,955,400
  3,955,715
  3,956,063
  3,957,124
  3,957,330
  3,958,158
C
G/2
C/G
T/C
G/A
A/-
T/-
G
C
C
C
-
-
T
A
A
3
2/-
T
3
T
T/A
A/G
2/-
G/-
A/G
G/A
T
T
C
T
G
-
T
-
G
4/-
3/-
C
T
G
-
C/G
T
G
A
T
G
C
A
T
4
C
2/-
C
T
-
A
C
G
A
A
A
T
4
G
G
C
3
C
2
A/G
-
G
C
C
T
A
G
-
2
3
A
C
T
C
T/C
A/G
C/T
C/T
C/T
A/G
G/T
A/G
2
-
-
-
T
T
-
2
A
G
C/T
G/2
2/-
G/A
2
C
T
2
2
T
C
G
G
C
G
G
G
11
G/A
G
C
T
-
A
T
C
G
T
C
T
6
T
G
G
T
-
C
T
C
T
-
C
C
A
A
G
A
T
C
T
2
3
T
T/C
-
C/A
-
3
-
C
T
G
A
3/GA
A
T
2
T
T
C
T
G
G
C
A
A
T
G
A
C
A
-
T
A
G
C
G
-
C
A
C
G
C
A
2
T