Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 49,455 (bp)   Positions: 302
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.005
.021
.019
.004
.007
.024
.03
.031
.233
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.012
.034
.011
.03
.203
.196
.014
.002
.004
.016
.005
.022
.132
.03
.052
.091
.001
.001
.0
.003
.001
.013
.022
.001
.0
.0
.001
.227
.225
.004
.01
.033
.001
.001
.392
.196
.236
.077
.119
.054
.061
.035
--
.03
.334
.41
.056
.053
.058
.307
.346
.533
.699
.592
.548
.27
.304
.028
.012
.009
.02
.042
.125
.013
.005
.002
.004
.005
.03
.284
.291
.294
.206
.195
.01
.006
.032
.023
.045
.008
.045
.577
.71
.713
.471
.266
.89
.011
.019
.029
.034
.016
.014
.012
.011
.008
.095
.066
.023
.007
.317
.23
.006
.007
.035
.019
.204
.01
.035
.038
--
.003
.01
.004
.012
.102
.004
.053
.001
.237
.0
.113
.015
.033
.0
.0
.0
.007
--
.111
.0
.0
.0
.0
.017
.022
.004
--
.001
.023
.004
.005
.079
.086
.004
.0
.041
.038
.005
.001
.002
.003
.004
.003
.013
.001
.003
.0
.0
.013
.0
.001
.001
.001
.0
.001
.001
.097
.031
.001
.002
.002
.006
.008
--
--
.003
.0
.005
.004
.004
.01
.02
.004
.003
--
--
--
.004
.008
.023
.059
--
--
.018
.02
.152
.297
.05
.658
.662
.054
.231
.0
.002
.001
.002
.001
.0
.002
.0
.0
.016
.042
--
--
--
--
.005
.01
.033
.026
.054
.012
.018
.002
.001
.092
.034
.001
.004
.003
.012
.003
.006
.315
.042
.048
.558
.297
.019
.041
.002
.018
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.186
.79
.18
.017
.488
.076
.056
.024
.061
.012
.014
.068
.05
.383
.114
.077
.002
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
Havcr1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
A
G
C
G
T
G
C
G
A
T
C
2
A
A
C
C
G
G
T
C
A
G
5
C
T
A
C
G
C
C
A
C
G
A
T
G
G
A
G
2
C
G
T
A
A
A
C
A
A
C
G
C
A
G
C
T
T
A
T
G
A
T
G
A
122
C
C
T
G
G
A
G
A
T
C
A
C
A
G
C
T
G
A
C
T
4
T
G
A
T
23
G
A
A
C
A
C
C
A
3
G
C
G
C
G
C
A
G
C
A
T
C
G
A
T
G
T
G
G
G
A
C
G
T
A
C
C
2
T
G
C
A
A
A
8
6
T
G
C
G
G
G
T
G
G
A
T
G
T
A
C
39
A
A
A
A
G
14
T
C
G
T
G
C
G
C
G
G
C
4
A
T
A
G
C
T
G
T
G
C
T
C
T
G
A
C
G
A
G
G
6
C
G
G
C
G
T
T
C
C
G
T
G
A
T
T
G
G
T
G
G
G
G
T
T
A
A
A
C
C
C
G
G
4
T
T
C
G
C
T
A
C
G
G
C
T
A
20
T
C
5
C
T
C
T
C
A
C
G
C
C
T
C
T
G
G
A
G
C
G
T
T
C
T
T
G
A
A
T
C
T
T
T
A
C
G
G
A
A
A
T
A
A
A
C
A
C
T
C
4
G
A
A
C
2
T
G
A
T
G
  31,632,940
  31,632,957
  31,632,960
  31,632,972
  31,632,987
  31,632,990
  31,632,992
  31,632,993
  31,633,011
  31,633,556
  31,633,586
  31,633,611
  31,633,632
  31,633,719
  31,633,768
  31,633,788
  31,633,838
  31,633,843
  31,633,862
  31,633,912
  31,633,921
  31,633,927
  31,633,940
  31,633,997
  31,634,003
  31,634,263
  31,634,320
  31,634,323
  31,634,376
  31,634,381
  31,634,468
  31,634,531
  31,634,548
  31,634,631
  31,634,702
  31,634,713
  31,634,775
  31,634,795
  31,634,797
  31,634,808
  31,634,839
  31,634,842
  31,634,908
  31,634,961
  31,635,001
  31,635,026
  31,635,033
  31,636,443
  31,636,504
  31,636,505
  31,636,542
  31,636,652
  31,636,653
  31,636,707
  31,636,717
  31,637,010
  31,637,062
  31,637,068
  31,637,180
  31,637,229
  31,637,269
  31,637,397
  31,637,555
  31,637,643
  31,637,673
  31,637,705
  31,637,852
  31,638,062
  31,638,174
  31,638,301
  31,638,375
  31,638,380
  31,638,416
  31,638,503
  31,638,504
  31,638,562
  31,638,602
  31,638,614
  31,638,616
  31,638,629
  31,638,632
  31,638,725
  31,638,738
  31,638,746
  31,638,780
  31,638,812
  31,638,890
  31,638,896
  31,638,900
  31,638,917
  31,638,920
  31,638,984
  31,638,994
  31,639,130
  31,639,146
  31,639,153
  31,639,191
  31,639,204
  31,639,269
  31,639,273
  31,639,291
  31,639,295
  31,639,366
  31,639,408
  31,639,452
  31,639,497
  31,639,508
  31,639,509
  31,639,537
  31,639,552
  31,639,749
  31,639,925
  31,640,022
  31,640,113
  31,640,117
  31,640,126
  31,640,129
  31,640,130
  31,640,149
  31,640,158
  31,640,180
  31,640,261
  31,640,269
  31,640,272
  31,640,501
  31,640,502
  31,640,610
  31,640,630
  31,640,867
  31,640,949
  31,641,056
  31,641,144
  31,641,157
  31,641,361
  31,641,912
  31,642,335
  31,642,351
  31,642,353
  31,642,711
  31,643,310
  31,644,031
  31,644,135
  31,644,270
  31,644,677
  31,645,324
  31,645,797
  31,645,914
  31,646,000
  31,647,013
  31,647,016
  31,647,024
  31,647,206
  31,647,540
  31,648,038
  31,648,325
  31,648,328
  31,648,330
  31,648,331
  31,648,339
  31,648,699
  31,649,052
  31,649,478
  31,650,398
  31,651,242
  31,651,353
  31,651,812
  31,652,880
  31,652,882
  31,652,965
  31,653,061
  31,654,107
  31,654,121
  31,654,221
  31,654,249
  31,654,255
  31,654,387
  31,654,389
  31,654,994
  31,655,076
  31,657,059
  31,658,042
  31,658,157
  31,658,323
  31,658,882
  31,658,988
  31,659,812
  31,659,840
  31,659,894
  31,659,907
  31,659,909
  31,659,910
  31,659,963
  31,659,969
  31,659,981
  31,660,186
  31,660,419
  31,660,455
  31,661,936
  31,662,125
  31,662,412
  31,662,598
  31,662,886
  31,662,920
  31,663,034
  31,663,085
  31,663,483
  31,663,776
  31,663,800
  31,664,373
  31,664,476
  31,664,498
  31,664,545
  31,664,658
  31,664,668
  31,664,857
  31,664,949
  31,665,234
  31,665,684
  31,665,911
  31,666,143
  31,666,274
  31,666,513
  31,666,581
  31,666,759
  31,666,763
  31,666,795
  31,666,922
  31,667,058
  31,667,288
  31,667,292
  31,667,340
  31,667,397
  31,667,769
  31,667,997
  31,668,040
  31,668,617
  31,668,793
  31,669,145
  31,669,326
  31,669,384
  31,669,466
  31,669,556
  31,669,694
  31,669,814
  31,670,011
  31,670,018
  31,670,021
  31,670,143
  31,670,308
  31,670,328
  31,670,374
  31,670,486
  31,670,726
  31,670,777
  31,670,848
  31,670,877
  31,671,308
  31,671,348
  31,672,182
  31,672,271
  31,672,546
  31,672,854
  31,673,301
  31,673,340
  31,673,780
  31,673,882
  31,674,200
  31,674,374
  31,674,383
  31,675,270
  31,675,658
  31,675,734
  31,676,552
  31,677,015
  31,677,213
  31,677,308
  31,677,514
  31,677,516
  31,677,561
  31,678,090
  31,678,555
  31,678,651
  31,679,244
  31,679,336
  31,679,410
  31,679,428
  31,679,479
  31,679,554
  31,679,581
  31,679,724
  31,679,811
  31,679,876
  31,679,927
  31,680,021
  31,680,310
  31,680,381
  31,680,547
  31,680,609
  31,681,076
  31,681,516
  31,681,594
  31,681,931
C
T
G
A
A
A
C
T
G
A
G
A
G
-
C
G
T
A
A
A
C
A
G
A
-
A
C
4
A
A
A
T
G
A
-
G
C
C
C
G
-
-
G
A
C
G
G
G
T
G
G
A
T
T
G
A
T
C
C
T
G
C
-
A
T
G
-
T
A
9
A
A
T
C
T
C
T
T
G
G
A
T
C
A
G
T
C
-
5
C
C
-
-
A
T
C
T
C
-
10
41
-
A
T
A
A
T
T
C
A
3
C
A
-
-
G
C
A
A
A
A
A
T
A
2
22
G
T
C/2
-
C
C
T
C
-
T
8/-
6/-
C
A
9
A
T
A
G
A
C
G
2
T
5
G
T
-
G
2
G
T
T
-
-
A
C
82
A
T
A
T
C
T
A
4/-
G
G
G
T
T
C
T
2
3
A
G
G
C
G/-
A/-
C/2
-/A
A/G
G/2
G/3
6/-
C/2
A
A
T
A
A
-
A
T
2
C
A
C
C
C
A
T
G
T
A
A
A
C
2
2
20
C
T
T
T
G/3
17
-
2
3
G
T
T
C
G
T
A
A
T
C
2
-
C
T
-
A
C
T
C
G
3
T
A
7
C/-
A
T
C
A
T
13
T
T
A
C
G
T
G
C
T
G
G
G
3
C
C
G
G
T
A
C
C
G
G
C
C
G
G
T
G
T
C
T
-
A
G
T
T
-
C
T
T
C
A