Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 94,751 (bp)   Positions: 309
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.0
.0
.947
.005
.001
.016
.009
--
.049
.318
.418
.415
.134
.105
.004
.015
.006
.004
.165
.023
.001
.033
.126
.123
.009
.99
.0
.0
.006
.198
.051
.001
.0
.242
.374
.0
.0
.0
.001
.0
.066
.012
.015
.007
.022
.001
.139
.003
.002
--
--
--
.022
.025
.322
.001
.015
.001
.0
.001
.0
.001
.159
.011
--
.001
.002
.034
.02
.023
.143
.029
.002
.0
.0
.013
.133
.009
.421
.0
.005
.005
.0
.005
.007
.006
.07
.006
.002
.001
.002
.004
.007
.0
.252
.01
.004
.005
.002
.304
.001
.001
.019
.012
.124
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.294
.007
.0
.005
.001
.0
.032
.0
.0
.009
.003
.001
.001
.17
.001
.041
.268
.005
.004
.164
.119
.091
.007
.21
.343
.308
.04
.032
.228
.034
.929
.003
.21
.0
.002
.013
.002
.969
.0
--
--
--
.005
.162
.003
.0
.0
.002
.123
.005
--
--
.0
.003
.003
.013
.118
.134
.001
.062
.002
.001
.001
.006
.008
.999
.977
.001
.001
.003
.005
.0
.004
.011
.002
.001
.0
.001
.003
.001
.001
.014
.075
.074
.173
.182
.18
.016
.024
.149
.046
.053
.053
.009
.039
--
--
--
--
--
.127
.034
.034
.034
.07
.067
.424
.027
.998
.99
.537
.345
.467
.401
.059
.09
.017
.071
.019
.047
.066
--
.036
.005
.004
.031
.024
.004
.033
.006
.026
.0
.001
.019
.001
.0
.57
.616
.597
.049
.002
.08
.088
.001
.008
--
.006
.032
.024
.0
.006
.001
.002
.001
.011
.241
--
.044
.059
.108
.046
.034
.021
.19
.085
--
.008
.154
--
.04
.001
.002
.001
.002
.026
.001
.03
.001
.025
.013
.014
.005
.003
--
--
--
.252
.838
.001
.005
--
.006
.058
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
C
C
T
C
C
A
C
T
A
T
A
A
A
C
G
C
G
4
2
G
C
A
T
G
A
C
A
T
G
C
T
C
T
A
A
C
T
C
A
A
C
8
C
T
C
A
C
C
G
A
G
A
G
T
T
A
A
T
T
G
T
C
C
C
A
T
A
G
T
G
A
A
2
C
A
T
A
C
G
A
T
C
T
C
T
G
G
T
T
T
T
T
T
T
C
G
A
A
C
A
C
T
A
T
G
C
A
T
A
A
T
G
A
T
C
A
15
T
T
C
A
C
T
G
A
T
T
T
T
T
A
G
A
G
G
T
3
G
A
C
G
G
T
T
C
C
A
A
A
5
G
T
G
A
C
C
G
A
G
A
C
14
G
T
C
A
G
A
64
C
A
G
2
T
4
T
G
C
C
16
G
G
A
C
C
A
A
C
G
C
G
C
A
C
G
A
C
A
15
14
G
G
G
T
C
A
C
G
T
A
G
G
A
C
A
T
C
A
T
T
A
C
C
A
C
A
3
T
G
G
A
2
T
A
6
A
A
G
10
A
T
C
C
G
A
G
C
G
T
G
A
C
40
11
T
C
G
A
G
A
C
A
T
G
G
G
T
G
T
T
C
C
T
T
A
A
G
A
A
C
C
A
G
C
G
3
C
A
A
T
18
A
A
G
G
4
C
C
G
6
4
C
G
A
C
G
A
T
G
  10,417,275
  10,417,626
  10,419,039
  10,419,533
  10,420,133
  10,422,299
  10,423,118
  10,423,237
  10,424,318
  10,426,514
  10,428,475
  10,428,616
  10,428,617
  10,429,094
  10,430,457
  10,430,810
  10,430,828
  10,437,240
  10,437,242
  10,438,647
  10,439,908
  10,440,850
  10,441,929
  10,442,231
  10,442,263
  10,444,324
  10,445,027
  10,445,941
  10,446,150
  10,446,288
  10,446,339
  10,447,298
  10,447,720
  10,448,175
  10,448,191
  10,448,604
  10,448,864
  10,448,946
  10,448,993
  10,449,203
  10,449,221
  10,449,417
  10,449,785
  10,450,101
  10,450,194
  10,451,320
  10,451,764
  10,452,304
  10,452,958
  10,454,002
  10,454,787
  10,454,788
  10,454,976
  10,456,926
  10,457,042
  10,457,185
  10,457,269
  10,457,408
  10,458,411
  10,458,651
  10,458,652
  10,458,708
  10,458,723
  10,459,004
  10,459,039
  10,459,210
  10,459,493
  10,459,500
  10,459,520
  10,459,626
  10,459,678
  10,460,030
  10,460,039
  10,460,067
  10,460,090
  10,460,093
  10,460,153
  10,460,198
  10,460,224
  10,460,247
  10,460,489
  10,460,719
  10,460,726
  10,460,845
  10,461,200
  10,461,242
  10,461,295
  10,461,359
  10,461,371
  10,461,373
  10,461,374
  10,461,377
  10,461,379
  10,461,380
  10,461,381
  10,461,459
  10,461,603
  10,461,815
  10,461,816
  10,461,949
  10,461,985
  10,462,277
  10,462,734
  10,462,903
  10,462,975
  10,463,031
  10,463,135
  10,463,466
  10,463,737
  10,463,870
  10,463,973
  10,464,000
  10,464,249
  10,464,275
  10,465,834
  10,465,882
  10,466,835
  10,467,064
  10,467,117
  10,467,130
  10,467,181
  10,467,185
  10,467,219
  10,467,247
  10,467,255
  10,467,270
  10,467,311
  10,467,381
  10,467,382
  10,467,417
  10,467,637
  10,467,793
  10,467,856
  10,467,903
  10,467,927
  10,468,044
  10,468,105
  10,468,276
  10,468,332
  10,468,588
  10,468,601
  10,468,621
  10,468,758
  10,468,759
  10,468,884
  10,469,085
  10,469,233
  10,469,285
  10,469,296
  10,469,409
  10,469,415
  10,469,645
  10,470,192
  10,470,906
  10,470,999
  10,473,976
  10,473,994
  10,474,000
  10,474,262
  10,475,934
  10,476,127
  10,476,837
  10,476,969
  10,477,031
  10,477,338
  10,477,365
  10,477,653
  10,477,867
  10,478,243
  10,478,482
  10,478,724
  10,479,381
  10,480,124
  10,480,191
  10,481,161
  10,481,709
  10,481,766
  10,481,797
  10,481,874
  10,481,914
  10,482,286
  10,482,508
  10,482,538
  10,482,595
  10,482,961
  10,482,966
  10,482,969
  10,483,031
  10,483,123
  10,483,224
  10,483,234
  10,483,236
  10,483,284
  10,483,439
  10,483,643
  10,483,702
  10,483,807
  10,483,831
  10,483,873
  10,483,874
  10,483,935
  10,483,939
  10,483,940
  10,483,982
  10,483,986
  10,484,121
  10,484,159
  10,484,161
  10,484,324
  10,484,336
  10,484,520
  10,484,563
  10,484,649
  10,484,728
  10,484,731
  10,484,812
  10,484,815
  10,484,850
  10,484,851
  10,484,863
  10,485,021
  10,485,024
  10,485,077
  10,485,127
  10,485,921
  10,485,948
  10,486,221
  10,486,229
  10,487,381
  10,487,393
  10,487,492
  10,488,316
  10,488,449
  10,488,693
  10,488,786
  10,488,893
  10,488,906
  10,489,102
  10,489,294
  10,489,535
  10,489,625
  10,489,682
  10,489,969
  10,490,205
  10,490,224
  10,490,448
  10,490,714
  10,491,019
  10,491,241
  10,491,349
  10,491,593
  10,491,825
  10,494,008
  10,494,109
  10,494,484
  10,494,521
  10,494,532
  10,494,552
  10,494,556
  10,494,626
  10,494,741
  10,494,793
  10,495,128
  10,495,173
  10,495,177
  10,495,194
  10,495,825
  10,495,905
  10,496,015
  10,496,280
  10,496,341
  10,496,357
  10,496,570
  10,497,020
  10,497,120
  10,497,472
  10,497,501
  10,497,667
  10,497,743
  10,498,589
  10,498,799
  10,499,163
  10,499,248
  10,500,470
  10,500,540
  10,500,915
  10,501,082
  10,501,503
  10,501,522
  10,502,014
  10,502,706
  10,502,864
  10,503,820
  10,504,056
  10,505,239
  10,505,265
  10,505,813
  10,507,151
  10,507,793
  10,508,036
  10,508,038
  10,508,462
  10,508,620
  10,508,637
  10,508,837
  10,508,991
  10,509,631
  10,510,493
  10,510,766
T
T
C
?
T
G
C/6
C
4
C
G
A/2
4/6
T
A
T
A
4/-
2/-
2
T
C
C
13
2
G
C
5
C
2
5
7
C
G
G
3
C
T
G
G
G
-
A
4
G
G
T
T
A
G
A
2
A
2
C
T
G
C
G
C
C
T
T
T
-
C
G
A
C
A
G
-
-
T
G
A
C
28
7
G
C
T
A
T
C
T
2
C
15
G
13
3
G
4
9
A
G
G
T
G
T
C
T
C
C
T
37
2
G
G
C
T
T
C
3
-
-
C
C
T
G
T
5
T
T
C
G
2
A
C
G
2
G
C
A
C
-
A
T
-
C
T
2
C
T
G
2
G
G
-
-
C
A
-
T
3
A
G
C
C
T
-
A
G
T
G
T
T
-
T
T
A
-
C
-
19
2
T
T
-
T
A
G
T
A
G
G
G
A
A
A
G
G
T
C
G
A
G
15/-
14/-
-
5
A
C
T
G
T
A
A
G
T
A
G
G
G
C
T
G
11
C
G
T
2
2
T
C
-
A
A
A
G
-
2
C
-
2
2
A
-
G
C
G
T
T
G
A
T
A
C
T
G
G
-
-
5
9
A
G
A
C
2
-
14
A
A
A
A
T
C
G
A
A
G
C
A/10
13
A
G
G
T
-
G
A
T
G/-
-
A
G
G
C
-
G
5/13
A
A
-
T
T
T
6/-
4/-
A
4
T
A
T
-
5
A