Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 94,751 (bp)   Positions: 310
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.009
.001
.0
.002
.0
.0
.947
.006
.022
.868
.002
.003
.001
.261
.004
.001
.175
.007
.001
.001
.001
.121
--
.0
.001
.001
.003
.076
.057
.049
.001
.0
.003
.0
.001
.049
.125
.105
.001
.0
.0
.0
.036
.006
.004
.321
.263
.001
.002
.033
.126
.123
.061
.6
.168
.009
.002
.0
.007
--
.025
.057
.006
.051
.046
.256
.0
.242
.374
.0
.066
.089
.015
.003
.022
.143
.012
.001
.016
.009
.091
.159
.011
--
.001
.002
.034
.02
.023
.143
.029
.002
.0
.0
.013
.133
.007
.009
.421
.0
.005
.005
.005
.007
.006
.07
.006
.002
.001
.002
.004
.007
.0
.01
.355
.004
.005
.002
.304
.001
.001
.019
.012
.124
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.0
.005
.001
.0
.032
.0
.0
.009
.003
.001
.001
.17
.003
.001
.041
.268
.005
.004
.164
.15
.177
.467
.091
.007
.159
.04
.032
.003
.001
.002
.001
.834
.969
.0
.098
.099
.043
--
--
--
--
.001
.0
.0
--
--
.002
.118
.132
.134
.062
.008
.001
.0
.011
.002
.001
.0
.001
.001
.001
.014
.06
.173
.182
.18
.016
.015
.024
.06
.149
.046
.053
.053
.009
.039
--
--
.034
.003
.003
.002
.424
.027
1.0
.998
1.0
.999
1.0
.771
.778
.857
.998
1.0
.99
--
.537
.345
.144
.317
.059
.141
.002
.268
.071
.047
.047
--
--
.064
.092
.003
.004
.006
.003
.001
.003
.011
.01
.001
.002
.005
.0
.001
.0
.001
.025
.026
.444
.441
.587
.604
.08
.001
.001
.008
.006
.001
.006
.001
.011
.154
.241
--
.058
.044
.13
.069
.045
.034
.208
.181
.381
--
.008
.154
.017
.04
.001
.002
.001
.002
.001
.131
.025
.013
.021
.005
--
--
--
--
.003
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
Gsap
C
C
T
G
C
T
T
C
C
G
A
2
T
T
G
G
C
G
T
A
T
C
A
A
G
A
T
T
C
A
T
T
G
T
C
G
C
T
G
A
T
G
T
207
4
2
C
A
A
G
T
G
A
G
T
2
C
G
C
A
2
4
2
C
C
2
T
A
A
C
A
8
6
T
G
T
4
G
T
A
C
G
C
A
T
A
G
T
G
A
A
2
C
A
T
A
C
A
G
A
T
C
T
T
G
G
T
T
T
T
T
T
T
C
A
G
A
C
A
C
T
A
T
G
C
A
T
A
A
T
G
A
T
G
A
T
T
C
A
C
T
G
A
T
T
T
T
T
C
A
G
A
G
G
T
2
T
C
G
A
G
T
T
A
6
4
2
A
A
C
G
T
G
A
G
A
A
A
G
A
G
A
G
2
C
T
T
G
C
C
C
G
C
A
C
A
C
A
8
G
G
G
T
G
C
C
A
C
G
T
A
G
G
C
T
C
3
T
C
A
C
T
A
C
C
G
A
A
A
C
A
10
3
T
C
A
A
T
G
C
A
A
A
2
T
57
55
G
G
G
G
T
C
C
G
A
C
C
G
G
G
G
G
A
G
2
G
10
A
A
G
C
T
T
T
T
C
C
C
T
G
T
C
A
C
A
T
A
C
A
G
C
2
3
C
A
A
T
A
A
G
4
A
C
8
C
G
A
A
A
  10,416,761
  10,416,881
  10,417,153
  10,417,806
  10,418,113
  10,418,608
  10,419,039
  10,419,533
  10,419,882
  10,419,919
  10,420,379
  10,420,864
  10,420,866
  10,421,192
  10,421,313
  10,421,331
  10,421,374
  10,421,539
  10,421,636
  10,422,299
  10,422,800
  10,422,901
  10,424,267
  10,424,318
  10,425,418
  10,425,909
  10,425,954
  10,425,998
  10,426,062
  10,426,114
  10,426,514
  10,426,541
  10,426,543
  10,426,608
  10,426,727
  10,426,740
  10,429,188
  10,430,283
  10,430,457
  10,431,292
  10,431,845
  10,431,983
  10,434,218
  10,436,692
  10,437,240
  10,437,242
  10,437,275
  10,438,536
  10,440,850
  10,441,684
  10,441,929
  10,442,231
  10,442,263
  10,442,294
  10,444,088
  10,444,277
  10,444,324
  10,444,428
  10,444,948
  10,445,458
  10,445,557
  10,445,681
  10,445,683
  10,446,288
  10,447,298
  10,447,299
  10,447,686
  10,448,175
  10,448,191
  10,448,604
  10,448,993
  10,449,417
  10,449,419
  10,450,101
  10,452,958
  10,456,926
  10,457,071
  10,458,196
  10,458,411
  10,458,557
  10,458,847
  10,458,991
  10,459,004
  10,459,039
  10,459,210
  10,459,493
  10,459,500
  10,459,520
  10,459,626
  10,459,678
  10,460,030
  10,460,039
  10,460,067
  10,460,090
  10,460,093
  10,460,153
  10,460,198
  10,460,220
  10,460,224
  10,460,247
  10,460,489
  10,460,719
  10,460,726
  10,461,200
  10,461,242
  10,461,295
  10,461,359
  10,461,371
  10,461,373
  10,461,374
  10,461,377
  10,461,379
  10,461,380
  10,461,381
  10,461,603
  10,461,676
  10,461,815
  10,461,816
  10,461,949
  10,461,985
  10,462,277
  10,462,734
  10,462,903
  10,462,975
  10,463,031
  10,463,128
  10,463,466
  10,463,737
  10,463,870
  10,463,973
  10,464,000
  10,464,249
  10,464,275
  10,465,690
  10,465,882
  10,467,064
  10,467,117
  10,467,130
  10,467,181
  10,467,185
  10,467,219
  10,467,247
  10,467,255
  10,467,270
  10,467,311
  10,467,381
  10,467,382
  10,467,417
  10,467,582
  10,467,637
  10,467,793
  10,467,856
  10,467,903
  10,467,927
  10,468,044
  10,468,106
  10,468,107
  10,468,154
  10,468,276
  10,468,332
  10,468,752
  10,468,758
  10,468,759
  10,469,285
  10,469,367
  10,469,369
  10,470,175
  10,470,261
  10,470,906
  10,472,142
  10,472,980
  10,473,423
  10,473,664
  10,473,855
  10,473,937
  10,473,988
  10,474,000
  10,476,317
  10,476,836
  10,476,921
  10,477,491
  10,477,867
  10,479,443
  10,480,124
  10,480,125
  10,480,191
  10,481,709
  10,482,286
  10,482,961
  10,483,031
  10,483,224
  10,483,234
  10,483,236
  10,483,284
  10,483,439
  10,483,702
  10,483,807
  10,483,831
  10,483,880
  10,483,935
  10,483,939
  10,483,940
  10,483,982
  10,483,983
  10,483,986
  10,484,096
  10,484,121
  10,484,159
  10,484,161
  10,484,324
  10,484,336
  10,484,520
  10,484,563
  10,484,614
  10,484,863
  10,484,941
  10,484,948
  10,484,963
  10,485,077
  10,485,127
  10,485,334
  10,485,415
  10,485,417
  10,485,419
  10,485,426
  10,485,467
  10,485,563
  10,485,609
  10,485,655
  10,485,866
  10,485,948
  10,486,127
  10,486,221
  10,486,229
  10,486,729
  10,487,199
  10,487,492
  10,488,317
  10,488,467
  10,488,531
  10,488,693
  10,488,785
  10,488,893
  10,489,130
  10,489,208
  10,489,243
  10,489,245
  10,489,776
  10,490,034
  10,490,448
  10,491,068
  10,491,241
  10,491,242
  10,491,514
  10,491,575
  10,491,593
  10,491,722
  10,491,841
  10,491,865
  10,491,999
  10,492,215
  10,492,706
  10,493,391
  10,493,608
  10,493,980
  10,494,048
  10,494,091
  10,494,485
  10,494,552
  10,494,626
  10,494,733
  10,494,741
  10,495,128
  10,495,672
  10,495,825
  10,496,280
  10,496,341
  10,496,352
  10,496,357
  10,496,570
  10,497,019
  10,497,020
  10,497,106
  10,497,458
  10,497,645
  10,497,667
  10,497,969
  10,498,000
  10,498,409
  10,499,163
  10,499,248
  10,500,470
  10,500,530
  10,500,915
  10,501,082
  10,501,503
  10,501,522
  10,502,014
  10,502,864
  10,505,216
  10,505,239
  10,505,265
  10,506,233
  10,507,151
  10,508,034
  10,508,046
  10,509,504
  10,509,631
  10,510,368
  10,510,494
T
G
C
T
T
C
C
9
T
A
G
2/-
T/12
A
A
T
T
A
C
G
C
3
-
4
A
G
C
G
T
G
C
C
A
C
A
A
C/5
A
A
G
C
A
G
207/-
4/-
2/-
T
G
C
A
C
13
2
7
2
-
G
T
T
G
-
4/-
2/-
2
3/7
2/-
G
G
G
CT/3
G
8/-
6/-
5
A
2
4/-
A
G
G
G
A
T
-
C
G
A
C
A
G
-
-
T
G
A
C
28
5
3
G
C
T
A
C
T
3
C
15
G
13
3
G
4
9
G
A
G
T
G
T
C
T
C
C
T
A/51
2
G
G
C
T
T
C
12
-
C
C
T
G
T
5
T
T
C
G
3
A
C
A
G
2
G
C
A
C
2/-
T/-
T
A
T
C
2
C
G
6/-
4/-
-
-
-
T
A
3
A
-
5
2
G
G
3
T
A
T
A
2/-
C/-
C
19
T
A
G
A
A
G
G
T
G
A
G
-
-
5
A
C
A
T
T
G
T
A
A
G
T
A
G
C
5
-
G
2
2
T
2
4
T
T
A
G
G
C
T
C
-
-
A
T
G
G
-
A
T
C
7
2
-
C
57/-
55/-
A
A
A
T
C
T
T
A
G
T
T
A
A
A
A
C
2
5
-
13
-
G
C
A
2
14
2
A
G
A
C/-
A
G
T
C
3/CA
9
A
G
3
3
7
G
A
T
-
-
A
G
G
C
G
G
A
-
G
T
-
G
A
-
G
-