Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 144,639 (bp)   Positions: 502
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.068
.046
.054
.005
.005
.016
.057
.001
.001
.001
.005
.009
.039
.021
.095
.173
.009
.0
.005
.139
.005
.002
.008
.0
.094
.0
.497
.299
.051
.001
.012
.001
.001
.277
.022
.004
--
.077
.08
.068
.017
.397
--
.037
.002
.77
.005
.001
1.0
.006
.533
.521
.468
.008
--
.006
.016
--
--
--
.001
.108
.0
.0
.0
.01
.098
.134
.003
.001
.003
.0
.007
.001
.018
.052
.45
.31
.019
.016
.007
.005
.001
.006
.015
.04
.007
.001
.006
.176
.176
.016
.013
.343
.004
.005
.132
.0
.007
.228
.826
.002
.003
.001
.004
.006
.002
.016
.002
.0
.002
.004
.001
.017
.002
.005
.012
--
--
--
.05
.014
.025
.181
.016
.003
.079
.025
.0
.0
.0
.024
.0
.0
.0
.034
.167
.025
.06
.722
1.0
1.0
1.0
.96
1.0
.106
.001
.016
.031
.0
.003
.0
.0
.005
.0
.171
.125
.005
.002
.012
.014
.17
.028
.06
.633
.001
.004
.003
.024
.005
.002
.002
.0
.166
.006
.001
.086
.003
.0
.003
.035
.949
.117
.002
.342
.001
.53
.996
.811
.043
.166
.096
.04
.022
.001
.003
.008
.006
.007
.04
.0
.005
.013
.215
1.0
.936
.066
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.268
.001
.006
.001
.006
.001
.005
.096
.001
.012
.003
.007
.001
.269
.333
.693
.847
.838
.776
.749
.771
.88
.959
.931
.646
.0
.036
.004
.041
.015
.021
.021
.003
.001
.0
.07
.017
.484
.196
.196
.008
.0
.014
.001
.0
.001
.001
.635
--
.003
.002
.0
.002
.0
.0
.002
.004
.001
.014
.011
.414
.181
.001
.001
.074
.408
.003
.005
.025
.528
.004
.001
.044
.106
.142
.006
.023
.006
.727
.042
.191
.092
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
--
--
--
.004
.009
.006
.023
.0
.0
.012
.043
.015
.006
.046
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.079
--
--
--
--
--
--
.027
.025
.019
.108
.056
.0
.012
.914
.116
.494
.01
.011
.001
.005
.001
.584
.0
.151
.0
.008
--
--
--
.005
.677
.003
.128
.114
.11
.002
.016
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.188
.094
.004
.835
.859
.898
.002
.0
.067
.02
.001
.003
.075
.071
--
--
--
.002
.012
.597
.637
.001
.001
.033
.498
.066
.056
.002
.0
.004
.002
.021
.0
.0
.004
.0
.006
.397
.0
.014
.077
--
--
.311
.453
.562
.023
.004
.133
.168
.028
.007
--
.04
.112
.0
.053
.01
--
.012
.004
.001
.074
.08
.116
.001
.001
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
Grin3a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
14
T
G
T
A
T
T
A
T
G
C
A
T
G
C
C
A
C
T
G
G
T
G
G
T
A
G
G
A
C
A
T
G
C
T
T
C
A
T
6
A
2
C
C
C
T
C
T
C
G
C
A
C
C
T
T
C
T
C
G
G
G
A
G
G
G
T
C
C
C
C
C
G
T
T
C
T
T
G
T
A
C
2
G
A
A
T
4
G
A
12
G
G
G
A
5
4
C
C
T
G
T
T
T
4
17
C
G
C
T
A
G
G
C
T
G
A
T
T
C
C
2
G
G
G
T
9
G
A
C
C
G
C
T
G
G
G
A
A
C
A
5
6
4
C
C
A
C
A
G
C
G
A
A
C
A
A
T
T
T
T
C
A
T
G
A
C
T
T
T
C
C
T
A
G
C
G
T
T
T
T
A
G
C
C
G
C
A
C
T
C
T
C
G
G
T
G
G
G
G
A
C
C
A
C
A
G
2
A
A
G
C
A
A
C
T
3
5
4
G
T
C
G
G
T
G
C
A
T
A
A
G
C
C
G
G
C
T
T
C
C
A
G
5
G
T
C
G
T
G
T
G
G
2
G
G
G
G
G
G
C
2
G
C
A
T
C
G
T
G
T
C
C
T
T
G
A
G
T
T
A
C
T
C
G
T
T
A
G
C
C
G
G
A
C
C
G
T
C
C
C
C
A
C
C
T
A
C
G
G
G
A
T
T
T
T
T
T
A
G
T
T
T
A
T
C
A
G
C
A
T
C
C
3
T
C
A
C
A
T
C
A
G
G
A
2
C
T
A
C
T
G
C
T
A
G
C
C
C
C
G
C
T
G
G
T
G
C
T
T
C
3
G
T
T
G
A
A
T
C
C
T
A
C
5
A
A
T
T
A
C
A
2
2
4
G
C
C
C
C
2
C
A
2
A
T
A
G
A
A
A
G
A
G
A
G
G
A
G
G
C
G
G
A
G
C
A
T
G
G
T
G
C
G
G
T
T
T
T
C
C
A
A
C
A
T
A
A
A
G
C
A
T
G
A
G
T
G
A
T
G
G
G
G
A
T
C
A
T
C
2
G
T
3
A
4
8
C
T
G
G
G
T
A
T
G
T
T
T
A
T
G
A
G
G
T
G
G
G
T
T
G
  69,421,169
  69,421,194
  69,421,882
  69,422,254
  69,422,715
  69,423,015
  69,423,160
  69,423,217
  69,423,276
  69,423,446
  69,423,564
  69,423,656
  69,423,688
  69,423,967
  69,424,031
  69,424,157
  69,424,182
  69,424,371
  69,424,577
  69,424,766
  69,424,820
  69,425,162
  69,425,179
  69,425,189
  69,425,705
  69,425,825
  69,426,031
  69,426,419
  69,428,357
  69,428,546
  69,428,963
  69,428,976
  69,429,575
  69,429,888
  69,430,103
  69,430,578
  69,430,653
  69,431,331
  69,432,035
  69,432,089
  69,432,124
  69,432,235
  69,432,341
  69,433,084
  69,433,248
  69,433,452
  69,435,270
  69,435,815
  69,437,466
  69,437,702
  69,438,746
  69,438,997
  69,439,001
  69,439,014
  69,439,515
  69,440,322
  69,440,561
  69,440,676
  69,440,761
  69,441,627
  69,442,031
  69,442,646
  69,442,670
  69,443,171
  69,443,175
  69,443,179
  69,443,270
  69,443,538
  69,443,609
  69,444,803
  69,446,795
  69,446,902
  69,446,908
  69,446,973
  69,447,162
  69,448,792
  69,448,982
  69,449,045
  69,449,488
  69,449,507
  69,449,509
  69,449,629
  69,449,653
  69,449,662
  69,449,674
  69,449,708
  69,449,717
  69,449,752
  69,449,766
  69,449,778
  69,449,807
  69,449,818
  69,449,866
  69,449,882
  69,450,112
  69,450,482
  69,450,483
  69,450,614
  69,450,818
  69,450,826
  69,450,862
  69,450,980
  69,451,204
  69,451,322
  69,451,394
  69,451,601
  69,451,633
  69,451,648
  69,451,852
  69,451,983
  69,452,055
  69,452,289
  69,452,905
  69,454,523
  69,454,530
  69,455,195
  69,455,244
  69,455,485
  69,455,559
  69,455,571
  69,455,577
  69,455,679
  69,455,702
  69,455,713
  69,455,928
  69,456,270
  69,456,411
  69,456,431
  69,456,751
  69,456,835
  69,456,838
  69,456,840
  69,456,857
  69,457,093
  69,457,094
  69,457,196
  69,457,857
  69,458,093
  69,458,150
  69,458,343
  69,458,502
  69,459,102
  69,459,108
  69,459,115
  69,459,362
  69,459,670
  69,459,888
  69,460,532
  69,460,548
  69,460,850
  69,461,069
  69,461,302
  69,461,508
  69,461,814
  69,462,489
  69,462,525
  69,462,603
  69,462,876
  69,463,228
  69,463,302
  69,463,621
  69,463,794
  69,463,808
  69,463,903
  69,463,913
  69,464,029
  69,464,193
  69,464,194
  69,464,375
  69,464,400
  69,464,553
  69,464,563
  69,464,665
  69,464,753
  69,464,762
  69,465,753
  69,465,833
  69,465,943
  69,465,976
  69,466,181
  69,466,201
  69,466,538
  69,467,078
  69,467,122
  69,467,206
  69,467,268
  69,467,390
  69,467,611
  69,467,729
  69,467,747
  69,467,802
  69,467,866
  69,467,887
  69,467,902
  69,468,220
  69,468,285
  69,468,315
  69,468,328
  69,468,332
  69,468,335
  69,468,386
  69,469,039
  69,469,249
  69,469,351
  69,469,579
  69,470,633
  69,470,640
  69,471,055
  69,471,255
  69,471,291
  69,471,321
  69,471,488
  69,471,861
  69,471,947
  69,472,084
  69,472,236
  69,472,440
  69,473,662
  69,473,963
  69,474,224
  69,475,581
  69,475,745
  69,475,811
  69,475,812
  69,475,888
  69,476,108
  69,476,159
  69,476,212
  69,476,240
  69,476,249
  69,476,419
  69,476,429
  69,476,436
  69,476,504
  69,476,513
  69,476,692
  69,477,364
  69,477,380
  69,477,520
  69,477,578
  69,479,064
  69,479,151
  69,479,200
  69,479,264
  69,479,926
  69,480,024
  69,480,658
  69,481,084
  69,481,289
  69,481,717
  69,481,848
  69,482,064
  69,482,839
  69,483,052
  69,483,079
  69,483,087
  69,483,095
  69,483,103
  69,483,127
  69,483,135
  69,483,157
  69,483,161
  69,483,177
  69,483,819
  69,484,313
  69,484,410
  69,484,556
  69,484,604
  69,484,676
  69,485,118
  69,485,350
  69,485,689
  69,485,749
  69,486,087
  69,486,224
  69,486,497
  69,486,524
  69,486,530
  69,486,749
  69,486,820
  69,487,680
  69,488,376
  69,488,378
  69,488,818
  69,488,880
  69,489,310
  69,489,560
  69,490,336
  69,490,501
  69,490,620
  69,490,671
  69,490,698
  69,490,705
  69,490,759
  69,490,772
  69,490,787
  69,490,839
  69,490,850
  69,490,858
  69,490,907
  69,491,049
  69,491,185
  69,491,195
  69,491,254
  69,491,278
  69,491,503
  69,491,710
  69,491,768
  69,491,845
  69,491,975
  69,492,129
  69,492,139
  69,492,256
  69,492,265
  69,492,460
  69,492,667
  69,492,729
  69,492,813
  69,492,873
  69,493,115
  69,493,193
  69,493,202
  69,493,247
  69,493,254
  69,493,283
  69,493,462
  69,493,511
  69,493,578
  69,493,689
  69,493,719
  69,493,732
  69,493,737
  69,493,949
  69,494,066
  69,494,209
  69,494,761
  69,494,985
  69,495,113
  69,495,185
  69,495,362
  69,495,838
  69,496,026
  69,496,041
  69,496,083
  69,497,312
  69,498,150
  69,498,885
  69,498,901
  69,499,447
  69,499,665
  69,499,888
  69,501,070
  69,502,074
  69,502,202
  69,502,213
  69,502,323
  69,502,347
  69,502,354
  69,502,361
  69,502,427
  69,503,738
  69,503,793
  69,504,582
  69,504,791
  69,505,199
  69,505,412
  69,506,678
  69,506,713
  69,508,339
  69,508,436
  69,508,710
  69,509,226
  69,509,894
  69,510,508
  69,511,523
  69,513,939
  69,514,057
  69,514,418
  69,514,514
  69,514,908
  69,515,192
  69,515,454
  69,515,544
  69,515,684
  69,515,943
  69,516,272
  69,516,413
  69,516,771
  69,516,954
  69,517,021
  69,518,516
  69,518,557
  69,519,706
  69,519,713
  69,519,729
  69,520,008
  69,520,493
  69,521,506
  69,521,735
  69,521,741
  69,521,742
  69,521,952
  69,523,696
  69,523,771
  69,524,204
  69,526,416
  69,526,566
  69,526,826
  69,526,911
  69,527,820
  69,528,236
  69,528,314
  69,528,349
  69,528,732
  69,529,929
  69,531,191
  69,531,994
  69,532,714
  69,533,396
  69,534,718
  69,535,453
  69,536,012
  69,536,907
  69,537,227
  69,537,772
  69,538,064
  69,538,138
  69,538,423
  69,538,705
  69,538,800
  69,539,142
  69,539,149
  69,539,167
  69,539,689
  69,540,136
  69,540,320
  69,540,581
  69,540,608
  69,540,612
  69,540,618
  69,540,627
  69,540,647
  69,540,914
  69,540,938
  69,541,271
  69,543,007
  69,543,298
  69,543,300
  69,543,325
  69,543,387
  69,543,395
  69,543,412
  69,543,513
  69,543,890
  69,544,225
  69,544,277
  69,544,334
  69,544,644
  69,544,664
  69,544,910
  69,544,983
  69,545,043
  69,545,302
  69,545,495
  69,545,737
  69,545,833
  69,545,891
  69,546,005
  69,546,065
  69,546,077
  69,546,114
  69,546,377
  69,546,438
  69,546,593
  69,549,185
  69,549,409
  69,549,467
  69,549,765
  69,549,952
  69,550,223
  69,550,762
  69,550,784
  69,551,265
  69,551,649
  69,552,537
  69,553,140
  69,553,416
  69,553,597
  69,554,390
  69,555,279
  69,555,460
  69,555,609
  69,556,064
  69,556,345
  69,556,532
  69,557,076
  69,557,186
  69,559,747
  69,562,314
  69,562,552
  69,563,244
  69,563,805
-
T/A
C
C
C
2
C
G
C
A
T
G
C
A
T
T
T
G
C
A
T
C
C
A
C
G
A
2
G
T
G
C
A
T
5
C
G
C
C
-
G
-
T
G
T
C
T
T/6
T
A
T
C
-/4
2
C
C
T
C
T
3
A
T
G
G/A
G/A
17/A
C
G
T
T
T
T
A
A
C
-
-
4
A
C
G
T
-
3
A/G
A/G
T/C
-
G/A
A/G
-
A
C
5
G
5/-
-
C/T
T
C
A
C
C
C
-
-
G
C
5/4
C
G
T
A
2
5
A
G
C
T/C
T
T
-
A
2
T
A
-
T
G
T
G
C
T
C
A
C
A
2
-
A
-
-
-
-
T
G
G
3
G
2
T
C
T
G
T
G
G
C
2
C
G
G
G
T/3
-
G
A
5
C
3
T
T
-
G
A
T
A
C
A
C
C
G
2
2
T
A
T
G
T
C
T
C
7
G/-
T
2
A
2
T
A
G
T
2
G
A
G
T
-
G
G
A
T
C
T
A
C
-
-
-
C
C
A
G/A
G/A
C
A
A
C
C
G
G
A
T
T
T
C
4
A
C
T
C/T
G
G/C
5/-
A
C
T
?
C
A
C
T
A
-
C
C
G/C
G/C
G/C
G/C
C/G
-
G/C
T
G
A
G
A
-
A
A
A
T
C
2
T
G
C
C
G
T
G
C
T
A
C
C
G
A
T
T
T
A
5
T
T
A
A
T
T
A
T
G
T
T
C
G
T
T
T
A
2
A
C
C
C
C
G
G
T
C
C
C
14
G
T
G
A
T
-
C
T
T
-
C
T
G
T
C
C
T
G
A
2
G
-
T
C
C
T
C
A
-
A
2
G/T
C/T
C/T
C/T
C/A
A
15
C
T
T
C
C
T
-/TG
2
T
3/-
C
C
C
A
G
G
G
A
T
-
G
T
-
3
-
2
A
G
T
C
-
-
-
A
T
C/2
G
C/G
-
T
G
-
-
A
A/G
G/A
-
T
T
A
T
C
G
A
A
C
3
C
G
A
A
G
T
T
T
C
20
A
C
T
G
T
A
C
C
C
C
A
T
G
G
T
G
C
G
C
G
C
G
G
C
2
C
A
C
A
G
-
A
A
G/A
A
G
C
T
G
2
T
-
A
C
-
G
-
-
T
2
A
A
A
2
G
A
T
C
G
C
C
C
2
G
T
A
G
T
G/T
A
A
5
A