Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 50,705 (bp)   Positions: 474
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.982
.0
.042
.003
.0
.003
.0
.001
.002
.001
.001
.001
.001
.06
.019
.021
.038
.073
.053
.79
.031
.002
.002
.054
.007
.008
.009
.001
.007
.447
.214
.0
.0
.137
.487
.012
.0
.001
.002
.037
.002
.003
.066
.002
.011
.0
.123
.124
.008
.046
.002
.002
.031
.006
.001
.0
.0
.001
.0
.001
.062
.001
.001
.0
.006
.001
--
.049
.12
.012
.067
.584
.592
.205
.188
.026
--
.025
.08
.083
--
--
.003
.002
.002
.005
.001
.053
--
.005
.013
--
--
--
--
--
.001
.01
.001
.0
.227
.05
.0
.041
.047
.001
.762
1.0
.038
.014
.007
.013
.007
.004
.006
.005
.01
.0
.001
.002
.004
.003
.004
.052
.039
.06
.048
.058
.05
.03
.155
.748
.106
--
--
--
--
.077
.007
.01
.007
.005
.011
.295
.001
.002
.004
.001
.001
.207
.033
.001
.34
.069
.018
.004
.002
.001
.601
.016
.007
.399
.236
.208
.004
.064
.104
.031
.584
.024
.009
.02
.002
.168
.604
.024
.003
.001
--
.018
.012
.017
.139
.075
.0
.001
.002
.006
.045
.008
.001
.002
.01
.017
.012
.013
--
--
.007
.007
.001
.319
.268
.001
.016
.476
.407
.371
.039
.525
.624
--
.023
.332
.336
.023
.122
.494
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.021
.296
.158
.399
.405
.268
.214
.008
.668
.03
.013
.004
.008
.005
.0
.133
.116
.046
.039
.05
.078
.105
.009
.012
.024
.006
.002
.01
.001
.001
.015
.041
.189
.308
.242
.033
.016
.023
.433
.003
.049
.002
.004
.009
.007
.001
.217
--
.005
.017
.009
.041
.018
.001
.042
.019
.003
.003
.279
.001
.018
.006
.004
.202
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.012
.031
.002
.064
.03
.162
.155
.008
.0
.001
.302
.001
.007
.082
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.461
.492
.112
.222
.228
.232
.248
.203
.068
.07
.009
.013
.013
.013
.378
.042
.023
.013
.012
.021
.037
.015
.012
.002
.0
.001
.002
.001
.005
.002
.005
.009
.002
.295
.001
.0
.0
.0
.27
.001
.028
.003
.001
.008
.323
.002
.003
.0
.005
.002
.0
.0
--
--
--
--
--
--
.015
.565
.019
.032
.006
--
--
--
--
--
.078
.194
.035
--
--
--
--
.004
.031
.086
.001
.0
.0
.868
.04
.014
.107
.005
.002
.034
.037
.008
.087
.001
.134
.05
.01
.025
.385
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.051
.056
.027
.002
.001
.0
.003
.004
.233
.002
.011
.002
.012
.755
.525
.006
.055
.567
.006
.007
.223
.0
.001
.06
.947
.963
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
Gpat3
G
G
T
T
A
A
C
C
G
C
G
C
C
C
A
C
112
T
T
G
G
T
T
T
C
T
T
T
8
A
A
G
A
T
C
A
A
A
T
C
C
T
G
T
G
A
C
T
C
114
C
A
A
G
A
G
T
T
C
17
G
A
G
G
G
G
T
120
T
4
A
T
T
G
G
T
2
G
2
6
T
T
T
G
A
G
C
C
6
A
C
14
A
T
A
A
G
A
G
A
A
A
G
G
T
G
C
T
C
C
C
G
A
C
C
A
C
C
T
C
G
T
G
C
A
C
A
C
T
G
G
C
8
T
2
T
T
T
A
T
G
G
4
G
A
G
A
C
A
G
A
C
A
A
G
C
C
G
A
C
G
T
C
G
C
G
G
T
A
G
C
A
C
C
T
C
5
5
G
A
A
A
A
20
C
T
G
G
G
G
T
C
G
T
G
C
A
C
A
T
T
T
T
A
A
C
2
10
C
C
T
A
T
C
T
T
22
C
6
2
2
C
C
C
A
G
G
C
C
A
G
G
A
G
C
C
C
A
T
T
G
G
A
G
C
G
T
A
G
T
7
T
T
T
A
C
T
3
C
3
C
T
T
G
2
A
C
A
A
T
A
G
C
T
A
A
A
A
A
A
G
G
G
C
G
T
T
C
T
A
A
T
C
C
G
A
2
4
A
C
C
26
C
C
C
C
G
A
A
T
3
C
A
G
G
A
A
A
G
G
T
T
C
G
A
C
C
T
C
C
G
C
G
C
A
T
C
C
C
T
G
T
A
A
G
T
T
T
T
T
T
T
T
A
T
G
T
C
C
T
8
G
G
A
C
G
A
G
T
T
G
C
C
G
T
G
G
A
C
C
A
C
T
G
T
T
A
T
4
C
5
G
C
G
G
T
T
T
T
G
A
A
G
C
A
C
G
2
G
T
2
C
T
A
G
T
C
C
A
A
C
A
A
T
C
C
C
A
C
6
G
A
G
G
A
A
T
A
A
A
T
A
A
92
60
56
75
C
A
A
T
C
C
C
C
G
T
C
T
T
C
C
5
A
C
G
C
C
G
C
C
C
T
G
  10,293,473
  10,293,634
  10,293,668
  10,293,703
  10,293,712
  10,293,726
  10,293,747
  10,293,754
  10,293,761
  10,293,820
  10,293,822
  10,293,827
  10,293,829
  10,293,893
  10,293,959
  10,293,964
  10,294,039
  10,294,174
  10,294,387
  10,294,412
  10,294,430
  10,294,457
  10,294,460
  10,294,471
  10,294,551
  10,294,552
  10,294,555
  10,294,586
  10,294,601
  10,294,631
  10,294,665
  10,294,795
  10,294,929
  10,294,983
  10,295,096
  10,295,113
  10,295,127
  10,295,144
  10,295,329
  10,295,502
  10,295,626
  10,295,656
  10,296,007
  10,296,148
  10,296,301
  10,296,378
  10,296,432
  10,296,433
  10,296,562
  10,296,589
  10,296,771
  10,296,772
  10,296,901
  10,297,193
  10,297,251
  10,297,505
  10,297,508
  10,298,433
  10,299,987
  10,300,093
  10,300,277
  10,300,499
  10,300,716
  10,301,493
  10,301,655
  10,301,845
  10,301,958
  10,302,151
  10,302,299
  10,302,547
  10,302,588
  10,302,872
  10,303,006
  10,303,197
  10,303,200
  10,303,403
  10,303,647
  10,304,097
  10,304,233
  10,304,238
  10,304,665
  10,304,715
  10,305,107
  10,305,468
  10,305,479
  10,306,074
  10,307,083
  10,307,088
  10,308,104
  10,308,998
  10,309,009
  10,309,368
  10,309,383
  10,309,414
  10,309,441
  10,309,443
  10,310,742
  10,310,762
  10,311,439
  10,311,601
  10,312,307
  10,313,196
  10,313,731
  10,313,857
  10,313,991
  10,314,348
  10,314,522
  10,314,629
  10,314,881
  10,314,885
  10,314,913
  10,314,934
  10,314,947
  10,314,954
  10,314,977
  10,315,105
  10,315,151
  10,315,166
  10,315,168
  10,315,178
  10,315,183
  10,315,186
  10,315,187
  10,315,215
  10,315,240
  10,315,251
  10,315,275
  10,315,280
  10,315,281
  10,315,375
  10,315,384
  10,315,461
  10,315,507
  10,315,531
  10,315,558
  10,315,619
  10,315,646
  10,315,775
  10,315,802
  10,315,813
  10,315,815
  10,315,817
  10,315,880
  10,315,934
  10,315,955
  10,315,971
  10,316,012
  10,316,101
  10,316,117
  10,316,134
  10,316,158
  10,316,217
  10,316,258
  10,316,315
  10,316,377
  10,316,408
  10,316,457
  10,316,522
  10,316,701
  10,316,761
  10,316,857
  10,316,953
  10,317,023
  10,317,032
  10,317,155
  10,317,158
  10,317,226
  10,317,336
  10,317,430
  10,317,456
  10,317,459
  10,317,518
  10,317,535
  10,317,558
  10,317,571
  10,317,596
  10,317,693
  10,317,851
  10,317,902
  10,318,108
  10,318,124
  10,318,131
  10,318,265
  10,318,298
  10,318,372
  10,318,374
  10,318,375
  10,318,447
  10,318,473
  10,318,484
  10,318,489
  10,318,501
  10,318,509
  10,318,512
  10,318,589
  10,318,698
  10,318,751
  10,318,832
  10,318,944
  10,319,141
  10,319,157
  10,319,211
  10,319,215
  10,319,257
  10,319,268
  10,319,325
  10,319,342
  10,319,350
  10,319,390
  10,319,411
  10,319,449
  10,319,534
  10,319,606
  10,319,928
  10,319,930
  10,319,981
  10,320,020
  10,320,133
  10,320,264
  10,320,273
  10,320,295
  10,320,345
  10,320,379
  10,320,398
  10,320,469
  10,320,537
  10,320,596
  10,320,609
  10,320,756
  10,320,766
  10,320,796
  10,320,797
  10,320,833
  10,320,843
  10,320,889
  10,320,963
  10,321,034
  10,321,035
  10,321,040
  10,321,042
  10,321,049
  10,321,069
  10,321,095
  10,321,105
  10,321,112
  10,321,121
  10,321,253
  10,321,305
  10,321,311
  10,321,344
  10,321,348
  10,321,361
  10,321,367
  10,321,369
  10,321,375
  10,321,389
  10,321,394
  10,321,419
  10,321,436
  10,321,451
  10,321,471
  10,321,478
  10,321,485
  10,321,486
  10,321,493
  10,321,551
  10,321,714
  10,321,807
  10,321,819
  10,321,820
  10,321,825
  10,321,877
  10,321,890
  10,322,026
  10,322,067
  10,322,104
  10,322,114
  10,322,116
  10,322,172
  10,322,173
  10,322,206
  10,322,230
  10,322,342
  10,322,350
  10,322,364
  10,322,533
  10,322,601
  10,322,737
  10,322,890
  10,323,001
  10,323,068
  10,323,171
  10,323,172
  10,323,324
  10,323,332
  10,323,450
  10,323,539
  10,323,553
  10,323,794
  10,323,813
  10,323,989
  10,324,166
  10,324,243
  10,324,353
  10,324,392
  10,324,704
  10,324,797
  10,324,844
  10,325,045
  10,325,470
  10,325,702
  10,325,713
  10,326,140
  10,326,301
  10,326,411
  10,326,632
  10,326,699
  10,326,861
  10,326,931
  10,326,933
  10,327,022
  10,327,033
  10,327,117
  10,327,200
  10,327,222
  10,327,233
  10,327,271
  10,327,457
  10,327,483
  10,327,610
  10,327,702
  10,327,712
  10,327,903
  10,328,084
  10,328,140
  10,328,236
  10,328,343
  10,328,560
  10,328,569
  10,328,609
  10,328,610
  10,328,611
  10,328,615
  10,328,626
  10,328,635
  10,328,639
  10,328,691
  10,328,692
  10,328,699
  10,328,706
  10,328,760
  10,328,763
  10,328,766
  10,328,767
  10,328,769
  10,328,771
  10,328,792
  10,328,887
  10,329,025
  10,329,210
  10,329,279
  10,329,309
  10,329,495
  10,329,512
  10,329,530
  10,329,539
  10,329,572
  10,329,576
  10,329,592
  10,329,723
  10,329,844
  10,329,849
  10,329,860
  10,329,866
  10,329,929
  10,329,964
  10,330,001
  10,330,265
  10,330,290
  10,330,329
  10,330,552
  10,330,638
  10,330,652
  10,330,791
  10,330,868
  10,330,870
  10,330,872
  10,330,874
  10,330,982
  10,330,993
  10,331,031
  10,331,057
  10,331,058
  10,331,064
  10,331,086
  10,331,131
  10,331,148
  10,331,227
  10,331,322
  10,331,485
  10,331,490
  10,331,579
  10,331,580
  10,331,665
  10,331,735
  10,331,798
  10,331,806
  10,331,834
  10,331,892
  10,331,957
  10,331,959
  10,332,237
  10,332,265
  10,332,321
  10,332,414
  10,332,423
  10,332,471
  10,332,578
  10,332,625
  10,332,639
  10,332,667
  10,332,737
  10,332,758
  10,332,825
  10,332,826
  10,332,998
  10,333,226
  10,333,267
  10,333,392
  10,333,439
  10,333,468
  10,333,604
  10,333,688
  10,333,825
  10,333,885
  10,333,931
  10,334,137
  10,334,302
  10,334,394
  10,334,399
  10,334,414
  10,334,508
  10,334,548
  10,334,593
  10,335,131
  10,335,135
  10,335,228
  10,335,909
  10,335,940
  10,335,941
  10,336,185
  10,336,303
  10,336,541
  10,336,855
  10,336,918
  10,336,998
  10,337,271
  10,337,336
  10,338,065
  10,338,323
  10,338,342
  10,339,242
  10,339,296
  10,339,326
  10,339,402
  10,340,248
  10,341,564
  10,341,628
  10,342,018
  10,342,527
  10,342,649
  10,342,860
  10,342,880
  10,343,352
A
T
G
C
T
G
T
T
A
T
T
A
T
T
-
G
-
C
C
A
C
C
C
C
-
6
4
C
-
G
C
A
G
C
2
G
G
T
C
T
T
A
A
A
-
11
T
C
A
-
A
T
4
C
G
6
-
C
3
-
3/4
T
A
A
3
A
C
-
C
-
G
C
C
2
4
C
-
GA/3
-
-
C
C
C
A
G
T
T
A
-
C
-
-
T
5/3
T
T
A
T
C
14
T
G
A
2
C
A
A
C
T
A
T
A
C
T
T
G
-
T
C
2
A
C
A
G
G
A
C
T
C
A
A
T
-
G
-
C
A
A
G
18
5
C
-
3
8
T
C
T
G
A
C
T
G
G
C
5
T
C
8
T
T
G
T
4
T
A
A
4
C
A
T
-
T
T
C
T
-
-
A
G
G
G
G
20/-
T
-
A
C
A
A
G
-
A
A
A
3
G
T
2
C
C
C
C
T
G
G
-
-
T
T
G
2
C
G
-
C
-
T
-
-
-
T
A
3
C
A
A
A
G
G
C
A
G
A
T
G
T
G
G
C
A
A
G
C
A
T
G
G
A
-
-
-
5
C
-
T
2
-
T
-
T
2
C
T
-
2
T
C
T
C
G
-
T
C
G
G
T
C
G
T
A
A
C
G
A
2
-
-
C
T
T
T/6
C/60
T
T
G
-
-
G
A
T
-
A
G
T
G
A
G
G
3
-
A
G
A
T
C
G
G
-
A
C
G
A
A
G
A
2
C
G
T
7
A
A
T
-
A
9
T
T
A
C
8
T
G
C
C
-
C
A
G
14
3
4
8
4
2
-
T
T
C
-
A
12
G
T
A
G
C
C
3
T
G
G
A
2
A
5
G
T
G
G
T
C
A
A
3
T
G
-
2
-
3
2
A
C
G
A
5
C
A
G
C
A
A
G
T
T
-
A
-
-
A
C
G
A
C
G
A
-
G
T
G
G
G
T
A
G
G
T
-
4
G
A
A
G
G
G
2
C
G
G
5
5
92/-
60/-
56/-
-
A
G
C
G
T
T
G
2
C
28
-
C
C
4
A
-
T
A
A
T
T
G/3
T
T
T
2
C