Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 98,032 (bp)   Positions: 342
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.979
.998
.023
.016
--
.085
.016
.018
.036
.004
.006
.0
--
--
.273
.001
.01
.141
.092
.114
.003
.151
.32
--
.396
.001
.332
.465
.438
.019
.138
.11
.081
.02
.006
.003
.149
.0
1.0
.148
.0
.0
.015
.007
.002
.016
.002
.021
.003
.17
.001
.01
.011
.123
.01
.018
.01
.0
.068
.061
--
--
--
--
--
.113
.015
.0
.019
.001
.008
.021
.0
.233
.151
.002
--
.324
.075
.002
.242
.101
.0
.001
.016
.018
.015
.01
.004
--
--
--
.007
.046
.245
.23
.085
.204
.055
.028
.011
.259
.024
.258
.01
.01
.159
.006
--
.559
.007
.005
.153
.461
.001
--
--
.003
.4
.56
--
--
.268
.005
--
--
--
.841
.297
.052
.022
.028
.01
.04
.092
.124
.154
.066
.053
.557
.277
.012
.024
.127
.187
.224
.248
.245
.007
.028
.375
.009
--
.08
.115
.054
.166
.205
.011
.005
.003
.117
.139
.639
.112
.214
.009
.02
.078
.008
.091
.173
.131
.107
.144
.004
.027
.891
.057
.012
.018
.189
.013
.191
.002
--
--
.035
.193
.144
.094
.244
.009
.124
.953
.019
.06
.015
.007
.313
.011
.01
.009
.001
--
--
--
.025
--
--
--
--
--
--
.845
.106
.008
.005
.19
.027
.027
.134
.032
.038
.009
.134
.011
.0
.12
.443
.105
.037
.011
.012
.001
.009
.004
.007
.0
.0
.1
.06
.99
.018
.072
.086
.027
.005
.004
.006
.098
--
.0
.019
.057
.08
.179
.002
.001
.042
.007
.003
.263
.005
.003
.717
.631
.187
.002
.375
.839
--
.022
.017
.002
.001
.035
.005
.228
.0
.063
.0
.056
.025
.112
.157
--
--
--
.016
.012
.004
.079
.284
.294
.37
.376
.034
.021
.004
.04
.035
.037
.337
.3
.0
.002
--
--
--
--
--
.009
.005
.001
.0
.032
.003
.002
.003
.004
.002
.001
.005
.001
.0
.0
.091
.001
.0
.026
.02
.002
.645
.001
.002
.789
.0
.047
.049
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
C
C
T
A
A
G
A
T
C
T
C
C
T
T
T
C
A
4
C
C
T
T
A
G
A
T
T
G
A
A
T
C
A
C
C
A
C
C
A
T
A
T
G
A
C
C
A
G
A
G
C
A
T
G
T
T
T
T
C
G
C
T
G
C
G
T
T
G
T
T
T
C
50
G
T
T
A
T
T
T
T
G
A
G
A
G
C
3
T
C
G
T
3
G
A
T
T
G
G
T
G
13
C
A
A
T
C
C
T
T
A
A
T
T
T
G
A
A
A
T
A
T
A
T
T
A
A
G
A
T
T
T
G
C
G
C
T
G
C
T
C
A
T
G
T
A
G
G
A
G
A
G
C
C
T
T
G
A
A
G
C
T
G
G
C
T
G
G
C
C
A
A
2
A
T
G
A
G
G
G
G
A
C
C
T
G
C
T
T
G
T
G
A
C
A
G
G
T
C
T
A
G
T
8
C
T
A
C
A
A
A
G
C
G
8
T
T
G
C
2
C
15
G
C
T
T
C
T
A
C
3
C
C
A
T
A
G
G
G
G
C
C
A
A
A
G
C
G
G
A
G
G
G
G
C
C
A
G
T
T
T
C
T
G
T
A
A
G
C
C
G
A
C
A
G
T
G
T
C
C
C
T
G
G
T
A
18
G
2
C
A
C
C
C
A
G
A
C
C
2
C
C
G
C
C
T
A
T
T
C
G
G
A
C
T
A
C
T
A
A
C
2
T
T
T
T
C
A
T
G
A
T
A
T
C
G
A
T
T
C
T
C
  40,687,139
  40,688,305
  40,689,343
  40,689,393
  40,689,734
  40,689,942
  40,690,183
  40,691,216
  40,691,587
  40,691,732
  40,691,852
  40,692,477
  40,692,772
  40,692,819
  40,693,557
  40,694,065
  40,694,732
  40,695,482
  40,696,610
  40,696,660
  40,696,992
  40,697,214
  40,697,792
  40,699,676
  40,700,235
  40,701,017
  40,701,436
  40,701,485
  40,701,488
  40,701,522
  40,701,821
  40,702,944
  40,703,152
  40,703,369
  40,705,390
  40,705,553
  40,706,737
  40,707,404
  40,707,604
  40,707,827
  40,708,005
  40,708,099
  40,708,207
  40,708,857
  40,708,962
  40,709,165
  40,709,178
  40,709,198
  40,709,503
  40,709,653
  40,710,689
  40,710,800
  40,711,342
  40,711,445
  40,711,648
  40,711,667
  40,711,671
  40,711,928
  40,711,936
  40,711,964
  40,711,978
  40,712,173
  40,712,198
  40,712,221
  40,712,224
  40,712,711
  40,713,022
  40,713,188
  40,713,206
  40,713,380
  40,713,391
  40,713,455
  40,713,476
  40,713,646
  40,713,685
  40,714,255
  40,714,366
  40,714,469
  40,714,541
  40,715,132
  40,715,496
  40,715,999
  40,716,026
  40,716,166
  40,717,054
  40,717,153
  40,717,227
  40,717,234
  40,717,290
  40,717,479
  40,717,618
  40,717,630
  40,718,029
  40,718,128
  40,718,275
  40,718,453
  40,718,558
  40,718,584
  40,718,639
  40,718,707
  40,718,865
  40,719,224
  40,719,237
  40,719,452
  40,719,687
  40,719,688
  40,719,850
  40,720,011
  40,720,033
  40,720,458
  40,720,518
  40,720,591
  40,720,876
  40,720,917
  40,720,976
  40,721,192
  40,721,212
  40,721,293
  40,721,321
  40,721,401
  40,721,607
  40,722,341
  40,723,198
  40,724,359
  40,724,587
  40,724,590
  40,724,598
  40,724,892
  40,724,999
  40,725,087
  40,725,102
  40,725,105
  40,725,140
  40,725,254
  40,725,260
  40,725,688
  40,725,691
  40,725,912
  40,725,948
  40,726,083
  40,726,145
  40,726,461
  40,726,521
  40,726,709
  40,726,972
  40,726,975
  40,727,088
  40,727,089
  40,727,383
  40,727,386
  40,727,716
  40,727,971
  40,728,033
  40,728,080
  40,728,104
  40,728,215
  40,728,236
  40,728,429
  40,728,474
  40,728,515
  40,728,536
  40,728,864
  40,728,995
  40,729,330
  40,729,491
  40,729,499
  40,729,885
  40,729,887
  40,729,891
  40,729,923
  40,730,351
  40,730,599
  40,730,660
  40,730,665
  40,731,125
  40,731,355
  40,731,459
  40,731,612
  40,732,012
  40,732,084
  40,732,212
  40,732,473
  40,732,518
  40,732,847
  40,733,347
  40,733,392
  40,733,393
  40,733,434
  40,733,521
  40,733,545
  40,733,580
  40,733,619
  40,733,952
  40,734,059
  40,734,394
  40,741,475
  40,741,501
  40,742,081
  40,742,454
  40,742,558
  40,742,725
  40,742,857
  40,742,871
  40,743,375
  40,743,478
  40,743,684
  40,743,755
  40,744,461
  40,744,507
  40,744,623
  40,744,698
  40,744,702
  40,744,705
  40,744,720
  40,744,761
  40,744,864
  40,745,002
  40,745,281
  40,746,076
  40,746,143
  40,746,558
  40,746,568
  40,746,933
  40,747,071
  40,747,109
  40,747,238
  40,747,728
  40,747,970
  40,748,089
  40,748,308
  40,748,325
  40,748,343
  40,748,375
  40,749,004
  40,749,076
  40,749,224
  40,749,693
  40,751,027
  40,751,427
  40,751,623
  40,752,771
  40,753,008
  40,753,706
  40,753,962
  40,755,064
  40,755,905
  40,756,560
  40,756,641
  40,757,388
  40,758,574
  40,759,174
  40,759,396
  40,759,517
  40,762,141
  40,763,330
  40,763,888
  40,764,273
  40,764,763
  40,765,012
  40,765,091
  40,765,125
  40,765,151
  40,765,534
  40,765,610
  40,765,943
  40,766,250
  40,766,291
  40,766,593
  40,766,607
  40,766,630
  40,766,699
  40,767,454
  40,767,893
  40,768,082
  40,768,098
  40,768,180
  40,768,216
  40,768,361
  40,768,521
  40,768,736
  40,768,761
  40,768,910
  40,769,119
  40,769,618
  40,770,110
  40,770,192
  40,770,804
  40,770,906
  40,770,933
  40,771,137
  40,771,143
  40,771,151
  40,771,163
  40,771,176
  40,771,178
  40,771,192
  40,771,193
  40,771,263
  40,771,264
  40,771,287
  40,771,984
  40,771,985
  40,774,247
  40,775,014
  40,775,017
  40,775,374
  40,775,666
  40,775,742
  40,775,914
  40,775,979
  40,776,006
  40,776,012
  40,776,328
  40,776,458
  40,776,910
  40,777,060
  40,777,078
  40,777,428
  40,777,473
  40,777,489
  40,777,490
  40,777,631
  40,777,844
  40,778,086
  40,778,128
  40,779,474
  40,779,475
  40,779,914
  40,779,924
  40,780,131
  40,780,144
  40,780,766
  40,781,200
  40,781,429
  40,781,562
  40,781,796
  40,781,890
  40,782,500
  40,782,806
  40,783,083
  40,783,880
  40,785,092
2
T
G
T
5
A
C
C
T
C
A
T
A
G
-
8
C
-
T
A
C
C
G
A
A/5
C
2
G/11
A/G
-
45
21
C
A
2
G
3
T
G
-
G
2
A
G
G
T
G
A
G
A
T
A/G
G
A
C
C
C
C
T
5
9
C
3
A
3
C
C
2
C
C
C
2
-
A
C
-
G
C
C
A
-
A
C
A
G
A
G
-
T/15
G
A
G
-
A
G
2
C
A
A
C
A
-
T
C
G
A
G
2
C
C
G
C
C
C
C
A
G
G
C
A
T
A
G
C
C
G
G
A
G
A
4
-
A
T
A
A
2
2
A
G
T
G
A
5
C
G
C
A
T
A
3
A
A
G
C
C
A
G
G
C
A
C
A
A
T
C
C
C
5
9
G
G
-
C
C
A
G
A
C
T
A
G
T
A
C
7
40
A
C
A
C
A
G
G
G
A
A
C
T
G
G
A
C
-
3
G
-
T
13/11
7
G
A
9
27
-
C
C
A
T
-
2
-
9
T
C
G
G
G
10
A
3/-
C/16
A
G
C
G
A
13
C
A
T
C/2
3
G
7
A
A
5
13/9
G
T
3
A
2
C/5
A
2
A
C
A
G
T
C
A
C
T
G
T
G
G
9
C
G
G
C
C
A
A
T
A
4
C
A
A
C
5
-
3
-
T
G
G
G
A
G
A
G
C/3
C/50
-
-
G
A
T
T
C
G
33
C
A
A
C
G
T
C
G
T
C
G
T
T
-
C
C
C
-
G
G
C
A
C
-
A/T
C
T
A
12
G
2
T
C
G