Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 98,032 (bp)   Positions: 357
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.979
.989
--
.018
.004
.04
.241
.273
.123
.008
.008
.114
.003
.024
.151
.32
--
--
.396
.083
.001
.02
.038
.025
.465
.449
.019
.334
.08
.055
.026
.012
.011
--
.11
.081
.078
.017
.071
.051
.008
.004
.024
.032
.002
.002
.016
.141
.067
.031
.116
.0
.0
.001
.001
.0
.001
.001
.0
.021
.006
.003
.992
.002
.003
--
.055
.149
.048
.0
.0
.004
.003
.248
.244
.239
.233
.226
.009
.018
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.113
.019
.001
.021
.023
.845
.696
.002
.0
.002
.0
.016
.015
.01
.007
.021
.013
--
--
--
--
.007
.046
.019
.032
.204
.026
.028
.003
.007
.005
.078
.461
--
--
--
.633
.004
.027
.002
.168
.005
--
--
--
.09
.771
.841
.297
.147
.052
.097
.04
.087
.124
.547
.066
.053
.848
.277
.652
.012
.024
.204
.127
.187
.224
.248
.007
.272
.375
.009
--
.115
.054
.011
.005
.113
.117
.1
.011
.578
.112
.214
.008
.086
.091
.173
.131
.144
.027
.057
.012
.708
.189
.256
.191
.266
.459
.009
.005
.006
.002
.031
.277
.018
.04
.001
.015
.937
.313
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.282
.14
.943
.106
.008
.005
.19
.027
.027
.134
--
.024
.009
.134
.0
.011
.0
.12
.443
.105
.037
.011
.012
.001
.001
.009
.997
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.0
.06
.993
.018
.022
.072
.027
.011
.015
.149
.19
.006
.833
.005
.019
--
--
.168
.017
.021
.027
.002
.104
.001
.042
.007
.003
.263
.005
.003
.717
.631
.187
.002
.375
--
.022
.017
.002
.001
.035
.005
.228
.0
.063
.0
.056
.025
.157
.095
.045
.009
.051
--
.016
.012
.004
.079
.008
.972
.04
.004
.222
.037
.337
.3
.0
.002
--
--
--
--
--
.008
.009
.005
.001
.0
.032
.003
.002
.003
.004
.002
.001
.005
.001
.029
.0
.001
.0
.026
.423
.007
.789
.307
.994
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
Glra1
C
T
A
T
T
A
A
T
C
C
C
C
T
7
T
A
C
T
A
C
T
T
T
G
G
2
A
G
4
C
T
C
C
C
C
A
C
T
T
T
T
T
T
T
4
G
C
A
A
A
G
T
C
C
C
C
C
C
G
T
C
A
G
C
C
G
T
C
3
A
T
G
A
G
G
T
T
T
C
T
T
C
C
2
2
10
G
C
2
2
G
A
10
G
T
T
T
C
C
G
G
T
G
T
A
A
C
3
C
T
T
C
T
G
T
3
G
T
A
G
C
T
T
A
A
G
T
C
C
A
G
T
G
A
G
T
T
A
A
G
A
G
A
C
T
C
C
A
C
G
G
C
C
C
A
A
T
G
G
T
A
G
A
C
A
G
C
T
T
A
G
A
T
C
C
G
C
T
C
G
A
A
2
T
A
G
G
A
A
T
C
G
T
A
T
6
C
T
C
C
G
G
T
T
T
T
C
C
T
A
A
A
C
A
G
10
4
C
A
6
T
T
G
C
T
C
15
A
2
T
T
C
C
T
A
C
3
C
C
A
T
A
A
G
G
G
G
4
C
4
2
T
2
6
2
2
4
C
G
G
C
C
A
C
A
C
G
C
A
A
A
C
A
G
4
2
C
A
2
G
G
C
T
T
T
C
T
G
T
A
A
G
C
C
A
C
A
G
T
G
T
C
C
C
T
G
G
A
2
G
6
4
G
C
A
C
C
A
C
C
C
C
G
C
C
T
A
T
C
T
C
G
T
A
C
T
A
C
T
A
A
C
2
T
T
T
C
T
T
G
A
T
G
A
C
T
C
  40,687,139
  40,687,406
  40,689,727
  40,691,216
  40,691,732
  40,692,166
  40,692,298
  40,693,557
  40,695,484
  40,695,525
  40,695,529
  40,696,660
  40,696,992
  40,697,029
  40,697,214
  40,697,792
  40,698,594
  40,699,986
  40,700,235
  40,700,271
  40,701,017
  40,701,112
  40,701,204
  40,701,391
  40,701,485
  40,701,487
  40,701,522
  40,701,720
  40,701,829
  40,701,834
  40,701,839
  40,701,848
  40,701,860
  40,701,917
  40,702,944
  40,703,152
  40,703,319
  40,703,727
  40,703,947
  40,703,952
  40,703,974
  40,703,979
  40,703,986
  40,703,990
  40,704,036
  40,704,242
  40,704,317
  40,704,612
  40,704,676
  40,704,751
  40,704,780
  40,704,852
  40,704,961
  40,704,963
  40,704,972
  40,704,982
  40,705,008
  40,705,009
  40,705,020
  40,705,178
  40,705,390
  40,705,553
  40,705,660
  40,705,914
  40,705,957
  40,706,052
  40,706,473
  40,706,737
  40,706,770
  40,708,005
  40,708,099
  40,708,202
  40,709,503
  40,711,067
  40,711,071
  40,711,075
  40,711,079
  40,711,083
  40,711,343
  40,711,667
  40,711,928
  40,712,004
  40,712,006
  40,712,085
  40,712,099
  40,712,108
  40,712,154
  40,712,157
  40,712,172
  40,712,197
  40,712,198
  40,712,212
  40,712,215
  40,712,224
  40,712,711
  40,713,206
  40,713,380
  40,713,455
  40,713,456
  40,713,519
  40,713,535
  40,714,255
  40,714,727
  40,715,132
  40,716,026
  40,717,054
  40,717,227
  40,717,234
  40,717,253
  40,717,257
  40,717,313
  40,717,479
  40,717,553
  40,717,618
  40,717,630
  40,718,029
  40,718,128
  40,718,348
  40,718,353
  40,718,584
  40,718,661
  40,718,707
  40,720,500
  40,720,518
  40,720,591
  40,720,782
  40,720,917
  40,721,785
  40,721,811
  40,722,460
  40,722,965
  40,723,158
  40,723,161
  40,723,212
  40,723,779
  40,724,359
  40,724,587
  40,724,590
  40,724,598
  40,724,709
  40,724,872
  40,724,892
  40,724,999
  40,725,067
  40,725,087
  40,725,175
  40,725,254
  40,725,380
  40,725,688
  40,725,736
  40,725,912
  40,725,948
  40,726,021
  40,726,145
  40,726,196
  40,726,461
  40,726,521
  40,726,555
  40,726,709
  40,726,972
  40,726,975
  40,727,088
  40,727,383
  40,727,552
  40,727,716
  40,727,971
  40,728,033
  40,728,104
  40,728,215
  40,728,474
  40,728,515
  40,728,595
  40,728,864
  40,729,112
  40,729,208
  40,729,338
  40,729,491
  40,729,499
  40,729,923
  40,730,263
  40,730,351
  40,730,599
  40,730,660
  40,731,125
  40,731,459
  40,732,012
  40,732,084
  40,732,275
  40,732,473
  40,732,760
  40,732,847
  40,733,602
  40,733,626
  40,733,952
  40,734,727
  40,734,728
  40,741,206
  40,741,272
  40,741,390
  40,741,453
  40,741,650
  40,741,706
  40,742,081
  40,742,152
  40,742,558
  40,742,871
  40,743,470
  40,743,478
  40,743,684
  40,743,755
  40,744,507
  40,744,623
  40,744,693
  40,744,698
  40,744,702
  40,744,711
  40,744,723
  40,744,735
  40,744,744
  40,744,763
  40,744,864
  40,745,002
  40,745,281
  40,746,076
  40,746,143
  40,746,558
  40,746,568
  40,746,890
  40,746,927
  40,747,109
  40,747,238
  40,747,649
  40,747,728
  40,747,970
  40,748,089
  40,748,308
  40,748,325
  40,748,343
  40,748,375
  40,749,004
  40,749,076
  40,749,085
  40,749,224
  40,749,449
  40,749,693
  40,749,924
  40,750,006
  40,750,071
  40,750,083
  40,750,090
  40,750,092
  40,750,103
  40,750,106
  40,750,111
  40,750,118
  40,750,161
  40,750,165
  40,750,168
  40,751,027
  40,751,427
  40,753,008
  40,753,575
  40,753,962
  40,754,928
  40,755,064
  40,756,560
  40,756,688
  40,756,737
  40,757,398
  40,757,402
  40,758,574
  40,759,292
  40,761,940
  40,762,141
  40,762,594
  40,762,596
  40,763,300
  40,763,341
  40,763,377
  40,763,378
  40,764,763
  40,764,917
  40,765,012
  40,765,091
  40,765,125
  40,765,151
  40,765,534
  40,765,610
  40,765,943
  40,766,250
  40,766,291
  40,766,593
  40,766,607
  40,766,630
  40,767,454
  40,767,893
  40,768,082
  40,768,098
  40,768,180
  40,768,216
  40,768,361
  40,768,521
  40,768,736
  40,768,761
  40,768,910
  40,769,119
  40,769,618
  40,770,192
  40,770,242
  40,770,569
  40,770,691
  40,770,753
  40,770,833
  40,771,137
  40,771,143
  40,771,151
  40,771,163
  40,771,341
  40,771,455
  40,771,984
  40,772,855
  40,774,165
  40,774,247
  40,775,014
  40,775,017
  40,775,374
  40,775,666
  40,775,742
  40,775,762
  40,775,914
  40,775,979
  40,776,006
  40,776,077
  40,776,328
  40,776,458
  40,776,910
  40,777,060
  40,777,078
  40,777,428
  40,777,473
  40,777,489
  40,777,490
  40,777,631
  40,777,844
  40,778,086
  40,778,128
  40,779,165
  40,779,474
  40,779,924
  40,780,131
  40,780,144
  40,780,377
  40,781,644
  40,781,890
  40,782,663
  40,784,434
  40,785,092
2
-
A/-
C
C
C
-
-
A
C/T
C/T
A
C
-
C
G
2
C
5/7
C/T
C
C
C
A
G/2
-
-
A
4/-
C/T
T/C
C/T
C/A
C/4
6
C
T
C
T/C
T/C
T/2
T/2
T/-
T/-
-
A
T
G
G
G
A
C
T
A
T
T
T
T
A
C
2
G
A
T
2
G/T
C
3
-
G
2
A
G
G/T
G/T
T/G
T/G
T/G
T
C
C
T
T
-
-
10/3
3
C/5
-
2/-
3
4
10/-
5
C
C
C
C/2
A
G/A
G/A
-
A
A
C
G
C/G
-
C/-
T/C
C
G
C
A
G
-
A
C
G
A
T
C
C
T
T
T
C
T
T
4
A
10
2
T
A
C
C
G
G
A
G
A
G
T
A
T
T
T
A
A
2
A
T
T
G
G
A
A
5
C
G
C
T
A
3
A
A
C
C
G
C
G
C
3
T
T
T
C
G/9
A
G
G
-
C
G
C
T
2
G
C
A
A
C
G
T/3
6/-
3/CT
G
G
G
A
A
C
2
G
C
-
4
G
-
5
A/5
C/T
G
G/A
10/-
4/-
C/T
A/G
6/-
C
C
A
T
-
2
15/-
A/G
-
C
G
A
G
G
10/G
A
-
C/T
A
G
C
G
G
A
A
G/A
G/T
-
C/T
-
2/-
T/C
2/-
6/-
2/-
2/-
4/-
5
5
C
2
3
G
T
3
A
2
T
G
A/G
G
C/T
G
2
4/-
2/-
T
A/T
2/-
3
A
T
C
A
G
T
C
A
C
T
G
T
G
G
C
G
G
C
C
A
A
T
A
4
C
A
A
5
-
A
6/-
4/-
G/A
T
G
G
G
G
A
-
T
T
A
T
T
C
G
7
C/2
C
A
A
C
G
T
C
G
T
C
G
T
T
-
C
C
C
T
-
C
A
C
A
T
12
2
C
G