Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 78,705 (bp)   Positions: 296
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.964
.585
.115
.048
.044
.009
.01
.11
.122
.156
.097
.063
.027
.004
.019
.605
.01
.001
.001
.005
.0
.692
.002
.216
.151
.621
.024
.001
--
--
.246
.047
.009
.011
.013
.01
.031
.012
.026
.721
.001
.089
.422
.049
.019
.002
.007
.292
.079
.039
.099
.073
.143
.002
.007
.021
--
.004
.027
.042
.001
.037
.153
.139
.006
.062
.089
.245
.243
.17
.005
.144
.168
.002
--
--
.01
.013
.001
.0
.002
.007
.002
.001
1.0
.001
.008
.321
.003
.027
.001
.005
.024
.505
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.099
.003
.003
.001
.002
.005
.005
.005
.137
.02
.038
.048
.014
.0
.292
.04
.0
.009
.002
.201
.019
.004
.049
.001
.003
.001
.746
.003
.003
.062
.008
.001
.003
.002
.057
.057
.001
.007
--
.0
.008
.166
.002
.045
.003
.007
.624
.574
.457
.106
.038
.03
.116
.092
.288
.001
.001
.0
.02
.049
--
--
--
--
.028
.0
--
--
.037
.001
.887
--
--
--
--
--
.073
.07
.043
.4
.023
--
.264
.535
.527
.023
.617
.696
.207
.002
.02
.002
.0
.003
.008
.001
.202
.305
.016
.004
--
--
--
--
.054
.034
.333
.015
.029
--
.01
.153
.007
.06
.041
.044
.0
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.079
.19
--
--
.009
.023
.134
.054
.181
.057
.005
--
.653
.684
.034
.346
--
.004
.42
.417
.001
.003
--
--
--
.013
.084
.005
.101
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
Gipc2
C
C
T
A
T
T
G
A
C
T
2
C
G
G
G
T
T
A
A
G
C
2
T
G
2
T
24
A
A
G
C
G
5
C
A
G
G
A
G
T
2
C
G
A
C
C
C
T
C
2
T
G
T
A
C
3
C
T
A
T
A
A
C
T
A
8
T
C
C
T
T
T
C
T
A
A
A
C
4
C
G
A
C
C
C
T
C
T
G
4
2
14
C
C
A
T
A
G
G
A
G
T
G
C
C
A
C
C
T
T
T
C
T
C
G
G
C
C
T
T
C
3
2
7
2
G
G
3
G
A
7
T
T
T
A
T
G
C
A
T
C
T
A
T
A
G
A
T
A
2
G
T
G
G
A
A
G
G
G
T
A
C
T
C
T
T
C
G
C
G
G
C
C
C
T
C
T
G
A
7
C
C
C
C
2
12
7
C
C
T
A
T
A
G
T
G
G
2
T
C
2
A
T
C
T
T
T
11
G
C
A
C
2
C
2
T
T
C
G
C
T
T
G
C
T
C
C
G
5
T
C
C
A
G
C
6
A
C
C
G
2
G
C
A
G
A
4
T
T
2
A
T
C
G
T
T
T
G
10
8
A
C
A
2
2
A
T
C
12
T
C
C
T
C
G
C
G
A
6
4
T
T
T
T
C
T
24
T
A
A
A
T
G
C
C
T
  275,974,623
  275,974,960
  275,975,128
  275,975,138
  275,975,140
  275,975,164
  275,975,165
  275,975,173
  275,975,175
  275,975,209
  275,975,216
  275,975,219
  275,975,222
  275,975,246
  275,975,252
  275,975,271
  275,975,405
  275,975,418
  275,975,420
  275,975,443
  275,975,459
  275,975,620
  275,975,845
  275,975,935
  275,975,939
  275,976,457
  275,976,738
  275,977,045
  275,977,797
  275,977,839
  275,978,351
  275,979,032
  275,979,123
  275,981,047
  275,981,108
  275,981,110
  275,981,573
  275,981,630
  275,981,707
  275,981,794
  275,981,902
  275,982,326
  275,982,388
  275,982,422
  275,982,494
  275,982,532
  275,982,557
  275,982,587
  275,982,691
  275,982,739
  275,982,796
  275,982,812
  275,982,950
  275,983,058
  275,983,076
  275,983,134
  275,983,328
  275,983,412
  275,983,692
  275,983,715
  275,983,742
  275,983,789
  275,984,110
  275,984,114
  275,984,226
  275,984,294
  275,984,346
  275,984,383
  275,984,468
  275,984,488
  275,984,574
  275,984,820
  275,984,822
  275,985,053
  275,985,160
  275,985,535
  275,985,845
  275,985,905
  275,986,484
  275,986,540
  275,986,950
  275,986,981
  275,987,487
  275,988,511
  275,989,603
  275,991,527
  275,991,842
  275,992,657
  275,993,366
  275,994,235
  275,994,948
  275,997,158
  275,997,245
  275,997,347
  275,997,629
  275,998,313
  275,998,356
  275,998,605
  275,998,613
  275,998,631
  275,998,633
  275,998,668
  275,998,671
  275,998,675
  275,998,766
  275,998,771
  275,998,837
  275,998,846
  275,998,937
  275,998,977
  275,998,982
  275,999,345
  275,999,399
  275,999,403
  275,999,710
  275,999,816
  276,000,073
  276,000,697
  276,000,946
  276,001,152
  276,001,260
  276,001,664
  276,002,050
  276,002,053
  276,002,383
  276,002,533
  276,002,563
  276,002,899
  276,002,951
  276,002,954
  276,005,549
  276,005,673
  276,005,781
  276,005,843
  276,005,964
  276,005,971
  276,006,005
  276,006,031
  276,006,291
  276,006,450
  276,006,669
  276,006,674
  276,006,688
  276,006,717
  276,006,825
  276,007,036
  276,007,205
  276,007,383
  276,007,493
  276,007,981
  276,008,412
  276,008,534
  276,009,027
  276,009,110
  276,009,334
  276,009,399
  276,009,427
  276,009,795
  276,009,849
  276,009,855
  276,010,112
  276,010,157
  276,010,220
  276,010,264
  276,010,310
  276,010,374
  276,010,376
  276,010,431
  276,010,648
  276,010,965
  276,011,217
  276,011,218
  276,011,323
  276,011,434
  276,011,546
  276,011,647
  276,012,188
  276,012,313
  276,012,373
  276,012,557
  276,013,059
  276,013,094
  276,013,569
  276,014,310
  276,014,624
  276,014,626
  276,014,631
  276,015,667
  276,016,311
  276,018,984
  276,019,041
  276,019,085
  276,019,480
  276,020,593
  276,020,701
  276,020,764
  276,021,109
  276,022,179
  276,022,531
  276,022,547
  276,022,688
  276,022,908
  276,023,537
  276,024,184
  276,024,447
  276,024,578
  276,025,040
  276,025,204
  276,025,343
  276,025,512
  276,025,614
  276,025,768
  276,026,034
  276,026,046
  276,027,014
  276,027,015
  276,027,238
  276,027,708
  276,027,773
  276,028,035
  276,028,347
  276,028,556
  276,028,557
  276,028,905
  276,029,323
  276,030,020
  276,030,062
  276,030,494
  276,030,541
  276,030,638
  276,030,872
  276,030,894
  276,030,910
  276,031,035
  276,031,893
  276,032,428
  276,032,751
  276,032,926
  276,032,943
  276,033,103
  276,033,117
  276,033,182
  276,033,721
  276,033,969
  276,034,325
  276,034,499
  276,034,713
  276,034,815
  276,035,141
  276,035,522
  276,035,673
  276,035,695
  276,035,928
  276,036,159
  276,036,293
  276,038,132
  276,038,757
  276,038,766
  276,038,775
  276,038,915
  276,038,954
  276,038,991
  276,039,028
  276,039,047
  276,039,089
  276,039,122
  276,039,217
  276,039,281
  276,039,640
  276,039,740
  276,039,752
  276,039,758
  276,039,876
  276,039,900
  276,040,014
  276,040,241
  276,040,521
  276,041,916
  276,043,389
  276,043,391
  276,043,562
  276,045,908
  276,046,728
  276,047,015
  276,047,265
  276,047,266
  276,048,407
  276,048,508
  276,049,090
  276,049,319
  276,049,501
  276,049,532
  276,049,665
  276,050,264
  276,051,509
  276,051,627
T
7
C
T
C
C
A
12
A
A
-
3
12
A
A
C
C
C
C
T
T
-
9
C
-
A
-
G
-
4
T
A
-
T
G
A
A
3
A
5
-
T
A
G
G
G
G
C
T
-
G
C
C
G
T
-
T
G
G
G
G
G
2
27
G
-
C
T
T
C
G
5
4
A
G
G
G
T
-
T
A
C
T
A
T
C
T
3
A
-
-
-
T
T
G
C
T
A
A
C
A
5
A
T
T
G
T
T
A
G
C
T
C
T
T
T
6
T
C
3/TA
T
-
-
-
-
A
C
-
A
59
-
3
C
G
G
G
-
T
T
A
A
G
G
C
G
C
G
C
G
-
T
C
A
7
G
G
A
A
A
C
G
7
G
T
G
G
T
A
G
A
A
G
G
A
C
3
C
A
-
-
T
T
T
-
2/-
12/-
7/-
T
9
C
G
G
G
A
C
A
15/11
-
C
T
-
G
-
T
3/4
C
C
-
A
T
G
5/3
-
5
2/-
T/-
3/4
C/2
A
T
C
C
A
T
-
T
C/2
A
-
-
T
15/17
11
C
T
-
3/AT
T
3
7/12
2/-
A
A
T
T
G
-
C
-
-
-
C
G
A
C
5
C
A
-
-
3
G
3
-
-
7
C
T
-
C
7
3
C
T
G/29
T
7
G
6/-
4/-
A
C
3
C
3/CT
T/-
-
15
G
G
3/AT
C
11
T
T
C