Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 111,526 (bp)   Positions: 604
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.917
.016
.873
.994
.005
.005
.0
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.066
.747
.021
.34
.04
.291
.046
.031
.154
.111
.004
.004
.029
.043
.199
.351
.035
.207
.003
.043
.001
.0
.0
.244
.0
.025
.002
.002
.002
.01
.002
.0
.0
.0
.001
.0
.013
.207
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.11
.012
.01
.006
.007
.042
.028
.002
.003
.22
.002
--
--
.219
.385
.047
.006
.003
.003
.002
.039
.003
.013
.058
.888
.436
.564
.004
.001
.515
.0
.0
.0
.0
.001
.006
.001
.002
.0
.019
.004
.0
.006
.003
.013
.001
.012
.028
.037
.008
.036
.023
.007
.023
.022
.005
.018
.069
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.003
.08
.297
--
--
--
--
--
.008
.023
.272
.071
.022
.011
.002
--
.059
.001
.184
.009
.057
.03
.002
.023
.004
.065
.011
.001
.004
.062
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.008
.066
.031
--
--
--
.167
.009
--
--
--
--
--
.083
.004
--
--
.009
.086
.019
.01
.021
.014
.016
.023
.01
.015
.023
.006
.017
.001
.028
.031
.001
.069
.028
.001
.001
.001
.148
.007
.009
.024
.002
.003
.02
.001
.003
.005
.002
--
--
--
.065
.067
.031
.024
.411
.003
.025
.0
.0
.0
.002
.327
.002
.037
.008
.026
.014
.003
.013
.001
.023
.0
.001
.001
.001
.015
.006
.01
.053
.207
.011
.062
.025
.015
.024
.013
.06
.008
.045
.001
.288
.001
.998
.001
.0
.0
.002
.0
.001
.002
--
--
.021
.018
.004
.999
.998
.999
.999
.999
.999
.999
1.0
.93
1.0
1.0
.987
.069
.711
.011
.043
.017
--
--
--
--
--
--
--
.008
.014
.002
.001
.05
.104
.031
.032
.0
.03
.521
.97
.179
.184
.125
.486
.005
.039
.004
.024
.057
.146
.003
.005
.003
.042
.02
.083
.068
.006
.005
.008
.002
.091
.118
.062
.04
.007
.033
.0
.301
.006
.009
.147
.008
.027
.274
.453
.54
.575
.213
.116
.006
.078
.066
.005
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
.011
.035
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.709
.149
.663
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.094
.568
.084
.017
.032
.034
.007
.01
.201
.368
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.015
.413
.258
.0
.001
.001
.016
.003
.115
.006
.003
.454
.022
.084
.002
.001
.007
.002
.025
.001
.001
.004
.0
.034
.002
.0
.144
.009
.0
.0
.0
.008
.003
.358
.0
.005
.001
.001
.0
.006
.015
.002
.669
.015
.098
.002
.007
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.03
.004
.015
.546
.135
.012
.081
.024
.036
.016
.004
.19
.021
.086
.055
.077
.009
.001
.108
.672
.005
.002
.018
.008
.518
.001
.004
.013
.017
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
G
G
3
A
A
A
A
A
A
C
G
T
G
C
T
G
C
G
G
G
C
A
A
A
G
A
A
G
G
G
A
G
G
A
G
T
T
C
A
A
C
A
A
C
G
T
A
A
T
C
A
G
C
A
C
C
C
A
G
A
C
C
C
T
C
C
T
C
A
C
A
C
A
A
T
A
A
C
C
C
G
T
A
G
T
C
18
A
T
G
T
C
T
C
A
C
C
T
T
A
G
C
A
T
C
T
G
G
A
A
G
G
T
C
C
A
T
T
T
T
T
T
9
A
3
C
G
G
G
C
G
C
2
G
C
G
A
T
T
C
C
T
A
C
C
A
G
G
T
A
T
A
T
A
C
T
G
A
A
G
A
G
A
T
A
C
T
A
A
G
C
G
C
T
A
T
G
G
G
10
C
A
7
G
C
C
G
G
C
C
C
T
G
T
A
G
A
G
G
T
C
A
A
T
C
T
G
A
T
C
C
G
T
T
G
C
A
T
T
A
T
C
G
T
A
A
T
G
C
A
G
G
G
G
C
G
T
T
C
G
A
A
G
G
T
T
G
A
G
T
G
A
G
G
T
4
T
C
C
A
T
A
5
G
G
3
C
G
C
C
A
T
G
C
T
T
T
C
T
A
T
G
A
A
C
T
T
G
G
C
A
G
G
A
T
A
C
C
A
T
T
T
T
T
G
G
T
A
8
8
C
A
2
C
C
T
G
C
G
T
T
T
A
G
G
A
A
G
T
G
C
A
2
A
C
T
G
T
T
A
G
T
C
G
C
G
A
A
G
5
A
C
G
A
G
A
G
T
G
T
T
G
A
A
G
G
G
G
T
G
C
T
A
T
A
G
G
C
G
T
G
C
C
C
G
A
A
T
C
A
T
T
G
C
C
A
C
T
G
A
A
T
G
C
T
G
T
G
T
A
G
A
A
C
T
A
C
T
T
C
C
A
G
A
T
C
T
C
T
T
T
C
T
C
C
T
A
C
A
T
C
C
T
T
C
T
T
G
G
A
C
C
G
G
A
G
T
2
C
T
T
G
T
C
T
A
C
G
G
T
A
G
C
G
A
G
G
A
A
A
A
A
A
G
G
T
A
G
A
T
A
T
G
T
3
T
A
A
A
C
T
C
T
A
G
G
C
G
A
C
A
A
T
T
5
G
T
G
G
A
G
G
G
C
A
A
C
3
10
C
A
A
T
T
C
C
T
C
T
C
G
C
A
A
T
T
C
G
C
G
C
T
G
T
A
C
A
C
G
A
C
T
C
T
T
C
C
C
C
C
2
A
T
A
G
A
A
T
C
T
C
A
C
C
G
C
T
T
C
G
A
C
A
6
G
T
A
C
A
C
C
C
A
G
  113,844,321
  113,844,467
  113,844,966
  113,845,030
  113,845,114
  113,845,613
  113,845,873
  113,845,888
  113,845,894
  113,846,479
  113,846,568
  113,846,947
  113,847,043
  113,847,090
  113,847,309
  113,847,489
  113,847,919
  113,847,947
  113,848,067
  113,848,703
  113,848,724
  113,848,782
  113,848,846
  113,848,866
  113,848,893
  113,848,903
  113,849,026
  113,849,048
  113,849,436
  113,850,015
  113,850,128
  113,850,413
  113,850,519
  113,850,556
  113,850,567
  113,850,814
  113,850,880
  113,850,999
  113,851,403
  113,851,576
  113,851,597
  113,852,233
  113,852,432
  113,852,438
  113,852,538
  113,852,750
  113,852,927
  113,852,973
  113,853,009
  113,853,152
  113,853,746
  113,853,945
  113,854,017
  113,854,339
  113,854,406
  113,854,430
  113,854,604
  113,854,725
  113,854,799
  113,854,976
  113,855,070
  113,855,081
  113,855,086
  113,855,112
  113,855,304
  113,855,400
  113,855,812
  113,855,866
  113,855,971
  113,856,101
  113,856,675
  113,856,716
  113,857,010
  113,857,481
  113,857,615
  113,857,649
  113,857,652
  113,857,702
  113,858,075
  113,858,092
  113,858,111
  113,858,174
  113,858,666
  113,858,759
  113,858,763
  113,859,060
  113,859,411
  113,859,459
  113,865,628
  113,865,630
  113,865,676
  113,865,814
  113,865,880
  113,865,965
  113,865,981
  113,866,130
  113,866,144
  113,866,261
  113,866,391
  113,866,544
  113,866,663
  113,866,675
  113,867,047
  113,867,187
  113,867,247
  113,867,266
  113,867,338
  113,867,381
  113,867,699
  113,868,005
  113,868,021
  113,868,063
  113,868,152
  113,868,180
  113,868,238
  113,868,370
  113,868,624
  113,868,681
  113,868,795
  113,869,083
  113,869,482
  113,869,483
  113,869,777
  113,869,811
  113,869,813
  113,870,196
  113,870,288
  113,870,314
  113,870,367
  113,870,517
  113,870,698
  113,870,839
  113,870,990
  113,871,140
  113,871,153
  113,871,386
  113,871,414
  113,871,797
  113,872,288
  113,872,445
  113,872,623
  113,872,644
  113,872,964
  113,872,993
  113,873,123
  113,873,148
  113,873,372
  113,873,510
  113,873,550
  113,873,666
  113,874,123
  113,874,143
  113,874,710
  113,874,713
  113,874,743
  113,874,749
  113,874,792
  113,874,803
  113,874,919
  113,874,967
  113,875,478
  113,875,521
  113,875,931
  113,875,991
  113,876,200
  113,876,319
  113,876,326
  113,876,553
  113,876,647
  113,876,850
  113,877,103
  113,877,351
  113,877,529
  113,877,576
  113,877,865
  113,877,905
  113,878,035
  113,878,137
  113,878,362
  113,878,725
  113,878,845
  113,879,098
  113,879,374
  113,879,514
  113,879,743
  113,879,970
  113,879,976
  113,880,119
  113,880,300
  113,880,349
  113,880,398
  113,880,672
  113,880,721
  113,880,970
  113,880,986
  113,881,034
  113,881,048
  113,881,263
  113,881,488
  113,881,489
  113,881,514
  113,881,559
  113,881,604
  113,881,669
  113,881,868
  113,882,526
  113,882,700
  113,882,981
  113,883,206
  113,883,288
  113,883,391
  113,883,550
  113,884,084
  113,884,241
  113,884,247
  113,884,348
  113,884,732
  113,885,096
  113,885,112
  113,885,131
  113,885,172
  113,885,216
  113,885,634
  113,885,761
  113,885,966
  113,885,981
  113,886,221
  113,886,226
  113,886,313
  113,886,637
  113,886,680
  113,886,879
  113,886,902
  113,887,226
  113,887,273
  113,887,278
  113,887,285
  113,887,369
  113,887,377
  113,887,429
  113,887,518
  113,887,576
  113,887,580
  113,887,698
  113,887,967
  113,888,035
  113,888,158
  113,888,186
  113,888,327
  113,888,383
  113,888,436
  113,888,485
  113,888,640
  113,888,767
  113,888,833
  113,889,008
  113,889,025
  113,889,030
  113,889,110
  113,889,323
  113,889,349
  113,889,402
  113,889,412
  113,889,486
  113,889,499
  113,889,524
  113,890,532
  113,890,544
  113,890,636
  113,890,698
  113,890,764
  113,890,793
  113,890,806
  113,890,813
  113,890,833
  113,890,850
  113,890,885
  113,890,901
  113,891,022
  113,891,142
  113,891,152
  113,891,171
  113,891,176
  113,891,279
  113,891,385
  113,891,389
  113,891,411
  113,891,529
  113,891,537
  113,891,551
  113,891,563
  113,891,646
  113,891,708
  113,891,774
  113,891,788
  113,891,823
  113,891,947
  113,891,952
  113,892,107
  113,892,128
  113,892,187
  113,892,201
  113,892,242
  113,892,339
  113,892,345
  113,892,375
  113,892,396
  113,892,397
  113,892,586
  113,892,596
  113,892,656
  113,892,896
  113,892,973
  113,893,003
  113,893,073
  113,893,169
  113,893,209
  113,893,241
  113,893,294
  113,893,338
  113,893,392
  113,893,561
  113,893,571
  113,893,611
  113,893,876
  113,893,954
  113,894,014
  113,894,036
  113,894,080
  113,894,088
  113,894,096
  113,894,122
  113,894,142
  113,894,145
  113,895,898
  113,896,277
  113,896,330
  113,896,602
  113,896,986
  113,897,025
  113,897,195
  113,897,285
  113,897,350
  113,897,411
  113,897,469
  113,897,578
  113,898,093
  113,898,116
  113,898,538
  113,898,733
  113,898,976
  113,899,334
  113,899,588
  113,900,263
  113,901,767
  113,903,692
  113,904,073
  113,904,138
  113,904,692
  113,905,028
  113,905,540
  113,905,932
  113,906,213
  113,906,282
  113,906,450
  113,906,490
  113,906,494
  113,906,514
  113,906,633
  113,906,865
  113,906,872
  113,906,941
  113,906,979
  113,907,011
  113,907,078
  113,907,389
  113,907,805
  113,908,272
  113,908,473
  113,908,654
  113,908,694
  113,908,771
  113,909,022
  113,909,491
  113,909,807
  113,910,130
  113,910,290
  113,910,566
  113,910,596
  113,911,452
  113,911,507
  113,911,552
  113,911,949
  113,912,203
  113,912,347
  113,912,909
  113,912,960
  113,913,109
  113,913,159
  113,913,212
  113,913,288
  113,913,475
  113,913,520
  113,913,587
  113,914,232
  113,914,394
  113,914,447
  113,914,577
  113,914,622
  113,914,625
  113,914,733
  113,914,858
  113,914,942
  113,914,960
  113,915,301
  113,916,117
  113,916,386
  113,916,392
  113,916,590
  113,916,598
  113,916,658
  113,917,136
  113,917,142
  113,917,378
  113,917,432
  113,917,481
  113,917,520
  113,917,535
  113,917,655
  113,917,694
  113,917,713
  113,917,742
  113,917,753
  113,917,779
  113,917,795
  113,917,861
  113,917,916
  113,918,039
  113,918,683
  113,918,917
  113,919,118
  113,919,124
  113,919,682
  113,919,701
  113,919,737
  113,919,824
  113,919,826
  113,920,149
  113,920,227
  113,920,280
  113,920,438
  113,920,529
  113,920,715
  113,920,723
  113,920,762
  113,920,870
  113,920,939
  113,920,943
  113,920,982
  113,920,992
  113,921,094
  113,921,165
  113,921,245
  113,921,309
  113,921,339
  113,921,554
  113,921,565
  113,921,684
  113,921,843
  113,921,865
  113,922,245
  113,922,289
  113,922,461
  113,922,597
  113,922,795
  113,922,932
  113,923,070
  113,923,299
  113,923,307
  113,923,357
  113,923,528
  113,923,585
  113,923,822
  113,924,266
  113,924,267
  113,924,268
  113,924,276
  113,924,415
  113,924,419
  113,924,422
  113,924,429
  113,924,434
  113,924,477
  113,924,671
  113,924,751
  113,925,412
  113,925,453
  113,925,623
  113,925,641
  113,925,648
  113,925,902
  113,925,983
  113,926,189
  113,926,229
  113,926,321
  113,926,610
  113,926,659
  113,926,754
  113,927,013
  113,927,015
  113,927,217
  113,927,502
  113,927,540
  113,927,689
  113,928,190
  113,928,244
  113,928,366
  113,928,400
  113,928,465
  113,928,496
  113,928,530
  113,928,535
  113,928,622
  113,928,887
  113,929,059
  113,929,125
  113,929,357
  113,929,526
  113,929,572
  113,929,848
  113,930,643
  113,931,075
  113,931,949
  113,932,540
  113,933,071
  113,933,861
  113,933,887
  113,933,891
  113,934,220
  113,934,325
  113,934,337
  113,934,386
  113,934,516
  113,934,587
  113,935,036
  113,935,671
  113,935,709
  113,935,921
  113,935,925
  113,935,956
  113,936,260
  113,937,067
  113,937,070
  113,937,857
  113,938,019
  113,938,349
  113,938,586
  113,938,910
  113,939,339
  113,940,022
  113,940,154
  113,940,160
  113,940,161
  113,940,181
  113,940,193
  113,940,213
  113,940,217
  113,940,221
  113,940,225
  113,940,237
  113,940,253
  113,940,254
  113,940,255
  113,941,072
  113,941,128
  113,941,391
  113,941,658
  113,941,933
  113,942,110
  113,942,140
  113,942,687
  113,942,841
  113,942,886
  113,943,114
  113,943,884
  113,944,330
  113,945,384
  113,945,404
  113,945,815
  113,946,128
  113,947,661
  113,948,372
  113,948,586
  113,950,122
  113,950,575
  113,950,783
  113,951,270
  113,951,591
  113,953,031
  113,953,573
  113,954,942
  113,955,424
  113,955,482
  113,955,600
A
A
-
G
G
G
G
C
T
2
A
A
2
T
C
T
T
A
A
A
T
G
T
C
A
G
G
A
T
A
C
A
A
C
C
G
C
T
C
G
T
G
G
T
A
C
G
G
3
T
G
A
T
G
T
G
-
G
A
G
T
A
G
C
T
2
G
T
5
T
G
A
G
G
C
G
2
A
T
T
C
C
T
T
C
T
-
G
A
A
C
A
C
G
C
T
T
C
G
G
A
T
G
C
T
C
T
A
T
G
A
T
2
T
T
G
-
G
C
C
T/-
7
-
-
-
T
A
A
A
G
A
A
-
T
T
A
G
C
C
T
G
C
G
T
T
G
A
A
C
G
C
G
C
G
T
C
A
G
G
A
T
T
G
-
C
T
C
G
G
A
T
A
A
C
G
C
A
2
T
10/-
G
T
-
A
T
T
A
C
T
T
T
C
A
G
C
A
C
A
A
C
-
G
G
A
G
G
10
G
C
T
A
A
2
C
T
T
T
C
-
C
-
T
A
C
-
T
C
A
T
G
A
A
T
A
G
A
C
A
G
10
G
G
A
T
A
G
A
G
A
C
A
G
T
C
C
-
A
G
T
2
C
T
-
G/A
2
-
6
T
G
A
T
C
T
T
2
G
A
T
3
G
2
T
G
G
T
C
C
C
A
T
C
T
A
G
C
G
C/G
G
T
G
C
A
C
G
A
A
G
G
-
-
T
C
-
T
T
C
A
T
A
C
C
A
C
A
A
C
T
C
A
A
A
2
-
2
A
C
T
G
C
-
C
C
A
A
T
A
G
-
A
-
G
T
C
2
A
G
A
C
T
C
G
A
-
G
G/T
A
A
2
C
T
T
C
T
C
T
A
C
T
A
T/A
G/A
C/T
T
A
A
G
G
9
C/T
G
4
G
A
T
G
G
2
-
A
G
G
G
9
A
-
A
2
T
A
G
T
G
C
A
C
T
T
A
C
T
T
G
A
-
C
T
C
T
2
C
C
T
C
T
G
G
T
G
T
-
T
T
T/C
T/C
C/T
T/A
2
A
A
G
T
3
A
A
G
A
-
-
T
G
C
A
2
A
C
G
T
A
A
A
G
A
-
T
-
A
A
A/2
-
2
T
T
T
A
C
C
G
C
G
C
T
C
A
C
-
C
C
G
G
T
G
T
C
T
A
T
A
A
C
T
-
T
C
C
-
2
A
A
A
G
C
A
A
A
13/7
G
T
-
-
T
G
T
C
C
T
T
C
T
T/A
C/T
G/A
3
G
C
C
G
A
C
A
C
T
A
A
C
T
T
-
T
A
-
T
T/2
2
T/C
T/C
C/T
C/T
C/T
C/T
C/T
-
3
T/3
T
T
G
C
5
A
C
T
G
T
G
A
T
A
4
T
G/2
G
T
G
-
A
C
G
T
T
T
T
T
G
G/C