Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 274,016 (bp)   Positions: 326
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.006
.026
.0
.029
.001
.006
.002
.0
.981
.001
.04
.001
.02
.16
.0
--
.046
.004
.0
.035
.015
.002
.011
.001
.003
.023
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.017
.4
.074
.018
.006
.489
.471
.493
.683
.048
--
--
--
--
.055
.062
.081
.101
.143
.376
.0
.001
.027
--
.005
.063
.002
.883
.003
.007
.102
.05
.186
.003
.076
.001
.017
.002
.006
.617
.008
.909
.959
.013
.003
.0
.003
--
--
.176
.001
.985
.002
.757
.0
.342
.053
--
--
.05
.007
.0
.001
.023
.546
.223
.008
.136
.7
--
.059
.0
.023
.09
.011
.029
.172
.161
.005
.0
.143
.336
.003
.005
.001
.119
.056
.028
.002
.048
.363
.025
.0
.006
.638
.561
.172
.186
.335
.001
.056
.035
.009
.002
.03
.021
.13
.003
.101
.091
--
--
--
.014
.001
.001
.01
.001
.178
.004
.005
.148
.675
.998
--
--
--
.374
--
--
.067
.013
.078
.58
.075
.002
.008
.056
.006
.004
.057
.003
.595
.292
.013
.182
.808
.009
.001
.675
.02
.024
.005
.018
.009
.359
.511
.035
--
.006
.059
.038
.081
.015
.009
.001
.052
.086
.118
--
--
.023
.872
.002
.013
.012
.137
.001
.001
.014
.701
.278
.0
.014
.843
.103
.011
.136
.472
.061
.515
.188
.029
.123
.001
.027
.045
.007
.086
.002
.003
.19
.001
.004
.015
.075
.037
.541
.476
.077
.058
.169
.063
--
.008
.017
.207
.008
.084
.589
.016
.037
.258
.408
.128
.993
.016
.001
.001
.057
.071
.144
.013
.0
.002
.0
.004
.011
.0
.001
.179
.174
.012
.022
.001
.082
.095
.01
.004
.01
.062
.027
.037
.002
.021
.001
.024
.015
.029
.093
.002
.918
--
.0
.075
--
.007
.19
--
.007
.76
.171
.003
.063
.234
.034
.004
--
.031
.006
--
--
--
.004
.008
.017
.02
.995
.71
.456
.074
.0
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
Frmd5
A
T
C
4
T
T
T
G
T
A
G
T
G
C
G
G
12
T
C
C
G
G
T
A
C
G
C
G
A
G
T
T
T
C
C
T
T
G
4
10
4
7
T
A
G
A
G
C
T
C
G
A
G
T
A
T
G
G
A
A
C
G
G
C
T
G
C
A
T
T
C
G
G
C
6
T
T
G
C
A
G
G
T
C
A
A
C
T
G
A
C
A
A
T
T
3
4
G
G
T
G
G
C
T
C
C
G
C
C
G
C
C
C
G
C
2
C
C
C
G
C
T
A
A
T
A
T
T
T
8
A
C
A
T
G
A
C
G
C
T
G
G
G
A
G
G
A
C
T
A
T
G
G
A
A
T
A
T
G
G
G
8
C
G
T
5
A
C
G
A
A
A
T
C
A
T
G
T
3
T
A
G
C
T
C
G
G
A
T
C
T
A
A
G
T
C
G
T
G
G
A
T
C
G
A
C
T
G
A
T
T
C
A
A
T
G
C
G
A
T
G
2
C
T
C
A
G
G
A
T
56
G
T
C
C
A
G
C
T
T
G
C
C
C
T
A
C
T
A
A
G
A
121
T
T
G
T
C
T
T
A
A
A
T
C
A
A
A
G
A
A
A
A
T
C
G
G
G
G
T
G
C
T
C
C
C
T
A
C
C
T
A
G
A
A
A
G
A
A
A
2
4
G
A
T
G
12
C
A
C
G
2
G
A
112
2
C
G
C
A
C
4
2
2
G
T
  120,023,164
  120,027,763
  120,029,116
  120,031,408
  120,034,293
  120,034,506
  120,037,204
  120,037,839
  120,038,124
  120,040,221
  120,041,424
  120,042,168
  120,042,534
  120,042,846
  120,043,848
  120,044,901
  120,045,835
  120,047,173
  120,047,348
  120,048,066
  120,048,615
  120,050,531
  120,051,198
  120,052,011
  120,052,247
  120,053,094
  120,053,156
  120,053,221
  120,053,293
  120,053,373
  120,054,427
  120,054,588
  120,054,653
  120,054,694
  120,055,368
  120,055,438
  120,056,036
  120,056,668
  120,056,682
  120,056,698
  120,056,813
  120,056,818
  120,057,112
  120,057,905
  120,057,980
  120,058,219
  120,058,221
  120,059,772
  120,059,821
  120,060,399
  120,061,207
  120,061,346
  120,061,460
  120,061,786
  120,062,836
  120,063,832
  120,065,991
  120,066,443
  120,066,518
  120,066,817
  120,067,628
  120,067,786
  120,069,919
  120,071,049
  120,071,800
  120,072,646
  120,073,021
  120,073,823
  120,076,154
  120,079,941
  120,088,114
  120,088,129
  120,088,572
  120,088,735
  120,089,608
  120,089,617
  120,090,286
  120,090,354
  120,091,476
  120,091,871
  120,092,025
  120,092,041
  120,092,137
  120,093,883
  120,094,431
  120,094,913
  120,095,082
  120,095,292
  120,095,342
  120,095,997
  120,096,599
  120,098,075
  120,098,417
  120,098,686
  120,099,040
  120,099,098
  120,100,320
  120,100,685
  120,100,722
  120,101,228
  120,102,398
  120,102,440
  120,102,963
  120,103,071
  120,103,183
  120,103,588
  120,103,707
  120,103,739
  120,104,113
  120,104,314
  120,104,458
  120,104,492
  120,104,888
  120,105,283
  120,106,039
  120,106,236
  120,106,337
  120,106,701
  120,107,242
  120,107,354
  120,107,512
  120,107,900
  120,108,014
  120,108,640
  120,108,847
  120,108,892
  120,108,898
  120,109,427
  120,109,611
  120,111,173
  120,111,550
  120,111,561
  120,111,813
  120,112,886
  120,112,926
  120,114,241
  120,115,039
  120,116,130
  120,117,437
  120,128,508
  120,130,057
  120,130,662
  120,131,841
  120,131,916
  120,131,935
  120,131,984
  120,133,043
  120,133,146
  120,133,147
  120,133,534
  120,133,768
  120,134,063
  120,134,796
  120,134,833
  120,135,244
  120,135,352
  120,135,424
  120,135,520
  120,135,618
  120,135,621
  120,135,819
  120,136,171
  120,136,263
  120,136,524
  120,136,566
  120,136,789
  120,136,893
  120,137,399
  120,137,880
  120,137,901
  120,138,027
  120,138,410
  120,138,589
  120,139,267
  120,139,519
  120,140,186
  120,140,365
  120,141,285
  120,141,432
  120,141,481
  120,141,523
  120,141,766
  120,141,974
  120,142,299
  120,142,652
  120,142,682
  120,142,735
  120,142,944
  120,143,008
  120,143,614
  120,143,989
  120,144,204
  120,144,371
  120,144,513
  120,144,822
  120,144,927
  120,145,013
  120,145,038
  120,145,252
  120,145,261
  120,145,935
  120,145,984
  120,147,288
  120,147,611
  120,148,005
  120,148,179
  120,154,643
  120,158,125
  120,158,127
  120,161,068
  120,162,558
  120,162,690
  120,162,780
  120,163,545
  120,163,656
  120,164,193
  120,165,160
  120,165,217
  120,165,368
  120,165,469
  120,166,198
  120,166,378
  120,166,651
  120,167,215
  120,167,533
  120,167,854
  120,167,912
  120,167,998
  120,168,067
  120,168,083
  120,168,203
  120,168,347
  120,168,592
  120,168,603
  120,168,693
  120,168,953
  120,168,956
  120,169,213
  120,169,435
  120,169,580
  120,169,733
  120,169,979
  120,170,020
  120,170,042
  120,170,507
  120,170,586
  120,170,745
  120,171,052
  120,171,109
  120,171,400
  120,171,471
  120,171,705
  120,171,913
  120,172,479
  120,172,962
  120,173,073
  120,173,312
  120,173,528
  120,173,668
  120,173,891
  120,173,905
  120,173,906
  120,173,941
  120,173,961
  120,173,965
  120,173,985
  120,174,109
  120,174,370
  120,174,539
  120,174,640
  120,174,879
  120,175,359
  120,175,372
  120,175,546
  120,175,555
  120,175,601
  120,175,663
  120,175,800
  120,176,387
  120,176,726
  120,177,996
  120,178,263
  120,179,396
  120,180,994
  120,181,259
  120,181,261
  120,181,373
  120,181,642
  120,181,769
  120,182,084
  120,182,510
  120,182,512
  120,182,781
  120,182,811
  120,183,140
  120,189,648
  120,196,852
  120,196,906
  120,224,900
  120,238,126
  120,241,740
  120,242,287
  120,246,692
  120,247,126
  120,249,254
  120,252,950
  120,256,091
  120,256,819
  120,257,331
  120,258,186
  120,259,458
  120,259,594
  120,261,309
  120,261,623
  120,262,812
  120,263,101
  120,263,381
  120,263,401
  120,263,403
  120,263,404
  120,263,965
  120,266,011
  120,278,830
  120,279,408
  120,284,373
  120,284,391
C
T/-
T
-
C
T/C
2
G/10
T/C
T
A
G
G/A
A
A
A
12/-
C
T
T
A
G/-
C
C
T
A
T
A
2
2
C
C
T/G
T
T
C
C
A
-
-
-
7/-
T/G
4
G/4
A/3
G/5
T
C
3
3
G
A
C
G
C
2
G/3
G
G
C/2
A
-
T
C
A
T
G
TG/3
T/-
T
A
A
T
6/-
T/C
C
A
A
G
A
C
-
T
A/-
G
A
C
A
A/2
T
-
A/2
T/23
C
-
-
A
A
A
A
2
T
C
T
T
A
T
T
A
G
C/T
G
C
2
2/-
T
T
A
A
T
T/13
2
G
C
G
A
A
2
-
A/G
T
G
G
A
A/2
T
G/2
T
C
A
G/C
A
T
A
A
T
3
2
T
C
A
A
G
G
2
A/G
A
A
T
G/T
-
T
G/A
C
-
G
C/T
A
A/G
C
8
-
T
C
C
A
A
-
C
C
A
T
C
T
A
A
G
A
A
C
A/4
C
A
-
T
A
A
A
G/5
-
A
2
24
G
T
T/C
3
C
C
T/A
C/3
C
T
C
2
T
A
G
C
A
-
C/T
C
T
G
A
A
-
T/2
-
A
C
T
T
G
A
G
C
G
A
T
3
G
C
C
T
C
G
G
A
G
-
A
C
A
2
C/A
C
T/C
G
C
-
G
T
C
G
G
A
A/G
G
G
G
C
T
A
G/A
T
A
C
A
G
C
T
T
T
C
-
T
G
C
A/9
A
G
A/T
3
A
G
12
G
-
-
-
G
A
A
-
4
A/9
T
A
-
A
A/-
-
2/-
A
A
T
G
G
-
2/-
2/-
G/-
C