Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 148,676 (bp)   Positions: 458
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.001
.001
.098
.002
.044
.0
.013
.012
.026
.0
.0
.067
.001
.003
.049
.045
.002
.005
.13
.015
.057
.078
.009
.009
.002
.023
.003
.03
.236
.049
.048
.05
.157
.174
.245
.274
.845
.115
.004
.011
.004
.007
.014
.179
.0
.01
.007
.028
.001
.495
.005
.004
.007
.0
.001
.008
.332
.056
.082
.0
.22
.535
.164
.0
.0
.003
.373
.724
.109
.527
.869
.949
.946
.0
.159
.011
.019
.002
.3
.002
.066
.002
.01
.035
.025
.015
.002
.001
.002
.0
.0
.0
.102
.002
.019
.109
.0
.001
.173
.005
.062
.01
.0
.131
.001
.011
.285
.002
.0
.929
.087
.091
.001
.16
.001
.008
.375
.009
.003
.881
.004
.002
.0
.038
.032
.023
.017
.027
.107
.094
.036
--
.139
.188
.055
.957
.021
.407
.397
.384
.375
.194
.176
.066
.003
.003
.004
.004
.001
.036
.068
.075
.002
.232
.001
.002
.043
.0
--
--
.0
.0
.001
--
.001
.001
.002
.002
.049
.006
.006
.073
.001
.1
.004
.038
.0
.001
.003
.002
.001
.759
.03
.003
.004
.049
.041
.011
.184
.0
.002
.963
.007
.0
.006
.681
.122
.049
.093
.255
.089
.256
1.0
.0
.019
.003
.008
.497
.005
.004
.003
.003
.003
.001
--
.011
.009
.023
.044
.069
.076
.069
.39
.001
.148
.365
.035
.257
.001
.0
.0
.002
.006
.016
.0
.0
.01
.011
.044
.003
.012
.046
.127
.189
.01
.027
.005
.0
.009
.026
.054
.0
.113
.02
.62
.001
.001
.004
.114
.046
.001
.003
.012
.046
.007
.027
.283
.095
.08
.002
.002
.001
.002
.001
.001
.004
.008
.002
--
--
.915
.006
.001
.981
.904
.905
--
.002
.994
.003
.003
.143
.165
--
.01
.113
.044
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.273
.004
.173
.05
.001
.0
.479
.001
.001
.005
.0
.023
.001
--
--
--
.035
.001
.003
.017
.0
.001
.001
.349
.16
.182
.259
.977
.002
.004
.025
.005
.004
.0
.001
.006
.001
.012
.032
.124
.168
.145
.351
.233
.0
.004
.006
.001
.006
.0
.108
.343
.001
.345
.999
.011
.988
.996
.005
.319
.776
.562
.001
.074
.002
.03
.002
1.0
.746
.001
.99
.4
.001
.015
.047
.004
.848
.362
--
.013
.032
.125
.143
.007
.021
.615
.003
.43
.483
.034
--
.004
.001
.032
.035
.008
.118
.741
.003
.974
.001
.014
.042
.061
.272
.506
.201
.003
.209
.236
.561
.005
.035
.185
.318
.001
.001
.01
--
--
.003
.029
.011
.016
.006
.036
.0
.02
.361
.369
.324
.012
.003
.002
.315
.001
.104
.0
.0
.003
.011
.009
.001
.0
.002
.068
.249
.706
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
C
C
G
G
T
A
A
C
C
T
G
G
A
2
A
C
A
A
A
A
A
A
A
A
G
A
C
T
T
A
C
T
T
G
T
C
A
A
2
C
G
8
C
G
G
T
G
119
A
A
T
C
T
C
C
4
T
G
C
G
12
10
A
T
T
T
C
A
G
A
C
A
A
G
G
C
C
C
T
A
A
3
C
T
A
C
C
A
A
T
A
6
A
T
C
G
A
2
C
G
T
A
A
G
4
A
A
T
A
C
A
G
C
4
C
G
C
G
A
T
T
A
G
G
T
G
C
C
C
T
12
4
2
A
G
G
C
C
G
T
T
A
G
C
T
A
A
A
G
T
G
A
T
A
T
C
T
T
C
C
A
G
C
C
C
T
G
5
A
C
A
A
A
A
T
T
26
C
C
T
C
A
T
A
C
A
C
T
A
C
A
C
A
3
G
A
A
A
A
A
G
T
G
A
G
T
A
T
A
T
10
6
2
T
G
C
C
T
A
C
C
C
C
G
16
T
2
T
A
6
T
A
G
C
C
A
A
C
C
C
C
2
G
G
A
A
C
C
G
C
C
C
G
2
G
T
C
T
T
G
8
A
G
G
C
A
A
T
G
G
C
G
T
C
T
G
2
A
A
G
C
T
A
C
C
T
G
C
A
T
C
G
G
C
G
T
C
2
A
G
2
A
A
2
A
2
A
G
A
G
G
A
G
G
C
C
A
G
A
8
A
A
T
G
A
C
C
C
C
A
T
10
8
16
A
T
G
A
C
G
A
C
G
C
A
T
A
T
A
A
C
G
G
T
C
A
C
C
4
T
G
T
G
G
G
C
C
A
C
T
C
A
C
T
G
A
C
T
A
T
2
G
2
C
G
T
C
C
A
A
A
C
T
A
10
T
T
40
T
A
G
A
C
C
T
2
G
G
14
C
G
G
G
T
A
C
C
G
G
2
G
G
14
T
G
G
A
A
T
C
G
T
A
C
A
20
18
A
G
C
G
A
4
G
T
A
G
C
T
C
G
G
C
A
A
T
  105,040,639
  105,041,871
  105,041,966
  105,042,101
  105,042,516
  105,043,468
  105,043,912
  105,044,204
  105,044,205
  105,044,804
  105,045,192
  105,045,719
  105,045,783
  105,046,257
  105,046,962
  105,047,949
  105,047,950
  105,048,422
  105,048,682
  105,048,763
  105,048,850
  105,048,859
  105,049,252
  105,049,973
  105,049,974
  105,050,052
  105,050,097
  105,050,124
  105,050,279
  105,050,311
  105,050,438
  105,050,439
  105,050,529
  105,050,558
  105,050,562
  105,050,588
  105,050,614
  105,050,856
  105,051,242
  105,051,484
  105,051,558
  105,051,584
  105,051,657
  105,051,665
  105,051,721
  105,051,958
  105,051,977
  105,052,001
  105,052,081
  105,052,253
  105,052,453
  105,052,494
  105,052,495
  105,052,514
  105,052,686
  105,053,983
  105,054,567
  105,054,787
  105,054,842
  105,054,856
  105,054,962
  105,055,331
  105,055,349
  105,055,351
  105,056,979
  105,057,010
  105,057,057
  105,057,211
  105,057,244
  105,057,292
  105,057,301
  105,058,228
  105,058,252
  105,058,253
  105,058,589
  105,058,845
  105,059,397
  105,059,871
  105,060,172
  105,060,657
  105,060,906
  105,061,306
  105,061,695
  105,062,315
  105,062,637
  105,063,084
  105,063,328
  105,063,626
  105,063,867
  105,064,156
  105,064,195
  105,065,248
  105,065,554
  105,066,091
  105,066,254
  105,067,065
  105,068,370
  105,068,431
  105,068,432
  105,069,424
  105,069,654
  105,069,834
  105,069,922
  105,070,306
  105,070,948
  105,071,917
  105,072,176
  105,072,418
  105,072,703
  105,072,840
  105,073,499
  105,073,836
  105,075,434
  105,075,833
  105,076,148
  105,076,263
  105,076,777
  105,077,793
  105,078,023
  105,078,156
  105,078,952
  105,079,595
  105,079,678
  105,079,908
  105,080,143
  105,080,147
  105,080,152
  105,080,154
  105,080,157
  105,080,242
  105,080,251
  105,081,173
  105,081,656
  105,081,784
  105,081,786
  105,081,959
  105,083,544
  105,084,223
  105,084,599
  105,084,601
  105,084,604
  105,084,606
  105,084,655
  105,084,886
  105,084,932
  105,085,231
  105,085,855
  105,085,965
  105,086,354
  105,086,542
  105,088,636
  105,088,938
  105,090,644
  105,090,940
  105,091,347
  105,092,985
  105,093,716
  105,094,210
  105,095,073
  105,096,115
  105,096,116
  105,097,301
  105,097,609
  105,097,925
  105,098,642
  105,098,780
  105,098,781
  105,098,884
  105,099,056
  105,099,108
  105,099,223
  105,099,810
  105,100,701
  105,101,126
  105,101,795
  105,102,084
  105,103,136
  105,103,224
  105,104,030
  105,104,132
  105,104,359
  105,104,641
  105,104,721
  105,104,869
  105,105,139
  105,105,164
  105,105,697
  105,105,698
  105,106,085
  105,106,310
  105,106,375
  105,106,406
  105,106,760
  105,107,006
  105,107,062
  105,107,089
  105,107,251
  105,108,109
  105,108,365
  105,108,422
  105,108,444
  105,108,468
  105,108,504
  105,108,878
  105,109,147
  105,110,186
  105,110,256
  105,110,335
  105,110,923
  105,111,371
  105,111,554
  105,111,559
  105,111,956
  105,111,972
  105,111,976
  105,112,058
  105,112,406
  105,112,417
  105,113,336
  105,113,673
  105,113,964
  105,115,512
  105,115,527
  105,115,814
  105,117,078
  105,118,138
  105,118,510
  105,121,136
  105,122,808
  105,125,027
  105,125,814
  105,126,529
  105,126,722
  105,126,998
  105,127,061
  105,127,244
  105,127,247
  105,127,625
  105,128,061
  105,129,961
  105,130,037
  105,130,155
  105,131,391
  105,131,442
  105,131,572
  105,131,594
  105,131,910
  105,131,938
  105,132,692
  105,132,925
  105,133,109
  105,133,885
  105,134,008
  105,134,385
  105,134,445
  105,134,540
  105,135,142
  105,135,462
  105,135,523
  105,135,592
  105,135,649
  105,135,708
  105,135,711
  105,135,982
  105,136,109
  105,136,351
  105,136,579
  105,136,657
  105,137,622
  105,137,641
  105,137,791
  105,137,844
  105,138,012
  105,138,606
  105,138,873
  105,139,091
  105,139,143
  105,139,158
  105,139,177
  105,139,641
  105,139,790
  105,140,259
  105,140,479
  105,140,823
  105,141,773
  105,141,867
  105,141,872
  105,142,193
  105,142,792
  105,142,970
  105,143,375
  105,144,065
  105,144,364
  105,144,411
  105,144,920
  105,145,665
  105,145,921
  105,146,130
  105,146,459
  105,146,472
  105,146,486
  105,146,524
  105,146,654
  105,146,668
  105,146,773
  105,146,822
  105,147,181
  105,147,228
  105,148,181
  105,148,295
  105,148,595
  105,148,662
  105,148,668
  105,149,123
  105,149,125
  105,149,315
  105,149,521
  105,149,525
  105,149,847
  105,149,900
  105,149,949
  105,150,065
  105,150,709
  105,150,773
  105,151,023
  105,151,250
  105,151,410
  105,151,763
  105,151,796
  105,152,117
  105,152,387
  105,152,597
  105,152,892
  105,152,977
  105,152,979
  105,153,062
  105,153,555
  105,154,080
  105,154,445
  105,154,520
  105,154,911
  105,155,090
  105,155,521
  105,155,637
  105,155,734
  105,155,920
  105,156,008
  105,156,023
  105,156,204
  105,156,307
  105,156,353
  105,156,415
  105,156,487
  105,156,616
  105,156,720
  105,156,958
  105,157,063
  105,157,146
  105,157,275
  105,157,292
  105,157,377
  105,157,533
  105,157,706
  105,157,750
  105,158,001
  105,158,025
  105,158,026
  105,158,087
  105,158,141
  105,158,357
  105,158,999
  105,159,017
  105,159,229
  105,159,809
  105,159,851
  105,159,978
  105,160,118
  105,160,189
  105,160,414
  105,160,465
  105,160,643
  105,160,849
  105,160,909
  105,160,934
  105,161,264
  105,163,064
  105,163,082
  105,163,145
  105,163,572
  105,163,581
  105,164,214
  105,164,580
  105,164,676
  105,164,744
  105,164,978
  105,165,719
  105,166,050
  105,166,448
  105,166,553
  105,167,366
  105,167,607
  105,169,827
  105,169,968
  105,170,067
  105,170,130
  105,170,811
  105,170,842
  105,171,091
  105,172,102
  105,172,130
  105,172,393
  105,172,853
  105,173,070
  105,173,228
  105,173,298
  105,173,351
  105,173,669
  105,173,723
  105,173,729
  105,173,883
  105,174,535
  105,174,560
  105,174,951
  105,174,965
  105,175,034
  105,175,443
  105,175,501
  105,176,233
  105,176,292
  105,176,981
  105,177,393
  105,177,550
  105,177,668
  105,177,851
  105,177,930
  105,178,243
  105,178,898
  105,179,053
  105,179,055
  105,179,956
  105,179,961
  105,179,996
  105,180,141
  105,180,236
  105,180,360
  105,180,390
  105,180,809
  105,181,164
  105,182,117
  105,183,101
  105,183,148
  105,183,168
  105,183,400
  105,184,086
  105,185,453
  105,185,593
  105,185,774
  105,186,493
C
G
T
T
A
A
5
2
5
2
T
C
A
A
T
-
A/-
T
C
-
C
G
G
2
2
G
A
G
T
C
-
C
-
C
11
32
13
T
T
-
-
T
A
-
2
A
A
-
A
-
G
C
A
T
C
-
T
-
22
A
-
A
12/-
10/-
11
G
C
G
T
G
A
G
T
G
G
A
T
T
T
3
C
-
G
-
T
6
C
T
T
-
G
-
G
6/-
G
C
T
2
A/-
-
A
2
C
T
C
A
-
G
G
C
G
T
-
A
13
-
T
A
T
A
G
C
7
-
2
2
2
T
2
-
-
2
-
-
2/-
T
GA/3
A
2
T
A
A
C
9/5
5/3
G
C
G
G
G
A
A
7/5
3
C
G
-
T
C
A
T
T
G
A
A
T
26
A
A
-
G
A
G
G
2
13
-
G
-
3
G
3
A
25
A
G
C/2
A/-
T
C
G
T
G
T
G
-
A
G
C
G
-
G
A
C
A
C
A
C
C
C
G
C
-
6/-
2/-
A
C
A
3
G
T
T
G
T
A
A
-
C
2/-
C
C
-
A
G
A
A
T
G
G
T
T
T
T
-
A
A
G
T
T
T
T
T
A
A
A
2/-
2
11/29
A
A
C
G/9
8/-
G
A
T
T
T
G
C
A
A
T
C
G
T
C
A
-
G
-
A
A
A
G
T
T
C
A
T
G
G
17
13
A
T
A
C
T
-
15
A
-
3
3
-
3
-
G
T
T
A
C
C
C
T
T
T
G
T
G
-
G
G
G
A
G
T
-
G
T
G
2
-
8/-
-
G
4
A
G
T
A
G
T
A
G
G
C
-
C
G
G
T
3
T
C
T
G
A
G
4/-
C
A
C
A
T
C
G
T
G
7
7
T
C
2
5
A
G
T
C
G
G
-
T
-
T
7
3
T
T
3
G
G
T
C
G
10/-
13/10
A
-
C
21
61
G
G
-
-
2/-
?
A
-
T
T
A
A
C
C
G
-
A
A
-
5
C
-
C
A
A
C
T
C
T
A
C
G
A
G
20/-
18/-
C
A
T
A
2
-
3
G
G
T
C/3
C
T
-
T
G
G
C
C