Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 148,676 (bp)   Positions: 329
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.0
.071
.086
.001
.098
.0
.0
.0
.026
.0
.067
.004
.003
.049
.007
.002
.057
.076
.101
.003
.009
.002
.023
.003
.008
.236
.049
.04
.157
.274
.004
.011
.179
.0
.007
--
.005
.004
.014
.0
.001
.113
.963
.094
.0
.003
.251
.373
.724
.109
.869
.946
.0
.159
.011
.019
.3
.002
.002
.01
.035
.005
.025
.015
.884
.002
.006
.002
.0
.0
.002
.001
.129
.03
.623
.062
.01
.69
.0
.131
.072
.001
.006
.011
.004
.285
.002
.0
.929
.091
.001
.688
.056
.007
.375
.009
.166
.881
.002
.004
.002
.0
.038
.032
.023
.017
.027
.107
.094
.036
.033
.109
.188
.055
--
.02
.96
1.0
.407
.397
.384
.375
.194
.176
.006
.003
.015
.06
.004
.004
.001
.0
.047
.018
.002
.018
.078
.232
.033
.0
--
--
.001
.001
.006
.001
.006
.006
.073
.001
.1
.004
.038
.0
.255
.004
.041
.049
.001
.129
.35
.023
.073
.044
.262
.017
.0
.148
.414
.558
.035
.0
.257
.0
.001
.001
.0
.007
.001
.0
.006
.0
.002
.0
.01
.011
.003
.177
.005
.002
.009
1.0
.996
.0
.151
.027
.047
.0
.0
.0
.001
.02
.002
.001
.001
.283
.015
.115
.007
.002
.0
--
--
--
.086
.997
.904
.021
--
.001
.003
.003
.165
--
.01
.044
.007
--
--
--
--
--
.001
.001
.05
.003
.004
.001
.0
.0
.302
.001
.005
.0
.023
--
--
--
--
--
.001
.001
.002
.001
.182
.016
.99
.977
.002
.001
.025
.001
.056
.002
.0
.0
.012
.032
.342
.0
.009
.001
1.0
.999
.776
.084
.003
.0
.037
.531
.001
.005
.004
.004
.002
.03
.003
.746
.001
.228
.047
.004
.028
--
.032
.125
.143
.647
.007
.021
.162
.22
.003
.543
.527
.483
.034
--
.013
.036
.027
.001
.741
.003
.416
.351
.272
.582
.001
.035
.001
.02
.044
.001
.035
.249
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
Frem1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
A
G
C
C
T
A
T
C
T
G
G
A
2
C
C
A
C
G
A
A
A
G
A
C
T
T
A
T
T
A
2
C
G
T
3
A
T
T
T
T
A
C
18
A
T
C
T
C
A
A
A
A
G
G
C
C
T
A
3
C
G
T
A
A
C
T
A
A
A
A
A
3
A
G
G
T
G
A
A
C
G
T
4
C
A
A
T
A
A
G
C
4
4
G
C
G
A
T
T
2
A
G
G
T
G
C
C
C
T
A
A
2
A
2
G
A
C
C
C
G
T
T
A
T
C
T
A
A
A
A
G
6
4
A
C
A
T
A
T
T
C
G
C
A
T
G
A
A
A
A
A
T
T
C
22
A
C
G
T
T
C
T
T
G
T
C
G
4
G
T
G
2
C
C
T
G
G
G
6
A
C
A
G
A
A
C
C
C
C
C
G
C
G
G
A
G
T
T
T
G
G
C
T
G
A
T
C
G
G
G
C
A
A
C
C
C
G
T
T
A
T
G
2
C
T
T
A
A
G
2
4
T
A
G
G
T
A
G
C
C
C
A
G
A
A
A
A
A
T
G
C
C
A
8
C
C
A
T
C
A
A
G
G
A
G
A
T
G
G
C
T
T
T
A
C
A
G
C
A
C
C
A
G
A
C
8
A
T
T
G
G
8
T
C
A
A
T
A
C
C
A
A
18
16
T
T
40
G
C
G
A
T
2
8
C
G
T
T
G
A
A
10
G
A
A
T
C
  105,040,224
  105,040,639
  105,041,738
  105,041,939
  105,041,966
  105,042,101
  105,043,912
  105,043,952
  105,044,192
  105,044,804
  105,045,719
  105,045,783
  105,045,905
  105,046,962
  105,047,949
  105,048,408
  105,048,422
  105,048,859
  105,049,453
  105,049,551
  105,049,858
  105,049,974
  105,050,052
  105,050,097
  105,050,124
  105,050,144
  105,050,311
  105,050,438
  105,050,442
  105,050,558
  105,050,614
  105,051,484
  105,051,558
  105,051,721
  105,051,958
  105,052,001
  105,052,361
  105,052,494
  105,052,495
  105,052,607
  105,052,686
  105,053,444
  105,053,473
  105,054,376
  105,055,343
  105,056,979
  105,057,057
  105,057,118
  105,057,211
  105,057,244
  105,057,292
  105,058,228
  105,058,253
  105,058,589
  105,058,845
  105,059,397
  105,059,871
  105,060,657
  105,060,906
  105,061,695
  105,062,315
  105,062,637
  105,062,991
  105,063,084
  105,063,328
  105,063,458
  105,063,626
  105,063,745
  105,064,156
  105,064,195
  105,065,554
  105,066,254
  105,068,432
  105,069,423
  105,069,660
  105,069,752
  105,069,834
  105,069,922
  105,070,037
  105,070,306
  105,070,948
  105,071,206
  105,071,917
  105,072,123
  105,072,176
  105,072,200
  105,072,418
  105,072,703
  105,072,840
  105,073,499
  105,075,434
  105,075,833
  105,076,192
  105,076,247
  105,076,255
  105,077,793
  105,078,023
  105,078,131
  105,078,952
  105,079,282
  105,079,595
  105,079,687
  105,079,908
  105,080,143
  105,080,147
  105,080,152
  105,080,154
  105,080,157
  105,080,242
  105,080,251
  105,081,173
  105,081,605
  105,081,783
  105,081,786
  105,081,959
  105,082,173
  105,083,299
  105,083,545
  105,083,688
  105,084,599
  105,084,601
  105,084,604
  105,084,606
  105,084,655
  105,084,886
  105,085,072
  105,085,231
  105,085,423
  105,085,872
  105,085,965
  105,086,354
  105,086,542
  105,087,586
  105,090,665
  105,090,667
  105,090,940
  105,091,073
  105,091,342
  105,091,347
  105,091,878
  105,095,073
  105,096,115
  105,096,116
  105,097,925
  105,098,781
  105,099,223
  105,099,360
  105,100,277
  105,100,638
  105,100,701
  105,101,126
  105,101,795
  105,102,084
  105,103,136
  105,103,224
  105,103,465
  105,104,100
  105,104,372
  105,105,697
  105,112,228
  105,112,454
  105,112,973
  105,113,336
  105,113,661
  105,113,673
  105,116,451
  105,116,695
  105,117,025
  105,118,138
  105,118,522
  105,118,602
  105,121,136
  105,121,421
  105,122,808
  105,123,758
  105,124,467
  105,125,027
  105,125,815
  105,126,184
  105,126,204
  105,126,529
  105,126,998
  105,127,244
  105,127,504
  105,127,544
  105,127,625
  105,128,061
  105,128,277
  105,128,732
  105,129,212
  105,130,202
  105,130,299
  105,130,600
  105,130,606
  105,130,825
  105,131,159
  105,131,910
  105,132,893
  105,133,000
  105,133,198
  105,133,199
  105,133,325
  105,134,445
  105,135,003
  105,135,462
  105,135,708
  105,136,657
  105,136,901
  105,138,481
  105,138,510
  105,138,606
  105,138,628
  105,139,396
  105,139,641
  105,139,790
  105,141,754
  105,141,802
  105,141,867
  105,142,164
  105,142,193
  105,142,745
  105,143,375
  105,144,065
  105,144,411
  105,144,476
  105,145,665
  105,146,130
  105,146,152
  105,146,486
  105,146,668
  105,146,740
  105,146,752
  105,146,820
  105,147,627
  105,148,181
  105,148,668
  105,148,745
  105,148,956
  105,149,123
  105,149,125
  105,149,257
  105,149,292
  105,149,521
  105,149,847
  105,149,900
  105,149,949
  105,150,362
  105,150,709
  105,150,773
  105,150,868
  105,151,023
  105,151,287
  105,151,371
  105,152,183
  105,152,597
  105,152,979
  105,153,245
  105,153,554
  105,153,555
  105,154,080
  105,154,383
  105,154,520
  105,154,557
  105,154,933
  105,155,215
  105,155,521
  105,155,629
  105,156,008
  105,156,023
  105,156,417
  105,156,616
  105,157,089
  105,157,533
  105,157,732
  105,157,750
  105,158,357
  105,158,381
  105,158,579
  105,158,615
  105,158,648
  105,159,000
  105,159,015
  105,159,057
  105,159,160
  105,159,161
  105,159,809
  105,159,851
  105,159,979
  105,160,189
  105,160,849
  105,160,932
  105,160,934
  105,161,263
  105,162,616
  105,163,145
  105,163,581
  105,164,214
  105,164,580
  105,164,608
  105,164,676
  105,164,744
  105,165,167
  105,165,637
  105,165,719
  105,166,042
  105,166,044
  105,166,448
  105,166,553
  105,167,366
  105,167,544
  105,167,668
  105,169,770
  105,169,827
  105,170,842
  105,171,091
  105,172,081
  105,172,519
  105,173,228
  105,173,894
  105,175,033
  105,175,720
  105,176,314
  105,178,898
  105,179,031
  105,181,167
  105,183,693
  105,185,593
  105,186,493
  105,188,102
A
C
G
C
T
T
5
C
6
2
C
A
2
T
-
T
T
G
T
A
T
13
G
A
G
T
C
A
T
C
5
-
2/-
2
A
-
-
C
A
C
C
C
C
T
-
11
C
T
G
T
G
G
G
G
A
T
T
3
C
G
-
T
A
6
C
-
T
C
-
G
G
G
-
-
C
A
2
C
A
T
C
T
A
3
-
9
G
G
C
G
-
A
T
-
-
A
T
A
G
C
C
-
-
2
2
2
T
2
-
-
2
-
A/5
-
T
2/-
A
-
T
2
T
A
A
C
A/5
G
G
C
G
G
G
G
A
6/-
-
3
T
G
C
C
C
A
T
A
26
G
C
-
2
G
G
2
13
-
G
T
-
G
2
A
C
3
3
C
G
A
A
T
A
-
T
C
A
-
T
T
C
2
2
A
-
G
A
T
A
G
G
T
A
A
A
A
A
T
A
-
G
A
C
2
A
G/-
A
T
29/11
9
T
A
T
A
C
A
T
G
-
T
T
T
A
C
G
G
G
13
2/-
T
C
-
15
3
A
-
-
A
G
C
A
C
C
C
T
T
T
G
T
G
-
G
G
G
G
5
T
A
G
-
T
T
G
4
T
G
T
2
A
G
T
G
C
A
3
T
C
2
C
G
T
3
2
T
C
11
T
G
A
C
2
-
G
G
C
T
3/GT
-
3
T
3
G
-
G
T
-
T
G
18/-
16/-
19
A
40/-
A
T
11
21
-
-
-
T
A
C
7
T
-
G
-
T
7
G
C
2