Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 116,154 (bp)   Positions: 387
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.134
.055
.0
.569
.006
.0
.114
.255
.043
.009
.04
.05
.003
.001
.459
.503
.028
.0
.011
.957
.002
.001
--
--
.03
.131
.126
.12
.113
.105
.081
.016
.001
--
--
.052
--
--
.025
.029
.002
.161
.07
.055
--
--
.238
.068
.085
.225
--
--
.094
.027
.024
--
--
.005
.004
--
.001
.01
.065
.002
.0
.0
.001
.093
.002
.554
.002
.017
.003
.0
.001
.019
.698
.947
.204
.014
.002
.006
.023
.034
.005
--
--
.001
.023
.133
.052
--
.013
.015
--
.001
.084
--
.002
.007
1.0
.0
.005
.003
.002
.0
.001
.0
.031
.0
.0
.0
.0
--
.002
.0
.008
.023
.211
.031
.059
.005
--
.011
.011
.001
.003
.001
.78
--
--
.621
--
--
--
.005
.045
--
--
--
--
--
--
.045
.041
.225
.156
.188
.557
.007
.037
.001
.227
.056
.005
.002
.178
.155
.014
.001
.062
.046
.049
.064
.008
.001
.004
.003
.009
.0
.0
.0
--
.012
--
.005
.041
.015
.204
.025
.018
.023
.048
.134
.166
.189
.21
.251
.047
.551
.009
--
.012
.051
.027
.0
.002
.001
.001
.0
.001
.002
.0
.004
.001
.001
.006
.002
.001
.0
.0
.956
.001
.001
.001
.127
.0
.001
.061
.023
.001
.025
.048
.077
.016
.004
.0
.003
.15
.107
.079
.011
.068
.014
.163
.098
.003
.023
.304
.009
--
.0
.523
.019
.012
.077
.127
.003
.006
.051
.011
.222
.007
.0
.003
.627
.541
.196
.213
.115
.037
.018
.001
.004
--
--
.054
--
--
--
--
--
.016
.005
.122
.136
.157
.001
--
.109
.012
.157
.31
.07
--
--
--
--
--
--
--
--
.08
.006
.001
.002
.069
.432
.364
.236
.028
.011
.009
.032
.026
.008
.115
.063
.088
.011
.006
.153
.033
.071
--
--
--
--
.011
.005
.006
.025
.721
.722
.719
.01
.046
.025
.037
.065
.053
.011
.095
.006
.094
.04
.526
.05
.005
.05
.02
.018
.037
.008
--
.016
.38
.099
.005
.033
.017
.001
--
--
--
.008
.013
.138
.143
.157
.008
.187
.025
.008
.103
.013
.004
.001
.005
.001
.0
.001
--
--
.074
.107
.01
.249
.15
.044
.0
.0
.005
.007
.0
.016
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
12
G
T
A
A
C
8
6
A
G
2
T
G
G
6
4
C
G
G
T
G
A
T
C
C
A
A
A
A
A
A
G
C
T
T
G
6
2
A
G
T
10
A
4
G
T
A
T
C
C
2
A
T
G
3
2
T
G
C
T
G
T
T
T
2
G
A
C
A
T
C
C
T
G
4
4
8
A
4
4
T
4
T
A
A
T
T
C
T
C
C
T
A
T
T
A
G
C
C
G
C
C
C
C
C
G
T
T
C
C
A
A
G
C
C
T
C
G
G
111
A
A
T
C
T
A
A
A
A
G
A
A
A
3
2
T
G
T
G
C
C
G
T
C
A
A
C
C
C
A
T
A
G
T
T
A
C
C
T
A
T
3
2
T
A
A
G
T
G
C
A
G
A
G
G
G
T
T
4
A
A
C
A
C
G
A
C
C
A
T
T
G
T
4
G
T
C
G
C
C
G
G
C
G
G
G
G
T
C
G
T
C
G
T
C
C
T
A
G
T
T
G
A
G
C
A
C
A
C
A
T
T
A
A
A
C
G
A
C
C
84
A
T
G
A
G
T
G
G
A
A
C
A
G
C
G
A
G
T
G
T
T
G
C
A
G
T
C
C
C
A
T
C
C
G
C
T
G
C
C
G
C
6
A
C
C
C
G
A
A
5
G
T
C
C
T
G
A
G
T
G
T
A
A
T
T
T
C
G
T
A
G
C
T
C
5
A
G
T
C
A
C
5
3
A
G
A
C
12
C
C
T
C
T
A
A
G
C
A
G
C
G
C
T
G
C
C
C
T
G
C
C
6
26
26
C
G
22
20
A
T
A
T
T
C
A
C
A
G
C
A
G
C
A
C
4
C
G
G
T
A
T
C
G
G
2
G
  164,151,418
  164,152,313
  164,153,585
  164,158,111
  164,158,426
  164,161,443
  164,162,515
  164,162,517
  164,163,660
  164,165,671
  164,166,545
  164,166,546
  164,167,048
  164,167,110
  164,167,271
  164,167,273
  164,167,326
  164,168,877
  164,169,079
  164,169,224
  164,169,306
  164,169,719
  164,170,164
  164,170,461
  164,170,552
  164,170,600
  164,170,602
  164,170,604
  164,170,606
  164,170,608
  164,170,613
  164,172,890
  164,174,312
  164,174,817
  164,174,822
  164,175,304
  164,176,810
  164,176,918
  164,177,173
  164,177,487
  164,177,512
  164,179,431
  164,179,484
  164,179,712
  164,179,811
  164,179,915
  164,180,107
  164,180,282
  164,182,128
  164,182,399
  164,184,322
  164,188,459
  164,189,037
  164,198,343
  164,198,590
  164,200,107
  164,200,131
  164,200,366
  164,201,470
  164,202,394
  164,202,746
  164,202,767
  164,203,805
  164,203,836
  164,204,370
  164,204,372
  164,204,648
  164,205,886
  164,206,938
  164,207,018
  164,207,117
  164,207,516
  164,207,614
  164,207,681
  164,207,718
  164,207,816
  164,207,903
  164,207,914
  164,208,048
  164,208,122
  164,208,193
  164,208,211
  164,208,519
  164,208,901
  164,209,021
  164,209,043
  164,209,068
  164,210,354
  164,210,801
  164,210,934
  164,210,994
  164,211,050
  164,211,250
  164,211,747
  164,212,125
  164,212,182
  164,212,715
  164,212,876
  164,213,096
  164,213,109
  164,213,519
  164,214,174
  164,214,294
  164,214,472
  164,214,522
  164,215,021
  164,215,136
  164,215,142
  164,215,304
  164,215,325
  164,215,326
  164,215,367
  164,215,374
  164,215,573
  164,216,258
  164,216,426
  164,216,435
  164,216,699
  164,217,362
  164,217,906
  164,218,150
  164,218,163
  164,218,402
  164,218,554
  164,218,649
  164,218,685
  164,218,925
  164,218,992
  164,219,050
  164,219,067
  164,219,088
  164,219,282
  164,219,661
  164,219,667
  164,219,672
  164,219,680
  164,219,777
  164,219,895
  164,219,933
  164,220,054
  164,220,074
  164,220,097
  164,220,165
  164,220,287
  164,220,361
  164,220,418
  164,220,506
  164,220,543
  164,220,613
  164,220,679
  164,220,720
  164,220,963
  164,221,161
  164,221,174
  164,221,279
  164,221,294
  164,221,492
  164,221,498
  164,222,551
  164,222,643
  164,222,975
  164,223,650
  164,223,651
  164,223,652
  164,223,949
  164,224,430
  164,224,553
  164,224,746
  164,225,173
  164,225,372
  164,225,436
  164,225,584
  164,226,284
  164,227,119
  164,227,319
  164,229,313
  164,229,357
  164,229,644
  164,229,669
  164,229,687
  164,229,717
  164,229,814
  164,229,864
  164,229,898
  164,229,900
  164,229,902
  164,229,905
  164,229,927
  164,229,998
  164,230,540
  164,230,703
  164,230,917
  164,231,546
  164,231,627
  164,232,445
  164,233,306
  164,233,460
  164,233,534
  164,233,753
  164,233,761
  164,233,782
  164,233,828
  164,233,837
  164,233,843
  164,233,883
  164,233,890
  164,233,929
  164,233,998
  164,234,155
  164,234,162
  164,234,257
  164,234,391
  164,234,457
  164,234,650
  164,234,663
  164,234,736
  164,234,745
  164,234,748
  164,234,870
  164,234,914
  164,234,957
  164,234,988
  164,235,009
  164,235,108
  164,235,164
  164,235,596
  164,235,610
  164,236,419
  164,236,555
  164,236,819
  164,237,029
  164,237,341
  164,237,370
  164,237,604
  164,237,676
  164,237,686
  164,237,985
  164,238,094
  164,238,230
  164,238,413
  164,238,550
  164,240,837
  164,241,125
  164,241,655
  164,241,807
  164,242,311
  164,242,573
  164,242,588
  164,242,592
  164,242,733
  164,242,752
  164,243,226
  164,243,347
  164,243,447
  164,243,635
  164,243,725
  164,243,729
  164,244,179
  164,244,368
  164,244,462
  164,244,633
  164,245,295
  164,245,802
  164,245,836
  164,246,837
  164,246,874
  164,247,215
  164,247,989
  164,247,990
  164,247,991
  164,248,297
  164,248,395
  164,248,721
  164,248,762
  164,248,815
  164,248,918
  164,248,941
  164,249,121
  164,249,214
  164,249,674
  164,250,163
  164,250,233
  164,250,291
  164,250,528
  164,251,390
  164,251,391
  164,251,429
  164,251,792
  164,251,917
  164,252,444
  164,252,464
  164,253,002
  164,253,234
  164,253,357
  164,253,639
  164,254,281
  164,254,313
  164,254,449
  164,254,457
  164,254,476
  164,254,804
  164,254,872
  164,254,910
  164,255,009
  164,255,013
  164,255,068
  164,255,123
  164,255,139
  164,255,147
  164,255,206
  164,255,272
  164,255,363
  164,255,456
  164,255,579
  164,255,671
  164,255,674
  164,255,701
  164,255,727
  164,255,960
  164,256,076
  164,256,078
  164,256,108
  164,256,162
  164,256,164
  164,256,166
  164,256,318
  164,256,335
  164,256,376
  164,256,382
  164,256,416
  164,256,485
  164,256,505
  164,256,595
  164,256,687
  164,257,023
  164,257,129
  164,257,194
  164,257,361
  164,257,496
  164,258,028
  164,258,212
  164,258,214
  164,258,426
  164,258,439
  164,258,630
  164,258,988
  164,259,238
  164,259,464
  164,259,490
  164,259,498
  164,259,713
  164,259,825
  164,260,264
  164,260,302
  164,260,340
  164,260,662
  164,260,767
  164,260,886
  164,260,888
  164,260,909
  164,261,197
  164,261,216
  164,261,377
  164,261,414
  164,261,674
  164,261,910
  164,262,042
  164,262,063
  164,262,849
  164,262,900
  164,263,111
  164,263,354
  164,263,463
  164,263,520
  164,264,008
  164,264,187
  164,264,620
  164,264,653
  164,264,993
  164,265,119
  164,265,243
  164,265,612
  164,265,971
  164,265,972
  164,266,098
  164,266,206
  164,266,249
12/-
2
3
A/5
3/AG
-
8/-
6/-
-
A
2/-
T/-
A
T
6/-
-
T
A
A
C
A
G
C
-
T
23
T
T
T
T
G
A
4
C
C
A
-
-
T
C
T/-
-
T
4/-
A
C
G
C
T
3
2/-
-
-
A
-
-
2
A
T
C
A
C
T/5
2
-
T
G
A
G
C
T
G
C
5
-
-
-
G
-
-
C
-
C
T
G
-
C
A
C
G
2
C
C
C
C
9
3/GT
3
T
-
T
T
T
T
T
A
C
4
T
3
G
G
A
CT/3
T
C
G
A
A
-
G
G
2
T
C
T
C
G
G
A
G
G
T
-
-
C
A
3
A
T
A
A
C
T
C
G
3
A
T
T
C
G
A
5
C
C
T
T
A
G
-
3/-
2/-
T/-
G
G
A
C
A
T
G
C
C
A
A
A
C
C
-
G
G
T
G
3
40
5
35
G
G
C
2
2
7
-
C
C
T
A
G
G
A
A
T
A
A
C
A
G
T
C
A
A
A
C
A
T
C
G
A
C
C
A
G
G/2
G
G
T
3
T
G
C
G
G
C
2
T
3
G
5
G
-
G
C
C
G
A
G
C
T
G
G
8
C
C
T
G/A
A/4
C
-
A
A
C
5
9
G
A
C
3
2
A
T
C
T
T
T
A
C
A
T
T
T
T
-
G
-
A
T
A
3
C
-
9/7
C
T
11
G
A
G
2
G
C
C
G
C
C
C
A
T
A
G
G
9
A
2
C/-
5/-
G
C
-
T
T
G
5/-
3/-
A/-
A
3
-
-
G
A
G
T
C
C
G
A
T
C
A
3
C
A
C
A
G
A
T
37
C
T
T
-
-
-
T
-
22/-
-
T
C
C
C
C
T
G
T
G
A
T
G
A
C/2
G
T
-
4
-
A
C
G
C
2
2
A
-
2