Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 116,154 (bp)   Positions: 332
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.028
.055
.255
.171
.113
.134
.0
.0
.0
.016
.167
.003
.001
.324
.261
.01
.006
.009
.0
.015
.005
.0
.001
.017
.041
.014
.0
.014
.006
.053
.066
.003
.01
.111
.0
.0
.028
.061
.957
.001
.493
--
.03
.126
.12
.113
.105
.081
.071
.003
.066
.133
.039
.0
.001
.055
.01
.066
.095
.016
.521
.001
.0
.635
.001
.004
.052
.032
.001
.0
.123
.002
.001
--
--
.004
--
--
.041
.238
.003
.005
.001
.001
.33
--
--
.018
.032
--
--
.006
.003
.059
.007
.003
--
--
.001
.116
.019
.018
.004
.004
.0
.116
.001
.207
.002
.0
.001
.001
.077
.024
.001
.022
.023
.251
.174
.134
.006
.009
.681
.001
.034
.0
.002
.002
.0
.031
.008
.011
.36
.021
.013
.001
--
--
.551
.061
.008
.683
.013
.671
.208
.329
.027
.0
.002
.306
.004
.004
.0
.002
.004
.048
.547
.017
.304
--
.074
.0
.523
.0
.018
.011
.082
.172
.066
.019
.028
.012
.049
.004
.007
.098
.015
.006
.004
.009
.005
.003
.127
.003
.006
.158
.337
.051
.011
.008
.073
.017
.054
.007
.004
.03
.079
.0
.013
.913
.627
.541
.004
.043
.196
.213
.149
.107
.018
.07
.028
.001
.017
.01
--
.011
.009
.002
.054
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.035
.005
.122
.069
.138
.157
.001
--
.002
.012
.31
.07
--
--
--
.006
--
--
--
--
--
--
.08
.006
.001
.001
.025
.002
.069
.432
.364
.236
.072
.011
.009
.032
.026
.034
.008
.115
.027
.005
.033
.216
.005
.006
.025
.046
.025
.065
.053
.011
.006
.094
.04
.526
.386
.05
.005
.011
.068
.019
.069
.036
.003
.14
.059
.033
.008
.008
.187
.239
.025
.008
.103
.013
.001
.005
.001
.0
.0
.001
--
--
--
.043
.1
.01
.249
.15
.0
.306
.002
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
Fhad1
C
G
T
G
T
G
C
G
T
T
A
G
G
A
C
2
A
T
T
G
A
G
T
C
C
A
C
C
T
C
C
C
A
A
A
C
C
C
T
A
C
C
C
A
A
A
A
A
T
T
C
A
G
T
G
G
C
C
G
G
T
C
T
T
C
A
G
T
G
T
T
G
C
2
6
A
T
T
C
A
G
T
2
T
T
C
T
C
A
G
G
G
G
C
T
G
G
G
C
A
T
T
T
C
T
T
C
A
C
G
G
C
C
T
T
C
C
2
A
C
C
G
T
C
T
G
G
G
C
T
G
T
T
A
A
A
G
A
T
2
2
C
A
A
3
G
G
C
C
G
G
T
T
C
C
A
T
A
C
84
T
A
T
T
C
G
C
G
T
G
T
A
T
A
G
C
T
A
C
C
C
A
T
G
G
C
G
A
A
C
T
G
T
A
T
T
C
G
A
3
G
A
C
T
G
T
G
C
T
G
A
C
G
G
A
A
G
T
T
C
C
A
A
T
A
2
A
C
G
G
G
C
C
C
G
A
G
C
C
G
G
C
T
G
C
A
G
6
A
C
C
C
C
C
T
A
5
G
T
T
C
C
A
C
T
G
A
G
T
T
T
A
A
T
T
T
T
C
2
C
G
C
A
C
A
C
C
C
T
T
A
A
G
T
C
A
G
G
G
G
G
T
G
G
G
C
T
A
G
T
T
C
A
A
G
C
A
A
G
T
3
A
G
T
C
G
G
A
A
G
G
G
  164,150,386
  164,152,313
  164,152,591
  164,152,708
  164,152,813
  164,152,820
  164,153,117
  164,153,239
  164,153,585
  164,155,278
  164,155,428
  164,155,980
  164,156,399
  164,157,396
  164,158,155
  164,158,425
  164,158,426
  164,158,648
  164,159,022
  164,159,607
  164,160,319
  164,160,423
  164,160,472
  164,161,023
  164,161,195
  164,161,248
  164,161,443
  164,161,452
  164,162,244
  164,163,173
  164,163,377
  164,163,679
  164,164,752
  164,164,981
  164,165,747
  164,166,895
  164,167,326
  164,167,798
  164,169,224
  164,169,719
  164,169,877
  164,170,461
  164,170,552
  164,170,602
  164,170,604
  164,170,606
  164,170,608
  164,170,613
  164,171,002
  164,171,015
  164,171,041
  164,171,047
  164,171,104
  164,171,623
  164,171,624
  164,172,241
  164,172,611
  164,172,623
  164,172,748
  164,172,890
  164,173,068
  164,173,656
  164,173,810
  164,174,012
  164,174,312
  164,174,363
  164,175,304
  164,175,344
  164,175,461
  164,175,957
  164,176,162
  164,176,433
  164,176,442
  164,176,806
  164,176,810
  164,177,511
  164,177,699
  164,179,915
  164,180,058
  164,180,107
  164,180,187
  164,180,626
  164,181,820
  164,181,996
  164,182,380
  164,183,138
  164,183,184
  164,183,625
  164,183,847
  164,184,303
  164,184,518
  164,184,996
  164,185,031
  164,185,202
  164,185,219
  164,185,932
  164,186,179
  164,186,372
  164,186,684
  164,186,781
  164,187,366
  164,187,538
  164,188,002
  164,188,049
  164,189,513
  164,189,931
  164,190,293
  164,190,454
  164,190,682
  164,190,852
  164,191,258
  164,191,470
  164,191,545
  164,191,748
  164,192,199
  164,192,203
  164,192,226
  164,192,406
  164,192,432
  164,192,510
  164,193,323
  164,193,410
  164,194,110
  164,194,138
  164,194,470
  164,194,838
  164,194,839
  164,194,968
  164,195,062
  164,195,316
  164,198,378
  164,198,792
  164,198,958
  164,209,477
  164,211,250
  164,212,182
  164,222,126
  164,226,284
  164,230,540
  164,231,455
  164,231,597
  164,231,983
  164,232,025
  164,232,117
  164,232,230
  164,232,291
  164,232,445
  164,232,553
  164,232,571
  164,232,855
  164,232,975
  164,233,301
  164,233,306
  164,233,460
  164,234,150
  164,235,009
  164,236,701
  164,236,762
  164,238,230
  164,238,550
  164,240,687
  164,240,837
  164,241,125
  164,241,176
  164,241,317
  164,241,396
  164,241,518
  164,241,578
  164,241,637
  164,241,655
  164,241,688
  164,241,807
  164,241,858
  164,241,881
  164,241,899
  164,242,182
  164,242,233
  164,242,346
  164,242,412
  164,242,440
  164,242,456
  164,242,466
  164,242,573
  164,242,588
  164,242,592
  164,242,598
  164,242,672
  164,242,733
  164,242,752
  164,242,815
  164,242,915
  164,243,068
  164,243,290
  164,243,347
  164,243,351
  164,243,401
  164,243,412
  164,243,447
  164,243,460
  164,243,699
  164,243,725
  164,243,729
  164,243,949
  164,244,053
  164,244,179
  164,244,368
  164,244,458
  164,244,881
  164,245,295
  164,245,450
  164,245,647
  164,245,765
  164,246,017
  164,246,763
  164,246,837
  164,247,082
  164,247,160
  164,247,167
  164,247,215
  164,247,440
  164,247,454
  164,247,459
  164,247,460
  164,247,543
  164,247,548
  164,247,557
  164,247,560
  164,247,581
  164,247,705
  164,247,758
  164,247,763
  164,247,989
  164,247,990
  164,247,991
  164,248,201
  164,248,297
  164,248,468
  164,248,742
  164,248,762
  164,248,815
  164,248,909
  164,248,927
  164,248,941
  164,249,121
  164,249,214
  164,249,853
  164,250,163
  164,250,291
  164,250,528
  164,251,009
  164,251,390
  164,251,391
  164,251,605
  164,251,786
  164,252,158
  164,252,444
  164,252,464
  164,252,739
  164,252,969
  164,253,234
  164,253,357
  164,253,639
  164,253,912
  164,253,943
  164,254,281
  164,254,313
  164,254,449
  164,254,457
  164,254,476
  164,254,622
  164,254,872
  164,254,910
  164,255,009
  164,255,013
  164,255,018
  164,255,068
  164,255,123
  164,255,193
  164,255,271
  164,255,456
  164,256,009
  164,256,076
  164,256,078
  164,256,108
  164,256,335
  164,256,376
  164,256,416
  164,256,485
  164,256,505
  164,256,687
  164,257,023
  164,257,129
  164,257,194
  164,257,285
  164,257,361
  164,257,496
  164,257,756
  164,257,907
  164,258,210
  164,258,296
  164,258,476
  164,259,302
  164,259,316
  164,259,431
  164,259,498
  164,260,662
  164,261,197
  164,261,216
  164,261,247
  164,261,377
  164,261,414
  164,261,674
  164,261,910
  164,262,063
  164,262,849
  164,262,900
  164,263,039
  164,263,111
  164,263,354
  164,263,476
  164,263,478
  164,263,520
  164,263,599
  164,263,997
  164,264,620
  164,264,653
  164,264,993
  164,265,243
  164,265,487
  164,266,045
  164,266,098
  164,266,249
G
G/2
A
C
-
A
2
A
3
C
G
A
A
A/2
11
2/-
A/3
C
G
A
2
A
C
5
T
T
-
C/T
G
T
C/T
T
G
G
2
T
C/T
T
C
G
A
-
T
T
T
T
T
G
T/C
T/C
T
C
A
T/C
G/A
A
T
T
G/C
A
-
G
C
G
2
A/G
G/A
A
A
G
C
A
T
-
-
4
T/C
C
T
G
A
C
-
-
T/A
T
C
T
G
C
T
A
A
G
A
A
G/A
A
C/T
T
C
T/C
A
-
C
C
T
G
2
A
A
T
T
C
C
5
T
2/-
A/-
T
C/T
T
C
T
C
C
T
A
T
A
A
C
T/C
G
C
-
A
C
C
-
-
G
A/G
C
-
A
C
T
T
A
A
C
C
T
C/T
G
C
G
5
-
C
G
T/C
C
T
A
T
C
C
C
G
A/G
2
G
A
A
T/C
C
T
C/T
T
A/C
G
C
T
A
A
G
G
T
G
T
A
C
C
G
T
C
T
3/-
G/A
4
-
2
C
-
A
G
C
A
C
T
A
C
G
G
A
C
C
-
A
G
G
C
2
-
G
T
A
A
A
3
C/2
C/A
A
T
A
T
T
T
A
T
C
A
T
A/G
T
-
G
T
-
A
T
C/T
C
C
-
G/C
A
C
T
11
T
T
T/G
A
A/G
2
G
G
C
G
C
C
G
C
A
T
2/-
C/A
T
T
T
G
3
-
G
A
G
C
C
G
A
A
T
C
A
A
5
A
G/A
C
T
A
C
T
C
C
A
C
C
T
G
G
A
C/T
C
A/G
A
T/C
3/-
G
A
T/C
4
-
A
G
2
A
A
2