Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 122,846 (bp)   Positions: 198
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.996
.994
1.0
.006
.059
.011
--
.124
.002
.223
.082
.149
.068
.817
.271
.053
.195
.006
.003
.005
.002
.124
.834
.08
.121
.011
.008
.013
.037
.447
.453
.435
.26
.044
.274
.11
.058
.091
.098
.175
.224
--
--
--
--
.013
.013
.006
.003
.001
.016
.004
--
.009
.215
.98
.045
.033
--
--
--
.267
--
.206
.067
.05
--
--
--
--
--
--
--
.043
.105
.192
.392
.015
.002
.025
.32
.009
.052
.237
.001
.233
.152
.001
.334
.579
.616
.616
.618
.02
--
.215
.218
.004
.0
--
.104
.001
.127
.073
.016
.1
--
.003
.001
.001
1.0
.021
.02
--
--
.019
.115
.002
.021
.476
.02
.152
.02
.441
.121
.023
.019
.155
.033
.123
.053
.314
.795
.015
.362
.376
--
.128
.15
.143
.259
.001
.002
.005
.002
.177
--
--
.038
.11
--
--
--
.009
.231
1.0
.0
.001
--
--
.019
.001
.001
.002
.572
.043
.136
.538
.173
.004
.004
.065
.017
--
.599
.427
.019
--
.352
.0
--
.026
--
.035
.712
.094
.825
.009
.003
.028
--
.061
.011
.519
.103
.002
--
--
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
T
T
C
10
5
T
C
C
C
2
C
G
C
T
T
G
A
C
T
C
C
G
C
C
C
C
C
C
C
C
A
G
T
T
T
C
C
C
C
C
G
6
C
C
G
A
A
2
A
C
A
A
T
C
C
T
T
A
C
T
C
G
2
G
G
C
G
C
T
A
A
C
T
C
C
T
T
A
C
G
2
A
G
A
A
T
T
10
4
G
G
G
C
A
3
T
T
C
A
G
A
A
T
C
T
C
G
A
C
G
G
G
C
T
G
2
4
T
2
G
G
G
A
T
C
C
T
C
G
A
G
A
5
T
A
A
G
G
T
C
T
T
T
3
T
T
C
G
C
T
G
C
T
A
A
C
A
C
A
A
G
A
A
G
C
A
A
G
A
A
6
C
G
G
G
3
C
C
C
G
G
T
C
A
A
G
C
A
A
T
C
G
T
C
9
G
  172,337,796
  172,337,798
  172,337,804
  172,338,265
  172,338,286
  172,338,314
  172,340,826
  172,341,390
  172,342,062
  172,343,033
  172,343,493
  172,345,927
  172,346,877
  172,348,682
  172,350,616
  172,351,507
  172,351,683
  172,353,267
  172,353,431
  172,355,275
  172,355,467
  172,355,679
  172,355,719
  172,355,853
  172,355,883
  172,355,946
  172,355,972
  172,355,974
  172,355,978
  172,356,060
  172,356,100
  172,356,251
  172,356,697
  172,357,789
  172,359,779
  172,361,426
  172,361,961
  172,361,972
  172,361,973
  172,361,984
  172,362,166
  172,366,818
  172,366,829
  172,367,314
  172,367,884
  172,368,869
  172,368,870
  172,368,887
  172,368,893
  172,369,461
  172,372,234
  172,372,340
  172,372,888
  172,373,607
  172,374,107
  172,378,108
  172,379,153
  172,379,610
  172,380,063
  172,381,570
  172,381,645
  172,387,766
  172,388,368
  172,389,447
  172,390,766
  172,390,768
  172,391,723
  172,391,765
  172,393,106
  172,394,743
  172,395,017
  172,398,548
  172,398,753
  172,399,031
  172,399,308
  172,399,664
  172,402,852
  172,402,955
  172,403,261
  172,403,543
  172,411,290
  172,411,955
  172,412,038
  172,412,499
  172,412,694
  172,413,131
  172,413,412
  172,413,832
  172,414,103
  172,414,489
  172,414,495
  172,414,497
  172,414,503
  172,415,052
  172,418,215
  172,421,646
  172,421,648
  172,421,787
  172,423,011
  172,423,414
  172,424,669
  172,425,057
  172,426,740
  172,427,928
  172,429,596
  172,431,241
  172,433,099
  172,439,811
  172,439,910
  172,439,911
  172,440,933
  172,441,441
  172,441,442
  172,444,742
  172,445,374
  172,446,324
  172,446,498
  172,446,656
  172,449,730
  172,451,526
  172,451,813
  172,452,451
  172,453,110
  172,454,946
  172,456,016
  172,456,791
  172,457,233
  172,457,389
  172,457,483
  172,458,672
  172,458,861
  172,506,938
  172,508,057
  172,508,400
  172,508,642
  172,508,880
  172,510,127
  172,512,438
  172,514,381
  172,516,418
  172,516,811
  172,517,696
  172,517,697
  172,517,699
  172,518,751
  172,519,125
  172,519,775
  172,519,807
  172,520,392
  172,521,458
  172,521,926
  172,521,959
  172,521,973
  172,522,577
  172,522,624
  172,524,717
  172,525,905
  172,527,117
  172,527,394
  172,527,662
  172,528,461
  172,530,019
  172,530,072
  172,532,387
  172,533,003
  172,533,067
  172,534,330
  172,534,446
  172,534,693
  172,535,084
  172,535,699
  172,536,050
  172,536,716
  172,537,563
  172,540,250
  172,541,004
  172,541,808
  172,542,165
  172,542,680
  172,542,862
  172,545,719
  172,550,502
  172,551,184
  172,552,595
  172,554,071
  172,557,406
  172,557,735
  172,559,129
  172,559,389
  172,560,238
  172,560,346
  172,563,573
  172,564,351
  172,567,539
  172,569,208
  172,571,673
  172,578,686
  172,578,732
A
T
2
C
C/A
10/-
-
5
C/G
2
T
-
T
C
T
T/10
C
G/-
-
A
C
T
T
2
C/G
T
T
T
T
T
A
T
G
G/A
C
T/-
T/C
C/A
C/8
C/2
A
A
A
-
-
T
T
T
T
-
A/3
-
G
G
-
T
T
A
T/C
G
2
C
C/2
A
2/-
G/3
A
A
A
9
C
A/2
C
T
C
T
C/-
C
G
G
T
-
2/-
C
T
C
C
A
5
10/-
4/-
G/A
G/A
A
A
-
-
-
C
T
T
C
G
A/G
T/G
-
T/-
A
T
T
G
G/2
T
A
C/A
T/-
A
-
-
A
-
A
A
A
G
-
T
2
T/-
T
A
A/G
T
T
-
-
A/G
3
A
A
A
-
A
4
-
-
T/C
A
T
A
T
C
-
T
2
G
G
C/2
A/G
T
G
2
A
G
C
A
T
2
2
C
-
C
6/-
9
G/A
A
A
3/-
C/T
T
C/A
C
G/A
-
C/T
G
G
A
T
C
G
2
A
A
-
C/G
-
T