Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 122,846 (bp)   Positions: 323
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.996
.994
1.0
.01
.006
.059
.003
--
.124
.007
.002
.004
--
.725
.168
.002
.04
.041
.114
.068
--
--
.001
.817
.08
.053
.006
.009
.003
.002
.124
.834
.08
.121
.011
.026
.008
.013
.037
.447
.453
.435
.26
--
--
.044
.008
.016
.007
.274
.11
.082
.091
.098
.175
--
.005
--
--
.177
.195
.143
.13
.093
.003
.02
.026
.018
.017
.002
.001
.001
.0
.001
.001
.006
.002
.002
.025
.013
.013
.006
.003
.572
.075
.04
--
.016
.004
.54
.009
.071
.215
.04
.003
.002
.846
.98
.21
.033
--
--
--
--
.001
.038
.043
.18
.06
.099
.03
--
.206
.119
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.044
.105
.162
.0
--
.015
--
.269
.009
.179
.201
.051
.052
.005
.011
.002
.237
.015
.814
.161
--
--
--
.006
.075
.221
.142
.018
.004
.049
.127
.073
.021
.015
.0
.0
.001
.001
.001
.0
.001
.001
.004
.011
.331
.424
--
.039
.003
1.0
.02
.034
.075
.299
.001
.003
.016
.018
.035
.61
.019
.115
.069
.0
.001
.007
.047
.002
.007
.008
.035
.002
.476
.606
.02
.005
.005
.023
.015
.0
.0
.0
.011
.134
.226
.06
.05
.064
.121
.023
.019
.055
.134
.074
.033
.07
.048
.053
.201
.314
.036
.795
.358
.376
--
--
--
--
--
--
--
.128
.06
.071
.102
.491
.143
.13
.732
.002
--
--
.0
.0
.159
.008
.623
.001
--
.859
.001
.02
.002
.572
.645
.164
.538
.004
.004
.017
.014
--
.004
.013
.427
--
.004
.0
.001
--
--
--
--
.026
--
--
.059
.025
.431
.094
.825
.009
--
.604
.891
.004
.061
.099
.011
--
--
--
.089
.228
.519
.839
.841
.949
.951
.103
.193
.002
.001
.437
.055
--
--
--
--
--
--
.07
.323
.995
.17
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
Fchsd2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
T
T
T
C
5
3
T
T
C
G
G
A
T
2
G
C
C
C
G
A
C
G
G
T
G
A
A
T
C
C
G
C
C
C
C
C
C
C
C
C
A
G
T
G
G
A
3
T
T
T
C
C
C
8
C
C
A
18
16
A
G
7
4
2
14
4
A
T
A
G
T
T
T
T
A
2
A
C
G
A
A
6
6
5
A
A
C
A
A
A
T
18
T
C
A
C
A
T
T
A
C
T
C
G
C
G
C
A
2
C
G
C
A
A
A
C
C
T
G
G
T
T
C
10
A
C
G
T
C
A
T
T
A
G
G
4
2
T
2
C
4
C
A
C
T
4
C
T
C
G
G
6
C
G
T
G
A
A
4
3
C
G
G
C
T
G
3
A
A
A
G
A
T
G
C
C
G
C
G
54
4
C
C
T
7
A
T
G
A
2
T
C
G
3
G
C
C
19
T
T
2
A
G
T
G
G
A
A
G
G
6
C
C
T
A
T
C
G
A
G
T
T
C
G
T
A
C
G
7
T
A
T
A
G
T
G
C
A
C
8
G
A
G
G
G
T
T
C
G
A
T
T
G
C
A
T
A
T
A
A
4
C
A
G
A
6
C
C
A
A
G
3
3
C
C
C
T
T
3
G
G
T
2
8
A
A
A
G
C
T
2
A
T
C
C
6
C
A
T
G
G
A
T
A
C
2
2
C
A
A
C
T
55
G
G
A
T
G
T
A
A
  172,337,796
  172,337,798
  172,337,804
  172,338,242
  172,338,265
  172,338,286
  172,338,319
  172,340,801
  172,341,390
  172,342,030
  172,342,062
  172,342,074
  172,343,737
  172,344,060
  172,344,862
  172,346,077
  172,346,234
  172,346,237
  172,346,655
  172,346,877
  172,348,081
  172,348,100
  172,348,666
  172,348,682
  172,351,375
  172,351,507
  172,353,267
  172,353,270
  172,353,431
  172,355,467
  172,355,679
  172,355,719
  172,355,853
  172,355,883
  172,355,946
  172,355,953
  172,355,972
  172,355,974
  172,355,978
  172,356,060
  172,356,100
  172,356,251
  172,356,697
  172,357,266
  172,357,629
  172,357,789
  172,358,114
  172,358,228
  172,358,291
  172,359,779
  172,361,426
  172,361,807
  172,361,972
  172,361,973
  172,361,984
  172,363,697
  172,363,971
  172,365,448
  172,367,313
  172,368,628
  172,368,630
  172,368,716
  172,368,717
  172,368,720
  172,368,730
  172,368,741
  172,368,744
  172,368,776
  172,368,822
  172,368,830
  172,368,831
  172,368,833
  172,368,835
  172,368,838
  172,368,839
  172,368,849
  172,368,850
  172,368,853
  172,368,862
  172,368,869
  172,368,870
  172,368,887
  172,368,893
  172,369,210
  172,370,348
  172,370,349
  172,372,097
  172,372,234
  172,372,340
  172,373,541
  172,373,607
  172,374,051
  172,374,107
  172,374,228
  172,374,522
  172,374,891
  172,377,750
  172,378,108
  172,378,756
  172,379,610
  172,380,063
  172,381,455
  172,381,608
  172,381,609
  172,383,408
  172,384,320
  172,384,499
  172,385,241
  172,385,532
  172,385,535
  172,387,199
  172,388,368
  172,389,447
  172,389,513
  172,391,410
  172,393,731
  172,393,983
  172,394,416
  172,394,547
  172,395,017
  172,395,082
  172,395,195
  172,395,339
  172,395,485
  172,398,480
  172,398,572
  172,398,753
  172,398,971
  172,399,231
  172,399,308
  172,399,648
  172,400,403
  172,402,621
  172,402,955
  172,410,797
  172,411,852
  172,411,955
  172,411,984
  172,411,986
  172,412,033
  172,412,038
  172,412,209
  172,412,213
  172,412,244
  172,412,499
  172,412,877
  172,414,390
  172,416,268
  172,418,229
  172,418,716
  172,418,787
  172,419,813
  172,421,391
  172,421,651
  172,424,908
  172,425,259
  172,426,345
  172,426,673
  172,426,740
  172,427,928
  172,428,277
  172,428,278
  172,429,975
  172,429,979
  172,429,981
  172,429,985
  172,429,990
  172,429,993
  172,430,008
  172,430,012
  172,430,028
  172,430,030
  172,430,186
  172,430,715
  172,433,128
  172,439,696
  172,439,811
  172,440,933
  172,441,442
  172,441,592
  172,444,055
  172,444,597
  172,444,663
  172,444,674
  172,445,271
  172,445,274
  172,445,582
  172,445,705
  172,446,324
  172,446,498
  172,446,581
  172,446,613
  172,446,614
  172,446,671
  172,446,982
  172,447,767
  172,448,178
  172,448,375
  172,449,654
  172,450,969
  172,451,526
  172,451,534
  172,451,813
  172,451,901
  172,451,902
  172,451,908
  172,452,556
  172,452,882
  172,453,138
  172,453,192
  172,453,233
  172,453,520
  172,454,966
  172,455,285
  172,455,443
  172,455,836
  172,456,016
  172,456,791
  172,457,233
  172,457,345
  172,457,390
  172,457,452
  172,457,483
  172,457,765
  172,458,790
  172,458,861
  172,506,523
  172,506,938
  172,507,580
  172,508,057
  172,508,643
  172,508,880
  172,509,652
  172,510,070
  172,510,127
  172,511,527
  172,511,532
  172,511,545
  172,511,596
  172,512,438
  172,514,943
  172,515,351
  172,515,609
  172,515,645
  172,516,418
  172,517,824
  172,518,219
  172,518,751
  172,519,775
  172,521,926
  172,524,318
  172,524,354
  172,525,539
  172,525,867
  172,526,751
  172,527,117
  172,527,394
  172,528,219
  172,530,019
  172,531,836
  172,532,387
  172,533,003
  172,534,163
  172,534,207
  172,534,446
  172,535,084
  172,535,699
  172,536,716
  172,536,983
  172,537,563
  172,538,371
  172,538,457
  172,541,004
  172,542,165
  172,542,308
  172,542,862
  172,543,202
  172,545,719
  172,546,024
  172,546,291
  172,546,294
  172,550,502
  172,551,184
  172,551,250
  172,554,148
  172,556,340
  172,556,667
  172,557,406
  172,557,735
  172,559,129
  172,560,530
  172,561,298
  172,561,323
  172,562,528
  172,563,573
  172,564,160
  172,564,351
  172,566,181
  172,566,187
  172,566,196
  172,566,238
  172,567,016
  172,567,539
  172,567,782
  172,567,783
  172,568,133
  172,568,134
  172,569,207
  172,569,947
  172,571,673
  172,571,675
  172,571,747
  172,575,550
  172,576,989
  172,577,930
  172,578,685
  172,578,732
  172,579,548
  172,581,983
  172,582,361
  172,582,611
  172,585,186
  172,585,195
A
T
2
C
C
A
5/-
-
5
5
G
7
A
G
G
-
T
13
T
T
A
13
2
C
A
10
G/-
A/-
-
C
T
T
2
G
T
A
T
T
T
T
A
T
G
A
T/-
A
A
G
-
C
T/-
13
A
2
2
-
C/2
C/8
5
18/-
16/-
-
C
-
-
-
-
-
C
C
T
T
G
G
G
3
C
-
G
T
T
T
T
-
6/-
5/-
A/-
A/3
-
-
G
G
-
-
T/-
T
-
T
9/11
A
C
G
C/7
T/-
T
2
T
T
T
10
-
2
A
T
G
G
A/2
T
2
C
A
G/-
-
2
T
10/-
C
T
T
C
T
G
9
C
-
A
-
-
2/-
2
-
3
-
21
C
T
G
-
-
G
T
A
A
-
C/3
G/2
A
A
G
G
4/-
3/-
A
A
A
G
15
-
-
T
T
5
A
C
11
2
A
G
T
A
A
-
-
T
C/3
T/-
-
-
-
A
2
2/-
T/-
3
C
-
A
G
T
-
A
A
-
T
A
A
A
T
G
G
3/GT
T
6/-
T
G
G
G
-
T
5
-
T
T/-
C
T
A
2
G
T
T
-
-
7
-
G
-
-
-
73
3
T
-
3/4
5
A
A
A
-
C
T
A
2
C
A
A
2
G
-
2
5/11
G
C
-
T
2
C
-
-
2
C/3
C
G
A
-
3/-
T
T
C/A
4
T/-
3/-
C
A
13
-
-
-
G
G
A
T
T/2
2/-
G
TA/3
T
A
-
T
G
T/2
T
A
-
G
-
T
-
-
G
G
G
T
2
-
7/10
T
T
A
A
C
-
T