Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 615,590 (bp)   Positions: 509
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
--
--
.025
--
.146
.459
.875
.021
.897
.875
.044
.013
.99
.149
.001
.011
.268
.074
.015
.014
.224
.003
--
.321
.0
.384
--
.005
.889
.019
.017
.204
.058
.185
.235
.004
--
.288
.001
.013
.408
1.0
.008
.486
.002
.002
.723
.01
.126
.003
.92
.129
.008
--
.103
.104
.01
.001
.001
.0
.002
.004
.004
.0
.0
.001
.021
.014
.01
.002
.0
.0
.0
.0
.004
.002
.004
.003
.001
.0
.0
.005
.051
.993
--
.073
.21
.562
.014
.003
.032
.004
.794
.017
.851
.001
.002
.031
.867
.8
.727
.0
.072
.015
.997
.998
1.0
.995
.038
.0
.001
.362
.885
.001
.014
.981
.007
.003
.005
.016
.001
.02
.0
.013
.006
1.0
.985
.0
.034
.0
--
.008
.002
.004
.008
--
.002
.001
.003
.002
.026
.025
.049
.007
.003
.004
.219
.006
.212
.312
.025
.001
.98
1.0
.0
.002
.0
1.0
1.0
.966
.544
.838
.408
.123
.004
.002
.007
.003
.002
.0
.0
.006
.021
.001
1.0
.879
.016
.229
.217
.215
.242
.165
.978
.972
.159
.225
.059
.303
.125
--
.011
.002
.019
.001
.02
.086
.014
.016
.203
.095
.105
.07
.002
.144
.126
.004
.009
.001
.007
.024
.025
.185
.006
.705
.0
.0
.005
.001
.152
.562
.014
.031
.136
.01
1.0
1.0
.24
.03
.006
.093
.003
.09
.004
.024
.052
.979
.0
.005
.001
.005
.003
.044
.655
.003
.014
--
.022
.004
.004
.002
.001
.021
.024
.025
.031
.007
.002
.049
.076
.001
.0
.153
.0
.001
.31
.007
.003
.056
.174
.19
.0
.056
.0
.236
.055
.221
.006
--
.0
.0
.001
.002
.03
.002
.301
.015
.0
.0
.009
.062
.0
.172
--
.412
.003
.053
.037
.001
--
.009
.005
.985
.0
.002
.005
.084
.006
.03
.027
.002
.0
.0
.024
.005
.001
.013
.002
.001
.0
.085
.0
.001
.003
.001
.003
1.0
1.0
.019
.004
.001
.157
.003
.091
.0
.069
.162
.05
.071
.835
.001
--
.03
.959
.001
.0
.0
.002
.005
.007
.009
.0
.018
.001
.001
.001
.73
.13
.006
.007
.009
.46
--
.012
.085
.01
.003
.042
.005
.217
.169
.001
.812
.0
.0
.003
.302
.003
.479
.121
.0
.977
.001
.006
.023
.003
.107
.978
.003
.002
.004
.001
.0
.075
.004
.007
.049
--
--
.003
.138
.962
.005
.043
.284
.004
.004
.389
.018
.008
.077
.002
--
--
.281
.058
.002
.003
.024
.044
.02
.0
.1
.001
.119
.0
.014
.001
.183
1.0
.018
.004
.0
.0
.005
.003
.029
.003
.002
.002
.0
.008
--
.006
.005
.217
.01
.044
.0
.031
.002
.016
.001
.943
.007
1.0
.93
.0
.392
--
--
.051
.199
.158
.007
.0
.001
.001
.007
.002
.0
.186
.988
.016
.025
.002
.969
.029
.002
.846
.063
.839
.0
.043
.015
.135
.001
.011
.042
.002
--
.004
.002
.003
.0
.018
.241
.055
.017
.003
.002
.001
.001
.0
.743
.809
1.0
1.0
.002
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
Esrrg
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
8
4
8
3
2
2
G
T
2
T
2
2
2
2
4
A
T
C
4
G
2
2
T
3
G
2
A
2
T
2
2
T
4
2
2
35
C
G
2
2
C
A
G
G
2
C
A
5
C
A
4
2
A
C
T
4
G
T
7
G
G
12
C
C
C
C
A
A
T
A
T
4
T
C
A
T
T
C
T
T
C
2
C
A
4
T
A
T
2
C
T
G
G
T
6
4
T
C
T
A
A
T
C
C
T
C
G
6
G
G
T
T
G
T
G
C
T
C
C
T
A
G
G
A
G
T
A
C
T
C
A
T
3
T
C
T
T
A
T
G
C
C
C
C
G
G
G
T
G
C
C
C
G
T
G
T
T
C
T
T
2
4
26
4
A
T
T
T
A
G
A
T
G
C
A
C
C
T
2
C
T
C
C
G
A
A
12
4
8
A
T
A
A
T
T
2
A
A
A
C
T
A
T
T
A
A
A
A
T
T
T
G
A
T
7
G
C
A
A
T
T
A
C
T
A
C
T
A
T
C
C
T
C
A
G
A
G
A
G
8
T
C
A
8
G
11
C
A
C
C
C
A
A
T
6
G
G
2
T
G
T
G
C
2
12
T
A
C
G
T
T
G
T
4
T
A
C
C
3
T
G
4
G
A
C
G
G
G
A
A
T
2
2
T
C
T
4
T
A
T
C
T
T
C
A
C
G
T
T
A
G
T
T
G
C
G
T
A
G
T
G
C
C
G
A
A
T
C
C
A
T
T
A
C
T
T
C
A
A
4
4
C
C
C
G
A
T
T
T
T
T
T
8
G
6
C
T
2
G
T
G
C
G
C
C
T
T
T
C
G
A
A
A
T
18
T
G
T
G
A
T
T
T
G
G
T
T
G
T
C
A
C
T
G
6
T
C
T
G
G
T
T
C
T
C
T
C
T
G
T
T
C
A
C
2
A
T
C
G
12
G
G
A
A
G
C
C
C
C
A
C
T
T
A
C
T
G
A
C
G
G
T
C
G
8
A
C
A
C
C
C
C
G
C
C
C
50
A
C
G
G
C
G
2
G
A
C
T
A
G
G
G
T
G
C
C
T
T
A
C
C
12
94
2
4
10
2
2
84
C
C
T
G
T
T
T
T
A
G
C
G
T
A
T
G
T
G
  110,715,572
  110,718,918
  110,718,923
  110,734,028
  110,735,704
  110,741,919
  110,744,458
  110,745,806
  110,752,598
  110,763,815
  110,777,547
  110,802,926
  110,802,927
  110,825,367
  110,828,273
  110,838,141
  110,847,409
  110,848,148
  110,850,341
  110,852,333
  110,852,334
  110,869,148
  110,887,693
  110,891,896
  110,901,090
  110,901,804
  110,908,077
  110,927,617
  110,931,740
  110,932,145
  110,945,180
  110,945,181
  110,946,212
  110,959,796
  110,960,402
  110,960,404
  110,962,391
  110,962,615
  110,967,229
  110,969,049
  110,985,076
  110,987,271
  110,989,581
  110,990,580
  110,992,769
  110,996,148
  110,996,149
  111,001,127
  111,004,645
  111,011,795
  111,013,527
  111,015,887
  111,020,933
  111,023,638
  111,043,586
  111,055,239
  111,055,240
  111,073,679
  111,077,759
  111,077,762
  111,077,765
  111,077,778
  111,077,780
  111,077,782
  111,077,793
  111,077,815
  111,077,846
  111,077,854
  111,077,857
  111,077,859
  111,077,862
  111,077,866
  111,077,881
  111,077,890
  111,077,893
  111,077,902
  111,077,925
  111,077,926
  111,077,934
  111,077,939
  111,077,942
  111,077,944
  111,077,947
  111,078,165
  111,080,486
  111,095,802
  111,099,409
  111,102,550
  111,103,966
  111,105,316
  111,110,719
  111,111,650
  111,113,032
  111,113,483
  111,113,521
  111,114,742
  111,114,883
  111,114,885
  111,117,026
  111,117,937
  111,119,256
  111,119,498
  111,119,590
  111,119,747
  111,119,772
  111,119,990
  111,120,015
  111,120,046
  111,120,089
  111,121,035
  111,121,205
  111,121,449
  111,121,840
  111,122,878
  111,123,717
  111,123,774
  111,124,801
  111,126,855
  111,126,955
  111,127,907
  111,128,387
  111,128,575
  111,128,893
  111,129,655
  111,129,908
  111,130,744
  111,131,860
  111,132,386
  111,132,603
  111,132,857
  111,133,516
  111,133,938
  111,134,107
  111,134,327
  111,134,842
  111,135,267
  111,135,750
  111,136,881
  111,137,027
  111,138,018
  111,138,235
  111,138,339
  111,138,779
  111,138,937
  111,138,978
  111,139,031
  111,139,101
  111,139,163
  111,139,457
  111,139,504
  111,140,307
  111,140,538
  111,140,616
  111,142,317
  111,145,218
  111,146,312
  111,146,794
  111,148,604
  111,148,937
  111,149,048
  111,149,254
  111,149,603
  111,149,653
  111,149,805
  111,150,005
  111,150,124
  111,150,254
  111,150,487
  111,150,924
  111,150,938
  111,151,215
  111,151,232
  111,151,251
  111,151,315
  111,151,370
  111,151,782
  111,151,953
  111,152,079
  111,152,868
  111,152,874
  111,152,875
  111,152,993
  111,153,045
  111,153,184
  111,153,279
  111,154,089
  111,154,535
  111,154,662
  111,155,050
  111,155,099
  111,155,175
  111,156,218
  111,156,815
  111,158,282
  111,158,682
  111,158,892
  111,159,569
  111,159,782
  111,159,783
  111,159,817
  111,159,827
  111,159,896
  111,159,969
  111,162,203
  111,163,327
  111,164,733
  111,164,843
  111,164,845
  111,164,925
  111,165,060
  111,165,418
  111,166,304
  111,166,900
  111,167,513
  111,167,767
  111,169,687
  111,169,748
  111,169,763
  111,169,765
  111,170,952
  111,170,996
  111,171,023
  111,171,064
  111,171,294
  111,171,472
  111,171,880
  111,171,933
  111,172,185
  111,172,278
  111,172,424
  111,174,552
  111,174,912
  111,175,248
  111,175,527
  111,175,556
  111,175,658
  111,176,291
  111,177,896
  111,178,113
  111,178,458
  111,179,540
  111,182,205
  111,183,874
  111,184,499
  111,184,734
  111,184,761
  111,185,653
  111,186,183
  111,186,293
  111,186,563
  111,187,090
  111,187,780
  111,187,826
  111,188,568
  111,188,630
  111,188,631
  111,189,110
  111,189,157
  111,189,210
  111,189,547
  111,190,319
  111,193,349
  111,194,509
  111,194,777
  111,195,748
  111,196,976
  111,198,777
  111,199,369
  111,200,518
  111,200,700
  111,200,701
  111,201,222
  111,201,738
  111,203,137
  111,204,407
  111,206,465
  111,206,577
  111,207,317
  111,207,738
  111,208,241
  111,208,623
  111,208,626
  111,210,366
  111,212,423
  111,213,649
  111,214,231
  111,214,242
  111,214,524
  111,214,525
  111,214,585
  111,219,966
  111,220,252
  111,221,192
  111,221,429
  111,221,591
  111,222,092
  111,222,859
  111,224,267
  111,225,314
  111,226,384
  111,226,423
  111,226,625
  111,226,788
  111,227,777
  111,227,950
  111,228,149
  111,228,572
  111,228,675
  111,228,933
  111,229,113
  111,229,737
  111,229,873
  111,230,182
  111,230,319
  111,230,496
  111,230,505
  111,230,705
  111,230,858
  111,231,118
  111,231,314
  111,231,799
  111,232,131
  111,232,335
  111,232,384
  111,232,640
  111,232,643
  111,233,333
  111,233,408
  111,233,724
  111,233,816
  111,233,906
  111,233,982
  111,234,256
  111,234,446
  111,234,456
  111,235,111
  111,235,130
  111,235,144
  111,235,298
  111,235,326
  111,235,395
  111,235,539
  111,235,548
  111,235,941
  111,236,201
  111,237,484
  111,238,104
  111,238,565
  111,238,884
  111,238,948
  111,239,799
  111,239,809
  111,241,386
  111,241,783
  111,242,420
  111,244,939
  111,246,139
  111,247,309
  111,247,672
  111,247,675
  111,248,126
  111,249,792
  111,251,530
  111,254,130
  111,254,253
  111,254,261
  111,254,338
  111,254,463
  111,254,586
  111,254,750
  111,254,835
  111,254,881
  111,256,421
  111,256,753
  111,257,378
  111,257,467
  111,257,483
  111,257,893
  111,258,425
  111,259,560
  111,260,676
  111,260,836
  111,262,162
  111,262,387
  111,262,574
  111,262,998
  111,263,552
  111,263,584
  111,263,944
  111,264,018
  111,264,976
  111,265,146
  111,265,562
  111,266,114
  111,266,420
  111,266,485
  111,266,881
  111,267,916
  111,267,946
  111,267,984
  111,268,039
  111,268,369
  111,268,943
  111,269,123
  111,269,307
  111,269,392
  111,269,400
  111,270,027
  111,270,058
  111,270,276
  111,270,440
  111,271,155
  111,271,358
  111,271,548
  111,271,873
  111,272,075
  111,272,180
  111,274,688
  111,274,813
  111,275,505
  111,276,964
  111,277,222
  111,277,431
  111,277,453
  111,277,508
  111,279,883
  111,280,238
  111,282,866
  111,285,072
  111,285,185
  111,285,405
  111,285,427
  111,285,606
  111,286,435
  111,287,390
  111,287,391
  111,287,996
  111,288,100
  111,288,223
  111,290,734
  111,291,164
  111,292,642
  111,293,414
  111,293,813
  111,294,140
  111,294,434
  111,294,722
  111,294,866
  111,296,481
  111,296,688
  111,296,793
  111,297,607
  111,297,945
  111,298,746
  111,299,946
  111,300,514
  111,300,920
  111,300,931
  111,301,764
  111,303,011
  111,303,168
  111,303,484
  111,303,638
  111,303,829
  111,304,447
  111,304,583
  111,304,989
  111,306,418
  111,306,839
  111,307,738
  111,307,965
  111,308,230
  111,308,901
  111,308,908
  111,309,160
  111,309,819
  111,310,136
  111,310,791
  111,312,097
  111,312,970
  111,314,197
  111,314,585
  111,315,290
  111,315,918
  111,315,971
  111,316,021
  111,316,075
  111,316,083
  111,316,818
  111,316,874
  111,318,365
  111,319,568
  111,319,864
  111,321,125
  111,321,218
  111,321,861
  111,322,375
  111,322,542
  111,323,471
  111,324,315
  111,324,395
  111,325,502
  111,325,554
  111,325,678
  111,325,866
  111,325,932
  111,327,754
  111,327,883
  111,328,137
A
5
8/-
4/-
8/-
3/-
2/-
2/-
5
T/3
2/-
T/5
2/-
2/-
2/-
2/-
-
C
T/-
C/5
-
G/28
2/-
2/-
5
3/-
G/-
2/-
48
2/-
T/13
2/-
2/-
T/2
4/-
2/-
2/-
35/-
5
G/13
2/-
2/-
C/2
G
5
G/3
2/-
2
-
5/-
112/114
G
-
2/-
62
C/2
T/-
4/-
4
6
-
A
A
-
12/13
G
A
A
-
2
2
C
A
-
5
G
G
A
G
T
A
G
G
-
T
5
-
C
-
T/3
-
C/5
G
C
A
-
6/-
-
3
T
C
C
-
-
T
G
C
T
A
-
A
A
C
C
A
C
A
C/2
2
G
T
C
G
A
C
4
T
G
G
T
A
G
G
C
-
C
79
2
-
G
C
A
T
T
T
T
A
C
A
C
A
G
T
T
A
C
-
C
-
T
2
19
-
-
26/-
-
9
-
C
C
C
T
G
C
-
T
G
T
T
T/3
2/-
T
A
T
T
A
C
C
12/-
-
-
C
C
G
G
A
C
2/-
-
A/23
A/16
A
C
G
7
G
2
2
G
C
C
C
-
G/15
G
C
-
T
T
G
G
C
C
G
-
C
G
T
C
G
C
T
T
13
T
-
A
A/8
A
G
A
-
C
A
A/7
8/-
A
-
T
G
T
T
2
T
5
5
-
3
5
-
A
C
C
5
11
-
-
C
5
3
11
C
T/11
A
-
-
C
G
C/2
T
-
3
5
-
G/3
-
T
4
10
3
A/5
G
A
2/-
2/-
C
A
C
-
C
-
C
T
C
2
T
G
A
A
C
-
G
T
G
C
A
T
A
C
T
C
A
C
T
A
A
2
G
C
T
T
11
C
C
G
A
C
C
T
G
G
-
-
T
T
T
T
T
13
C
5
C
C
C
-
T
-
3
T/3
2/-
T
T/11
A
-
T
T
A
3
C
A
G
A
5
G
G
G
-
C
A
A
2
C
G
A
G
C
A
C
C
A
C
A
G
T
C
A
-
C
T
3
3
A
C
C
G
C
T
C
T
C
A
C
C
T
C
T
-
G
C
T
GT/3
-
A
A
G
G
A
T
T
T
T
G
2
C
C
T
T
C
C
G
T
G/2
A
C
T
9
-
C
A
G
A
T
A
4
A
C/T
2
T
-
3
G
C
A
T
A
-
A
G
T
48
G
6
C
A
A
2
-
T
A
3
11
3
T
-
94/-
2/-
4/-
10/-
-
-
-
T
T
A
T
G
C
7
2
G
T
T
23
C
C
C
A
C
3/5