Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 64,494 (bp)   Positions: 462
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.323
.295
.004
.015
1.0
.005
.019
.072
--
--
--
--
--
.002
.002
.004
.015
.146
.006
.017
.129
.258
--
.004
.319
.377
.041
.002
.002
.002
.001
.0
.003
.004
.164
.002
.003
.002
.013
.036
.024
.024
.023
.009
.006
.015
.04
.199
.419
.594
.771
.924
.004
.129
.104
.436
.121
.139
.002
--
.002
.086
.64
.592
.095
.049
--
.015
.268
.027
.035
.041
.491
.508
.014
.008
.002
.031
.002
.999
.008
.077
.011
.009
.19
.283
.232
.119
.017
.21
.014
.033
.034
.011
.003
.038
.046
.001
.035
.036
.08
.0
.002
.0
.049
.004
.0
.625
.199
.007
.007
.019
.914
.019
.839
.635
.561
.003
.001
.005
.203
.047
.005
.003
.002
.974
.425
.0
.008
.028
.048
.003
.079
.031
.027
.009
.073
.008
.005
.033
.073
.056
.006
.039
.185
.006
.015
.023
.001
.002
--
.009
--
.005
.015
.061
.012
.009
.006
.035
.821
.0
.009
.108
.084
.019
--
.017
.006
.001
.0
.406
.415
.535
.015
.007
.009
.0
.024
.001
.002
.009
.001
.005
.017
.039
.006
.418
.058
.009
--
.028
.009
.002
.001
.006
.915
.006
.0
.0
.349
.668
.002
.004
.0
.035
.002
.011
.002
.0
.0
.091
.037
.002
.026
--
.096
.989
.001
.002
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.586
.861
.88
.045
.58
.54
.0
.185
.183
.015
.0
.004
.001
.001
.182
.017
.459
--
--
--
.17
--
--
.107
--
.129
.041
.064
.004
.007
.021
.0
.171
.002
.349
.07
.024
.011
--
--
--
--
--
.018
.053
.0
.06
.022
.056
.001
--
.152
.168
.102
.012
.007
--
--
.104
.151
.0
.001
.004
.0
.171
.976
1.0
.002
.0
.001
.0
.001
.006
.002
.004
.011
.006
.001
.007
.013
--
--
--
.857
.032
.008
.0
.007
.053
.023
.025
.002
.001
.223
.022
--
.017
.08
.004
--
--
--
--
.035
.003
.05
.002
.001
.005
.04
.06
.008
--
--
--
--
--
--
.066
.004
.993
.001
.297
.0
.06
.002
.729
.002
.0
.007
.0
.004
.021
.01
.099
--
.052
.044
.02
.004
.0
.0
.003
.042
.004
.123
.169
.008
.028
.036
.048
.033
.097
.001
.001
.0
.003
.678
--
--
.458
.897
.029
.052
.065
.011
.029
.001
.006
.036
.014
.107
--
.223
.003
.001
.005
.0
.001
.015
.04
.058
.028
.023
.058
.065
.052
.085
--
.236
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.081
.989
.349
.012
.29
.011
.006
.0
.002
.027
.014
.002
.0
.003
.962
.001
--
--
.215
.033
.018
.011
.0
.089
--
--
.017
.004
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
Egfem1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
14
C
C
16
G
C
A
A
A
T
A
C
T
6
C
C
A
C
G
C
G
2
G
A
3
A
C
G
A
A
T
T
A
G
G
G
T
C
C
4
C
C
2
G
C
2
A
C
T
A
T
C
T
13
T
C
C
T
C
A
G
C
C
C
T
A
C
T
C
A
C
A
T
G
121
G
G
G
T
A
T
G
T
G
G
T
C
C
A
G
T
C
G
A
2
T
T
T
A
2
G
T
G
20
A
C
G
T
A
C
A
G
64
T
C
A
A
C
T
A
T
T
T
A
C
T
T
C
A
6
A
G
T
G
A
G
T
T
A
A
C
A
A
T
T
A
C
C
G
A
C
A
T
G
T
14
12
G
G
A
T
A
G
T
T
A
A
C
A
C
2
T
C
C
2
A
T
C
G
C
T
A
A
T
G
T
G
3
G
G
G
C
C
T
G
T
A
C
T
20
18
A
C
C
C
C
A
4
T
T
A
A
T
T
C
C
A
C
T
G
A
G
7
C
T
C
C
C
T
G
G
T
G
A
2
8
6
T
6
4
T
C
G
C
A
G
T
2
C
2
A
14
T
T
G
A
C
C
2
G
C
T
G
T
C
8
G
C
A
G
C
2
C
6
G
C
G
C
C
C
C
C
C
A
T
G
A
C
A
T
C
G
A
G
A
15
G
G
C
A
C
G
A
G
C
T
A
A
G
G
G
C
G
T
A
C
A
A
6
A
G
10
C
2
G
T
T
A
G
T
T
A
A
G
C
C
A
A
C
T
T
T
G
G
4
T
A
G
T
A
G
T
T
C
G
T
A
2
C
T
T
G
C
17
A
T
C
C
A
T
C
G
G
A
C
T
G
G
T
C
A
C
G
A
A
G
G
A
T
G
T
G
C
C
C
6
G
T
C
T
T
G
14
12
G
T
C
A
T
A
A
G
C
C
A
A
A
C
C
A
T
T
T
C
G
T
A
T
T
7
A
G
3
C
C
T
2
T
G
A
A
A
G
G
G
G
T
G
4
3
4
G
G
T
G
T
G
4
7
T
  136,216,929
  136,217,006
  136,217,495
  136,217,798
  136,217,859
  136,219,638
  136,220,576
  136,220,731
  136,222,513
  136,222,957
  136,223,042
  136,223,126
  136,223,288
  136,223,296
  136,223,570
  136,223,581
  136,224,079
  136,224,334
  136,225,360
  136,225,763
  136,225,884
  136,225,893
  136,226,150
  136,226,529
  136,227,111
  136,227,140
  136,227,144
  136,227,830
  136,227,894
  136,228,266
  136,228,422
  136,228,484
  136,228,488
  136,228,846
  136,229,031
  136,229,247
  136,229,254
  136,229,259
  136,229,300
  136,229,309
  136,229,314
  136,229,318
  136,229,324
  136,229,327
  136,229,332
  136,229,337
  136,229,341
  136,229,344
  136,229,348
  136,229,367
  136,229,370
  136,229,374
  136,230,579
  136,232,932
  136,233,110
  136,233,846
  136,233,946
  136,234,188
  136,234,194
  136,234,351
  136,234,397
  136,234,666
  136,234,743
  136,234,818
  136,234,909
  136,235,190
  136,235,398
  136,235,601
  136,236,905
  136,237,081
  136,237,273
  136,237,524
  136,238,070
  136,238,241
  136,238,242
  136,238,996
  136,239,021
  136,239,993
  136,240,095
  136,240,165
  136,240,514
  136,241,045
  136,241,125
  136,241,157
  136,241,534
  136,241,776
  136,241,782
  136,241,824
  136,241,870
  136,241,887
  136,241,928
  136,241,999
  136,242,159
  136,242,269
  136,242,477
  136,242,641
  136,242,803
  136,242,850
  136,243,275
  136,243,382
  136,243,744
  136,244,428
  136,244,874
  136,245,314
  136,245,767
  136,245,793
  136,246,179
  136,246,192
  136,246,491
  136,246,568
  136,247,140
  136,247,181
  136,247,508
  136,247,908
  136,248,195
  136,248,626
  136,248,872
  136,248,873
  136,249,423
  136,249,430
  136,250,097
  136,250,175
  136,250,410
  136,251,027
  136,251,273
  136,251,739
  136,252,302
  136,252,333
  136,252,592
  136,252,877
  136,253,647
  136,253,653
  136,255,490
  136,255,803
  136,256,133
  136,256,134
  136,256,222
  136,256,252
  136,257,276
  136,257,593
  136,257,691
  136,258,371
  136,258,566
  136,258,640
  136,258,797
  136,258,882
  136,259,271
  136,259,281
  136,259,520
  136,259,880
  136,259,889
  136,260,285
  136,260,437
  136,260,557
  136,260,802
  136,261,140
  136,261,742
  136,262,293
  136,262,295
  136,262,450
  136,262,581
  136,262,719
  136,263,067
  136,263,193
  136,263,199
  136,264,125
  136,266,186
  136,266,444
  136,267,288
  136,267,347
  136,267,583
  136,267,621
  136,267,960
  136,267,961
  136,267,974
  136,268,136
  136,268,176
  136,268,177
  136,268,248
  136,268,361
  136,268,395
  136,268,396
  136,268,447
  136,268,541
  136,268,815
  136,268,816
  136,269,411
  136,272,308
  136,272,333
  136,272,415
  136,272,831
  136,273,003
  136,273,370
  136,274,691
  136,274,879
  136,275,207
  136,275,294
  136,276,784
  136,277,344
  136,277,374
  136,277,554
  136,277,691
  136,277,693
  136,278,338
  136,278,438
  136,278,903
  136,279,115
  136,659,401
  136,660,413
  136,660,440
  136,660,718
  136,660,765
  136,663,232
  136,663,334
  136,663,720
  136,663,782
  136,664,141
  136,664,433
  136,665,954
  136,666,323
  136,666,427
  136,667,205
  136,667,793
  136,668,304
  136,668,410
  136,668,499
  136,671,783
  136,672,943
  136,673,335
  136,673,963
  136,675,356
  136,675,716
  136,676,035
  136,677,330
  136,677,395
  136,677,396
  136,678,037
  136,678,065
  136,678,067
  136,678,633
  136,678,751
  136,678,753
  136,679,881
  136,680,891
  136,681,457
  136,682,086
  136,682,289
  136,682,917
  136,684,156
  136,684,580
  136,686,443
  136,687,717
  136,687,718
  136,688,767
  136,689,496
  136,690,216
  136,690,376
  136,690,707
  136,690,986
  136,692,551
  136,692,872
  136,692,985
  136,693,202
  136,693,676
  136,693,696
  136,694,359
  136,695,866
  136,695,911
  136,697,192
  136,697,741
  136,698,765
  136,701,240
  136,701,570
  136,701,664
  136,701,737
  136,701,873
  136,703,533
  136,703,690
  136,707,238
  136,708,248
  136,709,070
  136,714,555
  136,716,257
  136,716,377
  136,716,544
  136,716,704
  136,717,846
  136,718,311
  136,718,485
  136,718,972
  136,719,165
  136,719,951
  136,719,954
  136,722,034
  136,722,878
  136,723,658
  136,723,781
  136,724,048
  136,724,964
  136,724,973
  136,725,324
  136,725,673
  136,726,163
  136,726,208
  136,726,277
  136,726,910
  136,727,239
  136,727,240
  136,727,302
  136,727,599
  136,727,764
  136,728,085
  136,728,224
  136,728,395
  136,728,660
  136,729,350
  136,729,930
  136,731,220
  136,731,550
  136,732,295
  136,732,595
  136,732,674
  136,733,163
  136,733,400
  136,733,410
  136,733,433
  136,734,002
  136,734,654
  136,734,768
  136,735,407
  136,735,475
  136,735,831
  136,735,842
  136,736,853
  136,738,224
  136,738,293
  136,738,515
  136,738,943
  136,738,976
  136,740,066
  136,740,528
  136,741,777
  136,741,943
  136,742,176
  136,742,355
  136,742,695
  136,742,721
  136,742,901
  136,742,995
  136,743,066
  136,743,077
  136,743,636
  136,744,563
  136,745,240
  136,745,590
  136,746,220
  136,746,410
  136,746,984
  136,748,280
  136,748,884
  136,749,486
  136,749,557
  136,750,050
  136,750,261
  136,750,627
  136,751,137
  136,751,371
  136,751,805
  136,752,208
  136,752,745
  136,752,879
  136,752,893
  136,753,480
  136,753,628
  136,753,889
  136,753,956
  136,754,565
  136,754,622
  136,755,213
  136,755,456
  136,755,751
  136,755,789
  136,756,291
  136,756,556
  136,757,093
  136,757,350
  136,757,842
  136,757,954
  136,757,962
  136,758,280
  136,758,673
  136,759,285
  136,759,528
  136,759,968
  136,760,000
  136,760,634
  136,760,859
  136,761,802
  136,762,922
  136,763,032
  136,763,066
  136,763,104
  136,763,616
  136,763,753
  136,764,863
  136,765,174
  136,765,844
  136,765,881
  136,768,392
  136,768,641
  136,769,432
  136,769,490
  136,770,272
  136,770,620
  136,770,923
  136,771,246
  136,772,731
  136,773,016
  136,773,161
  136,773,244
  136,773,251
  136,773,297
  136,774,651
  136,775,292
  136,775,631
  136,775,713
  136,776,538
  136,776,952
  136,777,733
  136,778,050
  136,778,340
  136,778,827
  136,779,294
  136,780,455
  136,782,493
  136,783,360
  136,784,330
  136,784,441
  136,784,456
  136,785,394
  136,785,504
  136,785,942
  136,786,432
  136,786,612
  136,787,609
  136,788,429
  136,788,856
  136,790,558
  136,791,002
  136,793,084
  136,794,458
  136,794,459
  136,794,915
  136,798,966
  136,800,606
  136,801,652
  136,803,377
  136,803,426
  136,803,881
  136,804,118
  136,807,593
  136,807,646
A
A
-
T
T
-
-
G
G
T
G
A
T
A
C
-
T
C/2
G
T
7
18
2
-
A
-
3/-
-
G
A
G
-
2
G
2
-
-
-
-
-
-
-
A
T
-
-
-
-
4
-
-
-
C
G
G
-
A
T
G
C
G
G
T
2
T
A
C
C
T
T/46
T
C
T
T
G
C
-
A
C
C
C
-
2
A
C
16
A
A
T
A
G
C
C
T
T
G
-
C
A
C
G
-
A
C
C
-
C
T
A
C
G
T
G
T
64/-
C
T
G
C
A
C
G
-
A
A
G
T
C
C
T
G
-
T
A
C
A
C
2
C
2
G
G
T
G
G
C
A
G
A
T
A
G
T
11/17
A
A
C
14/-
12/-
A
-
T
G
G
A
-
-
G
C
T
C
T
2/-
-
T
-
-
4
A
T
A
T
C
C
2
T/-
A
C
C
-
A
C
A
T
T
-
A
G
G
T
C
20/-
-
-
T
G
2
4/3
T
-
C
C
G
-
C
3
T
T
-
A
C
-
T
2
-
-
T/-
T
2
2
C
C
T
C
T
C
-
-
6/-
G
6/-
-
G
G
A
A
2
A
C
-
-
2/-
-
-
C
C
A
-
T
5
-
A
C/7
G
A
8
G
-
A
T
G
5
T
-
T
-
A
2
A
T
5
A
T
A
G
G
-
A
T
T
T
A
2
T
13
-
G
-
T
A
T
G
A
A
G
A
T
C
G
T
A
G/33
A
A
A
C
7
A
C
C
-
G
5
10/-
G
-
C
A
A
-
G/5
-
-
G
A/2
3
G
G
A/G
G
T
13
G
G
A
A
-
C
G
A
-
T
A
C
C
T
A
G
G
-
-
C
G
A
T
-
G
T/3
T
G
C
C
T
3
2
C
2
C
C
3
G
T
G
-
A
-
2
A
A
5
2
A
-
C
T
T
A
-
A
-
T
C
-
A
-
-
T
C
T
C
3
G
T
2
T
T
G
G
6
T
T
25
C
4
A
T
A
C
G
C
G
-
G
A
-
T
T
A
-
A
A
C
11
G
A
A
A
2
C
A
4/-
3/-
-
3
5/9
3
11
3
9
-
-
C