Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 88,910 (bp)   Positions: 240
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.089
.008
.02
.002
.001
.041
.701
.004
--
.002
.001
.008
.264
.94
.382
.495
.009
.044
.28
.095
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.003
.041
.028
1.0
.001
.001
.667
.01
.002
.001
.01
.065
.0
.81
.989
.993
.133
.002
.0
.0
.014
.14
.798
.823
.001
.015
.024
.017
.005
.013
.01
.026
.016
.004
.002
.003
.021
.044
--
--
--
.1
.004
--
--
--
--
.004
.115
.016
.031
--
.078
.006
.056
.001
.517
.258
.004
.001
.001
.013
1.0
.002
.064
.003
.002
.075
.002
.001
.999
.995
.377
.06
.014
--
--
--
--
--
--
--
.002
.165
.002
--
.002
.012
.006
.0
.262
.003
--
--
.177
.145
.058
.018
.081
.007
.011
.021
.002
.0
.648
.332
.01
.256
--
.004
.012
.001
.828
.002
.009
.316
.049
.005
.192
.0
.154
.085
.001
.0
.061
.001
.0
.004
.497
.11
.004
.002
.001
--
--
.002
.027
.003
.23
.054
.113
.115
.026
.053
.003
.0
.0
.002
.004
.728
.278
.017
.025
.0
.017
.239
.063
.032
--
--
.001
.109
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.747
.002
.041
.081
--
.444
.122
.0
.044
.995
.001
.008
.016
.001
.272
.022
.017
.858
.003
.001
.003
.947
1.0
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
Eea1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
G
3
G
T
T
A
C
A
T
A
T
G
G
G
G
A
G
C
24
A
T
A
4
2
G
G
G
G
G
G
T
T
C
C
C
T
G
C
3
G
A
T
T
A
T
C
C
C
C
G
G
T
G
G
C
G
T
G
C
T
G
10
8
T
A
T
C
C
G
G
T
T
A
A
G
2
G
4
A
T
A
G
A
T
T
T
T
A
A
G
8
12
C
A
T
G
A
C
C
C
C
T
A
5
30
28
T
A
C
A
A
A
T
C
T
G
A
C
T
A
G
G
A
G
T
G
G
A
G
A
A
A
A
C
T
4
4
C
A
42
G
T
G
T
A
T
A
C
2
C
G
C
C
G
G
C
T
C
28
A
C
T
A
G
T
C
G
T
A
A
T
T
T
2
A
A
C
C
G
C
C
G
C
T
C
A
A
G
T
8
C
G
C
T
A
T
G
G
G
T
T
A
A
T
C
T
G
G
A
T
G
G
G
G
A
T
A
C
G
A
G
T
G
G
G
T
T
T
T
C
G
C
7
T
C
T
A
T
  37,145,004
  37,145,727
  37,146,029
  37,146,577
  37,146,579
  37,146,837
  37,147,104
  37,147,216
  37,148,465
  37,149,631
  37,149,634
  37,150,609
  37,152,002
  37,152,030
  37,152,199
  37,152,206
  37,152,489
  37,153,216
  37,153,351
  37,154,715
  37,154,973
  37,156,391
  37,156,392
  37,156,879
  37,157,137
  37,158,480
  37,158,808
  37,158,810
  37,158,816
  37,158,824
  37,158,826
  37,158,832
  37,159,034
  37,159,211
  37,159,902
  37,159,903
  37,159,927
  37,159,959
  37,160,139
  37,160,615
  37,160,748
  37,161,062
  37,161,164
  37,161,915
  37,162,211
  37,162,560
  37,162,593
  37,163,714
  37,164,536
  37,164,538
  37,164,540
  37,165,528
  37,166,103
  37,166,909
  37,166,972
  37,167,375
  37,167,400
  37,167,899
  37,168,128
  37,168,262
  37,168,268
  37,168,371
  37,169,262
  37,169,461
  37,169,463
  37,170,413
  37,170,558
  37,170,574
  37,170,603
  37,170,760
  37,171,825
  37,171,988
  37,172,464
  37,172,818
  37,173,446
  37,174,148
  37,174,268
  37,174,877
  37,175,260
  37,175,605
  37,175,662
  37,175,800
  37,176,025
  37,176,107
  37,177,280
  37,178,078
  37,178,673
  37,179,761
  37,179,784
  37,179,866
  37,180,501
  37,180,854
  37,181,852
  37,181,895
  37,182,177
  37,182,646
  37,182,682
  37,183,542
  37,183,771
  37,184,552
  37,184,650
  37,184,769
  37,184,930
  37,185,621
  37,186,324
  37,186,687
  37,187,200
  37,187,202
  37,187,479
  37,187,740
  37,187,887
  37,188,364
  37,188,550
  37,190,044
  37,190,489
  37,190,529
  37,190,651
  37,190,845
  37,190,849
  37,190,959
  37,191,169
  37,191,360
  37,191,666
  37,194,335
  37,195,167
  37,195,399
  37,196,116
  37,196,739
  37,196,948
  37,198,082
  37,198,754
  37,199,282
  37,199,313
  37,199,484
  37,199,499
  37,200,011
  37,200,014
  37,200,030
  37,200,054
  37,201,114
  37,202,251
  37,202,786
  37,202,857
  37,202,955
  37,203,108
  37,203,455
  37,203,479
  37,203,670
  37,203,688
  37,204,156
  37,204,802
  37,205,024
  37,205,099
  37,205,597
  37,205,866
  37,205,996
  37,206,505
  37,206,551
  37,206,714
  37,207,761
  37,208,170
  37,208,933
  37,208,949
  37,209,006
  37,209,046
  37,209,733
  37,209,968
  37,210,041
  37,210,118
  37,210,145
  37,210,716
  37,211,404
  37,211,481
  37,211,482
  37,211,947
  37,211,950
  37,212,207
  37,212,743
  37,212,883
  37,213,002
  37,213,180
  37,213,821
  37,214,036
  37,214,746
  37,215,028
  37,215,109
  37,215,548
  37,215,802
  37,215,807
  37,215,928
  37,216,391
  37,216,544
  37,217,187
  37,217,192
  37,217,313
  37,217,520
  37,217,824
  37,217,856
  37,217,858
  37,217,870
  37,218,036
  37,219,590
  37,219,704
  37,219,723
  37,219,735
  37,219,784
  37,219,801
  37,219,806
  37,226,322
  37,226,519
  37,226,583
  37,226,749
  37,227,154
  37,227,172
  37,227,230
  37,227,237
  37,227,701
  37,227,774
  37,228,003
  37,228,012
  37,228,053
  37,228,297
  37,228,532
  37,228,623
  37,229,006
  37,229,382
  37,229,755
  37,230,188
  37,230,529
  37,230,538
  37,230,676
  37,230,713
  37,230,927
  37,230,950
  37,231,530
  37,231,748
  37,231,826
  37,231,954
  37,232,940
  37,233,156
A
C
A
-
3
C
T/15
5
25
2
12
G
G
2
A
A
T
G
A
T
-
T
G
2
-
-
A
A
A
A
A
A
C
2
T
T
G
A
A
G
-
2
G
C
C
C
C
9
T
T
2
C
A
C
A
C
T
A
C
-
2
C
A
10/-
-
C
-
C
T
T
A
A
C
C
3
T
A
-
A
-
3
C
G
A
T
A
-
2
A
T
-
A
-
-
T
-
G
C
T
T
T
T
T
C
G
-
30/-
28/-
G
G
T
G
G
T
C
T
-
A
T
T
C
14
A
A
G
A
G
A
A
2
T
T
-
7
A/7
T
C
-
-
T
G
-
A
C
T
C
G
C
19
T
-
T
C
T
T
A
A
G
C
T
-
G
2
C
G
C
C
5
A
C
G
T
C
C
C
-
G
C
A
T
A
T
G
A
T
G
A
G
G
A
C
8/-
T
A
T
A
G
T/A
G/A
A
A
C
A
C
T
C
A
C
T
G/C
A/2
C
A
T
C
T
G
C
T
T
T
-
C
C
A
12
A
C
C
C
C
T
A
T
-
27
-
-
G
C