Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 62,092 (bp)   Positions: 336
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
1.0
.996
.994
.22
.038
.126
.092
.001
.344
.478
.032
.0
.003
.0
.019
.0
.429
.96
.15
.003
.006
.998
.508
.522
.997
.007
.956
.663
.957
.163
1.0
.011
.001
.022
.0
.0
.001
.315
.961
.319
.224
.004
.473
.12
.733
.031
.005
.003
.067
.2
.004
.0
.002
.0
1.0
.0
.0
.076
.045
.0
.006
.016
--
--
.064
.002
.001
.001
.008
.049
.029
--
--
.14
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.003
.012
.019
.107
.507
.006
.117
.03
.008
.003
.013
.167
--
.0
.083
.463
.021
.07
.003
.003
--
--
.531
.231
.016
.048
.201
.032
.09
.049
.123
.031
.043
.057
.129
.1
.022
.102
.112
.0
.005
.001
1.0
.0
.053
--
--
.039
.061
.225
.006
.009
.01
.021
.543
.012
.012
.0
1.0
.0
.0
.027
.036
.018
--
.085
.006
.099
.009
.0
.002
--
--
--
.006
.001
.001
.01
.005
.002
.001
.082
.088
.123
.001
.003
.001
.115
.06
.0
.0
.001
.076
.067
.782
.045
.003
.07
.017
--
.274
.199
.184
.108
.008
.031
.003
.021
.013
.042
.002
.016
.014
.174
.096
.036
1.0
.0
.0
.009
1.0
1.0
.428
.022
.014
.007
.049
.036
.657
.27
.002
.033
.015
.003
.003
.001
.088
.0
.042
.106
.142
.678
.002
.0
.016
.002
.132
.069
.005
.01
.11
.02
.227
.133
.007
.003
.052
.427
.018
--
.153
--
.292
.006
.051
.999
.997
.63
.374
.004
.005
.01
.003
1.0
.0
.095
.996
.001
--
.039
.49
.042
.054
.032
.423
.04
--
.828
.023
.003
.064
.006
.001
.015
.028
.0
.008
.24
.997
.947
--
.015
.344
.985
.323
.245
.009
--
--
.001
--
--
--
.015
.265
.003
.001
.0
.025
.08
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
Ect2
A
A
C
T
A
G
G
T
C
A
A
A
C
C
A
T
T
C
G
C
T
A
A
A
A
A
T
T
T
G
G
T
C
G
G
T
A
T
G
C
C
A
G
C
G
G
C
G
C
G
C
G
G
A
C
A
G
T
C
G
T
2
C
A
T
C
C
T
C
C
T
C
A
C
T
A
G
C
G
G
T
C
T
A
T
C
G
T
C
G
T
2
A
G
G
T
C
A
T
A
G
T
G
A
T
A
A
A
A
T
C
G
G
A
A
T
G
G
T
A
C
A
T
T
A
T
G
C
A
T
G
A
C
2
G
12
C
3
G
C
C
G
G
C
T
A
A
G
3
C
G
T
C
T
C
C
T
T
C
G
G
A
3
A
A
G
G
A
A
C
A
4
T
C
G
C
G
T
A
T
A
C
10
A
A
G
T
C
C
C
A
G
2
G
A
G
G
T
C
G
C
T
T
C
A
C
A
C
C
C
A
6
A
C
A
A
G
T
2
2
T
C
T
A
T
G
G
C
A
T
A
A
G
G
C
C
A
T
G
C
A
G
G
2
T
C
C
A
G
A
C
C
T
T
A
T
T
C
C
C
C
T
A
G
T
T
G
A
G
T
A
G
C
G
C
C
T
C
15
G
T
C
A
A
C
C
G
A
A
G
G
C
A
C
G
A
T
A
16
G
C
G
A
C
A
G
A
A
A
6
T
A
C
G
T
C
G
A
C
G
C
C
G
A
A
A
T
A
C
C
C
T
A
T
A
C
  132,490,077
  132,490,102
  132,490,183
  132,490,261
  132,490,269
  132,490,272
  132,490,287
  132,490,309
  132,490,348
  132,490,360
  132,490,447
  132,490,464
  132,490,474
  132,490,485
  132,490,589
  132,490,595
  132,490,629
  132,490,647
  132,490,790
  132,490,833
  132,490,850
  132,490,893
  132,490,943
  132,490,946
  132,490,953
  132,491,021
  132,491,063
  132,491,123
  132,491,179
  132,491,192
  132,491,291
  132,491,571
  132,491,644
  132,491,948
  132,492,146
  132,492,324
  132,492,733
  132,492,862
  132,492,895
  132,492,901
  132,492,995
  132,493,140
  132,493,168
  132,493,452
  132,493,733
  132,493,775
  132,493,834
  132,493,978
  132,494,034
  132,494,291
  132,494,437
  132,494,473
  132,494,647
  132,494,653
  132,494,739
  132,495,022
  132,495,372
  132,495,402
  132,495,408
  132,495,446
  132,495,647
  132,495,742
  132,495,747
  132,495,775
  132,496,018
  132,496,108
  132,496,465
  132,496,607
  132,496,800
  132,497,032
  132,497,160
  132,498,069
  132,498,174
  132,498,960
  132,499,332
  132,499,637
  132,499,823
  132,499,964
  132,499,992
  132,500,031
  132,500,309
  132,501,093
  132,501,426
  132,501,485
  132,501,633
  132,501,644
  132,501,669
  132,501,681
  132,501,819
  132,501,883
  132,502,309
  132,502,656
  132,503,074
  132,503,177
  132,503,183
  132,503,197
  132,503,242
  132,503,298
  132,503,464
  132,503,709
  132,504,003
  132,504,005
  132,504,013
  132,504,042
  132,504,063
  132,504,118
  132,504,519
  132,504,666
  132,504,769
  132,504,973
  132,505,013
  132,505,252
  132,505,331
  132,505,387
  132,505,525
  132,505,750
  132,505,768
  132,505,931
  132,505,955
  132,506,099
  132,506,879
  132,506,993
  132,507,034
  132,507,094
  132,507,101
  132,507,370
  132,507,377
  132,507,540
  132,507,616
  132,507,683
  132,507,758
  132,507,887
  132,508,192
  132,508,580
  132,508,963
  132,509,587
  132,509,857
  132,509,907
  132,510,131
  132,510,300
  132,510,395
  132,510,471
  132,510,975
  132,511,458
  132,511,791
  132,512,407
  132,512,437
  132,512,484
  132,512,500
  132,512,811
  132,512,829
  132,512,831
  132,512,959
  132,513,157
  132,513,162
  132,513,292
  132,513,353
  132,513,359
  132,513,578
  132,513,755
  132,514,527
  132,514,650
  132,514,858
  132,514,900
  132,514,935
  132,515,314
  132,515,539
  132,515,565
  132,515,719
  132,515,806
  132,515,853
  132,515,937
  132,515,942
  132,516,132
  132,516,559
  132,516,981
  132,517,071
  132,517,129
  132,517,552
  132,517,575
  132,518,008
  132,518,415
  132,518,562
  132,518,743
  132,519,198
  132,519,260
  132,519,573
  132,519,899
  132,519,950
  132,519,973
  132,520,139
  132,520,147
  132,520,172
  132,520,175
  132,520,184
  132,520,190
  132,520,193
  132,520,272
  132,520,283
  132,520,637
  132,520,680
  132,520,956
  132,520,977
  132,520,982
  132,521,474
  132,521,711
  132,521,875
  132,521,903
  132,522,103
  132,522,271
  132,522,321
  132,522,407
  132,522,546
  132,522,687
  132,523,312
  132,523,640
  132,524,022
  132,524,053
  132,524,057
  132,524,072
  132,524,189
  132,524,238
  132,524,259
  132,524,291
  132,524,447
  132,524,524
  132,524,541
  132,524,562
  132,524,594
  132,524,968
  132,525,356
  132,525,512
  132,525,619
  132,525,957
  132,526,205
  132,526,378
  132,526,439
  132,526,474
  132,526,877
  132,526,973
  132,527,011
  132,527,278
  132,527,312
  132,527,318
  132,527,356
  132,527,392
  132,527,788
  132,528,073
  132,528,093
  132,528,189
  132,528,233
  132,528,453
  132,528,779
  132,529,033
  132,529,651
  132,529,846
  132,529,851
  132,529,929
  132,530,175
  132,530,216
  132,530,308
  132,530,314
  132,530,614
  132,530,893
  132,530,933
  132,530,940
  132,531,139
  132,531,167
  132,531,192
  132,531,283
  132,531,380
  132,531,525
  132,531,862
  132,531,925
  132,532,071
  132,532,501
  132,533,670
  132,534,199
  132,534,446
  132,535,826
  132,536,120
  132,536,452
  132,536,555
  132,536,751
  132,536,780
  132,536,781
  132,536,792
  132,536,862
  132,537,085
  132,537,406
  132,537,524
  132,537,656
  132,537,960
  132,538,069
  132,538,408
  132,538,689
  132,539,143
  132,539,236
  132,539,323
  132,539,663
  132,539,968
  132,540,085
  132,541,183
  132,541,476
  132,541,920
  132,542,305
  132,542,509
  132,542,582
  132,542,619
  132,542,767
  132,543,715
  132,543,995
  132,544,605
  132,544,842
  132,544,966
  132,544,986
  132,545,518
  132,545,630
  132,546,887
  132,546,953
  132,547,168
  132,547,378
  132,548,506
  132,548,733
  132,548,925
  132,549,123
  132,549,517
  132,549,539
  132,550,716
  132,550,757
  132,551,063
  132,551,210
  132,551,347
  132,552,040
  132,552,058
  132,552,065
A/G
A/T
C/T
C
T
G/A
G/A
T/A
C/T
-
A/T
G
C/T
C/-
A/T
T/C
T/A
C/A
A
T
T/A
A/G
21
A/G
A/G
A/G
T/2
T/A
T/A
G/T
G/A
A
T
5
A
A
T
24
16
2
T
G
A
G
A
A
T
A
T
A
-
5
A
T
C/T
G
A
C
T
T
A
-
C/G
G
C
T
-
C
A
2
C
A
5
T
C
-
A
T
C
A
C
3
C
-
3
-
T
C
T
A
2
-
G
T
G/A
A
A
G
C
G
T
2
2
3
G
G
G
-
G
C
C/T
A
C
G
T
C
A
A
C
-
T
G
G
A
G
C
A
T
8
C
A
G
T
-
A
-
T
-
T
T
T
A
6
3
C
G
G
A
-
-
2
A
T
C
T
G
C
A
C/G
10
2
G
-
G
G
2
A
G
G
T
-
-
-
T
G/T
G
A
G
G
C
5
T
-
G
G
C
A
T
2
2
G
A
-
G/-
G
A
A
-
A
A
G
3
A
A
T
G
G
A
G
A
T
-
C
T
G
G
T
2
-
-
G
T
C
G
C
A
A
T
T
C
G
G
2
A
T
T
A/G
T/A
G/2
T
G
C
A
-
G
T
T
T
A
C
T
T
C
C
G
A
C
A
T
T
A
A
G
A
G
C
T
4
C
C
-
T
G
A
T
2
T/-
T
-
A
C
C/T
A/G
A/-
9
6
T
G
T
T
A
T
A/G
T
A
G
C
G
16/-
A
T
A
-
G
T
A
-
T
G
-
C
-
C/3
T
C
C/T
A
G
C/T
G/T
A
T
A
-
-
-
C
-
3
T
T
T/G
2
A
A/G
C/T