Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 198,373 (bp)   Positions: 543
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.004
--
--
--
.0
.931
.005
.049
.312
.262
.346
.062
--
--
--
.286
.207
.45
.512
.023
--
.056
.019
.021
.005
--
--
.008
.018
.008
.023
.033
.006
.579
.001
--
.014
.022
.005
--
.444
.006
.002
.002
.002
--
.994
.991
.0
.011
.022
.002
.072
.01
.001
.004
.046
--
--
.06
.111
.046
.003
.025
.0
.091
.0
.002
.001
.009
.073
.976
.003
.0
.079
.004
.073
.518
.018
.105
.018
.097
.002
.02
.001
.185
.001
.078
.003
.025
.007
.0
.024
.011
.008
.008
--
--
.354
--
--
.209
.208
.063
.738
.028
.002
.0
.028
.102
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.498
.045
.089
.025
--
--
.0
.037
.007
--
.003
.025
.038
.017
.009
.995
.014
.037
--
.004
.001
.001
.011
.09
.005
.002
--
--
.052
.06
.002
.005
.013
.144
--
.046
.06
.01
.011
.048
.012
.035
.002
.013
.027
.415
.367
.465
.171
.003
--
--
.068
.159
.094
.0
--
--
--
.003
.525
.394
.095
.122
--
.017
.005
.05
.002
.069
.073
.048
.007
.689
.005
.003
.003
.002
.065
.006
.014
.034
.016
.651
--
--
--
--
.49
.025
.011
.015
.011
.017
--
--
.118
.078
.017
.028
.008
.063
.02
.067
.018
.027
.008
.267
.001
.124
.055
.011
.007
.002
.092
.028
.06
.059
.021
--
--
--
--
.001
--
--
--
--
.004
.001
.024
.016
.011
.417
.268
.022
.0
.021
.076
.536
.084
.332
.002
.028
.011
.004
.022
.115
.001
.029
.006
.013
.072
.022
.005
.004
.033
.172
.033
.002
--
--
.003
.003
.046
.093
.39
.036
.088
.049
.009
.012
.024
--
--
.261
.009
.075
.096
.056
.117
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.869
.093
.021
.031
.003
.317
--
.036
.061
.008
.02
.001
.022
.537
.449
.379
.004
.558
.168
.0
.004
.035
.119
.305
--
--
.999
.004
.001
.016
.0
.091
.196
.0
.004
.558
.07
.079
.037
.011
.029
.08
.125
.024
.239
.34
.012
.458
.866
.002
.001
.126
.146
.011
.228
.034
.005
.001
.004
.006
.079
.121
--
--
.004
.056
.004
.0
.0
.0
.059
.18
.217
.246
.26
.274
.0
.002
.065
.481
.001
.001
.037
.001
.003
.003
--
--
.0
.009
.004
.001
.001
.003
.413
.134
--
--
--
--
--
.021
.0
.016
.379
.236
.002
.313
.177
.001
.002
.002
.001
.058
.011
.002
.002
.002
.021
.003
.008
.002
.0
.002
.002
.006
.0
.036
.0
.002
.0
.002
.046
.001
.024
.002
.0
.003
.502
.227
.017
.0
.003
--
.001
.027
.007
.023
.119
.004
.021
.002
.005
.01
.028
.0
.0
.052
.004
.092
.572
.013
.228
.881
.006
.078
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.561
.22
.001
.0
.003
.087
.015
.031
.01
.095
.012
.0
.002
.0
.018
.001
.029
.003
.005
.0
.0
.002
.007
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.04
.03
.0
.003
.0
.0
.0
.0
.003
.001
.006
.002
.0
.0
.003
.001
.001
.001
.0
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
Dtnb
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
A
T
C
A
G
G
G
G
A
T
C
A
A
A
G
4
2
2
C
A
A
T
4
2
A
T
A
G
G
2
C
T
A
4
G
3
C
T
C
2
C
C
A
A
A
T
G
T
4
T
7
T
C
A
C
G
A
A
G
T
A
A
T
A
C
C
G
G
A
C
C
T
C
G
C
T
A
C
T
C
G
C
G
A
C
A
T
T
A
G
T
T
C
C
T
G
G
G
A
2
A
G
C
A
C
C
G
T
C
G
C
A
C
C
T
A
G
G
G
8
T
G
A
C
A
T
A
4
A
G
A
T
A
C
C
C
A
T
C
A
T
T
G
C
C
A
G
G
T
A
A
G
C
G
A
C
G
T
T
T
T
T
C
C
T
C
C
T
C
T
A
C
C
A
G
G
2
2
G
A
G
2
A
G
2
A
G
A
4
G
C
C
A
T
G
A
T
2
2
G
G
A
A
T
2
A
T
8
2
2
C
C
G
G
G
T
A
T
T
A
T
G
A
2
A
G
G
C
T
T
T
2
T
2
C
A
T
T
A
C
A
C
4
C
A
T
T
G
C
G
G
C
C
C
7
C
T
A
G
G
A
C
G
G
A
A
A
T
G
G
A
G
G
G
G
C
T
A
T
G
A
C
T
T
C
A
G
A
T
T
G
A
T
G
T
C
2
A
2
A
G
C
G
T
G
G
G
T
T
T
A
G
T
G
G
C
C
T
T
G
C
3
A
T
T
G
C
G
A
A
T
G
C
A
C
G
T
C
A
C
A
A
A
A
G
A
A
A
T
A
4
C
T
2
4
G
C
C
T
G
A
C
A
G
2
C
2
G
G
G
G
G
C
T
A
A
G
C
T
T
T
T
A
T
A
G
A
G
G
2
T
C
T
T
13
G
C
C
C
A
T
T
T
T
T
A
A
G
T
T
7
2
A
G
C
A
G
G
A
A
T
C
C
C
G
T
A
T
A
2
A
C
T
T
G
G
T
G
T
G
G
G
G
T
G
A
C
C
T
G
C
A
T
A
T
G
C
T
A
A
G
2
C
C
A
A
T
C
C
T
C
A
A
T
C
T
G
A
A
T
2
4
T
2
T
A
T
2
8
C
6
T
4
T
G
C
A
C
G
T
C
C
C
C
A
C
T
C
G
T
T
C
T
G
A
T
T
C
G
T
T
G
G
G
T
A
T
A
G
A
A
A
T
C
C
T
C
10
A
A
T
  37,788,218
  37,791,031
  37,791,928
  37,792,671
  37,793,948
  37,794,024
  37,794,453
  37,794,793
  37,796,395
  37,796,484
  37,796,573
  37,796,980
  37,797,464
  37,797,468
  37,797,476
  37,798,784
  37,798,952
  37,802,691
  37,802,693
  37,803,191
  37,803,307
  37,803,371
  37,803,385
  37,803,414
  37,804,769
  37,804,818
  37,804,820
  37,805,153
  37,805,189
  37,805,468
  37,805,715
  37,805,898
  37,806,193
  37,807,830
  37,807,905
  37,808,818
  37,809,116
  37,809,753
  37,809,772
  37,809,923
  37,810,981
  37,811,236
  37,811,240
  37,811,243
  37,814,074
  37,816,385
  37,817,162
  37,817,163
  37,818,250
  37,818,583
  37,819,219
  37,819,481
  37,819,773
  37,819,976
  37,820,099
  37,820,592
  37,821,030
  37,821,305
  37,821,448
  37,821,967
  37,823,038
  37,823,202
  37,823,454
  37,823,759
  37,824,188
  37,824,394
  37,825,211
  37,825,273
  37,825,282
  37,825,592
  37,826,131
  37,826,795
  37,828,143
  37,829,609
  37,829,653
  37,830,152
  37,831,018
  37,831,196
  37,831,318
  37,831,846
  37,832,385
  37,832,586
  37,832,857
  37,833,876
  37,833,918
  37,834,863
  37,835,140
  37,836,024
  37,836,510
  37,836,625
  37,836,749
  37,837,303
  37,837,816
  37,837,884
  37,838,410
  37,839,002
  37,839,153
  37,839,166
  37,839,337
  37,839,655
  37,839,737
  37,839,796
  37,839,797
  37,839,906
  37,840,455
  37,840,557
  37,841,492
  37,842,080
  37,842,310
  37,842,393
  37,844,139
  37,844,295
  37,844,392
  37,844,512
  37,845,363
  37,845,421
  37,845,446
  37,845,611
  37,845,883
  37,846,133
  37,846,134
  37,848,862
  37,848,883
  37,848,885
  37,849,164
  37,853,060
  37,853,425
  37,853,743
  37,854,208
  37,854,511
  37,855,076
  37,855,284
  37,855,935
  37,856,037
  37,856,802
  37,857,079
  37,857,469
  37,857,476
  37,857,574
  37,857,627
  37,859,061
  37,859,203
  37,859,731
  37,860,973
  37,861,706
  37,863,031
  37,863,080
  37,864,715
  37,865,624
  37,866,582
  37,867,311
  37,867,826
  37,867,891
  37,868,671
  37,869,220
  37,869,804
  37,869,934
  37,870,062
  37,870,110
  37,870,807
  37,871,250
  37,871,407
  37,871,544
  37,871,588
  37,871,724
  37,871,896
  37,872,273
  37,872,394
  37,873,072
  37,873,403
  37,873,787
  37,873,792
  37,874,201
  37,875,650
  37,875,736
  37,875,947
  37,875,971
  37,876,645
  37,876,741
  37,876,753
  37,878,388
  37,880,355
  37,880,363
  37,880,367
  37,880,386
  37,881,015
  37,883,109
  37,883,371
  37,883,543
  37,883,932
  37,884,065
  37,884,558
  37,884,590
  37,884,917
  37,885,036
  37,885,301
  37,885,459
  37,885,728
  37,886,227
  37,886,761
  37,886,765
  37,886,783
  37,887,155
  37,887,312
  37,887,369
  37,887,715
  37,887,734
  37,888,038
  37,888,189
  37,888,321
  37,888,558
  37,888,636
  37,889,114
  37,889,713
  37,890,500
  37,890,509
  37,890,538
  37,890,957
  37,891,460
  37,891,976
  37,891,997
  37,892,554
  37,892,614
  37,894,513
  37,894,829
  37,895,030
  37,896,238
  37,896,474
  37,897,236
  37,897,652
  37,898,205
  37,898,282
  37,898,524
  37,899,580
  37,900,016
  37,900,907
  37,901,064
  37,902,843
  37,903,024
  37,904,138
  37,904,297
  37,904,545
  37,904,698
  37,905,030
  37,905,424
  37,906,105
  37,906,247
  37,906,330
  37,906,874
  37,907,236
  37,907,877
  37,908,143
  37,908,207
  37,908,380
  37,908,502
  37,908,530
  37,908,531
  37,908,632
  37,909,021
  37,909,261
  37,909,962
  37,910,074
  37,910,258
  37,910,515
  37,910,692
  37,910,915
  37,911,423
  37,912,124
  37,912,588
  37,912,854
  37,912,860
  37,912,942
  37,913,236
  37,913,398
  37,913,918
  37,914,298
  37,915,085
  37,915,438
  37,915,931
  37,916,412
  37,916,563
  37,916,652
  37,916,676
  37,916,716
  37,916,852
  37,916,862
  37,916,955
  37,917,030
  37,917,406
  37,917,421
  37,917,430
  37,917,443
  37,917,502
  37,917,638
  37,917,839
  37,918,020
  37,918,132
  37,918,254
  37,918,621
  37,918,680
  37,918,827
  37,918,984
  37,919,132
  37,919,144
  37,919,163
  37,919,174
  37,919,266
  37,919,302
  37,919,303
  37,919,307
  37,919,310
  37,919,357
  37,919,371
  37,919,377
  37,919,385
  37,919,391
  37,920,394
  37,920,684
  37,920,841
  37,920,870
  37,920,892
  37,921,075
  37,921,108
  37,921,671
  37,922,787
  37,923,423
  37,923,627
  37,923,634
  37,923,942
  37,924,214
  37,924,777
  37,924,780
  37,924,892
  37,925,215
  37,925,375
  37,925,804
  37,925,921
  37,925,985
  37,926,078
  37,926,981
  37,927,316
  37,927,317
  37,927,621
  37,927,896
  37,927,932
  37,928,558
  37,928,661
  37,928,873
  37,929,104
  37,929,325
  37,929,390
  37,929,464
  37,929,502
  37,929,655
  37,929,779
  37,929,824
  37,929,828
  37,930,227
  37,930,339
  37,930,695
  37,930,755
  37,930,942
  37,931,077
  37,931,138
  37,931,168
  37,931,317
  37,931,378
  37,931,552
  37,931,706
  37,931,781
  37,931,822
  37,932,186
  37,932,479
  37,932,829
  37,933,153
  37,933,188
  37,933,340
  37,933,580
  37,933,978
  37,933,982
  37,934,501
  37,934,702
  37,936,102
  37,936,796
  37,936,802
  37,936,804
  37,936,985
  37,936,998
  37,937,003
  37,937,007
  37,937,009
  37,937,011
  37,937,837
  37,938,754
  37,939,791
  37,940,965
  37,941,639
  37,941,735
  37,941,970
  37,942,230
  37,942,368
  37,943,005
  37,943,238
  37,943,242
  37,943,269
  37,944,223
  37,944,704
  37,944,812
  37,944,845
  37,944,848
  37,945,147
  37,945,480
  37,946,442
  37,946,461
  37,946,531
  37,946,543
  37,946,618
  37,947,093
  37,947,347
  37,948,094
  37,948,935
  37,949,159
  37,949,435
  37,949,595
  37,949,932
  37,950,290
  37,950,390
  37,950,595
  37,950,851
  37,951,759
  37,952,575
  37,952,926
  37,952,927
  37,953,992
  37,954,211
  37,954,217
  37,954,277
  37,954,302
  37,954,306
  37,954,331
  37,954,590
  37,955,085
  37,955,639
  37,955,772
  37,957,500
  37,957,515
  37,957,518
  37,957,855
  37,957,904
  37,958,506
  37,959,084
  37,959,373
  37,960,033
  37,960,481
  37,960,524
  37,960,806
  37,961,604
  37,961,936
  37,962,041
  37,962,611
  37,963,119
  37,964,589
  37,964,608
  37,964,807
  37,964,821
  37,965,812
  37,965,890
  37,966,659
  37,966,789
  37,968,919
  37,969,106
  37,969,192
  37,969,193
  37,969,275
  37,970,954
  37,971,320
  37,971,402
  37,973,566
  37,974,140
  37,974,704
  37,974,877
  37,975,069
  37,975,154
  37,975,230
  37,975,290
  37,975,538
  37,975,563
  37,975,565
  37,975,580
  37,975,603
  37,975,620
  37,975,628
  37,975,649
  37,975,714
  37,975,726
  37,975,794
  37,975,900
  37,976,171
  37,976,177
  37,976,230
  37,976,777
  37,976,898
  37,977,018
  37,977,420
  37,977,449
  37,977,706
  37,978,400
  37,978,609
  37,978,703
  37,979,057
  37,979,296
  37,979,579
  37,979,592
  37,980,280
  37,981,180
  37,981,560
  37,981,744
  37,982,368
  37,982,375
  37,982,872
  37,982,964
  37,983,258
  37,983,358
  37,984,167
  37,984,262
  37,984,263
  37,984,305
  37,984,312
  37,984,462
  37,984,518
  37,984,595
  37,984,678
  37,984,764
  37,984,816
  37,984,837
  37,984,921
  37,985,063
  37,985,085
  37,985,161
  37,985,333
  37,985,464
  37,985,628
  37,985,651
C
C
C
-
T
A/T
A
A
A
A
G
3
C/G
A/G
A/C
G
2
4/-
2/-
-
-
-
-
-
-
2/-
-
G
G
A
A
2/-
8
C
2
-
A
-
C/-
C
-
-
T
C/G
G
T
G
C
A
C
-
C
-
C
T
G
T
A
G
T
T
-
G
2
A
G
G
T
A
3
-
T
T
C
T
A
T
-
G
T
C
T
G/2
T
A
G
T
G
C
C
-
6
C
C
T
3
C
A
A
A
2
2/-
A/-
T
A
G
T
T
C
C
T
A
2
-
2
T
C
G
C
A
A
8/-
T/4
G/-
2
G
13
2
G
-
G
A
G
C
G
A
T
T
G
2
A
6
C
5
A
3
T
C
A
T
C
A/G
T
A
2
T
G
T
A
2
C
C
C
C
T
T
C
2
T
T/2
-
C
-
T
T
G
A
A
-
2/-
T
A/G
G/2
2/-
C
A
-
G
A
G
-
A
T
T
-
4
C
G
C
-
-
G/A
A
-
G
C
-
G
G
8/-
2/-
-
C/A
T
C
A
A
C
7
C
C
G
-
A
G
-
2
A
A
T
C
C
T/C
-
T/C
-
T
G
C
G
T
12
G
T
4/-
T
G
3
A
G/-
T
C
2
T
T
CG/-
7/-
T
C
C
A
C
G
T
A
A
4
5
T
C
A
A
T
T
C
A
T
A
C
G
C
T
G
G
-
4
C/T
G
A
G
G
G
T
3
C
A
C
T
-
C
-
G
T
C/T
A
5
A
C
A
C
A
G
G
-
-
A
A
T
T
C
C
3
2
-
-
3
C
A
T
T
T
G
C
A
T
G
T
C
C
T
G
G
G
G
G
G
A
2
G
G
C
G
-
A
3
2/-
-
2
G
G
C
A
C
3
4
C
-
T
-
A
A
A
A
C
T
C
G
G
A
C/T
C
A
G
4
2
3
T
2
-
2
-
-
C
T
C
A
-
A
A
G
T
G
C
C
A
C
C
9
G
A
-
C
-
-
G
A
T
G
A
A
G
G
4
C/2
2
G
A
C
G
A
G
2/-
A/-
T
C
C
-
A
C
-
C
C
T
A
T
-
A
G
G
T
C
A
C/-
G
C
A/-
-
A
T
T/C
AT/T
5
5
-
C/T
T
G
T
C
-
T
T/-
-
-
-
G
T
C
A
-
2
3
2/-
4/-
3
-
A
A/G
C
--/G
-
C/3
-
C
-
5
T
C/A
4
A
A
5
T
T
G
2
G
T
C
T
A
T/2
T/A
T
C
A
G
G
C
T
G/A
C
A
A
C
T
C
T
G
G
A
G
G
G
C
T
4
C
T
-
C
G
C