Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 93,080 (bp)   Positions: 300
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.075
.006
.023
.096
.098
.01
.149
.017
.168
.0
.0
.002
.019
.001
.997
.0
.001
.054
.0
.002
.001
.021
.023
.0
.016
.858
.002
.0
.0
.0
.001
.987
.0
.155
.078
.003
.08
.002
.129
.001
.001
.001
.269
.052
.02
.013
.001
.0
.003
.029
.0
.001
.001
.001
.005
.0
.002
.001
.459
.013
.004
.031
.045
.041
.002
.002
.0
.0
.058
.005
.064
.0
.0
.003
.354
.004
.004
.0
.001
.004
.0
.218
--
.002
.038
.048
.002
.0
.023
.01
.045
.027
.024
.001
.223
.241
.001
.018
.025
.024
.012
.015
.113
.002
.0
.103
.002
.004
.536
.857
.016
.009
.003
.01
.01
.0
.095
.0
.003
.002
.993
.003
.034
.001
.008
.997
.0
.0
.001
.0
.002
.001
.009
.001
.005
.008
.002
.017
.163
.9
.985
.303
.001
.0
.001
.001
.0
.001
.015
.992
.927
.253
.209
.013
.001
.006
.0
.0
.0
.001
.002
.002
.001
.0
.092
.09
.043
.0
.002
.024
.0
.003
.021
.002
.014
.125
.212
.048
.0
.001
.0
.001
.073
.399
.012
.0
.0
.634
.03
.047
.0
.022
.0
.0
.001
.011
.001
.001
.012
.002
.021
.003
.172
.001
.003
.001
.012
.031
.0
.055
.464
.001
.001
.261
.0
.002
.019
.0
.004
.022
.002
.0
.001
.0
.0
.001
.004
.001
.002
.0
.848
.096
.113
.0
.0
.001
.004
.001
.004
.0
.002
.009
.506
.008
.002
.01
.0
.088
.003
--
.002
.003
.001
.011
1.0
1.0
.004
.002
.004
--
.0
.008
.0
--
--
--
--
.228
.023
.003
.562
.106
.045
.947
--
--
.445
.02
.027
--
.251
.249
.006
.006
.168
.002
.021
.018
.059
--
.004
.284
.243
.203
.199
.175
.205
.549
--
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
Dpf3
G
C
T
3
C
G
A
A
G
3
A
C
C
G
A
A
C
T
A
G
T
T
A
G
T
A
A
A
G
A
C
G
G
A
A
A
16
G
A
C
A
C
A
C
G
A
T
A
G
G
A
A
A
T
4
T
2
C
C
A
G
G
C
2
G
G
G
G
G
A
G
T
A
A
8
C
G
G
A
A
T
T
C
A
A
A
T
A
G
C
A
G
G
A
A
C
G
T
T
T
T
T
3
T
G
C
G
A
G
G
T
A
A
C
C
A
A
A
T
T
G
G
A
A
G
C
C
A
7
A
A
A
A
G
T
C
C
A
G
A
3
A
G
A
C
C
G
G
T
T
G
G
G
T
G
A
G
T
G
C
C
A
T
G
C
T
T
T
4
A
T
C
G
18
T
C
T
2
G
A
A
A
T
G
T
A
T
T
A
4
C
C
C
8
T
A
G
2
T
T
A
C
T
A
A
A
G
G
T
T
5
A
A
C
G
C
T
T
A
2
C
G
G
C
T
19
A
G
G
T
G
3
G
C
G
G
A
G
G
T
T
G
C
C
14
T
A
6
G
C
C
C
C
A
10
8
A
G
4
T
G
A
A
G
G
G
C
C
A
3
T
A
3
C
C
4
16
G
C
G
2
A
C
C
C
G
A
A
C
A
A
C
A
18
16
A
G
C
T
A
  114,856,496
  114,856,677
  114,856,943
  114,856,963
  114,856,968
  114,856,994
  114,857,279
  114,857,935
  114,858,011
  114,858,243
  114,858,245
  114,858,466
  114,858,479
  114,858,947
  114,859,023
  114,859,281
  114,860,025
  114,860,055
  114,860,523
  114,861,581
  114,862,134
  114,862,682
  114,862,721
  114,862,851
  114,862,878
  114,863,272
  114,863,497
  114,863,668
  114,863,732
  114,863,733
  114,863,734
  114,865,030
  114,865,516
  114,866,278
  114,866,607
  114,866,627
  114,867,121
  114,867,539
  114,867,693
  114,868,529
  114,868,681
  114,868,682
  114,868,902
  114,869,323
  114,869,411
  114,869,450
  114,869,590
  114,869,760
  114,870,068
  114,870,508
  114,871,476
  114,871,591
  114,872,305
  114,872,316
  114,872,323
  114,872,998
  114,873,846
  114,874,083
  114,874,896
  114,875,335
  114,875,369
  114,875,431
  114,875,433
  114,875,434
  114,875,486
  114,875,498
  114,875,507
  114,875,513
  114,875,517
  114,875,594
  114,875,856
  114,877,135
  114,878,375
  114,878,866
  114,879,156
  114,879,938
  114,880,475
  114,881,047
  114,881,150
  114,881,386
  114,881,764
  114,882,101
  114,882,651
  114,882,779
  114,883,109
  114,883,296
  114,883,359
  114,885,533
  114,887,436
  114,888,159
  114,888,409
  114,888,410
  114,888,645
  114,888,657
  114,889,522
  114,889,526
  114,890,487
  114,891,107
  114,891,714
  114,892,009
  114,892,284
  114,892,289
  114,892,318
  114,892,363
  114,892,457
  114,892,521
  114,892,776
  114,892,808
  114,893,146
  114,893,173
  114,893,381
  114,893,635
  114,893,683
  114,893,697
  114,893,698
  114,893,738
  114,893,805
  114,893,896
  114,893,955
  114,894,354
  114,894,588
  114,894,672
  114,894,898
  114,894,924
  114,894,931
  114,895,210
  114,895,501
  114,895,505
  114,895,656
  114,895,679
  114,895,784
  114,895,847
  114,895,892
  114,895,948
  114,895,954
  114,896,015
  114,896,100
  114,896,237
  114,896,336
  114,896,374
  114,896,379
  114,896,439
  114,896,458
  114,896,477
  114,896,494
  114,896,506
  114,896,535
  114,896,684
  114,896,879
  114,896,898
  114,896,917
  114,896,956
  114,896,964
  114,897,068
  114,897,070
  114,897,079
  114,897,104
  114,897,142
  114,897,206
  114,897,381
  114,897,388
  114,897,392
  114,897,393
  114,897,396
  114,897,439
  114,897,440
  114,897,444
  114,897,487
  114,897,496
  114,897,502
  114,897,534
  114,897,638
  114,897,653
  114,897,718
  114,897,842
  114,897,946
  114,897,966
  114,898,159
  114,898,405
  114,899,551
  114,900,173
  114,900,365
  114,900,590
  114,900,904
  114,902,021
  114,902,654
  114,902,744
  114,902,906
  114,902,920
  114,902,978
  114,903,223
  114,903,262
  114,903,620
  114,903,798
  114,904,102
  114,904,121
  114,904,322
  114,904,335
  114,904,687
  114,904,807
  114,905,026
  114,905,240
  114,905,359
  114,905,620
  114,905,831
  114,905,955
  114,906,063
  114,906,075
  114,906,237
  114,906,772
  114,906,817
  114,907,061
  114,907,395
  114,907,666
  114,908,308
  114,908,322
  114,909,131
  114,909,252
  114,909,306
  114,909,779
  114,909,887
  114,910,049
  114,910,584
  114,910,704
  114,910,891
  114,911,238
  114,911,263
  114,911,519
  114,911,536
  114,911,592
  114,911,966
  114,911,994
  114,912,000
  114,912,234
  114,912,455
  114,912,774
  114,912,800
  114,912,833
  114,913,235
  114,913,567
  114,913,577
  114,913,682
  114,913,850
  114,914,410
  114,914,726
  114,915,213
  114,915,541
  114,915,578
  114,915,790
  114,915,909
  114,916,531
  114,917,104
  114,917,392
  114,917,489
  114,918,749
  114,918,751
  114,919,338
  114,919,720
  114,920,065
  114,920,111
  114,922,416
  114,925,139
  114,925,282
  114,925,850
  114,926,338
  114,927,892
  114,927,940
  114,929,145
  114,934,539
  114,934,968
  114,936,457
  114,937,806
  114,938,270
  114,938,484
  114,939,156
  114,939,178
  114,940,396
  114,940,860
  114,942,670
  114,943,204
  114,943,839
  114,943,840
  114,944,822
  114,944,823
  114,945,086
  114,945,239
  114,945,413
  114,945,819
  114,945,853
  114,946,179
  114,946,185
  114,946,322
  114,946,436
  114,946,668
  114,946,670
  114,946,860
  114,947,763
  114,947,806
  114,948,059
  114,948,714
A
G
C
-
-
A
G
G
A
3/-
A/-
T
A
A
C
T
T
3
T
C
C
A
G
A
C
-
-
25/27
A
G
T
A
A
G
4
G
16/14
C
G
T
G
T
G
T
T
G
C
G
A
A
G
-
G
C
-
A
-
2
T
7
3
2
C/8
-
-
-
A
-
-
G
A
C
G
G
8/-
T
A
A
G
T
C
C
13
G
G
T
C
G
A
T
C
A
A
G
G
T
C
A
5
C
3
4
-
C
C
T
C
G
C
A
C
G
G
4
A
C
G
G
-
C
A
A
G
C
A
T
A
G
-
C
-
G
C
T
-
T
T
G
C
G
-
T
A
T
T
T
A
A
C
C
A
T
A
C
A
C
A
C
A
T
T
2
A
A
G
C
C
C
-
5
C
T
A
-
G
T
C
-
A
G
G
T
3
A
6
2
G
C
G
-
T
T
T
-
C
G
A
2/-
C
C
T
T
C
G
G
G
2
A
C
C
-
G
C
T
A
T
C
C
G
-
A
A
A
T
C
19/-
-
35/36
T
G
A
-
7/6
T
A
A
G
A
A
C
C
A
T
T
-
C
G
-
A
T
T
T
T
C
10/-
-
G
A
-
2
A
G
G
G/11
A
3
19
-
G
-
2
G
-
T
17
-
16/-
T
T
15/17
2/-
A/-
7
A
T
53
G
3
7/5
6
21
T
C
18/-
16/-
5
A
T
A
T