Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 176,795 (bp)   Positions: 296
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.007
.0
--
.002
.009
.549
.556
.076
.018
.668
.001
.133
.049
--
--
.001
.001
.0
.011
.032
.028
.051
.044
.037
.001
.082
.027
.001
.011
.007
.004
.002
.022
.011
.017
.052
.002
.003
.005
.0
.001
.005
.006
.032
.322
.066
.02
.013
.988
1.0
.002
.0
.018
.032
.009
.0
.0
.0
.012
.074
.052
.064
.051
.002
.001
.002
.0
.018
.008
.087
--
--
.044
.12
.252
.001
.035
.027
.009
--
--
.065
.175
.003
.017
.001
--
--
--
.05
.0
.011
.134
.033
--
--
.012
.032
.004
.002
.003
.0
.001
.164
.183
.001
.005
.099
.003
.0
.001
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.005
--
--
.004
.002
.004
.006
.0
.002
.025
.002
.002
.249
.001
.042
.005
.001
.02
.576
.01
.002
.014
.028
.04
.215
.008
.294
1.0
.579
.041
.093
.002
.003
.005
.051
.041
.007
.001
.013
.002
.0
.0
.01
.029
--
.002
.003
.006
.001
.002
.0
.003
.013
.006
.007
.01
.004
.052
.008
.021
.001
.076
.023
.304
.002
.997
--
.037
.003
.001
.008
.023
.001
.022
.254
.006
.033
.002
--
.013
.001
--
--
--
.115
.029
.006
.006
.001
.164
.246
.0
.014
.986
.319
.082
.003
--
.836
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.056
.023
.006
.0
1.0
.001
.011
.744
.002
.029
.007
.003
.003
.038
.24
.301
.324
.018
.035
.14
.001
.0
.001
.0
.996
.015
.142
.011
.18
.001
.838
1.0
.998
1.0
.005
.026
.572
.003
.035
.011
.064
--
.994
.0
.001
.078
.331
.002
.009
.029
.141
.003
--
.115
.001
.01
.005
.004
--
--
.0
.12
.004
.02
.001
.005
.497
.008
.128
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
C
A
T
T
T
C
G
T
G
A
T
G
A
C
C
A
A
G
T
G
G
A
T
A
G
T
G
T
G
T
C
A
C
G
C
A
C
C
A
A
C
T
T
T
T
C
G
A
T
A
G
A
A
A
T
C
G
T
4
C
T
A
G
C
C
C
G
G
C
T
T
A
A
A
T
A
G
T
T
A
A
3
G
C
G
G
A
T
T
C
G
A
C
C
T
C
C
T
T
G
T
T
T
A
A
A
T
T
T
G
T
T
T
A
C
A
T
T
G
G
A
T
C
C
G
A
C
T
13
G
T
C
T
T
G
T
T
G
C
T
G
T
G
A
A
T
T
T
A
C
C
A
T
C
A
T
A
T
G
A
T
T
G
C
T
A
A
A
A
T
G
T
G
C
C
A
T
C
C
T
T
G
C
6
A
A
T
G
G
T
C
C
C
T
C
2
G
T
T
G
T
C
C
A
C
A
A
G
C
A
C
G
C
C
A
T
T
G
C
T
T
T
A
C
A
G
T
A
G
G
G
A
G
C
A
T
T
A
T
A
T
T
C
A
A
G
T
G
A
G
T
A
G
T
A
T
C
T
A
A
T
T
G
C
G
C
T
T
C
C
A
A
T
G
T
C
T
T
C
2
G
G
G
C
G
A
G
A
T
G
T
A
C
C
A
  100,627,438
  100,627,720
  100,629,768
  100,630,415
  100,630,714
  100,631,478
  100,631,479
  100,631,954
  100,632,005
  100,632,606
  100,632,982
  100,633,467
  100,633,686
  100,633,728
  100,633,824
  100,634,118
  100,634,414
  100,634,556
  100,634,694
  100,634,798
  100,634,979
  100,635,096
  100,635,125
  100,635,206
  100,635,285
  100,635,338
  100,635,391
  100,636,004
  100,636,159
  100,636,283
  100,636,286
  100,636,432
  100,636,482
  100,636,608
  100,636,915
  100,637,072
  100,638,035
  100,638,119
  100,638,142
  100,638,209
  100,638,305
  100,638,350
  100,638,352
  100,639,062
  100,639,308
  100,640,466
  100,640,748
  100,642,017
  100,642,123
  100,642,185
  100,642,266
  100,642,278
  100,642,292
  100,642,501
  100,643,778
  100,644,595
  100,645,406
  100,645,912
  100,645,951
  100,646,570
  100,646,600
  100,646,602
  100,646,612
  100,647,467
  100,647,924
  100,648,155
  100,648,454
  100,649,622
  100,649,646
  100,649,950
  100,650,128
  100,650,190
  100,650,449
  100,650,456
  100,651,716
  100,651,986
  100,652,434
  100,652,486
  100,652,494
  100,652,556
  100,652,692
  100,652,984
  100,653,181
  100,653,304
  100,653,423
  100,653,697
  100,653,903
  100,653,924
  100,654,086
  100,655,015
  100,655,049
  100,655,471
  100,655,566
  100,656,556
  100,656,677
  100,656,683
  100,657,566
  100,657,969
  100,658,062
  100,658,152
  100,658,165
  100,658,297
  100,658,967
  100,658,996
  100,659,153
  100,659,183
  100,659,337
  100,659,403
  100,659,508
  100,659,527
  100,659,941
  100,659,954
  100,660,007
  100,660,093
  100,660,145
  100,660,344
  100,660,385
  100,660,408
  100,661,689
  100,662,207
  100,663,399
  100,663,424
  100,663,503
  100,663,548
  100,663,576
  100,664,276
  100,664,278
  100,664,425
  100,665,252
  100,666,161
  100,666,398
  100,666,659
  100,666,782
  100,667,027
  100,667,041
  100,667,091
  100,667,120
  100,667,194
  100,667,336
  100,667,549
  100,667,558
  100,667,649
  100,667,834
  100,667,968
  100,668,234
  100,668,776
  100,668,867
  100,669,361
  100,669,484
  100,669,506
  100,669,508
  100,669,678
  100,669,839
  100,669,976
  100,670,711
  100,673,107
  100,674,629
  100,674,718
  100,674,789
  100,674,951
  100,675,409
  100,675,642
  100,675,759
  100,675,760
  100,675,771
  100,675,812
  100,675,873
  100,676,369
  100,676,414
  100,676,533
  100,676,548
  100,676,549
  100,676,564
  100,676,793
  100,677,164
  100,677,261
  100,677,412
  100,677,504
  100,680,774
  100,682,109
  100,685,407
  100,686,542
  100,691,418
  100,693,898
  100,694,391
  100,695,305
  100,696,852
  100,697,640
  100,698,051
  100,698,452
  100,698,831
  100,698,852
  100,698,930
  100,698,970
  100,698,978
  100,928,814
  100,928,958
  100,931,156
  100,937,590
  100,938,072
  100,938,301
  100,938,895
  100,938,921
  100,938,989
  100,939,774
  100,940,252
  100,940,758
  100,941,142
  100,942,757
  100,943,123
  100,943,545
  100,944,006
  100,944,043
  100,944,438
  100,944,807
  100,945,113
  100,945,626
  100,947,915
  100,956,519
  100,957,735
  100,959,147
  100,961,524
  100,963,549
  100,963,808
  100,963,969
  100,964,685
  100,965,162
  100,966,485
  100,966,835
  100,966,932
  100,967,586
  100,967,624
  100,968,367
  100,968,947
  100,969,241
  100,972,820
  100,972,867
  100,973,085
  100,973,121
  100,973,669
  100,974,418
  100,974,425
  100,974,426
  100,975,911
  100,976,028
  100,976,899
  100,977,053
  100,977,927
  100,978,183
  100,978,597
  100,978,641
  100,979,880
  100,979,928
  100,983,375
  100,983,724
  100,983,761
  100,983,803
  100,983,847
  100,983,963
  100,984,472
  100,985,048
  100,985,263
  100,985,469
  100,986,651
  100,986,874
  100,986,944
  100,986,958
  100,987,822
  100,989,379
  100,989,497
  100,989,795
  100,990,217
  100,991,443
  100,991,813
  100,991,896
  100,992,196
  100,992,212
  100,992,421
  100,993,139
  100,993,820
  100,994,072
  100,995,584
  100,996,513
  100,998,202
  100,998,501
  100,998,837
  100,999,205
  100,999,926
  101,000,054
  101,000,369
  101,000,447
  101,001,264
  101,001,602
  101,001,902
  101,001,908
  101,002,141
T
T
T
C
C
A
A
-
C
G/A
C
C
C
-
C/T
A
G
G
C
2
-
A
C
G
G
T
T/-
G/A
-
A
C
T
C
T
A
T
G
T
T
A/G
2
T
C
C
2
2
2
A
G
C
G
C
C
G
T
C
T
A
T/A
-
A
C
G
T
T
C/T
C/T
A
A
G
T/3
C
G
C
G
C
G
A
C
C
A/G
G
3/-
A
A
A
G/4
G
G
A
C/3
A
G
A
T
C
T
-
C
G
T
C
C
7
G
G
C
C
C
C
C
C
G
C
G
T
G
C
C
A
T
2
C
T
T
C
G
T
T/C
13/-
A
C
C/T
C
-
A
C
C
G/A
A
C
2
A
T
A/C
2
C
C
A
G
T
T
G
A
T
G
C
G
C
A
G
5
C
A
C/T
C
G
C
G
C
C
A
C
A
T
T
A/T
C
C/2
T
A
2
T
C/T
-
G
T
C
A
A
G
G
T
T
-
T
-
C
T/C
C
G/A
C
C/T
G
G
T
T
G
2
A
G
C/T
A
G
G
2
C
C
G/A
2
G
G
G
T
C/T
G
T
C
G
T
A
A
A/G
T
T
A/G
-
A
G
C
C
4
A
T
C
G
G/A
C
T
G
C
C
C
A
A
G
C
C/A
T/C
G
G
2
A
T
A
A
G
T/C
C
A
G
T
2
T/G
A
G
2
A
G
G
2/-
A
T
G/79
C/T
G/C
A/G
A
G
C
C
C
A/-
T
G
G