Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 176,795 (bp)   Positions: 361
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.011
--
.002
.009
.418
.006
.992
.993
.133
.131
--
.155
.062
.017
.001
.014
.032
.322
.001
.066
.129
.007
.118
.013
.993
.988
1.0
.0
.006
.018
.0
.032
.001
.001
.294
.0
.004
.001
.0
.996
.012
.079
.006
.074
.052
.009
.006
.024
.315
.53
.001
.002
.0
.018
--
.044
.12
.252
.001
.035
.027
.009
--
--
.032
.065
.175
.003
.017
.001
--
--
--
--
--
--
.019
.05
.0
.011
.134
.033
--
.012
.004
.002
.003
.0
.001
.164
.183
.001
.005
.099
.003
.0
.001
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.004
.002
.004
.006
.0
.002
.025
.002
.002
.249
.001
.042
.005
.001
.02
.576
.01
.002
.014
.028
.04
.215
.008
.294
.579
.041
.682
.093
.002
.003
.005
.051
.041
.007
.001
.013
.297
.625
.002
.0
.0
.01
.029
.016
.008
.001
--
--
--
.002
.003
.006
.001
.002
.0
.003
.013
.006
.007
.01
.004
.037
.008
.021
.001
.242
.051
.076
--
.097
.002
--
--
.067
.0
.072
--
.037
.004
.003
.008
.02
.341
.35
.023
.001
.022
.006
--
--
--
.003
.078
.047
.0
.001
.001
.994
.0
.0
.001
.0
.0
.002
.002
.0
.033
.526
.467
.038
.023
.029
.011
.0
.113
.013
--
--
--
--
--
.115
.029
.006
.041
.097
.103
.246
.795
.0
.986
.082
.061
.729
.441
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.0
.0
.744
.0
.007
.003
.003
.004
.038
.035
.008
.0
.001
.001
.0
.996
.015
.003
.251
.925
.18
.001
.838
.998
1.0
.026
.572
.003
.035
.064
.015
--
--
--
--
.0
.994
.078
.378
.331
.002
.009
.141
.014
.001
.002
--
.115
.09
.001
.03
.002
.005
.052
.002
.004
.001
.001
.007
.007
.0
.0
.0
.004
.02
.008
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
Dnah5
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
T
T
C
C
T
47
T
A
A
A
16
G
C
C
T
T
G
T
A
A
A
G
A
A
T
A
A
A
C
A
2
A
24
T
20
C
C
C
T
G
C
4
C
C
C
6
T
C
C
C
C
G
T
A
A
A
T
A
G
T
T
A
T
A
3
G
C
G
G
A
T
T
G
T
T
T
C
G
A
C
T
C
T
T
G
T
T
T
A
A
A
T
T
T
G
T
T
T
A
C
A
T
2
79
A
T
9
G
G
A
G
A
A
A
A
T
C
G
A
T
C
C
G
A
C
T
13
G
T
C
T
T
G
T
T
G
C
T
G
T
G
A
T
34
T
T
A
C
C
A
T
C
A
8
6
T
A
T
G
A
T
8
C
G
G
G
T
G
C
T
A
A
A
A
T
G
T
G
G
C
A
T
22
T
C
G
14
T
4
2
34
G
T
C
6
G
4
T
A
C
2
G
G
T
C
A
C
4
10
9
11
A
2
4
T
T
T
G
C
T
A
G
A
A
A
G
T
C
A
T
A
C
T
T
T
T
G
C
T
C
C
G
A
7
A
C
G
A
G
G
A
4
T
G
G
C
C
T
T
T
T
C
T
C
C
C
C
C
T
G
A
G
C
G
G
T
G
T
G
C
C
C
C
C
T
T
G
G
T
G
A
T
G
T
G
G
T
T
A
A
T
A
G
T
G
C
A
G
T
A
13
4
T
A
T
T
A
T
T
G
C
C
G
47
T
T
G
G
T
A
6
A
T
G
C
G
T
G
A
C
G
2
A
G
G
T
A
G
A
C
3
11
C
A
A
A
T
C
A
  100,627,235
  100,629,911
  100,630,415
  100,630,714
  100,631,060
  100,632,117
  100,632,219
  100,632,221
  100,633,467
  100,633,576
  100,633,728
  100,634,062
  100,635,292
  100,636,915
  100,637,413
  100,638,232
  100,639,062
  100,639,308
  100,640,290
  100,640,466
  100,640,469
  100,640,795
  100,641,574
  100,642,017
  100,642,111
  100,642,123
  100,642,185
  100,642,246
  100,642,249
  100,642,292
  100,642,301
  100,642,501
  100,642,598
  100,642,640
  100,642,868
  100,644,595
  100,645,014
  100,645,189
  100,645,406
  100,645,771
  100,645,951
  100,646,044
  100,646,172
  100,646,570
  100,646,600
  100,646,624
  100,646,770
  100,647,577
  100,647,896
  100,647,898
  100,647,924
  100,648,155
  100,648,454
  100,649,622
  100,650,128
  100,650,449
  100,650,456
  100,651,716
  100,651,986
  100,652,434
  100,652,486
  100,652,494
  100,652,556
  100,652,692
  100,652,761
  100,652,984
  100,653,181
  100,653,304
  100,653,423
  100,653,697
  100,653,903
  100,653,924
  100,653,986
  100,653,987
  100,654,051
  100,654,086
  100,654,687
  100,655,015
  100,655,049
  100,655,471
  100,655,566
  100,656,556
  100,656,683
  100,657,566
  100,658,062
  100,658,152
  100,658,165
  100,658,297
  100,658,967
  100,658,996
  100,659,153
  100,659,183
  100,659,337
  100,659,403
  100,659,508
  100,659,527
  100,659,941
  100,659,954
  100,660,007
  100,660,093
  100,660,145
  100,660,344
  100,660,385
  100,660,408
  100,660,802
  100,660,806
  100,661,247
  100,661,689
  100,661,981
  100,662,005
  100,662,008
  100,662,168
  100,662,207
  100,662,383
  100,662,578
  100,662,611
  100,662,641
  100,662,687
  100,662,803
  100,663,399
  100,663,424
  100,663,503
  100,663,548
  100,663,576
  100,664,276
  100,664,278
  100,664,425
  100,665,252
  100,666,161
  100,666,398
  100,666,659
  100,666,782
  100,667,027
  100,667,041
  100,667,091
  100,667,120
  100,667,194
  100,667,336
  100,667,549
  100,667,558
  100,667,649
  100,667,834
  100,667,968
  100,668,776
  100,668,867
  100,669,270
  100,669,361
  100,669,484
  100,669,506
  100,669,508
  100,669,678
  100,669,839
  100,669,976
  100,670,711
  100,673,107
  100,673,650
  100,673,652
  100,674,629
  100,674,718
  100,674,789
  100,674,951
  100,675,409
  100,675,449
  100,675,454
  100,675,461
  100,675,609
  100,675,617
  100,675,625
  100,675,759
  100,675,760
  100,675,771
  100,675,812
  100,675,873
  100,676,369
  100,676,414
  100,676,533
  100,676,548
  100,676,549
  100,676,564
  100,676,793
  100,676,942
  100,677,261
  100,677,412
  100,677,504
  100,680,104
  100,680,155
  100,680,774
  100,681,669
  100,681,789
  100,686,542
  100,687,421
  100,687,423
  100,687,901
  100,691,021
  100,692,614
  100,693,915
  100,694,391
  100,696,182
  100,697,364
  100,697,640
  100,697,831
  100,697,877
  100,697,882
  100,698,051
  100,698,452
  100,698,831
  100,698,930
  100,699,022
  100,699,075
  100,708,685
  100,847,514
  100,847,579
  100,928,213
  100,930,450
  100,930,452
  100,930,455
  100,930,831
  100,930,923
  100,931,017
  100,931,156
  100,931,421
  100,931,425
  100,931,532
  100,931,848
  100,931,859
  100,931,940
  100,932,053
  100,932,063
  100,932,156
  100,932,279
  100,932,539
  100,932,544
  100,934,231
  100,935,126
  100,936,576
  100,937,262
  100,937,590
  100,938,072
  100,938,108
  100,938,112
  100,938,895
  100,938,921
  100,938,989
  100,939,356
  100,940,949
  100,940,951
  100,941,142
  100,941,790
  100,942,757
  100,943,545
  100,944,043
  100,945,028
  100,945,124
  100,945,184
  100,945,626
  100,945,796
  100,945,908
  100,947,320
  100,947,379
  100,947,681
  100,947,700
  100,947,806
  100,947,915
  100,956,478
  100,957,616
  100,957,735
  100,957,750
  100,957,792
  100,957,907
  100,958,067
  100,958,174
  100,958,476
  100,958,667
  100,959,343
  100,959,352
  100,960,177
  100,961,017
  100,961,082
  100,961,571
  100,961,773
  100,961,905
  100,962,046
  100,962,613
  100,962,839
  100,962,977
  100,963,026
  100,963,549
  100,964,070
  100,964,074
  100,964,330
  100,964,604
  100,964,670
  100,964,685
  100,966,729
  100,966,932
  100,966,961
  100,968,947
  100,971,171
  100,972,867
  100,973,085
  100,973,121
  100,973,541
  100,973,669
  100,976,028
  100,976,268
  100,977,927
  100,978,183
  100,978,394
  100,978,597
  100,978,641
  100,979,880
  100,980,550
  100,983,080
  100,983,659
  100,983,724
  100,983,761
  100,983,803
  100,983,963
  100,984,472
  100,985,263
  100,985,469
  100,986,651
  100,986,874
  100,986,958
  100,987,045
  100,987,760
  100,987,818
  100,987,822
  100,987,914
  100,988,143
  100,989,379
  100,990,217
  100,991,060
  100,991,443
  100,991,813
  100,991,896
  100,992,212
  100,992,321
  100,992,687
  100,992,784
  100,993,451
  100,993,820
  100,993,856
  100,994,072
  100,995,626
  100,996,199
  100,996,513
  100,996,597
  100,996,929
  100,996,930
  100,997,061
  100,997,121
  100,998,257
  100,998,261
  100,999,142
  100,999,205
  100,999,615
  101,000,054
  101,000,369
  101,001,902
  101,002,141
-
2
C
C
T
7
-
-
C
A/3
-
7
-
A
A
T
C
2
A
2
7/9
T
G
A
G
G
C
G
G
C
T
G
-
G
-
C
-
5
T
T
A
A
G
-
A
T
T
-
C
A
T
T
T
A
3
G
C
G
C
G
A
C
C
G
13/7
G
-
A
A
A
4
G
A
A
T
G
A
A
3
A
G
A
C
T
C
G
T
C
C
7
G
G
C
C
C
C
C
C
G
C
G
T
G
C
-
79/-
2
C
-
C
A
T
A
T
G
2
G
2
3
T
2
C
T
T
C
G
T
C
-
A
C
T
C
-
A
C
C
A
A
C
2
A
T
2
C
-
C
A
G
T
T
G
A
T
G
8/-
6/-
C
G
C
A
G
6
-
5
5
G/5
C
C
A
T
C
G
C
G
C
C
A
C
A
G/-
T
T
C
-
C
2
2
-
2
4/-
2/-
-
2
T/-
?
-
A
-
C
A/3
T
-
A
A
G
T
T
2
-
-
-
-
G
-
-
C
G
G
C
T
G
C
A
G
G
G
A
10/7
A
C
G
G
13
-
C
C
C
T
G
C
T
G
?
-
7/5
G
T
2
G
A
A
T
4/-
C
2
C
T
T
C
-
C
C
T
-
2
C/2
T
G
T
C
2
G
A
T
-
T
C
A
C
A
A
2
T
T
T
G
C
A
A
-
A
G
C
T
G
T
A
-
A
G
C
C
C
A
C
T
6
G
C
C
5
-
-
A
G
C
C
G
2
A
T
A
G
A
47/-
C
C
9
A
C
T
-
2
G
A
2
A
C
C
T
G
A
-
-
A
T
A
C
T
G
A
-
-
T
G
9
G
C
T
G