Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 150,311 (bp)   Positions: 417
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.013
.02
.383
.031
.001
--
--
--
--
--
.004
.001
.001
.015
.005
.014
.103
.081
.044
.032
.003
.001
.11
--
--
--
.0
.008
.05
.031
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.026
.005
.04
.003
.009
.004
.008
.01
.0
.021
.042
.036
.987
.0
.028
.001
.0
.0
.011
.02
--
.057
.002
.041
.205
.028
.177
.126
.011
.33
.002
.016
.146
.01
--
--
.004
.003
.004
.008
.245
--
.293
--
--
.005
.0
.005
--
--
--
.067
.141
.001
.003
.001
.003
.008
.016
.277
.237
.0
.0
.0
.0
.283
.127
.0
.022
.055
.007
.002
.074
.032
.038
.005
.003
.003
.156
.053
.061
.019
.092
.038
.058
.003
.001
.005
.037
.777
.104
.017
.013
.647
.01
--
.991
.932
1.0
.935
.758
1.0
.004
.0
.066
.003
.026
.03
--
--
--
--
.417
.098
.0
.002
.001
.001
.001
.002
.002
.0
.007
.035
.005
.005
.003
.001
.019
.0
.017
.586
.921
1.0
.021
.001
.017
.008
.001
.082
.977
.017
.101
.004
.0
.0
.084
.007
.0
.001
.0
.001
.015
.0
.056
.001
.29
.279
.204
.004
.1
.025
.272
.005
.199
.054
.001
.0
.0
.006
.966
.037
1.0
.326
--
.014
.032
.982
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.463
.13
.99
.007
.002
.0
--
.005
.009
.008
.022
.06
.044
.211
--
--
--
.084
.953
.936
.013
.946
.881
.999
.956
.783
.973
.216
.64
.109
.001
.003
.003
.034
.112
.224
.861
.916
.265
.192
.991
.993
.992
.913
.474
.549
.596
.067
.041
.245
.025
.441
.404
.03
.978
.995
.618
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.113
.169
.001
.741
.007
.153
.158
.021
.379
.331
.207
.049
.058
.045
.082
.987
.001
.038
.833
.969
.006
.351
.001
.003
.004
.065
.394
.271
.093
.522
.997
.419
.263
1.0
.268
.161
.521
.536
.984
.011
.67
.001
.122
.475
.099
.032
.0
.0
.0
.188
.076
--
--
--
--
--
--
--
.027
.997
.004
.066
.405
.048
--
--
--
--
.001
.199
.002
.099
.037
.046
.095
.02
.317
.321
.54
.053
.001
.032
.018
--
--
--
.039
.026
.392
.004
.004
.646
.497
.029
.0
.001
.003
.004
.0
.001
.002
.013
.0
1.0
.972
.971
1.0
.997
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
Dmxl2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
G
C
2
A
C
T
T
A
A
G
2
A
G
G
A
G
C
A
C
T
A
T
G
A
T
C
C
C
4
2
2
C
8
6
4
C
T
C
T
A
C
G
G
C
G
T
G
G
A
A
G
C
A
G
T
A
T
A
A
G
A
C
14
A
A
T
T
A
C
C
G
C
T
2
4
T
5
2
4
A
T
G
A
A
G
T
C
G
G
C
C
G
C
G
A
C
G
C
C
G
G
A
G
C
T
C
C
C
A
A
C
G
A
A
G
A
G
G
T
T
T
C
A
T
T
A
C
A
3
G
G
10
2
5
G
C
G
T
G
T
C
G
T
T
C
C
G
G
G
G
T
G
G
A
G
G
A
G
G
G
3
A
T
C
C
A
T
T
C
T
A
C
8
G
T
G
A
A
4
C
A
A
T
G
T
G
A
T
T
A
T
T
G
T
G
A
4
G
C
A
T
A
C
A
T
T
G
T
C
C
A
A
G
A
G
A
T
G
3
T
T
T
T
T
T
T
T
C
C
G
G
G
G
A
A
C
A
T
G
C
C
G
G
A
T
G
G
C
C
A
G
G
T
C
A
C
T
C
T
C
G
T
T
T
C
T
T
C
T
C
T
T
T
C
C
C
C
C
T
C
C
2
G
C
T
T
T
T
A
T
T
T
A
A
T
G
G
A
T
A
G
T
T
C
A
T
A
3
C
C
A
C
2
A
A
T
G
A
7
A
8
A
A
T
A
A
T
C
A
C
T
T
T
G
T
A
C
C
4
A
G
A
A
3
2
G
C
A
C
C
C
T
C
T
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
A
A
A
A
A
T
G
T
A
A
A
G
A
A
T
A
G
C
A
2
A
G
C
G
G
T
T
G
G
C
C
T
G
G
C
A
G
10
C
C
C
A
C
C
A
A
G
A
T
C
C
  57,509,704
  57,509,817
  57,509,956
  57,510,082
  57,510,138
  57,510,188
  57,510,193
  57,510,208
  57,510,212
  57,510,238
  57,510,465
  57,510,470
  57,510,493
  57,510,513
  57,510,517
  57,511,129
  57,511,542
  57,511,618
  57,511,763
  57,511,847
  57,512,334
  57,512,502
  57,512,668
  57,513,135
  57,513,188
  57,513,235
  57,513,458
  57,513,501
  57,513,625
  57,513,693
  57,514,320
  57,514,322
  57,514,387
  57,514,405
  57,514,448
  57,514,449
  57,514,451
  57,514,478
  57,514,489
  57,514,497
  57,514,517
  57,514,590
  57,514,594
  57,514,857
  57,515,129
  57,515,296
  57,515,298
  57,515,302
  57,515,383
  57,515,560
  57,515,733
  57,515,879
  57,515,971
  57,515,989
  57,516,102
  57,516,218
  57,516,849
  57,516,951
  57,517,382
  57,517,837
  57,517,925
  57,518,304
  57,518,669
  57,518,982
  57,519,022
  57,519,043
  57,519,062
  57,519,182
  57,519,263
  57,519,267
  57,519,617
  57,519,646
  57,520,093
  57,520,722
  57,521,226
  57,521,455
  57,521,513
  57,521,516
  57,521,551
  57,521,554
  57,521,576
  57,522,259
  57,522,723
  57,522,820
  57,523,011
  57,523,429
  57,523,433
  57,523,957
  57,523,979
  57,524,233
  57,524,842
  57,524,877
  57,524,879
  57,525,588
  57,525,616
  57,526,315
  57,526,345
  57,526,518
  57,526,613
  57,526,615
  57,526,617
  57,526,630
  57,526,633
  57,526,669
  57,527,327
  57,527,328
  57,527,383
  57,527,989
  57,528,142
  57,528,802
  57,529,203
  57,529,214
  57,529,410
  57,529,565
  57,529,900
  57,529,958
  57,529,962
  57,530,001
  57,530,003
  57,530,040
  57,530,119
  57,530,285
  57,530,287
  57,530,940
  57,531,232
  57,531,255
  57,531,261
  57,531,287
  57,531,294
  57,531,299
  57,531,473
  57,531,605
  57,532,281
  57,532,523
  57,532,528
  57,532,847
  57,533,466
  57,534,410
  57,535,395
  57,535,946
  57,536,046
  57,536,415
  57,536,615
  57,536,827
  57,537,753
  57,538,375
  57,538,959
  57,539,137
  57,539,305
  57,539,309
  57,539,437
  57,539,440
  57,539,443
  57,539,455
  57,539,826
  57,540,236
  57,540,493
  57,540,621
  57,540,801
  57,540,873
  57,540,878
  57,540,886
  57,540,888
  57,541,139
  57,541,143
  57,541,281
  57,541,513
  57,541,703
  57,541,714
  57,542,378
  57,543,060
  57,543,124
  57,543,348
  57,543,442
  57,543,611
  57,543,887
  57,544,234
  57,544,413
  57,544,476
  57,544,491
  57,544,524
  57,544,636
  57,545,347
  57,545,456
  57,546,207
  57,546,221
  57,546,970
  57,546,971
  57,547,111
  57,549,185
  57,549,207
  57,549,534
  57,549,618
  57,549,709
  57,550,128
  57,550,177
  57,550,274
  57,550,722
  57,551,315
  57,552,206
  57,552,292
  57,552,432
  57,552,532
  57,552,549
  57,552,602
  57,553,455
  57,553,845
  57,554,789
  57,555,156
  57,555,658
  57,555,661
  57,556,362
  57,557,202
  57,557,469
  57,558,046
  57,559,669
  57,560,061
  57,562,965
  57,563,484
  57,564,222
  57,565,183
  57,565,191
  57,565,215
  57,565,218
  57,565,221
  57,565,224
  57,565,227
  57,565,230
  57,565,679
  57,566,451
  57,566,483
  57,566,558
  57,566,575
  57,566,609
  57,567,361
  57,567,600
  57,567,670
  57,568,366
  57,569,476
  57,571,199
  57,571,677
  57,571,707
  57,572,739
  57,572,885
  57,572,890
  57,572,921
  57,572,924
  57,573,258
  57,573,606
  57,575,058
  57,575,827
  57,576,734
  57,578,045
  57,578,872
  57,579,563
  57,579,565
  57,579,596
  57,579,933
  57,579,957
  57,580,163
  57,580,171
  57,580,427
  57,580,528
  57,580,612
  57,580,637
  57,580,700
  57,580,744
  57,580,750
  57,580,759
  57,580,776
  57,580,789
  57,580,793
  57,580,818
  57,580,827
  57,580,844
  57,580,846
  57,580,993
  57,581,055
  57,581,074
  57,581,108
  57,581,118
  57,581,121
  57,581,125
  57,581,130
  57,581,175
  57,581,193
  57,581,235
  57,581,244
  57,581,261
  57,581,312
  57,581,346
  57,581,411
  57,581,965
  57,583,268
  57,584,972
  57,585,163
  57,586,804
  57,586,816
  57,592,032
  57,592,388
  57,592,854
  57,593,193
  57,593,950
  57,594,761
  57,595,573
  57,595,635
  57,596,358
  57,597,753
  57,597,789
  57,598,607
  57,599,427
  57,599,513
  57,600,951
  57,601,407
  57,602,492
  57,602,493
  57,603,335
  57,603,551
  57,604,305
  57,605,369
  57,605,929
  57,605,938
  57,605,946
  57,605,953
  57,607,569
  57,608,275
  57,608,620
  57,609,714
  57,609,725
  57,609,837
  57,609,861
  57,613,359
  57,615,191
  57,615,573
  57,616,513
  57,619,453
  57,620,338
  57,620,832
  57,621,197
  57,621,799
  57,622,178
  57,622,205
  57,622,342
  57,622,532
  57,622,612
  57,622,721
  57,622,722
  57,623,087
  57,623,117
  57,623,442
  57,625,361
  57,627,655
  57,630,233
  57,632,426
  57,632,603
  57,632,759
  57,633,258
  57,633,308
  57,633,602
  57,634,334
  57,634,606
  57,634,610
  57,634,614
  57,634,624
  57,634,628
  57,634,632
  57,634,660
  57,635,013
  57,635,301
  57,636,796
  57,638,360
  57,638,425
  57,639,182
  57,641,081
  57,641,315
  57,641,647
  57,643,878
  57,645,054
  57,645,102
  57,645,576
  57,645,906
  57,646,470
  57,646,832
  57,647,348
  57,649,339
  57,650,978
  57,650,979
  57,651,712
  57,652,088
  57,652,528
  57,653,242
  57,653,368
  57,653,397
  57,653,414
  57,653,454
  57,654,188
  57,654,285
  57,654,443
  57,654,482
  57,654,711
  57,655,884
  57,656,167
  57,656,624
  57,657,470
  57,657,541
  57,657,812
  57,657,813
  57,657,909
  57,657,912
  57,657,932
  57,657,945
  57,657,957
  57,657,980
  57,657,988
  57,657,989
  57,658,047
  57,658,263
T
C
A
A
-
A/G
C/T
T/C
T/C
G
G
-
-
G
C
C
G
A
A
G
6
C
C
C
C
G
C
T
A
T
4/-
2/-
2/-
3
8/-
6/-
-
C/3
T/G
7/3
T/2
C
T
A
C
4
-
-
A
T
T
G
A
T
2
A
C
G
C
T
2
2
-
T
-
A/G
T
2
C
T
G
T
A
A
A
-
4/-
T/7
-
-
4/-
G
C
6
C
-
G/2
C
A
A
T
T
A
C
-
A
T
T
A
T
A
A
C
-
G/4
4
C
T
A
A
T
G
T
C
G
C
A
G
A
T
C
17
T/-
T
G
C
C
-
A
-
3/-
6/4
A
-
-
-
A
T
C
C
A
C
T
A
C
-
A
-
-
-
T
T
-
A
T
5/G
A
T
G
A
C
C
-
2
A
T
T
G
A
C
A
-
C
T
-
A
A
A
G
G
-
A
G
G
T/C
3
C
A
G
C
-
T
C
6
T
C
A
C
-
T
A
T
C
G
T
G
C
C
T
C
T
C/-
G
T
A
G
T
G
4
A
-
T/C
C
T/C
C
T/C
T/C
T/C
G
C/A
C/G
G/A
G/A
G/4
A
T
G
A
6
C
A
T
2
A
A
G
C
G/3
A
T
2
G
C
-
T/C
T
T
C/T
-
C/T
T/C
C/T
G/A
T/C
T/C
T/-
C/T
T/C
T/C
C/T
C
C/T
T/C
T/C
T/C
C/T
T
C/T
C/T
C/T
T/C
C/T
C/T
2/-
A
C/T
T/C
T/C
T/C
T/C
A/5
T/C
C
2
G
G
-
A
G/A
G
T/C
A/T
C
-
C
T
-
T/A
A/T
-
A
-
G
2
2/-
-
T
5
A
G
-
A/G
8/-
-
T
T/3
G
A/-
T/-
T
T
T
A
11
C
A
A
G
T
T
4/-
-
T
-
2
3/-
2/-
-
C/G
G
A
T
2
C
T
-
A
A
2
16
G/A
G/A
G/A
G/A
G/A
G/A
A/3
G
G
G
G
C
A
T/C
-
-
G
A
C
A/T
A
T
A
T
C
2/-
A/-
C
2
A
3/5
12
T/-
G/-
A
3
T
13
G/3
A
T
G
2
-
T
G
G
G
-
-
-
-
-
C
G
-
2