Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 83,916 (bp)   Positions: 267
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.039
.035
.023
.076
.117
.001
.019
.003
.015
.002
.124
.039
.034
.113
.003
.04
.005
.059
.001
.558
.05
.112
.016
.034
.005
--
--
.012
--
--
.007
.002
.041
.012
.001
.001
.01
--
--
--
.003
.024
.028
.031
.003
.019
.073
.092
--
--
.001
.007
.001
.009
.003
.017
.179
.124
.182
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.394
.002
.002
.003
--
--
.008
.025
.039
.002
.005
.009
.199
.005
.0
.005
.025
.148
.134
.086
.012
.879
.008
.08
.016
.01
.023
.001
.004
.006
.001
1.0
1.0
.0
.0
.003
.006
.002
.017
.001
.044
.38
.03
.04
--
--
--
.002
.044
.034
.029
--
.036
.059
.042
.33
.019
--
--
--
.047
.069
.037
.001
.081
.003
.032
.001
.02
.141
.065
.173
.011
.0
.128
.045
.024
1.0
.002
.002
.007
.085
.01
--
--
--
--
--
.0
.006
.001
.023
.058
--
.0
.001
.003
.004
.001
.014
.995
.001
.001
.001
.002
.075
.045
.005
.005
.001
--
.998
.976
.0
.0
.002
.015
.001
.002
.003
.004
.002
.0
.0
.0
.026
.006
.018
.058
.016
.599
.004
.445
.541
.277
.063
.01
.285
.28
.289
.123
.001
.004
.052
.035
.016
--
--
.0
.024
.015
.01
.001
.0
.0
--
--
--
.049
.036
.054
--
--
.009
.001
.005
.0
.021
.001
.0
.001
.0
.002
.294
.198
.048
--
--
--
--
--
.11
.121
.003
.005
.001
.001
.0
.0
.001
.002
.0
.001
.005
.002
.0
.0
.0
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
Dip2a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
A
2
2
3
G
T
T
T
T
A
A
2
G
T
2
G
G
G
C
A
G
A
T
G
G
24
A
2
T
C
A
11
C
A
A
A
2
G
T
A
A
A
A
A
G
G
C
T
A
A
T
A
T
T
A
T
20
T
T
A
C
C
C
A
12
G
28
T
G
C
G
C
T
18
C
G
G
G
C
G
C
C
G
A
G
T
C
G
G
C
A
A
G
C
T
G
A
T
C
T
C
A
T
A
C
G
A
C
A
C
A
C
14
12
C
T
T
A
G
A
2
G
G
6
T
4
G
T
A
T
G
A
A
T
C
A
G
C
T
A
T
A
T
G
C
T
A
C
G
A
C
A
T
T
C
C
C
C
T
A
114
2
C
G
G
C
G
T
A
G
C
T
C
4
G
G
T
G
T
G
T
A
G
C
G
G
C
C
G
G
T
G
45
G
T
G
C
G
C
C
G
G
7
G
C
T
G
G
C
C
T
T
C
A
A
G
A
G
T
C
A
T
T
C
A
G
C
G
C
G
C
G
G
G
T
G
G
G
C
T
G
T
T
T
A
A
18
8
13
8
13
A
A
T
G
A
T
C
T
T
A
T
A
2
A
G
  15,201,758
  15,201,759
  15,202,164
  15,202,311
  15,202,490
  15,202,734
  15,203,460
  15,203,512
  15,203,695
  15,203,900
  15,204,256
  15,204,429
  15,204,430
  15,205,393
  15,205,535
  15,206,392
  15,206,410
  15,206,944
  15,207,086
  15,207,611
  15,207,824
  15,208,763
  15,209,023
  15,209,145
  15,209,674
  15,210,964
  15,211,007
  15,211,639
  15,213,439
  15,213,448
  15,213,751
  15,214,293
  15,214,485
  15,214,829
  15,214,916
  15,214,957
  15,215,405
  15,215,504
  15,215,538
  15,215,547
  15,215,682
  15,216,032
  15,216,033
  15,216,034
  15,216,332
  15,217,008
  15,217,021
  15,217,294
  15,217,564
  15,217,606
  15,217,833
  15,218,143
  15,218,868
  15,219,021
  15,219,131
  15,219,291
  15,219,511
  15,219,863
  15,219,908
  15,220,074
  15,220,097
  15,220,199
  15,220,209
  15,220,268
  15,220,275
  15,220,350
  15,220,413
  15,220,470
  15,221,102
  15,221,295
  15,221,368
  15,221,435
  15,221,437
  15,222,189
  15,222,200
  15,222,283
  15,222,297
  15,222,597
  15,222,723
  15,222,919
  15,223,131
  15,223,365
  15,223,436
  15,223,441
  15,223,568
  15,228,533
  15,228,610
  15,228,720
  15,228,770
  15,228,970
  15,229,251
  15,229,496
  15,229,632
  15,229,720
  15,229,821
  15,229,876
  15,230,883
  15,230,942
  15,231,038
  15,231,665
  15,231,967
  15,231,981
  15,232,480
  15,232,740
  15,232,745
  15,233,820
  15,234,397
  15,234,606
  15,234,737
  15,235,270
  15,235,341
  15,236,823
  15,237,550
  15,238,528
  15,238,530
  15,238,545
  15,238,611
  15,238,677
  15,239,189
  15,239,198
  15,239,315
  15,240,990
  15,241,025
  15,241,051
  15,241,111
  15,241,475
  15,241,561
  15,241,568
  15,241,707
  15,241,744
  15,241,745
  15,241,970
  15,242,144
  15,242,331
  15,242,403
  15,242,704
  15,242,874
  15,242,932
  15,243,205
  15,243,280
  15,243,448
  15,243,974
  15,244,080
  15,244,535
  15,244,549
  15,244,643
  15,244,767
  15,244,831
  15,244,865
  15,245,154
  15,245,193
  15,245,519
  15,245,930
  15,246,123
  15,246,163
  15,246,217
  15,246,240
  15,246,448
  15,246,472
  15,246,521
  15,246,784
  15,246,899
  15,247,061
  15,247,652
  15,247,815
  15,248,227
  15,248,549
  15,249,573
  15,249,575
  15,249,654
  15,249,860
  15,249,861
  15,250,565
  15,251,076
  15,251,245
  15,251,263
  15,251,314
  15,251,707
  15,251,710
  15,252,296
  15,252,971
  15,253,009
  15,253,095
  15,253,383
  15,253,905
  15,253,956
  15,254,114
  15,254,878
  15,254,974
  15,255,482
  15,255,522
  15,255,693
  15,255,835
  15,256,017
  15,256,074
  15,256,108
  15,256,153
  15,256,278
  15,256,635
  15,257,084
  15,257,246
  15,257,414
  15,257,440
  15,257,575
  15,257,598
  15,257,645
  15,257,802
  15,257,803
  15,258,051
  15,258,106
  15,258,688
  15,259,192
  15,259,479
  15,260,759
  15,261,119
  15,261,441
  15,261,454
  15,261,941
  15,262,286
  15,262,533
  15,263,459
  15,263,981
  15,266,190
  15,267,021
  15,267,206
  15,267,276
  15,267,285
  15,267,436
  15,267,722
  15,267,928
  15,268,313
  15,268,329
  15,272,462
  15,272,858
  15,272,878
  15,272,879
  15,272,930
  15,272,950
  15,272,964
  15,274,152
  15,274,190
  15,274,548
  15,274,602
  15,274,631
  15,274,654
  15,274,815
  15,274,926
  15,275,012
  15,275,264
  15,275,273
  15,275,885
  15,275,894
  15,276,295
  15,276,460
  15,277,155
  15,277,592
  15,279,706
  15,280,844
  15,282,221
  15,283,205
  15,283,888
  15,283,917
  15,285,008
  15,285,010
  15,285,014
  15,285,015
  15,285,017
4
T
-
-
3/-
A
C
C
C
G
G
A/-
2/-
A
C
2/-
7
A
C
T
G
A
G
C
A
2
-
G
-
C
T
C
-
T
G
C
C
-
A
C
T
G
G
G
G
A
C
T
C
-
T
G
T
G
C
G
A
-
C
13
G
G
C/3
45
29
12/-
A
-
C
6
T
A
T
C
-
G
3
A
T
A
A
T
T
C
G
C
G
T
T
T
-
2
-
A
T
G
A
G
5
T
C
22
G
C
G
T
C
G
T
G
T
T
G
14/-
12/-
T
G
C
G
T
3
-
25
3
-
2
-
T
4
T
C
A
G
-
C
2
G
A
-
C
G
13
G
C
A
T
C
C
T
A
G
23
G
C
C
G
T
T
T
C
G
-
-
T
A
A
G
2
18
G
5
10
C
T
4/-
A
A
C
A
C
A
C
G
A
T
A
A
T
T
C
T
C
T
-
A
C
A
T
A
T
T
A
A
-
T
T
C
A
3
T
-
G
C
T
C
2
9
G
T
A
T
G
C
C
4/5
T
A
15
A
2
G/C
C/T
C
A
2
G
A
A
C
T
C
A
C
C
C
G
C
-
-
-
-
-
G
G
C
T
G
C
T
-
G
G
C
C
-
4
4