Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 50,471 (bp)   Positions: 282
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.009
.031
.006
.006
--
--
--
--
.0
.0
.09
1.0
.003
.069
.025
.059
.004
.039
.03
.071
.003
.019
.17
.163
.103
.26
.351
.229
.061
.004
.007
.004
.156
.321
.133
.08
.138
.005
.018
.014
.199
.06
.072
.005
.01
.071
.188
.001
.008
.019
.003
.002
.015
.999
.239
.185
.009
.0
.026
.0
.998
.001
.003
.002
.054
.008
.001
.0
.01
.001
.007
.011
.031
.011
.002
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.002
.001
.665
.185
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.009
.016
.007
.686
.706
.697
.319
.343
.147
.048
.0
.725
.213
.011
.028
.947
.001
.005
.011
.0
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.014
.131
.132
.487
.429
.301
.037
.064
.074
.07
.005
.004
.019
.021
.021
.292
.598
.259
.15
.006
.111
.472
.295
.298
.304
.498
.033
.003
.48
.013
.038
1.0
.872
.013
.004
.061
.0
.002
.005
.002
.403
.15
.002
.026
.002
.031
.024
.167
.0
.004
.001
.0
.002
.001
.057
.065
.011
.001
.005
.001
.005
.006
.088
.005
--
.003
.002
.011
.007
.008
.011
.002
.987
.002
.0
.004
.0
.0
.034
1.0
.999
.003
.042
.002
.0
.003
.194
.884
.81
.483
.605
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.019
.001
.003
.001
.009
.0
.0
.969
.922
.0
.003
.001
.002
.028
.324
.001
.005
.001
.073
.0
.002
.057
.003
.008
.081
.047
.005
.113
.583
.0
.022
.027
.019
.015
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
Dhx29
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
C
C
T
C
T
A
T
G
T
4
T
C
G
T
A
T
T
T
G
G
A
G
G
A
T
G
C
G
A
A
T
2
A
C
A
A
A
T
A
A
G
C
A
A
C
C
C
G
A
A
G
T
T
A
10
C
6
T
C
G
A
12
T
A
G
A
G
G
G
C
A
A
A
G
T
T
A
G
T
A
C
T
G
C
A
G
A
A
G
C
T
G
G
G
A
G
C
6
C
C
C
T
G
C
C
C
A
G
G
A
G
A
C
G
C
3
A
C
T
C
T
C
T
4
T
G
C
A
3
T
C
6
C
C
T
T
16
6
C
C
C
T
T
C
T
C
C
C
C
A
4
A
C
T
A
T
G
G
G
C
C
A
G
A
A
G
C
C
G
G
G
C
C
C
T
G
T
G
A
A
A
G
A
C
A
5
A
G
C
T
9
A
G
T
4
C
A
A
T
2
T
A
2
2
G
G
T
G
G
T
A
A
T
A
G
T
A
C
T
C
A
G
A
A
G
C
G
C
A
A
C
T
G
4
T
A
A
G
T
G
G
C
T
C
A
T
C
C
T
G
G
T
C
G
A
T
C
A
C
C
A
G
C
G
A
T
A
G
T
A
A
T
C
T
T
A
C
A
A
3
2
  63,827,287
  63,828,955
  63,828,960
  63,829,193
  63,830,692
  63,830,847
  63,832,003
  63,832,310
  63,832,730
  63,833,911
  63,834,633
  63,835,400
  63,835,606
  63,837,761
  63,837,821
  63,838,202
  63,838,228
  63,838,851
  63,838,853
  63,839,447
  63,840,844
  63,841,979
  63,842,036
  63,842,069
  63,842,072
  63,842,631
  63,843,035
  63,843,109
  63,843,475
  63,843,823
  63,844,772
  63,844,944
  63,845,339
  63,845,358
  63,846,885
  63,847,509
  63,847,584
  63,847,954
  63,848,077
  63,848,397
  63,849,909
  63,850,067
  63,850,099
  63,850,235
  63,850,325
  63,850,479
  63,850,590
  63,850,830
  63,850,858
  63,850,937
  63,851,586
  63,851,946
  63,852,048
  63,852,351
  63,852,455
  63,852,459
  63,852,473
  63,852,595
  63,852,647
  63,852,834
  63,853,002
  63,853,253
  63,853,259
  63,853,486
  63,853,574
  63,853,729
  63,853,783
  63,853,787
  63,853,832
  63,853,884
  63,855,113
  63,855,116
  63,855,184
  63,855,227
  63,855,300
  63,855,305
  63,855,352
  63,855,394
  63,855,395
  63,855,459
  63,855,464
  63,855,498
  63,855,509
  63,855,528
  63,855,530
  63,855,560
  63,855,579
  63,855,613
  63,855,632
  63,856,017
  63,856,328
  63,856,400
  63,856,423
  63,856,658
  63,856,698
  63,856,778
  63,856,779
  63,856,868
  63,856,870
  63,856,885
  63,856,977
  63,857,015
  63,857,032
  63,857,067
  63,857,068
  63,857,122
  63,857,126
  63,857,203
  63,857,208
  63,857,233
  63,857,254
  63,857,293
  63,857,315
  63,857,327
  63,857,333
  63,857,370
  63,857,438
  63,857,473
  63,857,513
  63,857,566
  63,857,676
  63,857,725
  63,857,749
  63,857,757
  63,857,897
  63,858,059
  63,858,060
  63,858,141
  63,858,211
  63,858,605
  63,858,620
  63,858,631
  63,858,635
  63,858,645
  63,858,652
  63,858,662
  63,858,668
  63,858,674
  63,858,702
  63,858,722
  63,858,725
  63,858,743
  63,858,875
  63,858,884
  63,858,998
  63,859,037
  63,859,082
  63,859,099
  63,859,104
  63,859,189
  63,859,214
  63,859,249
  63,859,253
  63,859,263
  63,859,267
  63,859,303
  63,859,306
  63,859,307
  63,859,324
  63,859,355
  63,859,385
  63,859,557
  63,859,623
  63,859,898
  63,859,961
  63,860,003
  63,860,005
  63,860,009
  63,860,074
  63,860,147
  63,860,164
  63,860,224
  63,860,277
  63,860,307
  63,860,386
  63,860,419
  63,860,439
  63,860,451
  63,860,461
  63,860,543
  63,860,545
  63,860,592
  63,860,646
  63,860,694
  63,860,701
  63,860,748
  63,860,770
  63,860,784
  63,860,814
  63,860,831
  63,860,860
  63,860,921
  63,860,979
  63,861,086
  63,861,105
  63,861,140
  63,861,205
  63,861,226
  63,861,246
  63,861,332
  63,861,365
  63,861,369
  63,861,390
  63,861,395
  63,861,396
  63,861,473
  63,861,636
  63,861,818
  63,862,371
  63,862,437
  63,863,676
  63,863,690
  63,863,706
  63,863,755
  63,863,786
  63,864,191
  63,864,250
  63,864,261
  63,864,431
  63,864,477
  63,864,487
  63,864,582
  63,864,676
  63,864,679
  63,864,714
  63,864,902
  63,864,934
  63,864,937
  63,864,958
  63,865,197
  63,865,223
  63,865,248
  63,865,266
  63,865,285
  63,865,400
  63,868,479
  63,868,511
  63,868,525
  63,868,537
  63,868,679
  63,868,710
  63,868,712
  63,868,717
  63,871,543
  63,871,621
  63,871,711
  63,871,968
  63,872,124
  63,872,403
  63,872,433
  63,872,486
  63,872,529
  63,872,580
  63,872,587
  63,872,645
  63,872,852
  63,872,969
  63,873,065
  63,873,319
  63,873,767
  63,873,945
  63,874,229
  63,874,316
  63,874,346
  63,874,554
  63,874,718
  63,874,836
  63,874,880
  63,875,146
  63,875,250
  63,875,525
  63,875,573
  63,876,112
  63,876,117
  63,876,641
  63,876,747
  63,876,777
  63,877,097
  63,877,127
  63,877,128
  63,877,134
  63,877,135
A
5
T
C
C/G
C
4
2
G/T
C
-
C
C/G
A
-
G
C
T/2
5/3
3
T
G
C
A
G
C
A
C/T
A
G
-
A
-
T
T
G
G
G
C
G
-
A
T
G
C
T
3
2
A
G
G
A
C
C
T
-
T
-
T/G
A
A
G
-
22
G
A
G
A
A
T
G
C
G
T
G/A
T/C
T/A
-
-
T/A
2
3
T/A
3
C/3
A/T
G/A
A/T
A/G
A
G
C
A
A
A
T
T
-
-
-
A
3
C
A
T
T
A
2
2
A
2
A
3
G
T
T
-
-
T
C
A
C
T
C
-
C
C
T
G
-
T/4
C/4
-
C/7
C/T
T/4
T/C
-
-
T
T
T
C
C
2
5
T
T
T
T
G
-
3
T
C
G
C
A
T
A
A
G
G
A
C
C
A
T
T
A
9
A
T
T
T
C
A
C
A
G
G
G
A
T
T
C
-
G
T
T
C
-
G
A
C
-
T
C
-
A
-
C
-
-
2/-
A
A
G
A
C
C
T
G
A
C
A
C
G
G
G
T
G
A
G
G
A
C/T
A
G
T
G
2
-
A
4/-
T/C
A/G
A/T
G/T
T/G
G/A
G/A
C/T
C
C/A
A/T
T/C
T
T
7
A
A
C
A
A
G
C
T
2
T
A
G
A
2
C
C
A
T
2
C
G
C
C
T
T/G
G
C
T
A/4
5
3/-
-