Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 79,871 (bp)   Positions: 301
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.045
.001
.11
--
--
--
--
.318
--
--
.027
.028
.139
.316
.323
.084
.004
--
--
--
.479
--
--
--
--
--
.081
.016
.015
.03
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.072
.163
.263
.002
.004
.002
.048
.048
.002
.086
.102
.081
.035
--
--
--
--
--
.01
.002
.011
.002
.043
.072
.011
.105
.107
.108
.108
--
.048
.033
.087
--
.098
.127
.106
.006
.004
.02
--
--
.344
.16
.003
.201
--
.295
.007
.004
.033
.157
.034
.011
.033
.116
.114
.109
.141
.085
--
--
--
--
--
--
.006
.007
.083
.27
.187
.046
.317
.149
--
.259
.119
.045
.032
.053
.002
.004
.083
.018
.203
.687
--
--
--
--
--
.191
.561
.005
.001
.008
.0
.187
.001
.011
.004
.157
.002
.316
.3
.178
--
.899
.457
.019
.0
--
.015
--
--
.027
--
--
.061
.001
.044
.002
.221
.015
.029
--
--
--
.007
.001
.075
.123
--
--
--
--
.197
.346
.012
.261
.068
.023
--
--
--
--
.005
.32
.003
.018
--
--
--
.053
.015
--
.577
.006
.001
.004
.001
.004
.261
.024
.176
.0
.769
.003
.0
.31
.007
.059
.077
.298
.074
.027
.112
.251
.059
.0
.018
.003
.135
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.703
.033
.035
--
--
.339
.02
.469
.087
.054
--
--
--
.002
.01
.26
.367
.509
.179
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.006
.011
.005
.794
--
--
.095
.179
.009
.013
.003
.009
.024
.0
.004
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
50
G
C
A
4
8
C
18
16
A
C
7
T
A
T
20
3
A
G
2
2
C
T
9
41
G
G
C
T
A
T
G
C
C
A
T
A
A
C
7
C
A
A
C
A
T
A
A
T
A
G
G
10
46
8
A
G
C
10
A
4
C
G
G
C
C
A
3
T
T
T
T
T
T
A
A
T
T
C
A
A
C
T
T
T
T
G
4
2
G
8
G
T
G
G
G
A
G
4
T
G
A
T
T
C
T
A
T
12
A
C
G
A
A
T
C
C
C
G
G
T
3
G
C
G
C
C
G
T
A
T
A
A
C
A
A
C
G
A
T
T
T
T
C
T
C
2
C
A
G
C
T
A
A
3
A
A
T
C
A
T
T
G
G
G
G
6
6
A
G
4
A
C
A
A
C
T
A
2
G
G
G
67
T
2
C
G
T
A
2
12
T
T
T
T
T
C
C
G
C
T
C
4
2
A
T
C
34
C
G
C
C
G
2
T
G
4
C
G
2
T
C
C
2
G
A
4
4
G
G
C
T
C
8
A
A
A
G
T
C
T
9
G
A
G
A
15
C
T
C
T
2
C
T
A
A
16
14
G
A
T
T
C
A
A
4
T
T
G
T
G
C
G
T
C
C
G
12
G
G
T
A
T
T
3
2
G
G
12
C
A
3
A
A
A
A
G
C
C
T
  14,589,177
  14,589,419
  14,589,532
  14,589,912
  14,590,474
  14,590,571
  14,590,614
  14,591,693
  14,592,071
  14,592,073
  14,592,346
  14,593,615
  14,593,771
  14,594,442
  14,594,455
  14,595,068
  14,595,246
  14,595,476
  14,595,678
  14,596,049
  14,597,464
  14,598,222
  14,598,237
  14,598,249
  14,598,297
  14,598,322
  14,598,607
  14,598,778
  14,598,795
  14,598,810
  14,599,372
  14,599,699
  14,600,142
  14,600,151
  14,600,153
  14,600,263
  14,600,311
  14,600,528
  14,600,790
  14,601,034
  14,601,040
  14,601,048
  14,601,049
  14,601,053
  14,601,054
  14,601,059
  14,601,074
  14,601,083
  14,601,089
  14,601,100
  14,601,103
  14,601,215
  14,601,227
  14,601,262
  14,601,280
  14,601,336
  14,601,353
  14,601,415
  14,601,514
  14,601,524
  14,602,518
  14,602,811
  14,602,867
  14,603,220
  14,604,063
  14,604,064
  14,605,192
  14,605,450
  14,605,455
  14,605,461
  14,605,465
  14,605,469
  14,605,473
  14,605,477
  14,605,667
  14,605,690
  14,606,742
  14,606,795
  14,607,386
  14,607,450
  14,607,947
  14,607,988
  14,608,694
  14,608,718
  14,608,720
  14,608,722
  14,608,726
  14,609,428
  14,610,873
  14,610,875
  14,611,067
  14,611,628
  14,611,854
  14,612,217
  14,612,218
  14,612,453
  14,612,785
  14,612,792
  14,612,928
  14,612,933
  14,612,986
  14,613,707
  14,614,038
  14,614,274
  14,614,993
  14,615,390
  14,616,023
  14,616,482
  14,616,842
  14,617,067
  14,617,213
  14,617,255
  14,617,278
  14,617,347
  14,617,379
  14,617,381
  14,617,387
  14,617,714
  14,617,839
  14,617,898
  14,617,994
  14,618,023
  14,618,137
  14,618,791
  14,619,200
  14,619,507
  14,619,540
  14,619,556
  14,619,594
  14,619,707
  14,619,977
  14,620,029
  14,620,063
  14,620,443
  14,620,689
  14,620,734
  14,620,850
  14,620,902
  14,621,185
  14,621,213
  14,621,720
  14,622,186
  14,622,599
  14,622,970
  14,623,018
  14,623,041
  14,623,104
  14,623,226
  14,623,285
  14,623,309
  14,623,396
  14,623,455
  14,623,699
  14,623,814
  14,624,016
  14,624,245
  14,624,448
  14,625,228
  14,625,683
  14,625,767
  14,626,815
  14,626,989
  14,626,990
  14,626,995
  14,627,251
  14,628,834
  14,628,850
  14,628,875
  14,629,568
  14,630,263
  14,630,433
  14,630,622
  14,630,661
  14,630,962
  14,631,065
  14,631,117
  14,631,261
  14,631,879
  14,632,001
  14,632,382
  14,632,614
  14,632,944
  14,633,860
  14,633,993
  14,634,302
  14,634,318
  14,634,828
  14,635,104
  14,635,420
  14,635,534
  14,636,624
  14,636,723
  14,636,781
  14,636,834
  14,636,979
  14,637,094
  14,637,491
  14,637,605
  14,638,062
  14,638,134
  14,638,548
  14,638,552
  14,638,562
  14,638,661
  14,638,793
  14,639,297
  14,639,326
  14,639,355
  14,639,710
  14,639,756
  14,639,763
  14,639,816
  14,640,018
  14,640,228
  14,640,402
  14,640,423
  14,640,524
  14,641,608
  14,643,862
  14,643,867
  14,644,990
  14,645,122
  14,645,221
  14,645,494
  14,645,678
  14,645,841
  14,646,692
  14,646,900
  14,647,206
  14,647,527
  14,648,291
  14,648,308
  14,648,458
  14,649,049
  14,649,724
  14,649,915
  14,650,306
  14,651,294
  14,651,552
  14,651,633
  14,652,195
  14,652,263
  14,652,367
  14,652,494
  14,652,496
  14,652,883
  14,652,916
  14,652,943
  14,653,058
  14,653,119
  14,653,133
  14,653,551
  14,653,568
  14,653,704
  14,654,227
  14,654,644
  14,654,675
  14,655,421
  14,655,423
  14,655,736
  14,656,110
  14,656,790
  14,656,807
  14,656,884
  14,657,161
  14,657,196
  14,657,197
  14,657,529
  14,657,942
  14,658,062
  14,658,088
  14,658,114
  14,658,158
  14,658,574
  14,658,885
  14,660,551
  14,660,557
  14,660,752
  14,661,187
  14,661,231
  14,661,350
  14,661,540
  14,661,649
  14,661,791
  14,661,818
  14,661,977
  14,662,021
  14,662,195
  14,662,312
  14,662,460
  14,663,229
  14,663,234
  14,664,751
  14,664,788
  14,664,830
  14,665,284
  14,665,480
  14,666,983
  14,666,999
  14,667,097
  14,667,440
2
-
A
T
29
-
-
T
18/-
-
G
T
7/-
C
2
3/5
-
-
G
A
2/-
-
T
C
-
-
A
T
A
-
A/2
G
G/T
5
T
G
A
G
G
G
-
A
6
G
2
G
C
3
G
C
7
A
G/5
10/-
-
-
G
3
T
10/-
-
-
-
T
A
T
T
-
-
A
A
A
A
A
T/3
G
G
C
C
T
?
G
3
C
C
C
C
16
4/-
-
A
-
29/27
C
A
A
A
G
A
-
C
A
G
G
C
G
C
G
C
-
2
T
A
2
2
C
T
T
T
A
A
C
-
A
T
A
T
A
T
3/TA
G
C
3
G
T
G
C
T
A
G
C
C
G
T/99
T
40
13
2/-
2
G
C
T
C
2
G
-
G
G
C
2
G
5
G
A
C
A
A
-
6/-
A/15
A
-
2
T
A/-
T
T
T/C
G
-
2
A
A
67/-
A
-
-
A
C
A/G
-
-
-
A
C
C
T/5
T
C/T
3
3
7
3
-
-
G
C
T
-
G
2
T
A
A
-
C
A
-
G
C
-
C
T
T
-
G/A
G
4/-
-
G/9
A
T
11
T
-
G
G
G
-
C
2
A
-
A
G
10
G
-
T
C
A
T/2
2/-
9/7
C
C
G
16/-
14/-
T
G
C
C
T
G
A/5
4/-
C
G
A
C
2
T
A
C
8
T
2
12/-
T
A
C
G
A
C
-
2/-
A
A
-
T
A/G
-
G
G
C
7
C
G
T
C