Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 79,871 (bp)   Positions: 359
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.045
.001
.001
.11
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.019
.003
.318
--
.027
.028
.139
.316
.323
.084
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.109
.081
.016
.015
.03
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.072
.163
.263
.002
.004
.002
.048
.048
.002
.086
.102
.094
.062
.085
--
.01
.002
.011
.002
.072
.011
.102
.105
.107
.108
.108
.108
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.048
.087
--
--
.098
.127
.106
.006
.004
.02
--
--
.344
.16
.003
.201
--
.295
.007
.004
.033
.157
.034
.011
.033
.116
.114
.141
.085
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.007
.083
.27
.187
.046
.317
.149
--
.259
.119
.045
.032
.053
.002
.004
.083
.018
.203
.72
.108
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.15
.191
.561
.005
.001
.008
.0
.187
.001
.011
.106
.101
.004
.157
.002
.316
.178
--
.899
.457
.018
.026
.015
--
--
.027
--
--
.061
.001
.044
.002
.221
.015
.029
--
--
.007
.001
.075
.123
--
--
--
--
--
.197
.346
.012
.261
.068
.023
.375
--
--
--
.005
.32
.003
.018
--
--
.053
.015
--
.577
.006
.001
.004
.005
.235
.257
.261
.024
.176
.0
.683
.003
.0
.31
.004
.001
.007
.077
.298
.027
.112
.251
.059
.0
.018
.003
.135
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.703
.033
.035
--
--
--
--
--
--
--
.339
.02
.001
.469
.087
.054
--
--
.002
.01
.26
.3
.367
.509
.179
.0
.0
.002
.025
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.006
.011
.005
--
--
--
--
--
.095
.179
.178
.009
.03
.194
.209
.013
.003
.009
.024
.0
.004
.257
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
Cyp4f39
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
T
G
C
A
A
G
G
G
T
C
4
T
T
T
T
T
T
C
T
C
16
A
C
7
T
A
T
T
3
A
G
2
C
T
A
9
T
G
G
C
G
G
C
T
T
G
C
C
A
T
A
A
C
A
T
A
T
A
A
T
A
G
G
A
2
2
G
G
C
2
G
G
G
G
G
A
G
C
10
A
4
C
G
G
C
C
A
3
T
T
C
A
A
T
T
C
A
C
T
T
T
T
T
T
A
C
G
G
A
3
G
A
3
A
3
2
G
8
C
G
T
G
G
G
A
G
4
T
G
A
T
T
C
T
A
T
12
A
C
G
A
A
C
C
C
G
C
G
T
4
3
A
G
C
G
C
C
G
T
A
T
A
A
C
A
A
C
G
A
T
T
T
C
C
4
T
C
A
3
T
3
2
C
C
C
A
G
C
T
A
A
3
A
A
T
T
T
C
A
T
G
G
G
G
6
4
G
4
A
C
A
A
C
T
A
2
G
G
G
T
2
C
G
T
A
G
12
G
T
T
T
T
T
C
C
G
A
2
C
4
2
A
T
C
34
G
C
C
G
2
T
G
4
T
4
2
2
T
C
C
2
G
A
4
T
C
4
G
C
C
8
A
A
A
G
T
C
T
9
G
A
G
A
A
15
A
C
T
C
T
2
T
A
A
4
G
2
G
G
G
14
G
A
C
T
T
C
A
A
T
T
G
C
T
G
C
G
T
G
T
C
C
C
A
C
G
C
G
G
G
T
A
T
T
C
2
G
G
C
A
C
T
C
3
A
3
A
2
C
T
A
A
G
C
C
T
T
  14,589,177
  14,589,436
  14,589,443
  14,589,532
  14,589,912
  14,590,470
  14,590,474
  14,590,478
  14,590,482
  14,590,486
  14,590,574
  14,590,621
  14,590,660
  14,590,798
  14,590,802
  14,590,806
  14,590,810
  14,590,814
  14,590,824
  14,590,831
  14,590,836
  14,591,693
  14,592,071
  14,592,346
  14,593,615
  14,593,771
  14,594,442
  14,594,455
  14,595,068
  14,595,272
  14,595,476
  14,595,678
  14,596,049
  14,598,222
  14,598,237
  14,598,249
  14,598,293
  14,598,297
  14,598,338
  14,598,346
  14,598,351
  14,598,362
  14,598,607
  14,598,778
  14,598,795
  14,598,810
  14,599,699
  14,600,142
  14,600,151
  14,600,153
  14,600,263
  14,600,311
  14,600,528
  14,600,790
  14,601,034
  14,601,041
  14,601,055
  14,601,059
  14,601,074
  14,601,083
  14,601,089
  14,601,100
  14,601,103
  14,601,227
  14,601,237
  14,601,245
  14,601,249
  14,601,257
  14,601,259
  14,601,263
  14,601,270
  14,601,280
  14,601,293
  14,601,325
  14,601,329
  14,601,341
  14,601,343
  14,601,353
  14,601,415
  14,601,514
  14,601,524
  14,602,518
  14,602,811
  14,602,867
  14,603,220
  14,604,063
  14,604,064
  14,605,192
  14,605,450
  14,605,455
  14,605,459
  14,605,463
  14,605,646
  14,605,690
  14,606,742
  14,606,795
  14,607,386
  14,607,450
  14,607,988
  14,608,694
  14,608,716
  14,608,718
  14,608,720
  14,608,722
  14,608,724
  14,608,726
  14,609,404
  14,609,414
  14,609,449
  14,609,527
  14,609,536
  14,609,543
  14,609,587
  14,609,596
  14,609,601
  14,609,617
  14,609,627
  14,610,873
  14,611,067
  14,611,628
  14,611,846
  14,611,854
  14,612,217
  14,612,218
  14,612,453
  14,612,785
  14,612,792
  14,612,928
  14,612,933
  14,612,986
  14,613,707
  14,614,038
  14,614,274
  14,614,993
  14,615,390
  14,616,023
  14,616,482
  14,616,842
  14,617,067
  14,617,213
  14,617,255
  14,617,278
  14,617,347
  14,617,379
  14,617,387
  14,617,714
  14,617,839
  14,617,898
  14,617,950
  14,617,994
  14,618,023
  14,618,136
  14,618,137
  14,618,229
  14,618,791
  14,619,200
  14,619,507
  14,619,540
  14,619,556
  14,619,594
  14,619,707
  14,619,977
  14,620,029
  14,620,063
  14,620,443
  14,620,689
  14,620,734
  14,620,850
  14,620,902
  14,621,185
  14,621,213
  14,621,720
  14,622,186
  14,622,599
  14,622,977
  14,623,006
  14,623,018
  14,623,029
  14,623,037
  14,623,088
  14,623,143
  14,623,155
  14,623,164
  14,623,216
  14,623,259
  14,623,285
  14,623,304
  14,623,309
  14,623,396
  14,623,455
  14,623,699
  14,623,814
  14,624,016
  14,624,245
  14,624,448
  14,625,228
  14,625,288
  14,625,293
  14,625,683
  14,625,767
  14,626,815
  14,626,989
  14,626,995
  14,627,251
  14,628,834
  14,628,850
  14,628,873
  14,629,552
  14,630,433
  14,630,622
  14,630,661
  14,630,962
  14,631,063
  14,631,117
  14,631,261
  14,631,879
  14,632,001
  14,632,382
  14,632,614
  14,632,944
  14,633,860
  14,634,302
  14,634,313
  14,634,828
  14,635,104
  14,635,420
  14,635,534
  14,635,893
  14,636,723
  14,636,734
  14,636,781
  14,636,834
  14,636,979
  14,637,094
  14,637,491
  14,637,605
  14,638,062
  14,638,134
  14,638,256
  14,638,445
  14,638,446
  14,638,661
  14,638,793
  14,639,297
  14,639,326
  14,639,355
  14,639,710
  14,639,763
  14,639,816
  14,640,018
  14,640,228
  14,640,402
  14,640,423
  14,640,524
  14,641,608
  14,643,631
  14,644,829
  14,644,831
  14,644,990
  14,645,122
  14,645,221
  14,645,494
  14,645,676
  14,645,841
  14,646,692
  14,646,900
  14,646,931
  14,646,987
  14,647,206
  14,648,291
  14,648,308
  14,649,049
  14,649,724
  14,649,915
  14,650,306
  14,651,294
  14,651,552
  14,651,633
  14,652,195
  14,652,263
  14,652,367
  14,652,494
  14,652,496
  14,652,883
  14,652,886
  14,652,916
  14,652,943
  14,652,959
  14,653,058
  14,653,119
  14,653,133
  14,653,551
  14,653,568
  14,654,227
  14,654,644
  14,654,675
  14,654,780
  14,655,341
  14,655,346
  14,655,348
  14,655,356
  14,655,360
  14,655,421
  14,655,736
  14,656,110
  14,656,381
  14,656,790
  14,656,807
  14,656,884
  14,657,161
  14,657,196
  14,657,529
  14,657,942
  14,658,062
  14,658,072
  14,658,088
  14,658,114
  14,658,158
  14,658,574
  14,658,885
  14,659,003
  14,660,363
  14,660,417
  14,660,422
  14,660,447
  14,660,452
  14,660,551
  14,660,602
  14,660,612
  14,660,752
  14,661,231
  14,661,350
  14,661,540
  14,661,649
  14,661,791
  14,661,818
  14,661,977
  14,662,021
  14,662,195
  14,662,312
  14,663,229
  14,663,234
  14,663,706
  14,663,707
  14,663,730
  14,664,751
  14,664,788
  14,664,790
  14,664,830
  14,664,834
  14,664,849
  14,664,850
  14,665,284
  14,665,480
  14,666,983
  14,666,999
  14,667,097
  14,667,440
  14,667,624
2
G
-
A
T
A/G
A/G
G/A
G/A
G/A
C
T
-
T/C
T/C
T/C
T/C
T/C
T/C
C/2
T/G
T
-
G
T
-
C
2
3/5
T/C
-
G
A
-
T
C
-
-
C
-
-
10
A
T
A
-
G
T
5
T
G
A
G
G
C/G
A/3
T/G
A/G
T/C
A/3
A/G
T/C
G/7
5
G/A
A/G
2/-
2/-
G/3
G/A
C/T
2/-
5
3
A
A
A
A/G
3
T
-
-
-
-
T
A
T
T
-
-
T/A
T/A
C/3
G
G
C
C
T
G
3
T/C
T/C
T/C
T/C
T/C
C
A/G
C/4
G/A
G/A
G
-
G/A
A/G
-
A/G
-
-
A
-
C/G
G/3
C
A
A
A
G
A
-
C
A
G
G
C
G
C
G
C
-
2
T
A
2
2
T
T
T
A
C/G
G/A
C
-
-
G
A
T
A
T
A
T
3
G
C
3
G
T
G
C
T
A
G
C
C
G
C/-
C/T
4/-
T/2
C/2
A/5
3/-
T/-
3/-
-
C/G
2
T
G
C
T
C
2
G
-
G
G
-
-
C
2
G
5
A
C
A
A
-
-
A
-
2
T
-
T
T
C
G
-
2
A
A
A
-
-
A
C
G
A
-
-
-
A
C
C
5
T
T
3
G
-
C/3
4/-
-
G
C
T
-
2
T
A
G/A
-
C
A
-
2
4/-
-
-
C
T
T
-
A
G
-
T/C
C/T
4/-
A
T
T
-
G
G
G
-
C
2
A
-
A
G
10
A/T
G
-
A/G
T
C
A
2
2/-
C
C
G
-
-
-
-
-
-
-
T
G
C/T
C
C
T
G
5
C
G
A
C/T
C
2
T
A
C
A
C
C/4
T
C/T
G
C/8
G/3
A
2
T
A
C
G
A
C
-
-
A
A
T
G
C/2
T/-
C/T
-
A/G
-
A/G
2/-
C/-
-
C
7
C
G
T
C
G