Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 77,916 (bp)   Positions: 457
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.811
.923
.837
.081
.063
.098
.384
.02
.003
.054
.176
.885
.611
.012
.936
.938
.922
.896
.453
.97
.963
.954
.12
.228
.179
.087
.329
.539
.993
.924
.913
.961
.987
.894
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.032
.92
.424
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.005
.016
.01
.021
.269
.022
.001
.109
--
.037
.053
.002
.002
.002
.001
.012
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.038
.004
.028
.034
.996
.012
.002
.055
.744
.02
.558
.653
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.016
.005
--
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.002
.418
.047
.033
.04
--
.007
.015
.004
.037
.015
.016
.058
.049
.233
.154
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.024
.822
.544
.118
.127
.17
.004
.022
.019
.031
.077
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.067
.749
.256
.198
.933
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.561
.672
.459
.739
.997
.876
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
Cyp2c7
C
G
C
G
T
A
G
C
G
A
C
A
G
A
A
T
G
G
G
G
T
A
C
T
2
2
G
C
G
T
T
C
G
G
C
C
T
C
T
A
G
G
T
C
C
C
A
C
G
G
T
4
G
A
G
A
T
A
G
C
G
G
G
2
T
C
T
G
G
A
T
C
T
A
C
C
A
T
T
A
A
G
T
T
C
C
C
A
C
A
G
C
A
G
A
G
A
G
C
T
G
A
A
G
6
G
A
T
C
A
G
G
G
G
T
T
A
A
G
G
T
T
C
C
G
G
A
A
C
C
G
A
G
C
C
G
T
C
T
A
T
A
A
T
G
A
G
C
C
A
G
C
G
G
G
T
G
A
G
G
A
4
A
C
C
C
G
2
A
G
A
C
A
G
T
T
G
C
A
4
G
A
A
T
A
C
T
T
G
C
T
T
C
A
G
A
G
C
A
A
T
A
T
2
A
C
A
G
T
C
G
A
A
G
C
T
C
C
C
A
A
C
C
A
C
T
C
C
T
C
A
C
C
T
2
2
A
T
C
T
C
C
T
G
C
C
T
T
T
G
G
G
A
G
T
G
C
C
C
A
C
G
G
2
A
C
C
C
A
T
A
A
A
A
A
T
C
C
G
C
A
C
G
T
C
G
T
T
A
C
G
T
C
C
A
C
C
T
C
A
T
C
A
G
T
T
C
C
T
T
C
G
C
C
T
G
G
T
C
T
T
G
C
C
T
A
T
A
T
G
C
T
A
C
A
A
G
A
A
C
A
A
A
A
A
T
G
A
T
T
C
G
C
T
T
G
T
A
A
G
G
T
A
G
11
A
3
C
A
C
T
T
T
G
A
C
T
T
C
A
T
G
G
A
G
A
A
A
C
G
C
T
G
G
C
C
A
C
C
A
A
G
G
G
A
A
C
T
G
G
T
C
T
C
T
A
A
G
A
A
T
C
G
T
A
A
C
G
T
C
T
T
C
G
T
T
T
C
3
A
G
A
A
A
A
A
C
A
G
C
T
A
A
A
G
C
T
  154,335,099
  154,335,107
  154,335,125
  154,335,215
  154,335,293
  154,335,302
  154,335,884
  154,335,885
  154,336,025
  154,336,238
  154,336,822
  154,336,972
  154,337,103
  154,337,254
  154,337,279
  154,337,291
  154,337,364
  154,337,425
  154,337,435
  154,337,616
  154,337,724
  154,337,746
  154,338,055
  154,338,341
  154,338,389
  154,338,391
  154,338,397
  154,338,405
  154,338,414
  154,338,465
  154,338,524
  154,338,569
  154,338,939
  154,338,972
  154,339,013
  154,339,017
  154,339,075
  154,339,081
  154,339,098
  154,339,109
  154,339,186
  154,339,190
  154,339,271
  154,339,388
  154,339,714
  154,339,764
  154,340,079
  154,340,124
  154,340,159
  154,340,430
  154,340,528
  154,340,741
  154,340,752
  154,340,778
  154,340,821
  154,340,852
  154,340,864
  154,340,903
  154,340,926
  154,341,028
  154,341,073
  154,342,895
  154,344,637
  154,344,912
  154,344,968
  154,353,175
  154,353,201
  154,353,248
  154,353,552
  154,353,628
  154,353,690
  154,353,717
  154,353,800
  154,353,871
  154,354,030
  154,354,040
  154,354,115
  154,354,193
  154,354,209
  154,354,249
  154,354,286
  154,354,348
  154,354,570
  154,354,581
  154,354,594
  154,355,492
  154,355,632
  154,356,010
  154,356,042
  154,356,208
  154,356,209
  154,356,331
  154,356,343
  154,357,444
  154,365,115
  154,365,229
  154,365,248
  154,366,692
  154,366,694
  154,367,177
  154,368,415
  154,368,672
  154,368,682
  154,368,739
  154,369,774
  154,369,781
  154,369,866
  154,369,868
  154,369,890
  154,370,017
  154,370,161
  154,370,214
  154,370,247
  154,370,491
  154,371,526
  154,371,535
  154,371,751
  154,371,752
  154,371,767
  154,371,908
  154,372,047
  154,372,120
  154,372,184
  154,372,367
  154,372,475
  154,372,571
  154,372,681
  154,372,865
  154,372,870
  154,373,030
  154,373,168
  154,373,222
  154,373,238
  154,373,309
  154,373,346
  154,373,421
  154,373,443
  154,373,445
  154,373,549
  154,373,749
  154,373,798
  154,373,994
  154,374,042
  154,374,110
  154,374,264
  154,374,270
  154,374,696
  154,374,824
  154,374,950
  154,374,996
  154,375,156
  154,375,467
  154,375,520
  154,375,597
  154,375,598
  154,375,875
  154,375,884
  154,375,889
  154,376,023
  154,376,104
  154,376,108
  154,376,156
  154,376,249
  154,376,697
  154,376,709
  154,376,710
  154,376,723
  154,376,724
  154,376,725
  154,376,814
  154,377,325
  154,377,537
  154,377,602
  154,377,729
  154,377,789
  154,377,846
  154,377,887
  154,377,904
  154,377,977
  154,378,169
  154,378,349
  154,378,400
  154,378,548
  154,378,628
  154,378,667
  154,379,066
  154,379,096
  154,379,116
  154,379,315
  154,379,405
  154,379,472
  154,379,473
  154,379,519
  154,379,755
  154,379,924
  154,380,346
  154,380,464
  154,381,171
  154,381,192
  154,381,298
  154,381,745
  154,381,770
  154,381,959
  154,381,960
  154,381,961
  154,382,012
  154,382,013
  154,382,152
  154,382,172
  154,382,224
  154,382,477
  154,382,922
  154,383,199
  154,383,385
  154,383,489
  154,383,719
  154,383,762
  154,383,874
  154,383,953
  154,384,200
  154,384,245
  154,384,867
  154,384,945
  154,385,042
  154,385,334
  154,385,508
  154,385,532
  154,385,637
  154,388,388
  154,390,243
  154,390,299
  154,390,384
  154,390,507
  154,390,537
  154,390,596
  154,390,612
  154,390,754
  154,391,423
  154,391,477
  154,391,503
  154,391,513
  154,391,521
  154,391,596
  154,391,597
  154,391,632
  154,391,779
  154,391,793
  154,391,937
  154,391,942
  154,391,986
  154,391,988
  154,392,018
  154,392,061
  154,392,079
  154,392,084
  154,392,105
  154,392,182
  154,392,184
  154,392,276
  154,392,347
  154,392,355
  154,392,519
  154,392,656
  154,392,683
  154,392,684
  154,392,769
  154,392,807
  154,392,845
  154,392,911
  154,392,948
  154,392,950
  154,392,954
  154,392,956
  154,392,960
  154,393,014
  154,393,049
  154,393,057
  154,393,073
  154,393,087
  154,393,123
  154,393,132
  154,393,182
  154,393,313
  154,393,316
  154,393,411
  154,393,412
  154,393,416
  154,393,447
  154,393,565
  154,393,578
  154,393,651
  154,393,673
  154,393,693
  154,393,700
  154,393,701
  154,393,708
  154,393,781
  154,393,801
  154,393,874
  154,394,025
  154,394,049
  154,394,413
  154,394,686
  154,394,690
  154,394,772
  154,394,823
  154,394,913
  154,394,950
  154,394,963
  154,395,064
  154,395,121
  154,395,158
  154,395,174
  154,395,187
  154,395,272
  154,395,479
  154,395,636
  154,395,750
  154,395,780
  154,395,783
  154,395,833
  154,395,861
  154,395,887
  154,395,941
  154,396,101
  154,396,872
  154,397,191
  154,397,540
  154,397,647
  154,397,716
  154,397,753
  154,397,955
  154,398,094
  154,398,107
  154,398,202
  154,398,242
  154,398,267
  154,398,268
  154,398,320
  154,398,332
  154,398,407
  154,398,414
  154,398,437
  154,398,439
  154,398,466
  154,398,499
  154,398,565
  154,398,570
  154,398,604
  154,398,631
  154,398,654
  154,398,659
  154,398,720
  154,398,810
  154,398,878
  154,398,888
  154,398,895
  154,398,899
  154,398,916
  154,398,944
  154,398,968
  154,398,982
  154,399,010
  154,399,081
  154,399,117
  154,399,125
  154,399,126
  154,399,221
  154,399,227
  154,399,290
  154,399,401
  154,399,473
  154,399,505
  154,399,511
  154,399,528
  154,399,555
  154,399,561
  154,399,595
  154,399,624
  154,399,652
  154,399,653
  154,399,675
  154,399,710
  154,399,714
  154,399,730
  154,399,793
  154,399,806
  154,399,810
  154,399,811
  154,399,812
  154,399,875
  154,399,897
  154,399,910
  154,399,979
  154,399,980
  154,399,986
  154,400,026
  154,400,044
  154,400,088
  154,400,096
  154,400,101
  154,400,124
  154,400,183
  154,400,631
  154,401,726
  154,401,756
  154,401,757
  154,401,958
  154,403,504
  154,403,563
  154,403,678
  154,403,835
  154,403,942
  154,403,977
  154,403,981
  154,404,044
  154,404,047
  154,404,051
  154,404,124
  154,404,130
  154,404,134
  154,404,162
  154,405,218
  154,405,223
  154,405,227
  154,405,252
  154,405,505
  154,405,551
  154,405,576
  154,405,626
  154,405,634
  154,405,777
  154,405,841
  154,405,857
  154,405,941
  154,406,280
  154,406,473
  154,406,692
  154,406,694
  154,406,700
  154,406,707
  154,406,749
  154,406,759
  154,406,773
  154,406,783
  154,406,915
  154,406,920
  154,406,929
  154,406,970
  154,406,980
  154,407,024
  154,407,189
  154,407,206
  154,407,517
  154,407,647
  154,407,668
  154,407,689
C/T
T
T
G/A
T/C
A/C
G/2
C/-
G/A
A/C
C/T
C
G/A
-
G
G
G/T
A
C
C
A
G
C/T
T/C
-
-
A
T
T
A
-
T
A
A
G
A
T/C
C/T
-
G
A
A
C
T
T
A
A/C
A
G/A
G/A
G
-
G/C
A/G
3
A/G
T/A
A/G
G/C
5
G/A
G/A
G/A
-
T/G
C/T
T/G
G/A
G/A
A/C
T/C
C/T
T/A
A/G
C/T
C/A
A/C
T/A
T/G
A/T
A/C
G/A
T/A
T/A
C/A
C/A
C/T
-
C/A
A/2
G/-
C/2
A/T
G/A
A/T
G/A
3
G/A
C/2
T/C
G/A
A/T
A/C
G/C
-
G/2
A/G
T/A
C/G
A/C
G/A
G/A
G/A
G/C
T/A
T/C
A/G
A/G
G/A
G/A
-
T/A
C/A
C/G
G/T
G/T
A/T
A/C
C/G
C/G
G/T
A/G
G/T
C/T
C/T
G/A
T/A
C/T
T/G
A/G
T/A
A/G
A/G
T/A
G/C
A/G
G/T
C/T
C/T
A/G
G/A
C/A
G/C
G/A
G/A
T/C
G/2
A/-
G/A
G/T
A/T
4/-
A/G
C/T
C/T
C/T
G/2
2/-
A/-
G/A
A/G
C/T
A/G
G/A
T/-
T/C
G/T
C/A
A/G
4/-
G/A
A/T
A/C
T/A
A/G
C/G
G
T/G
G/A
C/T
T/C
T/A
C/A
C
G/T
G
G/T
C/G
A/G
C
T/G
A/G
T/4
2/-
A/-
C/T
A/G
G/A
T/C
C/T
G/A
A/T
A/G
G/A
C/T
T/C
C/A
C/-
C/T
G
A/-
C/T
C/G
A/G
C/-
T/G
C/T
C/A
T/C
C/A
A/G
C/T
C/A
-
-
-
A/G
T/C
C/T
T/G
C/A
C/T
T/C
G/A
C/T
C/A
T/A
T/G
T/C
G/A
G/A
G/A
A/T
G/C
T/C
G/A
C/T
C/G
C/A
A/G
C/T
G/C
A
2/-
A/-
C/T
C/T
C/T
A/C
T/C
A/2
A/G
A/6
A/6
A/G
T/3
C/A
C/A
G/A
C/T
A/T
C/T
G/A
T/G
C/T
G/A
T/2
T/C
A/G
C/A
G/T
T/C
C/G
C/T
A/G
C/T
C/T
T/C
C/T
A/G
T/C
C/A
A/G
G/A
T/A
T/C
C/A
C/T
T/2
T/C
C/T
G/C
C/A
C/G
T/G
G/A
G/T
T/A
C/T
T/A
T/C
G/A
C/T
C/T
C
A/G
T/C
A/T
T/C
G/T
C/T
T/G
A/2
C/2
A/2
A/C
G/A
A/T
A/G
C/G
A/G
A/T
A/C
A/T
A/C
T/A
G/T
A/G
T/A
T/C
C/A
G/A
C/T
T/C
T/C
G/A
T/C
A/T
A/G
G/A
G/T
T/A
A/C
G/A
11/-
-
-
C/A
A/G
C/T
T/C
T/C
T/C
G/T
A/G
C/2
T/A
T/A
C/G
A/G
T/C
G/C
G/A
A/G
G/A
A/G
A/G
A/C
C/T
G/A
C/A
T/A
G/A
G/T
C/G
C/A
A/C
C/T
C/T
A/C
A/T
G/C
G/A
G/T
A/C
A/T
C/G
T/A
G/A
A
-
C/T
T/C
C/G
T/A
A/G
A/C
G/A
A/2
A/T
T/A
C/T
T
A
2
AT/-
C/T
G/A
T/C
C/T
T/A
T/C
C/A
G/A
T/C
T/G
T/G
C/-
3/-
A/C
G/A
A/C
A/G
A/G
A/G
A/G
C/T
A/G
G/A
C/T
T/A
A/C
A/T
A/G
G/T
C/A
T/G