Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 139,675 (bp)   Positions: 414
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.137
.016
.007
.118
.017
.008
.067
.084
.292
.295
.773
.013
.044
.043
1.0
.084
.054
.04
--
.594
.154
.043
--
.074
.464
.056
.042
.001
--
--
.001
.477
.001
.675
.016
.008
.309
.079
--
--
--
.2
.346
.107
.001
--
.026
.027
.005
.0
.082
.111
.381
.067
.004
.005
.006
.025
.019
.008
.005
.0
.101
.319
.045
.012
.001
.041
.025
.516
.336
.308
.0
.031
.0
.001
.011
.004
.003
--
.044
.115
.289
.3
.569
.793
.011
--
--
--
--
--
--
.096
.018
.01
.037
.888
.199
.144
.017
.056
.085
.057
.023
.002
.003
.001
.125
.003
.0
.128
.071
.111
.093
--
.162
.011
.016
.002
.007
.022
.028
.042
.03
.0
.0
.15
.002
.17
.006
.02
.191
.246
.002
.003
.708
.137
.435
.084
.091
.03
.111
.013
.282
.145
--
--
.175
.578
.001
.002
.009
.521
.007
--
--
--
--
--
--
.11
.007
.007
.01
.037
.246
.003
.003
.043
.246
.195
.06
.08
.001
.028
.035
.018
.059
.001
.014
.008
.246
--
--
.079
--
--
--
--
--
--
--
.044
.082
.001
.172
.553
.001
.031
.004
.005
--
--
--
.001
.46
.075
.081
.032
.174
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.457
.072
.289
.504
.049
.038
.24
.088
.005
.914
.454
--
--
--
--
.288
.72
.008
.035
.047
.005
.97
.058
.154
.046
.344
.038
.003
.351
.161
.015
.0
.014
.038
.036
.04
.103
.251
.713
.005
.005
--
.002
.002
.005
.008
.008
.269
.002
.014
.05
.707
.142
.895
.035
.189
--
--
--
--
--
.054
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.079
.962
.996
.99
.992
.995
.998
.998
1.0
1.0
1.0
.994
.09
--
.616
.113
.071
--
--
.123
.0
.976
.015
--
.137
.0
.023
.008
.018
.001
.005
.082
.018
.136
.022
.066
.042
.015
.001
.339
.062
.11
--
--
--
.006
.193
.148
.001
.002
.013
.001
.044
--
.02
--
--
.004
.169
.118
.107
.011
.047
.005
.041
.001
.03
.037
.21
.03
.128
.59
.056
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.265
--
--
--
--
--
.257
.063
.004
.001
.012
.004
--
.007
.007
.167
.011
.062
.183
.055
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
S100g
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
Ctps2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
T
A
A
6
A
T
3
A
A
G
A
3
C
A
G
A
C
A
T
C
2
A
C
C
C
A
G
G
A
G
A
C
G
A
A
A
2
G
T
3
C
A
G
G
G
A
T
T
C
G
C
A
G
A
G
T
T
C
C
A
A
T
A
A
T
T
A
2
T
C
C
C
G
4
T
5
G
C
G
G
A
A
5
G
T
T
A
C
G
C
A
A
G
G
A
A
A
G
A
G
G
A
A
G
C
T
T
A
C
A
T
A
T
A
C
C
A
G
A
C
A
T
A
C
C
T
G
C
A
2
T
A
C
G
A
T
T
2
G
C
G
A
G
T
T
A
G
A
A
A
G
G
G
C
C
T
11
A
A
C
C
C
A
8
A
T
G
T
C
C
A
A
A
A
A
C
T
A
C
A
A
C
A
C
T
G
C
C
C
4
C
G
A
A
T
C
T
T
T
G
G
C
T
G
A
T
A
C
T
3
G
A
G
T
A
A
G
A
C
G
C
G
C
4
G
C
C
A
G
C
C
T
T
C
A
T
T
A
T
A
T
A
4
A
C
T
C
G
A
T
A
G
C
G
C
T
G
T
A
G
5
T
T
A
C
T
4
T
C
A
A
G
A
A
G
3
A
T
G
C
C
G
T
C
T
G
G
C
A
G
C
T
G
C
G
A
A
C
G
A
T
G
G
C
G
C
T
C
C
C
A
G
G
C
A
T
T
A
G
C
A
T
T
G
G
G
C
C
T
G
A
C
C
T
T
T
C
G
A
C
G
C
G
G
C
G
C
G
A
G
G
G
C
G
T
C
G
A
G
T
4
C
T
C
C
A
G
G
A
G
T
A
A
G
G
G
G
T
C
T
A
C
A
2
G
G
C
G
2
2
A
G
C
G
A
G
A
2
C
G
G
G
G
C
T
G
T
G
C
A
2
C
  33,730,938
  33,731,033
  33,732,770
  33,733,019
  33,733,308
  33,733,777
  33,733,795
  33,733,801
  33,734,287
  33,734,289
  33,734,904
  33,735,091
  33,737,906
  33,742,245
  33,745,810
  33,749,132
  33,750,904
  33,751,416
  33,751,506
  33,752,097
  33,753,395
  33,753,979
  33,754,437
  33,754,541
  33,755,059
  33,755,545
  33,755,561
  33,756,129
  33,756,398
  33,756,640
  33,756,868
  33,756,896
  33,756,978
  33,757,560
  33,757,780
  33,757,837
  33,757,878
  33,758,051
  33,758,647
  33,758,659
  33,758,660
  33,759,096
  33,759,664
  33,760,110
  33,760,823
  33,762,111
  33,763,315
  33,763,438
  33,764,165
  33,764,899
  33,765,130
  33,765,580
  33,765,753
  33,765,842
  33,765,945
  33,765,955
  33,765,957
  33,765,965
  33,765,975
  33,765,977
  33,765,979
  33,766,200
  33,766,722
  33,767,246
  33,767,397
  33,767,644
  33,768,492
  33,768,926
  33,769,398
  33,769,807
  33,769,943
  33,769,950
  33,770,474
  33,770,769
  33,770,802
  33,770,948
  33,770,966
  33,770,967
  33,770,971
  33,771,119
  33,771,157
  33,771,293
  33,771,800
  33,771,802
  33,771,856
  33,772,409
  33,773,211
  33,773,377
  33,773,398
  33,773,501
  33,773,860
  33,773,995
  33,774,028
  33,774,551
  33,774,635
  33,774,639
  33,774,810
  33,775,134
  33,775,425
  33,775,595
  33,776,699
  33,776,817
  33,776,837
  33,776,854
  33,776,862
  33,776,996
  33,777,002
  33,777,035
  33,777,654
  33,777,755
  33,779,958
  33,781,060
  33,782,644
  33,782,958
  33,782,961
  33,783,623
  33,783,674
  33,784,114
  33,784,119
  33,784,288
  33,784,301
  33,784,316
  33,784,340
  33,784,356
  33,784,358
  33,784,363
  33,784,368
  33,784,434
  33,785,324
  33,786,041
  33,787,386
  33,788,000
  33,788,130
  33,789,968
  33,791,182
  33,791,208
  33,791,454
  33,791,606
  33,792,457
  33,793,832
  33,793,851
  33,793,941
  33,794,276
  33,794,312
  33,794,634
  33,794,786
  33,795,314
  33,795,423
  33,795,547
  33,796,153
  33,796,313
  33,796,314
  33,796,591
  33,796,697
  33,796,953
  33,797,282
  33,797,290
  33,798,701
  33,798,997
  33,799,062
  33,799,565
  33,800,273
  33,800,666
  33,800,669
  33,800,752
  33,800,775
  33,801,009
  33,801,641
  33,801,823
  33,801,999
  33,802,379
  33,802,586
  33,802,650
  33,802,684
  33,802,898
  33,802,995
  33,803,248
  33,803,444
  33,803,944
  33,804,721
  33,804,813
  33,805,041
  33,805,793
  33,805,820
  33,805,852
  33,806,384
  33,806,801
  33,807,721
  33,807,931
  33,807,943
  33,807,949
  33,807,954
  33,807,963
  33,808,608
  33,809,087
  33,809,467
  33,809,827
  33,810,147
  33,810,180
  33,810,558
  33,810,574
  33,810,608
  33,810,790
  33,810,876
  33,810,913
  33,810,971
  33,811,408
  33,811,455
  33,811,749
  33,811,976
  33,812,030
  33,812,057
  33,812,063
  33,812,064
  33,812,073
  33,812,085
  33,812,128
  33,812,199
  33,812,203
  33,812,245
  33,812,561
  33,812,587
  33,812,588
  33,812,635
  33,813,423
  33,813,458
  33,813,933
  33,814,329
  33,814,947
  33,815,084
  33,815,090
  33,815,230
  33,815,534
  33,815,618
  33,816,322
  33,816,581
  33,816,665
  33,817,229
  33,817,301
  33,817,516
  33,817,854
  33,817,968
  33,818,132
  33,818,258
  33,818,310
  33,818,405
  33,818,619
  33,819,576
  33,819,727
  33,819,773
  33,819,864
  33,820,008
  33,820,146
  33,820,536
  33,820,894
  33,820,934
  33,821,000
  33,821,063
  33,821,126
  33,821,167
  33,821,484
  33,821,491
  33,821,539
  33,821,945
  33,821,952
  33,822,145
  33,822,232
  33,822,247
  33,822,351
  33,822,412
  33,822,468
  33,822,804
  33,822,862
  33,822,958
  33,823,080
  33,823,113
  33,823,325
  33,823,769
  33,824,367
  33,824,787
  33,824,925
  33,824,937
  33,824,940
  33,824,941
  33,824,984
  33,825,251
  33,825,341
  33,825,346
  33,825,389
  33,825,519
  33,825,738
  33,825,768
  33,825,774
  33,825,788
  33,825,939
  33,825,945
  33,837,863
  33,838,272
  33,838,877
  33,838,992
  33,839,037
  33,839,084
  33,839,086
  33,839,097
  33,839,127
  33,839,135
  33,839,155
  33,839,173
  33,840,318
  33,840,481
  33,840,804
  33,841,054
  33,841,463
  33,841,628
  33,841,767
  33,842,167
  33,842,277
  33,843,246
  33,845,093
  33,845,262
  33,845,523
  33,845,597
  33,846,043
  33,846,549
  33,846,680
  33,846,796
  33,847,047
  33,847,104
  33,847,114
  33,847,122
  33,847,218
  33,847,312
  33,848,729
  33,848,969
  33,848,974
  33,848,981
  33,849,130
  33,849,232
  33,849,579
  33,849,754
  33,849,972
  33,850,047
  33,850,185
  33,851,054
  33,852,105
  33,852,615
  33,852,950
  33,853,016
  33,853,024
  33,853,053
  33,853,292
  33,853,470
  33,853,791
  33,854,266
  33,854,276
  33,854,320
  33,854,588
  33,854,712
  33,854,749
  33,854,823
  33,854,907
  33,854,925
  33,854,972
  33,855,348
  33,855,404
  33,855,408
  33,855,925
  33,856,047
  33,856,126
  33,856,235
  33,856,356
  33,856,492
  33,856,510
  33,856,553
  33,856,570
  33,856,589
  33,856,593
  33,856,613
  33,856,624
  33,856,643
  33,856,647
  33,856,664
  33,857,195
  33,857,196
  33,857,197
  33,857,223
  33,857,321
  33,857,399
  33,857,406
  33,857,408
  33,857,434
  33,857,511
  33,857,679
  33,857,840
  33,858,510
  33,859,332
  33,859,387
  33,860,583
  33,861,288
  33,861,323
  33,861,730
  33,862,528
  33,863,191
  33,864,206
  33,864,533
  33,864,536
  33,866,016
  33,866,570
  33,866,610
  33,867,150
  33,867,533
  33,867,788
  33,867,904
  33,868,309
C
C
-
2
-
-
A/T
T/A
-
-
G
2
G
-
C/2
T
A
-
C/2
2
A
G
-
-
T
2
T
G
2
2
G
A
G
T
A
G
G
C
-
2
2
-
T
3
A
A
A
G
C
C
T
A
T
3
T
T
T
T/C
7
C/3
C/T
G
T
-
G
G
C
C
C
-
C
T
T
T
A
-
T/2
5/-
G/-
T
A
A
G
A/G
-
A
G
5
C
A
A
T
2
-
A
A
-
G
-
GT/-
G
-
G/A
A/G
A/G
C
G
C
A
C
T
A/G
C
-
2
G
T
C/2
A/C
2
-
A
2
2
2
-
2
G
A
T
G
-
3
-
C/G
G/C
3
C
C
-
7
T
A
G
A
-
-
T
C
9
G
G
A
A
2
2
C/-
C
-
G
G
T
A
T
G
-
2
T/-
G/A
2
T
G
G
G
C
2
G
T
C
G
G
T
G
T
-
T
C
3
G
G
C/A
4/-
C/G
A
A/T
G
C
A
C
G
C
A
A
3
C
C
G
C
T
T
A
-
2
3
C
C
T
A/G
G/C
T
C/T
G/A
C/A
G/T
T
-
2
15
T
G
A
G
G
G
C
2
-
G
4
T
2
G
G
G
-
2
3
C
T
A
G
C
G
A
T
T
A
3
C
C
G
T
-
-
13
G
A
C
-
6
G
-
G
C
5
G
T
-
-
-
A
G
T
A
C
G
C
C
T
A
A/G
A
C/T
T/G
A
-
A
7
C
2
C
G
-
-
-
A
-
-
C
T
T
3
G
A
3
C/2
3
2
2
C
A/40
T
G
C
C
C
A
A
T
T
T/-
A
C
12
C/G
C
2
G
T
A
T
A
A
4
A
G/2
T
-
10
A
C
A
A
-
-
A
G
T
A
C
C
C
-
T
C
G
T
G
A
2
T
A
C
T
A/G
G/A
G/A
G/C
G/A
3
-
2
A/4
C/T
A/2
2/-
G/A
3
C/-
-
2/-
-
G
A
2
2
-
A
T
-
T
-
A
3
18
C/G
A
A
C
A
T
G
-
2