Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 144,650 (bp)   Positions: 278
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.392
.398
.003
.001
.001
.005
.159
.069
.031
.002
.004
.297
.0
.007
.889
.001
.033
.089
.004
.012
.001
.29
.001
.002
.001
.006
.028
.001
.002
.01
.011
.001
.002
.002
.987
.004
.002
.004
.001
.002
.006
--
.008
.009
.005
.02
.003
.003
.162
.004
.016
.937
.053
.036
.006
.0
.338
.024
.03
.0
.027
.002
.002
.007
.011
.009
.127
.001
.011
.004
.129
.003
.004
.018
.0
.007
.061
.001
.003
.0
.0
.0
.611
.842
.418
.005
.008
.749
.655
.017
.006
.018
.002
.0
.005
.039
.043
.055
.0
.0
.027
.028
.002
.002
.001
.007
.007
.001
.028
.016
.005
.069
.048
.11
.665
.006
.001
.14
.115
.186
.0
.012
.001
.006
.0
.03
.009
.019
.012
.003
.002
.001
.072
.474
.005
.053
.004
.059
.0
.0
.0
.001
.086
.042
.129
.038
.053
.009
.001
.001
--
.06
.087
.002
.0
.016
.017
.001
.0
.966
.008
.066
.0
.0
.003
.01
.0
.046
.0
.075
.0
.001
.002
.012
.002
.003
.0
.159
.776
.001
.001
.004
.007
.012
.0
.988
.005
.0
.001
.095
.06
.09
.001
.023
.962
.003
.005
.011
.014
.038
.005
.009
.003
.142
.387
.0
.02
.544
.137
.024
.026
.006
.352
.586
.534
.726
.793
.1
.074
.011
.036
.17
.159
--
--
.024
.075
.298
.027
.02
.017
.496
.614
.108
.085
.003
.051
.024
.239
.235
.185
--
.02
--
.011
.419
.135
.038
.002
.0
--
.932
.005
.086
.016
.012
.007
.01
.059
.032
.014
.065
.032
.0
.002
.023
.001
.02
--
.002
.068
.0
.357
.001
.0
.064
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
A
6
T
T
T
T
T
G
4
C
C
C
C
C
G
A
G
T
T
T
18
T
C
A
T
G
3
A
G
T
4
A
4
G
T
G
2
T
A
G
A
C
C
C
A
4
C
G
A
A
T
G
G
G
G
6
C
C
3
2
C
G
A
T
A
T
A
G
A
T
A
C
G
A
T
C
G
C
G
C
T
A
G
C
T
C
T
C
T
A
G
2
T
C
T
A
A
T
T
A
A
G
C
12
10
C
T
T
A
5
G
C
T
G
T
T
G
A
T
G
A
A
C
G
T
T
20
T
G
A
T
A
C
14
G
T
3
G
C
A
A
G
T
T
A
T
9
C
C
C
A
A
G
C
A
T
A
T
A
T
T
A
A
T
T
T
C
A
T
T
A
T
C
G
T
A
C
G
A
A
G
A
C
C
2
G
T
A
C
G
A
T
C
C
T
A
16
14
A
T
T
9
G
G
T
G
G
G
C
C
G
A
A
2
A
18
T
T
A
C
G
T
G
T
2
104
T
G
C
G
C
6
C
C
A
A
A
G
T
A
T
A
A
A
A
T
T
G
A
G
C
G
T
C
A
T
T
G
A
G
C
C
A
2
C
A
C
T
A
T
C
G
A
A
T
C
2
2
  113,728,774
  113,728,828
  113,728,965
  113,729,145
  113,729,189
  113,729,373
  113,730,601
  113,730,766
  113,730,798
  113,731,133
  113,732,179
  113,732,814
  113,733,616
  113,734,225
  113,736,345
  113,741,383
  113,743,613
  113,746,430
  113,747,003
  113,747,055
  113,747,063
  113,747,200
  113,747,241
  113,747,783
  113,749,473
  113,749,534
  113,749,582
  113,750,102
  113,750,644
  113,751,433
  113,751,581
  113,753,061
  113,753,103
  113,753,207
  113,753,212
  113,753,880
  113,754,622
  113,754,623
  113,755,598
  113,760,407
  113,763,914
  113,765,164
  113,768,721
  113,771,727
  113,771,728
  113,772,767
  113,773,143
  113,773,551
  113,773,685
  113,774,283
  113,774,354
  113,774,451
  113,775,135
  113,775,457
  113,775,880
  113,776,193
  113,776,269
  113,776,430
  113,777,060
  113,777,061
  113,778,837
  113,779,126
  113,779,185
  113,779,405
  113,780,116
  113,780,140
  113,780,789
  113,780,933
  113,781,069
  113,781,194
  113,781,602
  113,781,783
  113,781,965
  113,782,147
  113,782,154
  113,782,242
  113,782,254
  113,782,544
  113,782,726
  113,782,749
  113,782,990
  113,783,091
  113,783,215
  113,783,743
  113,783,785
  113,783,812
  113,783,958
  113,783,990
  113,784,028
  113,784,054
  113,785,432
  113,787,173
  113,787,292
  113,787,335
  113,787,357
  113,787,377
  113,787,385
  113,787,510
  113,787,516
  113,787,523
  113,787,726
  113,787,829
  113,787,831
  113,788,270
  113,788,272
  113,790,162
  113,790,331
  113,790,699
  113,791,021
  113,791,168
  113,791,658
  113,792,720
  113,793,081
  113,793,215
  113,794,412
  113,794,496
  113,794,559
  113,795,416
  113,796,287
  113,796,630
  113,797,019
  113,797,168
  113,797,244
  113,797,491
  113,797,834
  113,799,704
  113,801,803
  113,805,275
  113,805,534
  113,806,956
  113,807,926
  113,808,553
  113,808,698
  113,809,287
  113,809,694
  113,809,722
  113,810,042
  113,810,427
  113,810,452
  113,810,846
  113,810,847
  113,811,069
  113,811,109
  113,811,206
  113,811,530
  113,811,556
  113,811,673
  113,811,700
  113,811,859
  113,811,874
  113,811,890
  113,812,643
  113,812,840
  113,812,898
  113,812,942
  113,813,157
  113,813,181
  113,813,182
  113,813,210
  113,813,247
  113,813,512
  113,813,575
  113,813,677
  113,813,975
  113,814,136
  113,814,298
  113,814,328
  113,814,531
  113,814,684
  113,814,968
  113,815,137
  113,815,292
  113,815,295
  113,815,314
  113,815,318
  113,815,416
  113,815,431
  113,815,492
  113,815,953
  113,816,406
  113,816,763
  113,816,772
  113,816,799
  113,817,025
  113,817,103
  113,817,264
  113,817,890
  113,818,647
  113,818,992
  113,819,780
  113,820,080
  113,820,524
  113,820,544
  113,820,573
  113,821,026
  113,821,097
  113,821,780
  113,821,782
  113,822,316
  113,822,528
  113,824,606
  113,825,296
  113,826,937
  113,826,988
  113,827,162
  113,827,593
  113,828,073
  113,830,828
  113,830,886
  113,831,226
  113,831,580
  113,831,744
  113,831,847
  113,831,945
  113,832,140
  113,832,159
  113,832,206
  113,832,212
  113,832,385
  113,832,398
  113,832,601
  113,832,702
  113,832,748
  113,833,229
  113,833,243
  113,833,247
  113,833,388
  113,833,416
  113,833,431
  113,833,489
  113,833,502
  113,833,523
  113,833,617
  113,833,630
  113,833,853
  113,834,122
  113,834,544
  113,834,557
  113,834,581
  113,834,620
  113,834,621
  113,834,628
  113,835,861
  113,836,291
  113,837,361
  113,839,132
  113,839,544
  113,839,627
  113,841,258
  113,841,645
  113,854,226
  113,854,989
  113,855,307
  113,855,454
  113,855,549
  113,855,632
  113,855,638
  113,856,018
  113,856,172
  113,856,335
  113,856,407
  113,856,798
  113,857,133
  113,857,420
  113,857,976
  113,858,132
  113,858,282
  113,858,299
  113,858,624
  113,858,783
  113,858,793
  113,859,444
  113,861,947
  113,864,015
  113,868,346
  113,868,350
  113,868,767
  113,869,091
G
6/-
G
C
C
G
C
A
-
T
21/23
T
G
A
A
A/7
A
C
C
C
-
5/4
4
G
A
A
-
G
7
C
-
T
-
A
C
T
2/-
T/-
3
GT/3
-
T
A
G
G
-
T
23
G
11
A
A
C
2
C
-
A
T
-
2/-
T
A
G
G
G
C
G
A
T
G
C
A
T
-
G
T
A
T
A
T
T/2
G
A
G
C
T
C
T
A
G
C
-
C
G
C
G
G
3
2
T
G
-
A
12/-
10/-
T
C
C
G
-
A
T
2
A
G
3
4
G
C
A
12
-
T
A
C
C
-
A
A
G
2
T
T
-
A
C
-
A
T
G
T
T
A
-
T
C
-
A
G
T
G
G
A
9
G
G
T
G
-
C
C
G
G
C
C
A
T
G
C
C
G
C
T
2
G
T
T
A
G
G
A
-
T
T
-
A
G
G
T
3
G
3
T
3
C
3
16/-
-
T
C
C
-
G/3
A
-
A
A
T
T
T
A
C
T
-
G
-
A
A
G
T
A
C
T
A
-
-
G
A
T
A
5
6/-
T
T
T
G
A/41
G/8
T/33
A/3
T/7
9/27
G
-
G
C
G
A
G
A
T
11
C
T
3
C
A
A
G
15/17
T
T
G
-
T
G
14
G
G
C
23/21
A
C
-
75
T
-
-