Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 144,650 (bp)   Positions: 348
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.006
.002
.015
.005
.146
.003
.001
.005
.159
.088
.129
.031
.002
.815
.004
.297
.0
.007
.183
--
.024
.033
.084
.007
.089
.004
.012
.012
.29
.196
.001
.452
.002
.018
.028
.004
.0
.002
.001
.001
.003
.011
.001
.002
.002
.987
.007
.004
.002
.004
.004
.092
.006
--
.008
.009
.005
.02
.003
.003
.162
.004
.016
.937
.053
.036
.0
.338
.024
.0
.027
.002
.002
.007
.011
.009
.127
.001
.011
.004
.129
.003
.004
.018
.0
.007
.061
.001
.003
.0
.0
.0
.611
.842
.418
.005
.008
.749
.655
.349
.017
.006
.018
.002
.0
.005
.039
.043
.055
.0
.0
.027
.028
.002
.002
.002
.001
.007
.007
.001
.025
.049
.048
.006
.009
.001
.134
.186
.0
.001
.563
.006
.0
--
.0
.001
.012
.053
--
.012
.004
.002
.002
.0
.0
.017
.58
.083
.474
.005
.053
.004
.059
.0
.0
.0
.001
.086
.631
.001
.042
.077
.129
.038
.053
.009
.001
.001
.534
--
--
.037
.172
.036
.087
.0
.0
.0
.0
.0
.046
.006
.0
.075
.0
.001
.002
.012
.002
.003
.001
.001
.004
.0
.012
.005
.095
.0
.001
.13
.023
.876
.001
.0
.038
.315
.001
.009
.142
.162
.387
.01
.168
.198
.042
.091
.517
.921
.934
.907
.492
.514
.321
.005
.007
.045
.043
.015
.007
.029
.012
.01
.019
.004
.04
.04
.015
.02
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.02
.241
.015
.352
.579
.09
.159
--
--
.024
.075
.298
.027
.02
.005
.017
.496
.108
.003
.003
.229
.005
.01
.02
.152
.087
.082
.072
.135
.008
.002
.038
.033
.012
.004
.005
.0
.921
.013
.015
--
.932
.005
.086
.016
.012
.007
.059
.014
.0
.269
.109
--
.011
.018
.347
.068
.147
.483
.147
.0
.0
.002
.0
.001
.0
.0
.001
.355
.357
.001
.001
.0
.256
.064
.021
.44
.001
.001
.319
.209
.028
.035
.026
.001
.001
.0
.059
.058
.005
.03
.006
.003
.013
.001
.002
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
Col6a6
G
A
G
20
G
T
T
T
G
2
T
C
C
A
C
C
C
G
C
G
A
T
2
A
T
T
18
G
C
G
A
C
T
2
A
4
C
T
A
G
T
A
4
G
T
G
3
2
T
A
G
A
C
C
C
A
4
C
G
A
A
T
G
G
G
G
C
C
3
C
G
A
T
A
T
A
G
A
T
A
C
G
A
T
C
G
C
G
C
T
A
G
C
T
C
T
C
T
A
G
G
2
T
C
T
A
A
T
T
A
A
G
C
12
10
8
C
T
T
A
3
G
G
G
A
A
A
A
A
G
C
T
G
T
T
6
G
G
T
A
C
A
G
T
A
8
A
T
G
T
3
G
C
A
A
G
T
T
A
C
A
G
T
9
C
C
C
A
T
G
A
G
C
C
C
T
C
T
C
A
T
T
T
A
T
C
G
T
A
C
G
A
C
C
2
A
A
G
C
G
T
G
G
A
T
C
A
G
T
G
G
G
C
T
T
A
T
T
A
G
T
T
A
A
A
G
C
G
G
G
T
A
G
C
C
A
C
C
A
A
C
C
C
A
G
G
C
2
A
G
G
G
A
G
6
G
T
2
104
T
G
C
G
C
C
10
C
A
G
A
G
A
G
A
T
A
C
G
G
T
G
A
T
C
C
A
C
C
A
C
C
T
C
A
T
T
G
G
C
C
A
24
G
C
T
G
G
A
4
A
C
A
C
A
A
G
A
A
2
A
G
A
A
A
A
G
T
G
T
A
T
C
G
G
G
T
C
10
8
T
9
C
T
T
G
2
C
C
  113,727,874
  113,728,154
  113,728,279
  113,728,814
  113,728,899
  113,729,145
  113,729,189
  113,730,601
  113,730,766
  113,730,800
  113,730,813
  113,731,133
  113,732,179
  113,732,633
  113,732,814
  113,733,616
  113,734,225
  113,736,345
  113,739,320
  113,741,449
  113,746,139
  113,746,430
  113,746,716
  113,746,845
  113,747,003
  113,747,055
  113,747,063
  113,747,189
  113,747,241
  113,747,485
  113,747,783
  113,748,147
  113,749,473
  113,749,583
  113,750,102
  113,750,645
  113,751,140
  113,751,433
  113,751,699
  113,752,839
  113,752,929
  113,753,061
  113,753,103
  113,753,207
  113,753,212
  113,753,880
  113,754,621
  113,754,622
  113,754,623
  113,755,598
  113,759,335
  113,763,886
  113,765,164
  113,768,721
  113,771,727
  113,771,728
  113,772,767
  113,773,143
  113,773,551
  113,773,685
  113,774,283
  113,774,354
  113,774,451
  113,775,135
  113,775,457
  113,775,880
  113,776,269
  113,776,430
  113,777,060
  113,778,837
  113,779,126
  113,779,185
  113,779,405
  113,780,116
  113,780,140
  113,780,789
  113,780,933
  113,781,069
  113,781,194
  113,781,602
  113,781,783
  113,781,965
  113,782,147
  113,782,154
  113,782,242
  113,782,254
  113,782,544
  113,782,726
  113,782,749
  113,782,990
  113,783,091
  113,783,215
  113,783,743
  113,783,785
  113,783,812
  113,783,958
  113,783,990
  113,784,028
  113,784,054
  113,784,374
  113,785,432
  113,787,173
  113,787,292
  113,787,335
  113,787,357
  113,787,377
  113,787,385
  113,787,510
  113,787,516
  113,787,523
  113,787,726
  113,787,829
  113,787,831
  113,788,270
  113,788,272
  113,788,274
  113,790,162
  113,790,331
  113,790,699
  113,791,021
  113,791,170
  113,793,214
  113,793,215
  113,794,559
  113,794,569
  113,795,416
  113,795,786
  113,797,019
  113,797,168
  113,797,491
  113,797,648
  113,797,834
  113,798,121
  113,798,471
  113,799,704
  113,801,817
  113,803,018
  113,804,437
  113,806,630
  113,806,956
  113,807,429
  113,808,553
  113,808,820
  113,808,865
  113,808,919
  113,809,367
  113,809,438
  113,809,535
  113,809,694
  113,809,722
  113,810,042
  113,810,427
  113,810,452
  113,810,846
  113,810,847
  113,811,069
  113,811,109
  113,811,206
  113,811,401
  113,811,456
  113,811,530
  113,811,550
  113,811,556
  113,811,673
  113,811,700
  113,811,859
  113,811,874
  113,811,890
  113,812,153
  113,812,524
  113,812,643
  113,812,727
  113,812,743
  113,812,838
  113,812,898
  113,813,157
  113,814,007
  113,814,136
  113,814,144
  113,814,531
  113,814,684
  113,814,834
  113,814,968
  113,815,137
  113,815,292
  113,815,295
  113,815,314
  113,815,318
  113,815,416
  113,815,431
  113,816,763
  113,816,772
  113,816,799
  113,816,915
  113,817,103
  113,818,647
  113,820,080
  113,820,103
  113,820,573
  113,820,734
  113,821,026
  113,821,087
  113,822,313
  113,822,563
  113,824,606
  113,825,788
  113,826,517
  113,826,937
  113,827,162
  113,827,525
  113,827,593
  113,827,668
  113,828,873
  113,829,159
  113,829,230
  113,829,291
  113,829,339
  113,829,359
  113,829,364
  113,829,381
  113,829,409
  113,829,511
  113,829,611
  113,829,659
  113,829,683
  113,829,714
  113,829,727
  113,829,733
  113,829,735
  113,829,742
  113,829,830
  113,829,831
  113,829,855
  113,829,870
  113,829,945
  113,829,980
  113,830,098
  113,830,115
  113,830,201
  113,830,276
  113,830,334
  113,830,353
  113,830,366
  113,830,526
  113,830,534
  113,830,559
  113,830,684
  113,830,690
  113,830,771
  113,830,781
  113,830,828
  113,831,016
  113,831,585
  113,831,945
  113,832,165
  113,833,000
  113,833,229
  113,833,243
  113,833,247
  113,833,388
  113,833,416
  113,833,431
  113,833,489
  113,833,502
  113,833,515
  113,833,523
  113,833,617
  113,833,853
  113,833,955
  113,834,544
  113,834,613
  113,835,419
  113,836,231
  113,836,291
  113,838,786
  113,838,788
  113,838,789
  113,838,790
  113,839,627
  113,839,854
  113,840,032
  113,841,258
  113,842,218
  113,842,603
  113,842,737
  113,854,004
  113,854,226
  113,854,550
  113,854,902
  113,854,903
  113,855,040
  113,855,307
  113,855,454
  113,855,549
  113,855,632
  113,855,638
  113,856,018
  113,856,335
  113,856,798
  113,857,976
  113,858,169
  113,858,375
  113,858,784
  113,858,896
  113,859,110
  113,859,284
  113,859,444
  113,859,946
  113,860,462
  113,860,599
  113,861,893
  113,861,947
  113,862,045
  113,862,679
  113,862,761
  113,862,853
  113,863,354
  113,863,358
  113,864,014
  113,864,015
  113,864,503
  113,864,702
  113,864,714
  113,865,031
  113,865,321
  113,865,395
  113,866,003
  113,866,235
  113,867,003
  113,867,136
  113,867,166
  113,867,778
  113,867,832
  113,868,008
  113,868,223
  113,868,346
  113,868,350
  113,868,759
  113,868,761
  113,869,090
  113,869,292
  113,869,437
  113,870,788
  113,870,865
  113,870,911
  113,871,028
  113,871,714
  113,871,786
A
G
A
-
A
C
C
C
A
-
C
T
13
C
T
G
A
A
T
5
C
C
-
G
C
C
-
-
4
T
G
T
A
-
G
-
A
C
AT/3
A
A
T
-
A
C
T
3/-
2/-
T/-
2
A
A/-
T
A
G
G
-
T
23
G
11
A
A
C
2
C
A
T
-
T
A
G
G
G
C
G
A
T
G
C
A
T
-
G
T
A
T
A
T
2
G
A
G
C
T
C
T
A
G
A
C
-
C
G
C
G
G
3
2
T
G
-
A
12/-
10/-
8/-
T
C
C
G
-
2
A
2
T
G
2
12
-
A
T
C
T
4
C
-
G/2
C
T/2
G
T
T
A
C
G
-
6
C
A
C
-
A
T
G
T
T
A
-
T
G
T
A
C
-
A
G
T
G
C
A
G
A
A
T
9
G
T
C
G
G
C
C
C
G
C
T
2
G
T
T
A
-
T
T
-
G
G
A
3
A
C
3
A
G
C
T
G
3/9
-
A
A
T
-
C
3
G
C
3
G
A
C
C
G
T
G
A
G
T
A
A
C
G
A
T
2
G
A
2
C
G
G
A
-
-
A
A
T
-
G
A
T
A
G
G/2
6/-
T
A
-
-
G
A
T
A
5
T
10/12
T
T
T
A/41
G/25
G
C
-
6
2
A
3
A
C
T
G
2
A
T
2
T
T
12
A
5
C
T
2
C
A
A
15
T
T
G
24/-
G/3
T
C
A
A
2
-
6
T
C
T
C
C
A
G
C
2/-
A/-
A
G
G
2
-
A
G
A
C
2
13
T
A
A
A
75
T
10/-
-
3
-
T
20
5
23
-
G
T