Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 100,713 (bp)   Positions: 211
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.005
.005
--
.068
.219
.362
.002
.104
--
--
.0
.0
.042
.002
.0
.0
.216
.09
.035
.542
.173
.13
.009
--
.007
.006
.0
.898
.075
.863
1.0
.004
.001
.007
.001
.005
.005
.017
.0
.004
.152
.023
.018
.048
.132
--
--
--
.411
.971
.026
.814
.011
.032
.0
--
--
.008
.005
.017
.007
.004
.101
.034
.011
.001
.002
.039
.034
--
--
--
--
--
--
--
.044
.0
.006
.041
.906
.01
--
.001
--
.036
.002
.007
.007
.001
.064
.131
.001
.112
--
.015
.118
.13
.037
.001
.009
.0
.055
.0
.048
.028
.044
.0
.992
.0
.0
.0
.05
--
--
--
.02
.001
.056
.056
.405
.001
.0
.006
.016
.026
.077
.087
.015
.017
.121
.0
.016
.006
.018
.0
.006
.57
.259
.115
.001
.001
.022
--
.01
.002
.039
.005
.022
.143
.026
.033
.004
.378
.029
.224
--
--
.002
.555
--
--
.002
.731
.273
.076
--
.192
--
--
--
--
.0
.076
.009
--
--
--
--
--
--
--
.012
.033
.001
.477
.433
.008
.107
.02
.026
.774
.945
.939
--
--
--
.009
.394
.043
.001
.007
.236
.0
.0
.096
.026
.169
--
--
.097
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
Cmc1
T
A
T
T
G
T
A
T
A
T
A
C
A
G
A
C
C
G
C
G
2
A
G
A
C
T
3
G
C
C
A
T
C
A
G
A
C
A
3
G
12
T
A
T
A
G
G
G
T
C
A
A
C
G
A
4
2
C
A
A
T
2
G
A
G
G
4
C
G
G
A
G
T
C
C
A
3
G
A
4
C
4
T
T
C
G
G
C
G
C
G
C
2
C
G
T
19
C
C
G
G
G
C
C
2
T
A
G
T
T
A
A
C
A
C
A
A
2
4
2
T
T
G
C
G
T
T
5
C
T
C
T
T
G
C
A
2
G
C
G
A
G
A
C
A
G
T
G
G
T
3
A
G
A
A
A
A
T
G
C
T
G
G
G
G
T
16
T
C
A
A
T
T
6
A
T
A
A
4
T
G
G
C
C
G
T
C
G
C
T
T
C
C
G
C
A
A
T
C
G
G
4
G
T
A
G
C
G
C
C
T
  125,682,236
  125,682,602
  125,683,583
  125,684,877
  125,685,163
  125,685,576
  125,685,756
  125,685,797
  125,685,928
  125,686,002
  125,686,179
  125,686,724
  125,687,098
  125,687,335
  125,687,998
  125,689,090
  125,689,908
  125,689,942
  125,690,189
  125,690,382
  125,690,564
  125,690,615
  125,690,708
  125,690,768
  125,691,145
  125,691,159
  125,692,150
  125,692,497
  125,692,511
  125,692,909
  125,693,613
  125,693,813
  125,693,900
  125,694,160
  125,695,614
  125,695,773
  125,695,782
  125,695,947
  125,696,192
  125,696,674
  125,696,997
  125,697,243
  125,697,514
  125,697,525
  125,697,640
  125,698,105
  125,698,112
  125,698,231
  125,698,405
  125,698,480
  125,698,769
  125,700,766
  125,702,839
  125,704,967
  125,705,616
  125,706,272
  125,706,274
  125,708,901
  125,709,153
  125,709,371
  125,709,510
  125,709,511
  125,710,098
  125,710,969
  125,711,366
  125,711,640
  125,712,645
  125,716,926
  125,718,869
  125,721,876
  125,723,310
  125,723,581
  125,723,701
  125,724,432
  125,724,715
  125,724,716
  125,725,305
  125,725,911
  125,726,013
  125,726,060
  125,727,020
  125,727,834
  125,727,890
  125,729,335
  125,730,172
  125,730,627
  125,731,330
  125,731,578
  125,732,245
  125,733,081
  125,733,128
  125,733,172
  125,733,383
  125,733,826
  125,734,468
  125,734,814
  125,735,102
  125,736,376
  125,736,520
  125,736,739
  125,736,858
  125,737,039
  125,737,061
  125,737,733
  125,737,772
  125,737,775
  125,737,934
  125,738,269
  125,738,634
  125,738,789
  125,738,790
  125,739,156
  125,739,285
  125,739,426
  125,739,453
  125,739,697
  125,739,883
  125,740,315
  125,741,025
  125,741,027
  125,741,908
  125,742,620
  125,743,451
  125,744,787
  125,745,172
  125,745,334
  125,745,357
  125,745,448
  125,745,675
  125,746,355
  125,746,863
  125,747,028
  125,747,618
  125,748,075
  125,748,427
  125,748,589
  125,748,641
  125,749,310
  125,749,914
  125,750,029
  125,750,108
  125,750,497
  125,751,225
  125,752,212
  125,752,400
  125,752,424
  125,752,479
  125,752,574
  125,753,189
  125,753,564
  125,753,595
  125,753,610
  125,755,085
  125,755,716
  125,755,824
  125,756,441
  125,757,355
  125,757,613
  125,759,862
  125,760,177
  125,760,898
  125,760,998
  125,761,303
  125,761,812
  125,761,822
  125,762,051
  125,762,213
  125,762,372
  125,763,540
  125,763,558
  125,764,130
  125,764,497
  125,764,822
  125,765,074
  125,765,201
  125,766,231
  125,767,579
  125,768,990
  125,769,023
  125,769,605
  125,770,316
  125,770,504
  125,771,811
  125,771,975
  125,772,173
  125,772,345
  125,772,491
  125,772,639
  125,772,764
  125,773,193
  125,773,369
  125,773,558
  125,773,586
  125,773,604
  125,773,859
  125,773,894
  125,773,895
  125,774,207
  125,774,816
  125,775,234
  125,775,650
  125,775,671
  125,775,900
  125,776,419
  125,776,437
  125,777,058
  125,777,159
  125,778,413
  125,779,532
  125,779,589
  125,779,857
C
G
C
C
A
C
G
C
G
C
G
T
G
A
2
T
T
A
-
A
-
T
A
G
T
C
-
A
T
T
T
C
T
C
T
T
T
G
-
7
-
C
G
C
-
A
A
T
C
T
G
G
A
A
G
4/-
2/-
A
G
G
T/3
2/-
A
C
A
A
-
T
A
A
T
A
6
C/T
C/3
A/-
-
G/-
2
-
5
4/-
G
G
A
G/2
A
2
A
T
A
T
2/-
4
A
13
-
T
T
A
A
A
-
G
-
3
C
A
A
G
G
G
A
G
A
18
C
-
4/-
-
C
C
T
T
T
A
A
-
T
G
2
C
C
A
T
T
-
-
T
A
G
A
G
-
G
A
C
A
A
C
-
G
A
G
G
-
5
C
C
T
47
A
A
A
A
C
16/-
A
4
G
T
C
C
6/-
T
G
G
C
-
C
A
A
A
T
A
G
T
-
T
C
C
T
G
A
A
2
2
C
T
A
A
-
2
C
G
C
T
A
T
T
C