Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 63,973 (bp)   Positions: 233
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
1.0
.001
.0
.0
.0
--
--
--
--
.409
.029
.026
.066
.005
.426
.02
.001
.013
.001
--
--
--
.011
.128
.054
.039
.025
--
--
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.013
.0
.006
.075
.079
.111
.005
.003
--
--
--
--
.012
.312
.031
.058
.002
.025
.038
.068
.002
--
.023
.018
.005
.222
.468
--
--
.023
.023
.322
.146
.042
.077
.285
.238
.046
.204
.0
.043
.028
.032
.01
.008
.012
.036
.069
.221
.186
.021
.45
.001
--
--
--
.04
.041
.034
.038
.003
.006
.342
.013
.101
.06
.023
.0
.001
.0
.004
.001
.001
.007
.03
.063
.021
.013
.032
--
.036
.004
.004
.252
.042
.002
.006
.087
.037
.002
.12
--
--
--
.193
.003
.025
.017
--
--
--
--
.166
.177
.138
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.045
.159
.008
.546
.098
.103
.017
.01
.031
.007
.003
.357
.036
.0
.0
.0
.003
--
.029
--
--
--
.421
.0
--
--
.313
.18
.613
--
.09
.002
.0
.014
--
.042
.003
.332
.422
--
--
--
.001
.006
.005
.004
.001
.001
--
--
--
--
.228
.01
.274
.0
.001
.001
--
.004
.0
.651
.154
.0
.386
--
--
--
.002
--
.998
.004
.001
.0
.006
.007
.01
.019
.061
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
Clip2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
C
G
C
C
C
A
T
G
A
C
G
A
T
T
2
T
G
C
A
C
5
A
C
T
G
T
T
T
T
T
T
T
G
3
T
C
A
A
C
T
4
G
C
A
G
A
C
A
C
T
T
A
A
C
G
A
C
C
A
C
T
G
T
T
T
2
3
T
C
C
C
A
G
C
T
G
T
A
A
T
A
T
A
T
C
C
A
C
A
C
A
2
2
2
A
G
C
G
G
A
G
A
T
C
A
T
C
G
T
G
A
A
A
T
G
G
A
A
4
A
C
G
A
10
A
C
C
A
G
T
2
C
A
2
4
A
T
C
A
C
C
T
C
4
C
C
2
2
2
2
2
T
G
T
C
G
T
15
T
T
T
T
A
C
C
T
G
C
T
3
C
3
G
G
G
G
G
A
T
T
T
T
T
C
C
A
G
G
G
C
G
G
G
53
5
C
G
A
T
12
G
A
2
C
A
A
C
C
A
G
C
C
A
A
C
C
C
10
T
C
C
A
A
A
T
C
3
2
A
8
A
  27,174,179
  27,174,345
  27,174,831
  27,174,906
  27,175,000
  27,175,453
  27,175,811
  27,175,844
  27,175,865
  27,175,921
  27,176,002
  27,176,185
  27,177,400
  27,177,469
  27,178,408
  27,178,424
  27,178,677
  27,178,831
  27,179,081
  27,179,324
  27,179,336
  27,179,496
  27,179,747
  27,179,843
  27,179,884
  27,180,067
  27,180,748
  27,180,967
  27,181,218
  27,181,475
  27,181,574
  27,181,789
  27,182,217
  27,182,261
  27,182,695
  27,183,084
  27,183,408
  27,183,567
  27,183,587
  27,183,780
  27,184,058
  27,184,421
  27,185,423
  27,186,859
  27,186,915
  27,187,140
  27,187,192
  27,187,194
  27,187,405
  27,187,509
  27,187,674
  27,187,690
  27,187,732
  27,187,804
  27,187,929
  27,188,004
  27,188,179
  27,188,459
  27,188,466
  27,188,548
  27,188,636
  27,188,697
  27,189,302
  27,189,309
  27,189,585
  27,190,311
  27,190,377
  27,191,064
  27,191,088
  27,191,255
  27,191,347
  27,191,439
  27,191,548
  27,191,710
  27,191,918
  27,192,075
  27,192,092
  27,192,289
  27,192,369
  27,192,577
  27,192,964
  27,193,007
  27,193,010
  27,193,189
  27,193,504
  27,193,568
  27,193,771
  27,194,042
  27,194,142
  27,194,543
  27,194,720
  27,194,844
  27,194,928
  27,194,974
  27,195,048
  27,195,054
  27,195,554
  27,195,559
  27,195,655
  27,195,667
  27,195,925
  27,196,024
  27,196,199
  27,196,405
  27,196,482
  27,196,580
  27,196,583
  27,197,364
  27,197,668
  27,197,756
  27,197,788
  27,197,940
  27,198,200
  27,198,517
  27,198,757
  27,198,779
  27,198,874
  27,199,366
  27,199,404
  27,199,664
  27,200,183
  27,200,416
  27,200,456
  27,200,544
  27,200,582
  27,200,762
  27,200,852
  27,200,890
  27,200,924
  27,200,946
  27,201,014
  27,201,190
  27,201,273
  27,201,460
  27,201,501
  27,201,733
  27,202,045
  27,202,076
  27,202,150
  27,202,165
  27,202,173
  27,202,247
  27,202,302
  27,202,306
  27,202,328
  27,204,005
  27,204,026
  27,204,054
  27,204,057
  27,204,061
  27,204,065
  27,204,069
  27,204,073
  27,204,077
  27,204,804
  27,205,045
  27,205,301
  27,205,402
  27,206,870
  27,206,872
  27,206,888
  27,206,890
  27,206,936
  27,207,371
  27,207,938
  27,208,014
  27,208,116
  27,208,822
  27,209,103
  27,209,475
  27,209,600
  27,209,641
  27,209,986
  27,210,133
  27,210,200
  27,210,242
  27,210,460
  27,211,087
  27,211,327
  27,211,558
  27,212,009
  27,212,137
  27,212,296
  27,212,633
  27,214,282
  27,214,387
  27,214,452
  27,214,665
  27,215,130
  27,215,225
  27,215,460
  27,215,542
  27,215,559
  27,216,052
  27,216,083
  27,216,099
  27,217,832
  27,217,873
  27,218,232
  27,218,639
  27,218,982
  27,218,983
  27,219,097
  27,219,132
  27,219,138
  27,219,139
  27,219,331
  27,219,839
  27,220,454
  27,221,560
  27,222,085
  27,222,187
  27,225,369
  27,225,849
  27,226,064
  27,226,559
  27,227,407
  27,227,677
  27,229,112
  27,229,533
  27,229,556
  27,229,628
  27,230,114
  27,231,495
  27,232,248
  27,233,235
  27,233,377
  27,233,740
  27,233,837
  27,233,838
  27,233,839
  27,234,771
  27,234,977
T
2
9
C
T
T
2
G
54
A
T
T
A
G
G
A
-
C
A
2
T
T
5/-
2
A
-
A
C
C
-
G
4
G
C
A
-
C
CT/3
T
C
T
C
-
4
T
G
2
6
3/CT
-
T
C
C
G
G
T
A
G
T
G
G
2
C
A
C
C
6
-
-
C
T
T
T
11
T
T
C
A
C
G
G
C
18
A
G
C
T
T
G
3
G
T
3
-
-
-
G
T
T
A
T
G
A
G
C
G
T
C
4
A
3
A
G
G
G
C
-
A
G
-
-
G
T
T
G
-
2
T
T
G
C
3
-
T
3
-
-
G
-
4
T
T
G
C
T
-
T
T
-
-
-
-
-
C
-
C
T
A
-
-
G
G
C
A
G
T
A
C
C
G
-
-
C/3
-
A
-
A
A
A
-
C
T/17
C
G
-
T
G
G
A
A
A
C/T
G/2
T
T
-
-
T
A
G
T/9
-
2
A/6
2/-
6/3
G
A/56
T
T
G
A
T
T
A/-
C
T
T
2
-
9
T
T
G
G
G
6
18
3/-
2/-
A/-
-
53