Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 48,801 (bp)   Positions: 376
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.015
.002
.037
.002
.017
.019
.007
.215
.161
.022
.997
.316
.035
.03
.025
.001
.003
.087
.0
.001
.998
.862
.998
.011
.0
.005
.609
.003
.009
.001
.003
.023
.191
.078
.059
.024
.001
.02
.005
.001
.071
.001
.005
.0
.01
.003
.004
.002
.0
.127
.005
.015
--
--
--
.097
.032
.016
.006
.005
.006
.063
.158
.001
.0
.001
.0
.0
.008
.012
.003
.004
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.001
.001
.0
.005
.001
.001
.004
.001
.0
.0
.001
.001
.022
.178
.284
--
--
--
--
--
--
--
.19
.001
.008
.003
.0
.0
.302
.0
.001
.008
.001
.011
.011
.004
.0
.0
.0
.003
.002
.032
.003
.001
.009
.027
.01
.025
.037
.004
.007
.009
.068
.317
.009
.001
--
--
.02
.006
.069
.009
--
.003
.003
.001
.003
.001
.0
.002
.007
.002
.0
.998
.998
.0
.0
.0
.002
.007
.246
.013
--
--
.003
.004
.001
.006
.522
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.007
.007
--
--
--
.013
.004
.221
.0
.069
.002
.001
.032
.091
.001
.047
.003
.001
.028
.032
.003
.0
.001
.005
.002
.0
.017
.006
.002
.002
.049
.05
.0
.001
.002
.015
.001
.004
.002
.001
.0
.007
.043
.015
.0
.007
.002
.006
.0
.0
.0
.002
.404
.003
.183
.176
.003
.073
.012
.105
.122
.015
.002
.061
.082
.036
.022
.048
.666
.87
.137
.082
.002
.01
.012
.0
.061
.026
.27
.004
.377
.381
.001
.012
.001
.006
.001
.003
.033
.04
.006
.0
.001
.004
.014
.003
.026
.014
.221
.005
.019
.055
.122
.035
.035
.034
.014
.02
.041
.008
.15
.001
.003
.001
.003
.043
.001
.001
.001
.0
.002
.002
.0
.001
.151
.034
.025
.004
.001
.001
.002
.001
.0
.001
.002
.976
.442
.001
.006
.004
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.225
.002
.002
.052
.137
.001
.002
.0
.001
.009
.0
.0
.019
.001
.002
.002
.007
.011
.006
.076
.0
.0
.0
.269
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
Clic5
C
T
T
G
C
C
G
T
T
G
12
T
C
T
16
14
A
T
A
T
T
G
A
T
G
C
A
A
T
C
T
C
C
C
G
T
A
A
A
A
T
G
A
A
A
C
A
C
T
T
G
C
A
C
T
T
A
A
A
T
G
G
G
3
A
G
C
G
T
T
G
C
A
G
C
T
G
A
A
G
T
G
T
T
A
G
A
T
G
G
G
T
G
28
C
G
G
C
G
2
2
T
T
C
T
A
T
C
G
4
G
T
G
C
T
4
A
T
A
G
T
C
C
4
A
T
A
G
T
G
G
G
A
A
A
6
G
G
T
T
G
35
A
G
C
C
G
A
A
G
G
T
C
C
C
T
T
G
C
G
T
10
C
C
T
G
A
C
A
4
C
T
G
C
C
C
G
4
G
T
C
C
A
T
C
C
C
8
C
C
A
A
T
T
G
C
T
A
C
C
C
T
G
A
15
G
A
C
T
C
A
G
A
2
T
C
C
C
G
C
T
C
G
14
G
T
G
C
A
T
C
T
A
G
T
T
T
T
G
T
C
A
C
T
G
G
G
C
G
6
T
C
C
A
T
C
T
A
A
159
46
C
A
C
A
A
G
T
T
A
T
A
G
G
A
G
T
G
C
G
G
C
C
T
T
C
T
A
C
C
A
G
T
A
A
C
T
G
A
C
G
C
5
A
A
10
8
C
G
T
C
C
G
A
G
2
T
T
A
C
G
C
T
T
T
A
G
51
G
A
T
T
A
G
T
A
C
T
C
A
T
T
T
C
T
T
A
G
C
G
C
T
T
T
A
C
G
A
C
G
T
A
A
T
T
G
T
G
A
18
A
G
C
T
20
C
  18,004,973
  18,005,178
  18,005,189
  18,008,672
  18,008,855
  18,010,691
  18,010,886
  18,012,835
  18,013,885
  18,015,890
  18,016,788
  18,017,162
  18,017,203
  18,017,605
  18,017,929
  18,017,931
  18,018,228
  18,018,552
  18,019,385
  18,019,737
  18,020,299
  18,021,022
  18,021,126
  18,021,272
  18,021,447
  18,021,520
  18,021,572
  18,021,746
  18,021,790
  18,021,823
  18,021,979
  18,022,282
  18,022,288
  18,022,909
  18,023,373
  18,023,448
  18,023,501
  18,023,548
  18,023,629
  18,023,755
  18,023,904
  18,024,104
  18,024,254
  18,024,958
  18,024,964
  18,025,113
  18,025,591
  18,025,597
  18,025,884
  18,026,209
  18,026,702
  18,026,971
  18,027,424
  18,028,209
  18,028,215
  18,028,388
  18,029,189
  18,030,750
  18,030,785
  18,030,853
  18,030,911
  18,031,438
  18,031,664
  18,031,686
  18,032,134
  18,032,152
  18,032,372
  18,032,653
  18,032,705
  18,032,793
  18,032,930
  18,032,939
  18,033,291
  18,033,305
  18,033,315
  18,033,321
  18,033,322
  18,033,334
  18,033,354
  18,033,423
  18,033,437
  18,033,451
  18,033,540
  18,033,548
  18,033,549
  18,033,556
  18,033,559
  18,033,562
  18,033,569
  18,033,576
  18,033,577
  18,033,580
  18,033,584
  18,033,595
  18,033,702
  18,033,707
  18,033,736
  18,033,803
  18,033,830
  18,033,843
  18,033,852
  18,033,936
  18,033,964
  18,033,995
  18,034,004
  18,034,081
  18,034,220
  18,034,264
  18,034,409
  18,034,464
  18,034,479
  18,034,592
  18,034,664
  18,034,697
  18,034,881
  18,035,032
  18,035,070
  18,035,115
  18,035,213
  18,035,299
  18,035,306
  18,035,312
  18,035,353
  18,035,537
  18,035,901
  18,036,003
  18,036,107
  18,036,542
  18,036,626
  18,036,924
  18,036,978
  18,038,092
  18,038,182
  18,038,245
  18,038,844
  18,040,408
  18,040,573
  18,040,780
  18,042,893
  18,043,873
  18,044,295
  18,045,842
  18,046,329
  18,047,020
  18,047,052
  18,047,067
  18,047,222
  18,047,744
  18,047,861
  18,049,161
  18,049,419
  18,049,551
  18,049,723
  18,049,774
  18,203,186
  18,203,187
  18,203,244
  18,203,310
  18,203,658
  18,203,679
  18,203,725
  18,203,747
  18,203,894
  18,204,000
  18,204,010
  18,204,081
  18,204,177
  18,204,243
  18,204,462
  18,204,690
  18,204,715
  18,204,890
  18,205,053
  18,205,320
  18,205,337
  18,205,480
  18,205,557
  18,205,585
  18,205,747
  18,205,779
  18,206,106
  18,206,154
  18,206,276
  18,206,412
  18,206,425
  18,206,449
  18,206,617
  18,206,772
  18,207,041
  18,207,087
  18,207,259
  18,207,712
  18,207,741
  18,207,769
  18,207,781
  18,207,903
  18,207,961
  18,208,160
  18,208,211
  18,208,221
  18,208,253
  18,208,348
  18,208,367
  18,208,371
  18,208,470
  18,208,495
  18,208,503
  18,209,077
  18,209,236
  18,209,259
  18,209,260
  18,209,283
  18,209,286
  18,209,465
  18,209,621
  18,209,624
  18,211,166
  18,213,072
  18,214,480
  18,215,296
  18,218,463
  18,218,504
  18,219,181
  18,219,944
  18,221,056
  18,222,434
  18,223,308
  18,224,918
  18,226,039
  18,226,368
  18,226,452
  18,226,690
  18,226,809
  18,226,946
  18,227,020
  18,227,186
  18,227,189
  18,227,387
  18,227,411
  18,227,561
  18,227,579
  18,227,609
  18,227,663
  18,227,670
  18,227,684
  18,227,701
  18,227,709
  18,227,712
  18,227,815
  18,227,890
  18,227,935
  18,228,157
  18,228,172
  18,228,231
  18,228,239
  18,228,345
  18,228,418
  18,228,438
  18,228,495
  18,228,744
  18,229,014
  18,229,256
  18,229,438
  18,229,636
  18,229,845
  18,229,858
  18,230,040
  18,230,048
  18,230,120
  18,230,128
  18,230,188
  18,230,228
  18,230,359
  18,230,397
  18,230,481
  18,230,506
  18,230,598
  18,230,680
  18,230,735
  18,230,812
  18,230,828
  18,231,165
  18,231,208
  18,231,274
  18,231,512
  18,231,580
  18,231,616
  18,231,624
  18,231,626
  18,231,628
  18,231,657
  18,231,673
  18,231,872
  18,231,991
  18,232,971
  18,233,359
  18,233,827
  18,234,421
  18,235,324
  18,235,526
  18,236,119
  18,236,549
  18,237,152
  18,237,202
  18,237,817
  18,237,863
  18,237,875
  18,238,082
  18,238,354
  18,238,578
  18,238,920
  18,238,950
  18,239,275
  18,239,289
  18,239,297
  18,240,118
  18,240,221
  18,240,255
  18,240,654
  18,240,907
  18,241,051
  18,241,402
  18,241,803
  18,241,806
  18,241,821
  18,241,856
  18,242,033
  18,242,068
  18,242,188
  18,242,308
  18,242,327
  18,242,363
  18,242,375
  18,242,390
  18,242,429
  18,242,433
  18,242,502
  18,242,506
  18,242,551
  18,242,597
  18,243,202
  18,243,478
  18,244,852
  18,245,161
  18,245,256
  18,245,429
  18,245,594
  18,246,084
  18,246,085
  18,246,212
  18,246,486
  18,246,544
  18,246,545
  18,246,833
  18,246,890
  18,247,386
  18,247,387
  18,247,644
  18,247,739
  18,247,821
  18,248,413
  18,248,475
  18,248,985
  18,249,150
  18,249,613
  18,249,633
  18,250,081
  18,250,132
  18,250,239
  18,250,279
  18,250,424
  18,250,449
  18,250,465
  18,250,874
  18,251,015
  18,251,442
T
C
A
5
2
T
3
C
C
3
-
C
T
C
16/-
14/-
G
C
C
C
A
A
-
2
A
T
G
T
A
T
C
T
T
T
C
C
11/5
G
T
G
C
T
G
T
G
A
G
T
C
C
A
T
G
C/8
T/37
C
9
G
2
5
5
A
C
-
2
A
T
T
C
C
8
T
C
A
A
C
A
G
G
A
G
A
C
G
C
2
T
-
C
C
C
C
2
-
15
103
11
G
A
-
-
-
G
T
C
G
G
T
T
-
A
C
A
T
C
-
G
G
G
A
2
T
G
-
G
G
G
A
C
A
A
A
G
C
G
-
7
T
C
-
A
-
G
C
T
A
A
G
G
A
A
C
T
T
T
G
C
A
T
G/3
T/4
-
T
T
C
A
G
T
G
-
G
A
A
G
G
T
A
-
2
C
T
17
G
-
10
T
T
-
T
T
C
T
C
C
A
T
G
G
T
T
T
C
A
G
-
-
-
T
C
T
G
T
4
-
G
T
G
G
A
T
-
3
9
-
A
C
T
T
3
C
T
A
C
T
C
C
C
C
A
C
T
T
A
C
C
5
A
T
C
-
3
T
T
2
C
T
A
G
G
159/-
-
T
G
T
G
G
2
C
C
G
C
G
A
A
G
T
C
A
T
A
C
2
11
C
C
G
C
G
T
T
G
A
C
2
T
T
9
A
C
T
T
A
-
G
T
-
-
T
8
C
G
T
A
T
-
-
T/16
C
C
G
A
T
C
C
C
G
A
-
2
G
C
C
2
A
C
25
T
C
T
-
C
C
C
T
A
C
3
-
T
C
A
6
A
2
C
12
A
G
T
T
C
-
G
G
G
A
C
A
5
-
G
A
T
8
20/-
T