Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 141,433 (bp)   Positions: 384
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
1.0
.999
.051
.001
.013
.003
.003
.128
.0
.0
.035
.94
.851
.0
.894
.001
.001
.003
.0
.133
.013
.006
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.001
.796
.26
.001
.002
.004
.001
.003
.038
.038
.006
.0
.001
.001
.035
.001
.0
.0
.0
.0
.002
1.0
--
.002
.003
.002
.805
.003
.002
.152
.011
.013
.001
.002
.016
.002
.873
.012
.006
.0
.013
.004
.003
.272
.041
.004
.223
.0
--
--
--
--
.075
.005
.008
.217
.026
.505
.008
.207
.172
.01
.036
.023
.07
--
--
.044
--
.003
.398
.13
.975
.0
.007
.003
.075
.005
.386
.001
.959
.016
.653
.141
.081
.007
.0
.004
.003
.0
.001
.985
.0
.0
.0
.005
.002
.015
.001
.017
.018
.02
.035
.013
.007
.002
.007
.047
.992
1.0
.005
.004
.002
.001
.0
.001
.062
.039
.033
.733
.024
.203
.004
.082
.043
.063
.019
.022
.032
.199
.43
.001
.011
.096
.006
.003
.16
.498
.076
.207
.0
.011
.032
.001
.003
.001
.002
.001
.006
.0
.006
.0
.006
.036
.003
.005
.024
.003
.0
.065
.093
.019
.075
.105
.216
.001
1.0
.792
1.0
1.0
1.0
.999
.998
.003
.029
.0
.037
.681
.035
.001
.001
.003
.018
.488
.002
.012
.005
.0
.006
.07
.055
.003
.007
.003
.029
.008
.198
.013
.039
.041
.001
.09
.911
.0
.007
.003
.003
.022
.018
--
.045
.051
.0
.431
--
.029
.002
--
--
--
--
--
.0
.006
.01
.01
.001
.657
.098
.039
.0
.028
.04
.065
.068
.122
.147
.001
.029
.108
--
.071
.001
.007
.259
.094
.149
.136
.14
.146
.001
.001
.001
.011
.198
.188
.009
.043
.01
.01
.075
.069
.076
--
.045
.012
.028
.006
.039
.001
.001
--
.006
.036
.13
.127
.0
.001
.369
.344
.002
.03
.943
.641
.062
.003
.047
.005
--
.016
.025
.094
.119
.157
.134
.757
.012
.003
.018
.019
--
--
.01
.008
.002
.008
.221
.236
.994
.001
.088
--
.002
.849
.045
.059
.027
.017
.051
.213
.018
.121
.892
.097
--
--
--
--
.248
.98
.015
.001
.439
.0
.0
.001
.022
.001
.987
.0
.0
.001
.0
.988
.067
.008
.001
.009
.0
.016
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
G
A
A
G
C
A
C
C
16
C
C
C
C
T
C
A
C
C
G
G
G
G
36
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
G
T
C
A
T
A
T
C
G
2
4
T
C
T
G
C
G
T
G
G
A
T
C
T
A
C
T
G
C
T
C
4
3
C
T
T
A
G
A
C
T
T
7
T
C
A
A
T
C
G
C
C
C
T
G
G
T
A
G
3
G
T
C
A
A
T
T
T
12
T
G
C
C
G
G
A
G
T
6
8
G
T
T
C
2
G
C
C
T
T
A
A
A
A
G
A
T
T
T
T
C
2
C
C
G
G
C
2
A
G
G
C
G
C
C
T
C
C
T
G
4
C
G
C
4
A
T
C
T
T
C
T
T
T
C
T
C
G
G
G
G
G
C
A
C
A
C
A
G
T
G
2
G
G
A
C
G
T
T
C
G
4
G
2
10
A
A
C
T
G
A
G
G
G
C
G
6
A
A
8
A
T
10
38
C
A
G
A
G
T
A
A
C
A
T
4
G
G
A
2
A
A
C
A
A
C
A
T
C
G
A
G
C
G
C
G
C
C
T
T
T
4
G
A
G
T
A
C
C
A
G
T
G
G
G
T
G
A
A
T
A
T
C
G
A
T
A
T
A
A
G
A
A
C
T
T
C
A
G
C
C
G
T
G
A
A
A
A
C
A
6
4
T
T
C
C
4
T
G
A
G
T
G
C
T
G
C
T
C
T
4
T
9
A
A
G
C
C
C
31
A
C
G
T
G
G
G
T
C
T
G
C
G
C
T
A
G
T
A
G
C
T
T
2
A
G
T
T
T
22
T
32
G
6
4
A
G
C
G
G
A
C
G
C
A
T
A
C
A
T
G
  91,681,814
  91,681,982
  91,682,795
  91,683,309
  91,683,444
  91,684,721
  91,684,726
  91,686,163
  91,686,896
  91,687,092
  91,688,200
  91,688,412
  91,688,433
  91,688,735
  91,688,831
  91,689,042
  91,690,333
  91,690,386
  91,690,723
  91,690,789
  91,691,347
  91,691,725
  91,691,811
  91,691,848
  91,691,852
  91,691,854
  91,691,856
  91,691,858
  91,691,860
  91,691,862
  91,691,864
  91,691,866
  91,691,868
  91,691,965
  91,692,616
  91,692,983
  91,693,597
  91,693,961
  91,694,036
  91,694,419
  91,694,546
  91,695,535
  91,695,626
  91,695,627
  91,695,917
  91,696,568
  91,697,513
  91,697,677
  91,697,846
  91,698,615
  91,699,164
  91,699,817
  91,699,874
  91,700,092
  91,700,283
  91,700,602
  91,701,256
  91,701,271
  91,701,288
  91,701,770
  91,702,418
  91,702,582
  91,702,640
  91,703,314
  91,703,408
  91,703,409
  91,704,647
  91,708,903
  91,709,310
  91,709,987
  91,710,178
  91,710,259
  91,711,045
  91,712,481
  91,714,045
  91,714,047
  91,714,252
  91,715,050
  91,715,305
  91,715,464
  91,716,304
  91,716,403
  91,716,814
  91,716,825
  91,716,835
  91,716,840
  91,717,198
  91,717,304
  91,717,386
  91,717,427
  91,717,510
  91,717,617
  91,717,728
  91,718,197
  91,718,211
  91,718,226
  91,718,562
  91,718,571
  91,718,930
  91,720,824
  91,721,031
  91,721,790
  91,721,897
  91,722,056
  91,722,632
  91,723,029
  91,723,727
  91,725,179
  91,727,923
  91,727,983
  91,729,039
  91,729,821
  91,729,894
  91,730,323
  91,730,427
  91,733,777
  91,734,033
  91,734,086
  91,736,433
  91,737,591
  91,738,548
  91,738,708
  91,738,977
  91,741,048
  91,741,705
  91,742,291
  91,742,761
  91,742,770
  91,742,906
  91,742,929
  91,742,943
  91,743,125
  91,743,280
  91,743,395
  91,743,588
  91,743,589
  91,743,592
  91,743,888
  91,743,918
  91,743,933
  91,744,431
  91,744,592
  91,744,740
  91,744,857
  91,745,765
  91,745,925
  91,746,137
  91,746,206
  91,746,228
  91,746,261
  91,746,423
  91,746,477
  91,746,715
  91,746,813
  91,747,179
  91,747,436
  91,747,497
  91,748,134
  91,748,144
  91,748,444
  91,748,864
  91,748,877
  91,748,963
  91,749,088
  91,749,190
  91,749,693
  91,750,085
  91,750,135
  91,750,497
  91,750,707
  91,751,004
  91,751,065
  91,751,100
  91,751,168
  91,752,113
  91,752,609
  91,752,768
  91,752,866
  91,753,301
  91,753,595
  91,754,825
  91,754,902
  91,755,174
  91,755,278
  91,755,355
  91,757,130
  91,757,193
  91,757,246
  91,757,894
  91,758,469
  91,760,068
  91,761,102
  91,761,278
  91,761,662
  91,761,917
  91,762,026
  91,762,046
  91,762,407
  91,762,416
  91,763,456
  91,764,623
  91,764,734
  91,764,902
  91,764,903
  91,764,928
  91,764,936
  91,764,963
  91,765,051
  91,765,616
  91,765,990
  91,766,645
  91,766,691
  91,766,731
  91,768,942
  91,769,444
  91,769,558
  91,771,939
  91,772,272
  91,774,828
  91,775,089
  91,775,760
  91,775,797
  91,776,086
  91,776,280
  91,776,384
  91,776,595
  91,776,825
  91,777,201
  91,777,393
  91,777,853
  91,778,104
  91,778,400
  91,778,565
  91,778,566
  91,779,407
  91,779,448
  91,779,881
  91,781,186
  91,781,268
  91,781,431
  91,782,197
  91,782,396
  91,782,492
  91,782,587
  91,783,177
  91,783,187
  91,783,375
  91,784,197
  91,784,311
  91,784,525
  91,785,007
  91,785,762
  91,785,764
  91,785,794
  91,785,863
  91,785,933
  91,786,462
  91,786,469
  91,786,897
  91,786,898
  91,789,442
  91,789,566
  91,789,619
  91,789,965
  91,790,396
  91,790,534
  91,790,539
  91,790,658
  91,790,659
  91,790,666
  91,790,683
  91,790,810
  91,791,200
  91,791,220
  91,791,284
  91,791,504
  91,791,549
  91,791,701
  91,791,769
  91,791,953
  91,792,068
  91,792,148
  91,792,168
  91,792,169
  91,792,376
  91,792,503
  91,792,683
  91,792,717
  91,792,994
  91,792,997
  91,793,083
  91,793,129
  91,793,290
  91,793,292
  91,793,487
  91,793,544
  91,793,604
  91,793,794
  91,793,972
  91,794,076
  91,794,203
  91,794,229
  91,794,485
  91,794,551
  91,794,553
  91,794,771
  91,795,772
  91,795,810
  91,795,832
  91,795,840
  91,795,866
  91,795,939
  91,796,184
  91,796,205
  91,796,225
  91,796,553
  91,796,611
  91,796,781
  91,797,048
  91,797,094
  91,797,475
  91,797,499
  91,797,564
  91,797,826
  91,797,830
  91,798,118
  91,798,123
  91,798,138
  91,798,147
  91,798,954
  91,799,077
  91,799,191
  91,799,376
  91,799,751
  91,799,791
  91,799,825
  91,799,919
  91,800,271
  91,800,325
  91,801,011
  91,801,971
  91,801,994
  91,802,334
  91,802,776
  91,803,148
  91,803,451
  91,803,798
  91,804,355
  91,805,460
  91,805,532
  91,805,778
  91,805,976
  91,806,174
  91,806,221
  91,806,599
  91,806,946
  91,807,548
  91,808,372
  91,808,621
  91,808,855
  91,809,067
  91,809,447
  91,810,060
  91,810,440
  91,812,939
  91,813,467
  91,813,851
  91,814,262
  91,816,178
  91,816,327
  91,818,983
  91,819,153
  91,819,302
  91,819,610
  91,819,879
  91,819,923
  91,820,103
  91,820,600
  91,820,660
  91,820,716
  91,820,886
  91,820,909
  91,820,917
  91,821,221
A
G
C
A
T
G
T
9
-
T
G
T
T
C
T
G
T
T
5
T
A
C
-
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
A
C
T
G
C
G
C
T
A
2/-
4/-
A
T
T/C
A
T
C
C
A
A
3
C
T
3
C
A
C
3
T
C
T
4/-
-
-
C
C
G
G/3
G
G
C
-
-
-
2
C
3
C
G
-
G
T
G
C
A
A
G
G
G/7
-
T
C
G
G
G
5
C
2
12/-
A
7
T
T
-
T
G
C
G
-
-
A
2
3
2
-
T
T
26
G
C
G
C
C
G
A
G
A
C
C
C
T
-
6
A
C
C
T
-
G
A
A
T
A
T
T
C
T
T
C
A
-
T
A
G
-
A/G
C
5
C
A
T
C
-
C
T
2
T
2
T
T
2
A
2
T
T
2
T
G
A
-
A
2/-
A
3
G
3
C
C
C
C/4
2
-
A
-
-
G
G
T
C
T
G
A
A
T
T
A
-
5
A/9
8/-
G
C
-
-
2
G
A
G
A
C
G
21
T
G
C
-
A
A
G
2/-
A/-
T
T
-
2
G
2
C
A
A
G
A
A
T
3
7
T
T
C
G
C
-
A
G
A
A
T
T
T
-
2
C
A
A
A
C
A
G
A/5
A
C
3
G
A
G
2
G
C
-
G
2
G
G
T
G
C
T
G
C
T
A
A
G
-
G
G
4
C
T
G
-
4/-
13
2
T
A
-
C
T
3
A
-
A
T
C
A
T
C
T
-
-
3
-
A/T
G
G/2
T
T
T
-
T
T
2
C
A
A
6
C
A
C
C
T
2
A
C
9
A
16
G
A
A
A
2
2/-
9
2
C
C
C
22/-
-
-
A
-
-
G
4
-
C
A
G
T
A
T
7
C
G
-
C
C
A