Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 141,433 (bp)   Positions: 402
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
1.0
.999
1.0
--
.007
.007
.128
.004
.211
.015
.003
.0
.795
.94
.0
.894
.001
--
.044
.091
.085
.074
.066
.001
.003
.0
.133
.007
.006
.002
.009
.001
.796
.26
.002
.009
.004
.001
.001
.038
.006
.0
.001
.001
.035
.001
.0
.0
.0
.0
.002
1.0
--
.002
.003
.002
.002
.805
.003
.002
.0
.152
.011
.013
.127
.002
.016
.015
.002
.873
.012
.694
.004
--
--
.014
.006
.006
.015
.011
.027
.011
.008
.003
.272
.004
.001
.223
.0
.007
--
--
--
.003
.004
.058
.172
.01
.036
.023
.013
.07
.166
.163
.166
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
.111
--
--
--
--
--
--
.003
.001
.001
.86
.871
.798
.459
.368
.302
.247
.221
.139
.975
.087
.003
.0
.01
.001
--
.016
.64
.14
.141
--
.081
.0
.003
--
.011
.086
.0
.037
.0
.0
.43
.017
.006
.045
.002
.074
.004
.12
.093
.038
.001
1.0
.999
.936
1.0
1.0
.998
.998
.01
.001
.0
.272
.992
.699
.104
.002
.061
.004
.001
.126
.039
.017
.354
.843
.004
.077
.005
.0
.001
.001
.003
.006
.0
.03
.0
.157
.0
.006
.023
.383
.495
.488
.492
.448
.068
.253
.003
.007
.013
.007
.003
--
--
.007
.005
.021
.151
.097
.001
.033
.002
.0
.128
.131
.035
.004
.006
.001
.123
.496
.458
.007
.003
.008
.029
.017
.013
.006
.041
.001
.073
.911
.0
.007
.003
.089
.003
.022
.051
.005
--
1.0
.002
--
--
.436
.229
.124
.2
.001
.0
.034
.057
.012
.008
.017
.039
.122
.131
.02
.029
.041
--
--
--
--
--
.0
.0
.017
.007
.094
.136
.001
.0
.004
.198
.009
.173
--
--
.115
.012
.039
.005
.001
.001
.001
--
.006
.036
.13
.127
.001
.002
.057
.034
.309
.003
.03
.943
.641
.029
.062
.003
.01
.047
--
--
--
--
.005
.097
.083
.093
.185
.511
.748
.146
.003
.019
--
--
.01
.008
.032
.022
.03
.01
.046
.32
.236
.654
.02
.997
.002
.002
.002
.079
.114
--
--
--
.002
.0
.849
.009
.018
.121
.899
.021
.097
--
--
--
--
--
--
.005
.001
.001
.001
.238
.228
.44
.133
.439
.039
.0
.0
.001
.012
.018
.001
.0
.032
.991
.985
.067
.0
.008
.001
.009
.0
.005
.0
.974
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
Chst8
G
A
G
G
A
C
C
A
C
A
T
2
G
C
T
C
A
G
C
T
G
T
G
C
C
G
G
C
G
G
T
T
C
A
A
G
T
G
C
8
T
C
T
G
C
G
T
G
G
A
T
C
T
A
C
C
T
G
C
T
C
C
4
3
G
T
T
C
A
G
A
T
C
10
G
2
2
2
G
G
A
T
A
T
C
A
G
T
C
T
G
C
C
A
C
C
T
C
A
A
C
T
T
T
C
A
G
T
G
T
T
G
T
T
A
C
C
T
T
G
2
G
2
C
C
G
G
T
G
T
A
C
G
G
C
G
G
G
G
2
T
A
5
2
T
G
C
T
C
A
G
3
C
A
T
2
4
T
C
G
G
A
T
4
14
A
C
C
G
G
G
G
G
4
10
6
G
A
28
G
2
A
G
T
T
G
C
A
C
C
C
G
C
A
T
4
2
C
T
C
A
T
C
G
G
G
C
4
G
C
G
C
A
T
2
G
T
A
C
C
C
A
T
C
T
A
G
G
4
C
G
T
6
A
A
A
A
T
6
4
C
A
G
A
A
C
A
A
C
A
C
T
G
C
C
4
G
G
T
A
C
C
G
A
T
C
G
C
C
A
A
G
G
C
7
T
C
C
A
C
C
G
G
G
C
A
A
A
A
C
A
T
A
G
A
A
G
A
A
C
12
C
5
C
T
C
C
4
G
T
G
G
A
G
G
C
T
C
G
C
G
T
T
T
A
G
G
T
2
A
G
C
A
C
C
A
C
G
T
G
C
G
T
G
G
8
C
C
G
A
A
G
C
5
T
G
3
G
C
T
T
C
T
T
G
G
A
G
T
T
T
A
3
T
T
2
T
20
8
C
C
4
T
4
A
G
G
C
G
C
A
A
A
T
C
A
C
A
T
A
T
G
  91,681,814
  91,681,982
  91,682,068
  91,684,287
  91,684,363
  91,685,881
  91,686,163
  91,686,244
  91,686,514
  91,686,558
  91,686,734
  91,686,902
  91,686,997
  91,688,412
  91,688,735
  91,688,831
  91,689,042
  91,689,303
  91,689,313
  91,689,405
  91,689,406
  91,689,457
  91,689,458
  91,690,333
  91,690,386
  91,690,723
  91,690,789
  91,691,692
  91,691,725
  91,691,730
  91,692,046
  91,692,616
  91,692,983
  91,693,597
  91,694,036
  91,694,066
  91,694,419
  91,694,532
  91,694,546
  91,695,629
  91,695,917
  91,696,568
  91,697,513
  91,697,677
  91,697,846
  91,698,615
  91,699,164
  91,699,817
  91,699,874
  91,700,092
  91,700,283
  91,700,602
  91,701,256
  91,701,271
  91,701,288
  91,701,431
  91,701,770
  91,702,418
  91,702,582
  91,702,640
  91,702,864
  91,703,314
  91,703,408
  91,703,409
  91,704,253
  91,708,903
  91,709,310
  91,709,640
  91,709,987
  91,710,178
  91,710,259
  91,710,416
  91,710,618
  91,710,984
  91,710,999
  91,711,058
  91,711,134
  91,711,142
  91,711,151
  91,711,163
  91,713,443
  91,713,520
  91,714,032
  91,714,252
  91,715,050
  91,715,464
  91,716,208
  91,716,304
  91,716,403
  91,716,597
  91,716,814
  91,716,825
  91,716,835
  91,717,282
  91,717,291
  91,717,850
  91,718,211
  91,718,226
  91,718,562
  91,718,571
  91,718,574
  91,718,930
  91,719,100
  91,719,464
  91,719,468
  91,719,754
  91,719,968
  91,719,971
  91,720,432
  91,720,453
  91,720,742
  91,720,743
  91,720,824
  91,721,031
  91,721,378
  91,721,828
  91,721,832
  91,721,870
  91,721,897
  91,721,916
  91,722,027
  91,722,056
  91,722,069
  91,722,076
  91,722,685
  91,722,705
  91,722,721
  91,722,753
  91,722,774
  91,722,806
  91,722,811
  91,722,818
  91,722,951
  91,723,727
  91,724,916
  91,727,983
  91,728,275
  91,728,785
  91,729,857
  91,732,249
  91,733,777
  91,734,034
  91,734,082
  91,734,086
  91,735,153
  91,736,433
  91,738,548
  91,738,977
  91,739,545
  91,740,319
  91,741,242
  91,741,548
  91,741,689
  91,742,761
  91,746,228
  91,746,795
  91,750,361
  91,755,174
  91,755,361
  91,761,586
  91,761,663
  91,761,736
  91,761,912
  91,761,917
  91,762,403
  91,763,456
  91,764,623
  91,764,630
  91,764,666
  91,764,902
  91,764,928
  91,764,963
  91,765,001
  91,765,182
  91,765,984
  91,765,990
  91,766,087
  91,766,433
  91,766,692
  91,766,895
  91,767,095
  91,767,207
  91,767,214
  91,767,431
  91,767,619
  91,767,684
  91,767,837
  91,767,947
  91,768,029
  91,768,281
  91,768,322
  91,768,457
  91,768,638
  91,768,942
  91,769,444
  91,769,558
  91,769,560
  91,769,704
  91,770,988
  91,771,145
  91,771,296
  91,771,434
  91,771,482
  91,771,940
  91,771,952
  91,771,956
  91,772,272
  91,772,374
  91,772,396
  91,772,479
  91,772,582
  91,772,637
  91,772,917
  91,773,221
  91,773,239
  91,773,252
  91,773,505
  91,773,620
  91,773,653
  91,773,655
  91,773,706
  91,773,786
  91,774,110
  91,774,301
  91,774,774
  91,774,828
  91,774,919
  91,775,216
  91,775,378
  91,775,617
  91,775,656
  91,776,086
  91,776,379
  91,776,388
  91,776,394
  91,776,398
  91,776,825
  91,777,201
  91,777,318
  91,777,393
  91,777,834
  91,778,400
  91,778,551
  91,778,566
  91,779,407
  91,779,534
  91,779,881
  91,781,186
  91,781,268
  91,781,431
  91,782,006
  91,782,197
  91,782,361
  91,783,187
  91,783,574
  91,784,312
  91,784,906
  91,785,215
  91,785,794
  91,786,008
  91,786,097
  91,786,161
  91,786,233
  91,786,268
  91,786,412
  91,786,438
  91,786,912
  91,788,310
  91,788,604
  91,789,922
  91,789,925
  91,789,965
  91,790,666
  91,790,668
  91,790,947
  91,791,200
  91,791,203
  91,791,330
  91,791,331
  91,791,332
  91,791,347
  91,791,359
  91,791,622
  91,791,624
  91,791,643
  91,791,701
  91,791,953
  91,792,148
  91,792,503
  91,792,688
  91,792,702
  91,792,994
  91,793,083
  91,793,198
  91,793,794
  91,793,808
  91,793,966
  91,794,076
  91,794,485
  91,794,524
  91,794,545
  91,794,562
  91,794,564
  91,795,060
  91,795,772
  91,795,810
  91,795,832
  91,795,840
  91,795,939
  91,796,021
  91,796,099
  91,796,162
  91,796,182
  91,796,300
  91,796,553
  91,796,611
  91,796,781
  91,796,856
  91,797,048
  91,797,094
  91,797,367
  91,797,475
  91,797,564
  91,797,572
  91,797,637
  91,797,647
  91,797,821
  91,797,871
  91,798,151
  91,798,203
  91,798,359
  91,798,524
  91,798,595
  91,798,629
  91,799,191
  91,799,751
  91,799,791
  91,799,825
  91,799,919
  91,801,011
  91,801,032
  91,801,320
  91,801,321
  91,801,336
  91,801,444
  91,801,655
  91,801,994
  91,802,127
  91,802,220
  91,802,478
  91,802,646
  91,802,785
  91,803,078
  91,803,165
  91,803,316
  91,803,451
  91,803,461
  91,803,481
  91,803,798
  91,804,001
  91,804,355
  91,805,969
  91,806,599
  91,806,946
  91,807,547
  91,807,955
  91,808,372
  91,808,621
  91,808,855
  91,809,067
  91,809,447
  91,809,559
  91,809,580
  91,809,652
  91,809,667
  91,809,669
  91,809,670
  91,810,062
  91,810,064
  91,810,439
  91,812,629
  91,813,851
  91,814,137
  91,814,264
  91,816,178
  91,816,327
  91,818,950
  91,819,048
  91,819,153
  91,820,103
  91,820,184
  91,820,599
  91,820,601
  91,820,660
  91,820,685
  91,820,716
  91,820,886
  91,820,909
  91,820,917
  91,821,119
  91,822,399
  91,822,458
A
G
T
4
G
T
5
G
T
G
C
-
T
T
C
T
G
G/-
C/T
T/C
G/A
T/C
G/A
T
T
4
T
T
C
A
T/G
C
T
G
G
A
C
A
T
-
A
T
C
A
T
C
C
A
A
AT/3
C
T
T/3
C
A
T
C
3
T
C
T
T
-
3/-
A
C
C
T
G
G/3
G
A
2
-
G/C
-
-
2/-
G/C
G/C
G
C
5
-
2
3
A
C
G
C
-
G
T
G
T
T
C
G
G
G
T
5
C
C
2
T
C
A
A
C
C
A
C
3
3
G
C/G
C
A
9
-
G/7
2/-
3
C/-
G/-
G/T
T/C
T
C
G
G
T
-
2
C
A
A
G/C
2/-
3
-
-
-
A/TA
T
26
C
C/G
G
G/2
-
T
G
C
-
-
-
C/3
T
A
-
C
-
-
G
T
T
A
T
A
T
A
-
-
-
A
G
-
A
-
G
T
-
A
A
T
G
T
T
A
A
A
G
C
4/-
2/-
T
C
3
G
G
T
T
T
T
2
-
A
T
-
T
G
C
-
G/A
C
A/G
C/T
A
C/T
G
C
A
A
G
A
A
-
T
A
C
6/-
15
A/G
A/G
G
C
6/-
-
T
G
G/2
A/-
T
T
-
2
G
2
T
C
A
A
G
4/-
T
A
T/C
-
T
T
T
G
G
T
A
T
T
C
T
2
A
T
-
A
G
G
G
T
A
A
A
A
G
G
G
-
G
G
T
C
G
A
G
A/G
A
4
G
T
-
C/-
5/-
T
2
T
A
-
T
A
T
A
-
A
A
T
C
T
A
T
A
C
-
A
G
A
A
C
-
G
A
T
G
T
T
T
T
2
C
6
A
C
10
A
T
-
A
T
A
G
G
A
T
-
C
3
-
2
A
C
C
T
A
2
3
5/3
9
2
C
C
C
T
-
T/C
T/2
2/-
T/2
-
-
2
-
-
3
-
G
4
A
T
C
T
G
8
6
C
G
G
-
T
C
C
C
2