Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 205,850 (bp)   Positions: 590
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.0
.175
.023
.004
.879
.007
.006
.002
.003
.002
.971
.984
.002
.015
.036
.627
.0
.0
.0
.0
.002
.05
.002
.006
.002
.0
.008
.048
--
.009
.076
.005
.056
.005
.24
.012
.048
.004
.003
.002
.773
.037
.025
.005
.003
.407
.107
.004
.001
.0
.251
.002
.001
.0
.004
.004
.008
.004
.009
.064
.004
.091
.012
.025
.029
.026
.008
.024
.021
.032
.267
.012
.016
.009
.109
.085
.01
.01
.0
.005
.652
.692
.699
.057
.0
.001
.015
.001
.0
.326
.776
.002
.0
.009
.001
.019
.001
.004
.003
.045
.068
.025
.336
.015
.016
.022
.008
.005
.0
.248
.0
--
--
.001
.978
.988
.002
.005
.027
.003
--
--
.01
.329
.002
.001
.0
.0
.003
.062
.319
.026
.047
.0
.013
.003
.0
.0
.001
.003
.002
.294
.082
.107
.999
.005
.959
.016
.055
.03
.003
.049
.257
.65
.032
.006
--
--
--
.032
.425
.634
.001
.001
.023
.008
.005
.061
.003
.01
.008
.067
.444
.465
.483
.413
.438
.071
.003
.005
.005
.0
.0
.005
.002
.002
.062
.002
.0
.042
.003
.005
.163
.059
.002
.028
.995
.029
.199
.055
.055
.013
.006
.978
.709
.215
.004
.223
.513
.034
.038
.046
.028
.0
.0
.001
.063
.0
.982
.004
.026
.002
.0
--
.059
.29
.288
.042
.044
.001
.02
.01
.006
.001
.0
.004
.006
.03
.001
.054
.014
.004
.002
.003
.005
.0
.009
.0
.0
.046
.0
.016
.093
.027
.0
.003
.002
.004
.322
.002
.48
.004
.024
.206
.138
.09
.045
.044
.019
.248
.026
.011
--
--
--
--
--
.01
.004
.121
.192
.013
.004
.01
.01
.045
.09
.017
.047
.002
.013
.002
.007
.05
.005
.002
.002
.003
.101
.002
.001
.011
.012
.974
.11
.034
.012
.004
.0
.004
.0
.001
.0
.001
.002
.003
.002
--
--
.006
.007
.016
.022
.077
.001
.04
.0
.08
.008
.0
.001
--
.034
.004
.062
.088
.09
.001
.001
.017
--
.007
.001
.402
.321
.309
.306
.008
.029
.042
.003
.0
.004
.002
.201
.003
.04
.315
.048
.152
.032
.05
.017
.001
.041
.006
.0
--
.048
.005
.005
.004
.004
.0
.0
.001
.028
.0
.002
.002
.002
.014
.0
.008
.01
.068
.007
.222
.033
--
--
--
.0
.001
.986
.0
.044
.0
.01
.003
.021
.0
.013
--
--
--
--
--
.001
.195
.083
.086
.003
.003
.002
.01
.001
.047
.002
.135
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.871
.995
--
.001
.004
.0
.0
.0
.095
.116
.002
.002
.001
.001
.005
.002
.272
.071
.02
.006
.088
.009
.072
.0
.002
.004
.0
.001
.005
.02
.003
.006
.002
.002
.001
.0
.029
.001
.0
.007
.003
.914
.005
.243
.0
.45
.0
.006
.066
.0
.0
.005
.042
.0
.029
.003
.0
.0
.0
.07
.023
.192
.192
.035
.048
.149
.0
.002
.013
.001
.001
.003
.009
.001
.048
.0
.009
.267
.003
.001
.001
.001
.004
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.001
.002
.002
.004
.139
.043
.05
.001
.005
.001
.001
.002
.0
.001
.989
.031
.001
.006
.046
.001
--
--
--
--
--
.015
.003
.002
.211
--
--
--
.005
.099
.017
.001
.008
.005
.002
.004
.058
.034
.002
.005
.001
.461
.005
.008
.036
.001
.015
.001
.023
.109
.004
.006
.028
--
--
--
.008
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rpl4-ps2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
A
T
A
A
A
G
A
C
T
A
T
G
G
A
A
G
T
C
5
A
A
C
T
C
C
T
T
C
G
A
G
2
A
G
A
T
A
G
A
T
G
A
G
T
T
C
T
2
T
G
T
A
T
T
C
A
T
A
C
T
4
C
A
A
T
A
A
C
C
A
G
G
C
C
A
A
A
T
T
C
A
C
A
G
A
A
T
C
A
A
A
T
T
T
G
G
A
5
130
A
T
A
C
G
T
A
2
A
T
C
T
A
A
C
C
G
T
G
T
A
T
97
G
A
G
G
A
G
A
G
A
A
C
T
T
C
A
A
A
G
A
T
A
A
C
C
C
T
A
C
G
G
T
A
T
T
T
T
C
G
A
T
T
C
C
C
A
12
T
A
2
A
T
G
6
G
G
G
5
A
A
G
C
G
G
C
G
G
C
T
A
T
T
12
G
G
A
20
G
A
G
A
C
C
G
A
T
A
G
T
T
A
A
C
G
C
7
C
C
T
G
G
G
10
A
12
10
G
G
G
A
A
T
A
T
6
G
T
T
C
C
C
A
12
G
A
C
C
T
2
A
A
A
4
A
T
C
T
G
A
T
G
G
G
A
G
T
C
A
A
G
A
G
G
T
C
A
C
G
2
A
G
A
A
G
G
102
T
T
G
T
C
T
T
T
G
A
C
G
C
G
G
A
G
T
C
G
T
T
G
G
T
A
A
C
G
G
G
C
C
A
T
9
A
T
G
A
C
T
C
G
G
A
6
4
2
2
C
T
G
T
A
2
G
T
2
C
G
G
T
C
T
T
G
A
A
G
T
G
C
C
C
G
A
C
A
A
45
A
A
2
A
C
C
2
C
C
G
A
G
T
C
C
A
T
T
C
A
T
A
2
89
T
G
T
A
G
C
A
A
T
G
A
A
G
C
C
T
C
T
T
A
A
G
A
G
T
A
C
A
C
G
T
C
T
C
A
C
G
T
C
T
T
A
G
T
T
A
C
G
C
T
T
A
T
A
T
15
A
T
A
C
T
G
C
5
G
G
8
A
T
22
C
T
A
T
T
G
C
T
G
2
C
A
C
A
C
G
T
T
29
A
A
A
T
C
A
T
G
T
A
A
C
22
G
G
C
C
C
T
G
15
A
A
T
C
A
G
C
G
C
A
C
C
C
G
C
C
C
G
C
C
C
G
C
C
C
C
G
C
C
C
G
G
T
T
T
C
A
G
G
A
C
A
A
T
T
T
A
2
C
C
C
C
A
C
A
G
T
T
A
A
G
T
T
T
A
T
A
G
A
G
A
G
A
A
C
A
G
C
G
G
C
A
C
A
A
T
G
  134,915,289
  134,915,572
  134,915,903
  134,916,333
  134,916,450
  134,916,485
  134,916,664
  134,917,669
  134,918,052
  134,918,062
  134,918,329
  134,918,855
  134,919,260
  134,920,229
  134,920,235
  134,920,248
  134,920,330
  134,921,553
  134,921,628
  134,921,630
  134,922,172
  134,923,647
  134,925,922
  134,926,275
  134,926,327
  134,926,351
  134,926,828
  134,927,131
  134,927,475
  134,928,291
  134,928,443
  134,928,877
  134,928,892
  134,928,912
  134,929,171
  134,930,047
  134,930,080
  134,930,131
  134,930,712
  134,930,874
  134,930,990
  134,931,014
  134,931,784
  134,931,848
  134,931,900
  134,931,973
  134,932,166
  134,932,229
  134,932,261
  134,932,400
  134,932,591
  134,932,649
  134,932,787
  134,932,987
  134,933,219
  134,933,537
  134,933,562
  134,933,637
  134,933,746
  134,933,855
  134,934,198
  134,934,241
  134,934,353
  134,934,383
  134,934,622
  134,934,699
  134,934,702
  134,934,743
  134,934,759
  134,934,771
  134,934,820
  134,934,960
  134,935,263
  134,935,334
  134,935,416
  134,935,470
  134,935,472
  134,935,543
  134,935,740
  134,936,116
  134,936,127
  134,936,207
  134,936,221
  134,936,222
  134,936,396
  134,936,418
  134,936,790
  134,936,821
  134,937,115
  134,937,125
  134,937,272
  134,937,301
  134,937,420
  134,937,439
  134,937,457
  134,937,767
  134,937,897
  134,937,997
  134,938,185
  134,938,191
  134,938,483
  134,938,665
  134,938,863
  134,939,109
  134,939,147
  134,939,149
  134,939,405
  134,940,190
  134,940,293
  134,940,472
  134,941,491
  134,941,509
  134,944,204
  134,944,329
  134,945,224
  134,946,118
  134,946,152
  134,947,296
  134,947,906
  134,948,289
  134,948,367
  134,948,904
  134,949,179
  134,949,840
  134,950,178
  134,950,261
  134,950,423
  134,950,598
  134,950,703
  134,950,729
  134,950,812
  134,950,871
  134,951,064
  134,951,186
  134,951,391
  134,951,420
  134,951,516
  134,951,863
  134,952,000
  134,952,954
  134,953,066
  134,953,110
  134,953,290
  134,953,339
  134,953,877
  134,954,452
  134,954,632
  134,954,824
  134,955,327
  134,955,395
  134,957,107
  134,957,154
  134,957,379
  134,957,438
  134,957,492
  134,957,570
  134,957,658
  134,957,753
  134,957,768
  134,957,805
  134,957,936
  134,957,992
  134,958,015
  134,958,383
  134,958,458
  134,958,609
  134,958,613
  134,958,919
  134,958,941
  134,959,247
  134,959,291
  134,959,496
  134,959,540
  134,959,614
  134,959,622
  134,959,627
  134,959,653
  134,960,166
  134,960,748
  134,961,103
  134,961,108
  134,961,119
  134,961,143
  134,961,260
  134,961,382
  134,962,235
  134,962,426
  134,962,687
  134,962,701
  134,963,309
  134,963,318
  134,964,063
  134,965,037
  134,966,386
  134,966,763
  134,967,505
  134,968,147
  134,968,373
  134,968,489
  134,968,714
  134,970,291
  134,970,729
  134,970,839
  134,970,841
  134,972,052
  134,973,370
  134,973,475
  134,973,560
  134,973,609
  134,973,613
  134,974,583
  134,974,866
  134,975,806
  134,976,373
  134,976,655
  134,976,828
  134,977,302
  134,977,585
  134,978,011
  134,978,135
  134,978,298
  134,978,319
  134,978,604
  134,979,064
  134,980,839
  134,982,706
  134,982,853
  134,982,855
  134,982,920
  134,982,926
  134,983,436
  134,983,479
  134,984,248
  134,984,499
  134,984,677
  134,985,105
  134,985,319
  134,985,445
  134,985,459
  134,985,465
  134,985,480
  134,985,508
  134,985,514
  134,985,518
  134,985,538
  134,985,555
  134,985,594
  134,986,655
  134,986,823
  134,986,825
  134,987,966
  134,988,310
  134,988,720
  134,989,752
  134,989,798
  134,990,536
  134,990,615
  134,991,961
  134,995,417
  134,995,698
  134,995,736
  134,995,780
  134,995,912
  134,995,919
  134,996,522
  134,996,639
  134,996,879
  134,996,991
  134,997,647
  134,997,722
  134,997,885
  134,997,915
  134,998,211
  134,998,356
  134,998,528
  134,998,643
  134,998,672
  134,999,588
  134,999,786
  134,999,927
  135,000,100
  135,000,504
  135,000,677
  135,000,766
  135,000,783
  135,000,795
  135,000,912
  135,001,054
  135,001,202
  135,001,394
  135,001,464
  135,001,533
  135,001,545
  135,001,577
  135,001,619
  135,001,701
  135,002,123
  135,002,161
  135,002,408
  135,002,495
  135,002,504
  135,002,585
  135,002,617
  135,002,733
  135,002,752
  135,002,799
  135,002,833
  135,003,087
  135,003,265
  135,003,295
  135,003,336
  135,003,340
  135,003,543
  135,003,630
  135,003,715
  135,003,788
  135,003,802
  135,003,805
  135,003,876
  135,004,071
  135,004,423
  135,004,430
  135,004,456
  135,005,291
  135,005,507
  135,005,731
  135,005,965
  135,006,430
  135,006,827
  135,006,947
  135,007,142
  135,007,545
  135,007,648
  135,008,283
  135,009,382
  135,009,455
  135,009,457
  135,009,497
  135,013,030
  135,013,324
  135,013,586
  135,019,563
  135,020,095
  135,020,432
  135,020,958
  135,020,980
  135,020,984
  135,020,985
  135,021,482
  135,021,539
  135,021,547
  135,021,726
  135,021,739
  135,021,987
  135,022,212
  135,022,996
  135,023,036
  135,023,334
  135,023,350
  135,023,910
  135,024,083
  135,024,209
  135,024,536
  135,024,701
  135,025,016
  135,025,423
  135,025,840
  135,026,029
  135,026,107
  135,026,210
  135,026,426
  135,026,677
  135,026,678
  135,026,868
  135,026,976
  135,026,992
  135,027,177
  135,027,519
  135,027,574
  135,027,594
  135,027,747
  135,027,750
  135,028,394
  135,028,412
  135,028,582
  135,028,880
  135,029,027
  135,029,275
  135,029,448
  135,029,552
  135,029,665
  135,029,728
  135,029,731
  135,030,109
  135,030,160
  135,030,629
  135,030,861
  135,030,992
  135,031,134
  135,031,175
  135,031,176
  135,031,201
  135,031,356
  135,031,595
  135,031,649
  135,031,664
  135,031,748
  135,031,760
  135,031,946
  135,032,848
  135,033,243
  135,033,351
  135,033,352
  135,035,793
  135,035,798
  135,035,856
  135,036,000
  135,036,536
  135,036,688
  135,036,850
  135,037,116
  135,037,702
  135,037,939
  135,038,288
  135,038,461
  135,038,620
  135,038,809
  135,038,888
  135,038,891
  135,039,076
  135,039,092
  135,039,548
  135,041,044
  135,041,270
  135,041,331
  135,041,345
  135,041,377
  135,041,396
  135,041,487
  135,041,536
  135,041,635
  135,041,646
  135,041,796
  135,043,206
  135,043,531
  135,043,886
  135,043,891
  135,043,898
  135,044,070
  135,044,094
  135,044,116
  135,045,123
  135,045,139
  135,045,460
  135,045,591
  135,045,667
  135,050,783
  135,051,168
  135,051,282
  135,051,332
  135,051,548
  135,052,290
  135,052,356
  135,052,709
  135,052,774
  135,053,102
  135,053,679
  135,054,909
  135,054,928
  135,055,447
  135,056,115
  135,056,205
  135,061,109
  135,062,145
  135,063,569
  135,063,585
  135,064,944
  135,069,288
  135,069,979
  135,070,849
  135,071,703
  135,071,789
  135,071,984
  135,072,648
  135,072,701
  135,072,792
  135,073,818
  135,074,175
  135,074,234
  135,074,426
  135,074,647
  135,074,732
  135,075,886
  135,076,132
  135,076,494
  135,076,926
  135,077,205
  135,077,226
  135,078,035
  135,078,735
  135,078,890
  135,080,457
  135,080,460
  135,080,991
  135,081,071
  135,081,207
  135,082,154
  135,082,488
  135,085,611
  135,088,142
  135,089,270
  135,091,078
  135,092,139
  135,097,498
  135,098,238
  135,098,246
  135,098,309
  135,098,320
  135,098,337
  135,098,351
  135,098,354
  135,098,355
  135,098,359
  135,098,365
  135,098,366
  135,098,372
  135,098,375
  135,098,377
  135,098,394
  135,098,395
  135,098,401
  135,098,402
  135,098,910
  135,099,307
  135,099,327
  135,099,573
  135,099,780
  135,099,900
  135,100,241
  135,101,078
  135,101,107
  135,101,204
  135,101,674
  135,102,206
  135,102,486
  135,102,969
  135,103,141
  135,104,100
  135,104,793
  135,106,235
  135,107,239
  135,107,369
  135,107,401
  135,107,550
  135,107,576
  135,107,676
  135,107,928
  135,108,043
  135,109,002
  135,109,030
  135,109,147
  135,109,235
  135,109,337
  135,109,569
  135,109,996
  135,110,427
  135,110,552
  135,110,636
  135,110,643
  135,110,891
  135,110,925
  135,110,968
  135,111,685
  135,111,782
  135,112,116
  135,113,129
  135,113,350
  135,113,351
  135,113,422
  135,113,704
  135,113,933
  135,114,848
  135,114,951
  135,115,340
  135,115,640
  135,116,375
  135,118,095
  135,118,096
  135,118,373
  135,120,587
A
G
C
-
2
G
A
G
5
C
G
C
A
C
T
G
A
C
-
-
G
G
G
G
T
T
C
C
T
A
G
A
-
G
A
T
C
10
A
2
C
A
3
T
G
G
2
-
-
C
T
-
C
C
C
T
G
A
3
2
-
-
T
G
C
C
G
G
A
A
T
A
A
T
T
2
T
C
C
G
T
G
T
C
A
G
G
C
T
C
T
G
C
C
108/109
A
T
G
-
130/-
G
9
G
T
T
C
G
-
C
C
G
C
G
9
5
T
A
C
T
C
-
A
-
C
G
T
A
G
A
G
A
C
G
T
A
G
C/2
G
T
G
T
G
G
T
2
T
T
T
G
C
T
A
A
A
G
C
A
C
G
T
A
C
C
G
A
T
A
G
-
G
G
-
G
G
-
-
-
2
A
-
C
2
A
T
2
A
G
A
-
G
C
G
-
3/5
-
A
-
C
-
-
G
A
C
T
T
A
G
C
T
A
C
2
-
G
A
A
G
-
G
T
A
A
C
C
-
G
12/-
-
3
5
A
G
5
C
C
C
-
-
-
2
T
-
T
T
-
T
2
T
T
C
-
G
2
T
-
G
C
C/3
C
T
G
C
A
C
T
G
A
-
A
G
G
T
2
A
A
2
2
-
A
C
-
G
A
C
G
2
A
-
A
-
C
2
-
C
C
C
A
G
-
A
T
C
A
G
A
C
T
A
C
C
T
C
14
T
G
T
A
A
A
A
G
G
G
-
G
A
A
2
G
C
G
A
T
G
-
4/-
-
-
T
G
-
3
T
2/-
12
G
2/-
C/-
A
A
C
T
A
3
T
3
C
C
G
A
2
A
T
A
T
T
G
C
-
G
2
2/-
-
T
T
-
T
G
A
2
A
A
T
T
G
C
A
A
20
C
T
-
-
3
A
C
G
A
-
G
G
G
A
2
3
C
T
G
5
3
16
2
12
T
T
G
A
C
T
G
G
T
A
C
A
C
T
G
T
C
G
T
C
C
C
A
C
C
G
A
C
3
C
A
T
A
C
C
-
G
G
G
T
C
C
T
-
T
A
-
C
C
-
T
C
T
-
C
A
A
A
A
-
5
5
3
T
T
A
C
TA/3
-
3
C
T
A
2
-
C
T
C
G
4
T
-
A
C
T
T
T
G
-
-
C
C
C
T
G
A
T
A
T
5
A
T
T
T
T
G
T
T
T
T
-
T
T
T
G
T
T
T
A
21
3
G/7
C
C
G
T
G
A
T
T
T
G
G
3
-
C
3
-
T
T
A
T
T
A
G
A
A
A
C
G
A
C
C
C
C
A
G
A
C
A
G
C
G
T
A
-
A
T
A
A
T
-
3
2
4
A
C